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SCNpilot_solid_1_scaffold_853_3

Organism: SCNPILOT_SOLID_1_Sphingobacteriales_41_19

near complete RP 53 / 55 MC: 1 BSCG 51 / 51 ASCG 13 / 38
Location: comp(2126..5311)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
TonB-dependent receptor plug n=1 Tax=Runella slithyformis (strain ATCC 29530 / DSM 19594 / LMG 11500 / NCIMB 11436 / LSU 4) RepID=F8EQU0_RUNSL similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 49.6
  • Coverage: 984.0
  • Bit_score: 924
  • Evalue 1.20e-265
TonB-dependent receptor plug similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 49.6
  • Coverage: 984.0
  • Bit_score: 924
  • Evalue 3.30e-266
TonB-dependent receptor plug {ECO:0000313|EMBL:AEI51981.1}; Flags: Precursor;; TaxID=761193 species="Bacteria; Bacteroidetes; Cytophagia; Cytophagales; Cytophagaceae; Runella.;" source="Runella slithy similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 49.6
  • Coverage: 984.0
  • Bit_score: 924
  • Evalue 1.60e-265

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Runella slithyformis → Runella → Cytophagales → Cytophagia → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3186
ATGATTCCAATTACAGGGTACCGAAATGATAAAGGTGTCATTTTATTACCATCTGCACTCGGGAGGTATATGAGATTAACAACCATTCTTCTGTTGTTGTTTACACTTCGGGTTAGTGCAAATGACTACATGGGGAATAATGCTCGTACAGAAAAGAATTTTCCTTTGATAGATATTTTTAAATCTATCAATCATAATGATTTCTTCCCCGCGAAGGAAATAACCTATTTTAAGCCTCAGTTGGCCCCGCTGACGGTAGTAGCGTCTGAAACGCCTCCTAAAGAGATACGTGGCATAGTTACCAATAAAGATGGTGAGCCTTTACAAAATGTATCAGTATTGGTGGTAGGTACTCAGATTGGGGCCGTTACCGATGCGAACGGACGTTTTTCACTGTCTGTTTCGCTCGACAGGAATATTGTGTTGGAAGTTTCTAGTGTGGGATTTGAAACGAAACGAATAAATCTGGGAAAACAGACTGAGATTAATATTACATTGGACGATGTTGTTGCAGGAATGGAGGAAATTGTTATTGGCTATGGCACGGTTAGAAAAAAAGATCTTACGGGATCGGTTGCGCAGGTAAAGGCTGCTGATTTAAAGGCCTTTGCTGCAGCCAACCCGCTGCTCACTTTATCGGGTCGTGCGGCGGGGGTTCAGGTTAAGCAGGTTTCCGGCCAGCCGGGTGCTGAATTGTTTATCAGGATCAGGGGATCCAATTCTATCCGCGGAAGCAATGACCCCTTGTATGTTATTGATGGTATTCCCACTGATAATCCTTATGTATTAAATAATGGCGATATAGAAAGCATGGAAATATTAAAAGATGCATCTTCTACTGCCATTTATGGTTCACGGGGAGCTAACGGCGTTGTGATCATCACTACGAAAGGAGGGGTTGCAGGCCGCACCAAAATAGACTTGGAATCGAGGTATACAGGTCAGCAATTGAGAAAAAAGATTGACCTGATGGATGCCCAGGAGTATACCAGCTTTTATAATCAATTAGCCGCAAACTCAGCTATGGCTCCATTTTATACAGATGAAATGATCAAAGGCTACGGCAAGGGTACAGACTGGCAGGATCTTGTATTCAGAAAAGCCCCTATGCAGGATCATACTTTAACGATCAGCGGCGGCAATGCAAAAACCAGATTTTCTTTAGCCGGTAGCTTATTCGATCAGCGGGGTATTATCGAAAACAGTTCTTTCAAAAGATACTCCGCGCGCATGAACTTTCGCCATGAGGTAAATAATTGGATGGATGTTGAGTTTTCAAGTATTGCCAGCCGGTCGGATCAGTCTTTGCAGAGTTCAGCAGGTGCGAGGCTGGGAGGATCTCTGATTGCGGCAACCATTACGGCACCGCCTATATTTGAACCCTATGATTCAACAGGAAGCCCCACTATTTTTTCACAAACATATCCGTTTCCCAGCTCCGCTATGGGGAATCCCCTGCTCTATACAAAACTAACCCAGGGAGGCAGCGTAAAAAATGACGTTAACACAACCGGGAAACTGTCATTTAAGATTATTGAGGGCTTACGGCTTAATGTGCAGGGCGGCTATATAACACGTGACATCAGGAATGACTCCTATCAGTCTATTGAGTACAACCGCCGAGGCAACGCATCCGTTTCTACAAGTAACTATACCAGTACGCTCAGCGAAAATACGCTTGAATATAGACGCGTTTTTAATAGAAAGCATAGCTTAAATGTTTTGGCAGGACAAACGTATCAAAATTTTATTACGAAAGGGCTAAGCGGGTCTGCAACGGACATGTTAAGTGATATCACGAATTCATATAATCTGGCAAGCTCGCGCACACCCGGGATTCCTGCTTCAAGCTATAACAAATCTGTTCTTTTATCTTATCTGGGAAGAATTAATTATAGCTATAACGACATGGTATTGCTAACAGGTAGTTTACGTGCTGATGGAGCATCGAAATACAGTGCTGGTGAAAAATGGGGTTATTTTCCATCGTTTGCGGTTGCATTGAAGATAAAAGAAATGGTTCTTGAAAATGTTGATGCAGTCAGTGATCTAAAACTGAGAGGAAGCTGGGGAAAGACTGGCAGCCAGGCCATTAATGCATATGCTACCATGAACCTCCTCCAGGCGGGTGCCACTATATTCGGCAGCGATACCCGTACTGTAACGCTTGCACCCGGAAATTCACTTCCCTTTCAATTAAAGTGGGAAAGCACAGCACAGCTGGATTTTGGTATTGATGCATCTTTTCTTGAAGGCAGGTATAGATTTGTGGCTGATTTTTACAGAAAGGTTACCACCAACCTCTTAAGTATTGTATCTCTGCCTACCTCTACCGGATATGCTTCTTCGCTTCAAAATATTGGAGCAATGGAAAATAAGGGGGTTGAATTTTCTATTGAGGCTAATTTGATAAAAAACAGGGCGGTGAATTGGAATGTTTCCGGAAACATATCCTTTAACAGGAACAAAATTAAAGAGCTATATGGTGGAAAAGATATTATAACGGGTAATTTTAATTTTGGCGGTGCGCAGTTTATAGATGACATAGTAGTATTAAGACAAGGCCAGCCACTGGGCATGTTCTACGGCTATGAGGAAAATGGATATGTACAGGGCGCACACGGAGCACTTTCCGTTGTTACTTATAAAGACCGTAATAATGATGGTATTATTAATGTAGAGGATAAAATAAAAATAGGTGATCCCAATCCTGATTTTATATATGGGTTTAGCTCTTTTTTAACATACAAGGCGTTCTCCTTAAGTGCATATTTTCAGGGTACTTATGGAAATGATATTGCCAACCTTAGTGCATTAACTTTATATGAGGTGCCTTATTGGGTTAATACGCTTAAAGAAATGCCTCAAAATTTAGCTACAAGTAATAATCCAAACGCCAAATATCCCCAGCCAGAACAAAGAAATCTTGGATTGTTGTTTTCCAAAAGATTTGTAGAAAACGGGTCTTACCTGAGGTTGCAGCACATTGAATTGGGGTATAGCTTACAAAAAGGTCCAAGAAGTGCCTATATCTTTATTGGTGGAGATAATCTGCTTACGTTCACAAAGTATTCATGGTGGGATCCTGAGGTTAATGCCACAGGGGTTGATATTGTTCAGGGGGTTGATTATAATACCTATCCAAGAACAAAGTCTTATACGTTTGGTGTGAGGCTATCTCTTTAA
PROTEIN sequence
Length: 1062
MIPITGYRNDKGVILLPSALGRYMRLTTILLLLFTLRVSANDYMGNNARTEKNFPLIDIFKSINHNDFFPAKEITYFKPQLAPLTVVASETPPKEIRGIVTNKDGEPLQNVSVLVVGTQIGAVTDANGRFSLSVSLDRNIVLEVSSVGFETKRINLGKQTEINITLDDVVAGMEEIVIGYGTVRKKDLTGSVAQVKAADLKAFAAANPLLTLSGRAAGVQVKQVSGQPGAELFIRIRGSNSIRGSNDPLYVIDGIPTDNPYVLNNGDIESMEILKDASSTAIYGSRGANGVVIITTKGGVAGRTKIDLESRYTGQQLRKKIDLMDAQEYTSFYNQLAANSAMAPFYTDEMIKGYGKGTDWQDLVFRKAPMQDHTLTISGGNAKTRFSLAGSLFDQRGIIENSSFKRYSARMNFRHEVNNWMDVEFSSIASRSDQSLQSSAGARLGGSLIAATITAPPIFEPYDSTGSPTIFSQTYPFPSSAMGNPLLYTKLTQGGSVKNDVNTTGKLSFKIIEGLRLNVQGGYITRDIRNDSYQSIEYNRRGNASVSTSNYTSTLSENTLEYRRVFNRKHSLNVLAGQTYQNFITKGLSGSATDMLSDITNSYNLASSRTPGIPASSYNKSVLLSYLGRINYSYNDMVLLTGSLRADGASKYSAGEKWGYFPSFAVALKIKEMVLENVDAVSDLKLRGSWGKTGSQAINAYATMNLLQAGATIFGSDTRTVTLAPGNSLPFQLKWESTAQLDFGIDASFLEGRYRFVADFYRKVTTNLLSIVSLPTSTGYASSLQNIGAMENKGVEFSIEANLIKNRAVNWNVSGNISFNRNKIKELYGGKDIITGNFNFGGAQFIDDIVVLRQGQPLGMFYGYEENGYVQGAHGALSVVTYKDRNNDGIINVEDKIKIGDPNPDFIYGFSSFLTYKAFSLSAYFQGTYGNDIANLSALTLYEVPYWVNTLKEMPQNLATSNNPNAKYPQPEQRNLGLLFSKRFVENGSYLRLQHIELGYSLQKGPRSAYIFIGGDNLLTFTKYSWWDPEVNATGVDIVQGVDYNTYPRTKSYTFGVRLSL*