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MEL_C3_46_17

Organism: MEL.C3

partial RP 36 / 55 MC: 3 BSCG 39 / 51 ASCG 0 / 38
Location: comp(19258..21015)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
lytB; SpoIID/LytB domain-containing protein LytB similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 29.6
  • Coverage: 503.0
  • Bit_score: 172
  • Evalue 4.00e-40
transmembrane_regions (db=TMHMM db_id=tmhmm from=5 to=27) iprscan interpro
DB: TMHMM
  • Identity: null
  • Coverage: null
  • Bit_score: null
seg (db=Seg db_id=seg from=530 to=543) iprscan interpro
DB: Seg
  • Identity: null
  • Coverage: null
  • Bit_score: null

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Clostridium sp. CAG:306 → Melainabacteria → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 1758
GTGAGAAAAAAGTTTCTTTCAACTTTAATTGCTATCATATTAAATTTATGTATATTTAATTTTGCAAATGCTTATAACACCAACAAATTAATTCGTGTTGGTATTTCATCAAACGATTTTTCAAAACTTTTATATAATGAAACGAATATAACTTCAAATAATAATTTTTATGTTATTGATAAAGAAATCAATAAAAAACTTATTAGTTTAAAAAATGATGAAAAGTTGAATATTAAATATTGTAATGGAAAATATATTTTGTCATCAAATGATAAAAATGTTGAAACTTTAAATTCTATTCTGGAAATAAAAACACAAGATGACAAAGGATATTTGCAAATTGTAGGTTTAAAACGTGCAGGAATTGATGTTCTATATGATGGTACAATTGAACTTGTTGCAAATAAAACTCAAAATAACAAATTTGCTATAGTGAATGTCGTGCCGTTGGAAAACTATTTAAAAAGTGTTGTTCCAAATGAAATGCCTGTTCGATTTGGACTTGAAGCTTTAAAAGCACAAAGTGTTGCCGCGCGTAATTATGTTTTAAAACCTCGTGAGAAATTTTATAAAGAATTTGATGTATGCGACTCGACTGCTTCTCAGGTTTATTATGGAATGTCTAGTCGTAAACCACTTTCAAATAAGGCGGTTGATGAAACTAAAGGTATTGTTGCATTATATAAAGATGATCTCATTTTAGCTTTATATTGTTCGACAATTGGCGGTTATAGTGAAAGCTATAAAAATGCATTTTCTACAAATAAACCTAAAGTAAAGTTTCCATCACATGATATTCCATATTTAAAAGCAAAACCTGACAATTTAAATATACAAAAATTAGAAACAGAAGGGCTTGCGACATGGTTTTATACAAATAAAATCGATTCGTATGATATTGATTCTCCTTATTATCGTTGGGAAACAGTTTGGTCTTATAGTGAGCTTGATAAAATATTAAGAGAACGTATAAGGCAAAACATCAATTCAGGTTTTATTTTTCCAAAAGTTGATAAAAATTTTGATTTTGGAAAGCTAAAAGATATAAAAGTTCTTGAGCGGGGTGAGAGCGGTAAAATAATAAGCATGGATATTGTTTTTGATAATATTACATTTAATGTTAAAAAAGAACTTATTATTCGAAAATTATTTATTAAAAATAATAAAATGTTAAAAAGTGCAAATTGTGTGTTCCAATTTACTTATAATAAAGAAAATTTAGGCGATAATAATTTAAAAAATTCTTTTTATCAATTTGAAAAAGAAGAATATATAAATAATTTACCTCTTTATTTTGATGAAATCAAAGCAATAGGCGGCGGTTTTGGCCATGGGGTCGGTTTGAGTCAATTTGGTGCAGCAAATATGGCGAAAAATGGACACAATTGTGCAGCAAATATGGCGAAAAATGGACACAATTATGAGCAAATTTTAAAACATTATTATTCTAATATTGATTTAGCCACTCAACCTCATATTTTAAATTATAGAGATAATGAATATTTAGCTTCGTTTTTTACAAAAGACAAGAATGTATTTATTGTTTTTGAAAATAATTTATCATTTGCTAAAATAAAAGCTGAGGTTAATAATAATATAATTGAAATTAATTTAAATCCCACCATAATAAAACATAAAGAGGATATTTCAGAATATATTAAAAATGGGGAAAATAATATAAAAATAACTTTGAATAAAGATGATAAAAATTTCAATAAAGTTAATATAAAGACTTTTGTTGAATTTAATTGTGATTAA
PROTEIN sequence
Length: 586
VRKKFLSTLIAIILNLCIFNFANAYNTNKLIRVGISSNDFSKLLYNETNITSNNNFYVIDKEINKKLISLKNDEKLNIKYCNGKYILSSNDKNVETLNSILEIKTQDDKGYLQIVGLKRAGIDVLYDGTIELVANKTQNNKFAIVNVVPLENYLKSVVPNEMPVRFGLEALKAQSVAARNYVLKPREKFYKEFDVCDSTASQVYYGMSSRKPLSNKAVDETKGIVALYKDDLILALYCSTIGGYSESYKNAFSTNKPKVKFPSHDIPYLKAKPDNLNIQKLETEGLATWFYTNKIDSYDIDSPYYRWETVWSYSELDKILRERIRQNINSGFIFPKVDKNFDFGKLKDIKVLERGESGKIISMDIVFDNITFNVKKELIIRKLFIKNNKMLKSANCVFQFTYNKENLGDNNLKNSFYQFEKEEYINNLPLYFDEIKAIGGGFGHGVGLSQFGAANMAKNGHNCAANMAKNGHNYEQILKHYYSNIDLATQPHILNYRDNEYLASFFTKDKNVFIVFENNLSFAKIKAEVNNNIIEINLNPTIIKHKEDISEYIKNGENNIKITLNKDDKNFNKVNIKTFVEFNCD*