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SCNpilot_cont_1000_bf_scaffold_19569_2

Organism: SCNpilot_cont_1000_bf_UNK

megabin RP 53 / 55 MC: 53 BSCG 51 / 51 MC: 51 ASCG 21 / 38 MC: 17
Location: comp(191..1894)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Polymorphic outer membrane protein n=1 Tax=Methanobacterium sp. (strain SWAN-1) RepID=F6D6L7_METSW similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 27.6
  • Coverage: 579.0
  • Bit_score: 175
  • Evalue 1.30e-40
hypothetical protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 27.6
  • Coverage: 579.0
  • Bit_score: 175
  • Evalue 3.90e-41
Polymorphic outer membrane protein {ECO:0000313|EMBL:AEG17730.1}; Flags: Precursor;; TaxID=868131 species="Archaea; Euryarchaeota; Methanobacteria; Methanobacteriales; Methanobacteriaceae; Methanobacterium.;" source="Methanobacterium paludis (strain DSM 25820 / JCM 18151 / SWAN1).;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 27.6
  • Coverage: 579.0
  • Bit_score: 175
  • Evalue 1.80e-40

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Methanobacterium paludis → Methanobacterium → Methanobacteriales → Methanobacteria → Euryarchaeota → Archaea

Sequences

DNA sequence
Length: 1704
ATGTCAACGATTACAGTAAACGACGGAATGGATAATACTTTACGAGAATGTTTAAATAAAGGAAATAAATTAATTTTAAATAATAACATGAAAATTAATATTCACTCTGAATTTTTAATTAAAGATAATGTTGAAATTGACGGTAATGGTTCAACTTTAATTGCTAAAAATTGTAGACATTTTAATATTAAAAAAGGAGCAACTTTAACTTTAAAAAATTTAATTTTAACTAACGGTAAAGAAAATTTTGGTGGTAGTATTTATTCAAATTTACCCACAAATACTATTATTCTTAACAATGTTGAAATTTTAAATAATGAAGCAATGTATGGAGGTGGTATTTTTACTTTAGGTAGTTTAATTGTCGAAAATTCAAGAATAAATAATAATATTGCACAAAAACAAGGTGGTGGTTTATGGTGTGCTAAAAATTTAACTTTATTAAATTCAACAATTAATAATAATAAAGTTGAAAGAATATCTAATAATAATTTTGCTGGAGGTGCTTATGTTGATGATGGTAATGTTGCATTAAATGATAGTCAAATAAATAATAATCTTGTTTCATTTAATGATAACAATGGTGGTTATTGTGGTGGTATTATGATTAATAGTGGTTCATTAACATTGAATAATAGCACTATTAATAATAATAAATCATTTAGTTCTGCTGGTGTTCAAATGGGAACCGGTGATATAAATTTATTTGGAAGCTCAATTTCTGATAATAATTCATATATTACTGGAACAAACTGTGGTGGTGGAGGTATTGTTATTATGAATGGAAATGTTTATGCTGAACGCAGTAAAATTACAAATAATATTACTAAAGGAATGTATTCTGGTTCACTTGTTTCATTTATTGGAAATGTTACAATTTCAGATAGTGAAATATCTGGAAATGTTAATAGAGGTCCAGGTGGTGGTATTGCTTGTAATTTTAATAGTGATGTGTTGATTAAAAATAGTAAAATAATTAATAATACTGGCGCAAGTTTAGGTGGAGGTATTGTTAACTTTTCAGATAAAGATGGAAGTATTTCAGTAAATAATAGTGAAATATCAAATAATATTTTAACAAATTATCAAACTATTGGTGAAACATTAGATGCATTTTTAAGCGTTGTGATGTCTAGTATTAAAGATAATACAAATAATTCTAAATCTGTTCAAAAAATACATCCTGAATCAACTGGAGCCACAAAATTATTAAGTGTTTTATCTAATTTAGAATCGTTAGCTAATAAACATAATTTAACACTTCAAAAAATTTCAAATATACATAACTCAACAGGTGGTGGAGGTATTGCAACATTATTAAGATGTGCAATAAATATTAATAATTCAAAATTAAATGGAAATAATATTACAAAAGATACAACAGGTAGAAAATCATTAGCTTTTGGAGGAGCATTATTTTCAATAAATTCAGTAAGTTCTATAATTAAGACAACAATTATGGATAATTTATCAAATTATGAAGCAGCAGCTATTTATAATAATGATAAATTATCAATAACAAGCACTAAAATTGTTAAAAATAAATCCAAAAAAGGAAAAACAATAATTAATACAAATAATGGAGTAATGTATATAAATAATTCATTATTTGTTAATAATGATGATATTGATATTTATAATGATGGAATATTAACATTATATCAAACGAGAGCTAATGTTGAAGGTAATGTTATTGAATTGTAA
PROTEIN sequence
Length: 568
MSTITVNDGMDNTLRECLNKGNKLILNNNMKINIHSEFLIKDNVEIDGNGSTLIAKNCRHFNIKKGATLTLKNLILTNGKENFGGSIYSNLPTNTIILNNVEILNNEAMYGGGIFTLGSLIVENSRINNNIAQKQGGGLWCAKNLTLLNSTINNNKVERISNNNFAGGAYVDDGNVALNDSQINNNLVSFNDNNGGYCGGIMINSGSLTLNNSTINNNKSFSSAGVQMGTGDINLFGSSISDNNSYITGTNCGGGGIVIMNGNVYAERSKITNNITKGMYSGSLVSFIGNVTISDSEISGNVNRGPGGGIACNFNSDVLIKNSKIINNTGASLGGGIVNFSDKDGSISVNNSEISNNILTNYQTIGETLDAFLSVVMSSIKDNTNNSKSVQKIHPESTGATKLLSVLSNLESLANKHNLTLQKISNIHNSTGGGGIATLLRCAININNSKLNGNNITKDTTGRKSLAFGGALFSINSVSSIIKTTIMDNLSNYEAAAIYNNDKLSITSTKIVKNKSKKGKTIINTNNGVMYINNSLFVNNDDIDIYNDGILTLYQTRANVEGNVIEL*