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SCNpilot_cont_1000_p_scaffold_3966_2

Organism: scnpilot_dereplicated_Eukaryote_unknown_3

partial RP 8 / 55 BSCG 8 / 51 ASCG 5 / 38
Location: comp(1932..5810)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
dna-directed rna polymerase II; K03006 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 [EC:2.7.7.6] similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 28.0
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 342
  • Evalue 5.50e-91
DNA-directed RNA polymerase {ECO:0000256|RuleBase:RU004279}; EC=2.7.7.6 {ECO:0000256|RuleBase:RU004279};; TaxID=5851 species="Eukaryota; Alveolata; Apicomplexa; Aconoidasida; Haemosporida; Plasmodiidae; Plasmodium; Plasmodium (Plasmodium).;" source="Plasmodium knowlesi (strain H).;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 28.0
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 342
  • Evalue 2.50e-90
DNA-directed RNA polymerase n=1 Tax=Plasmodium knowlesi (strain H) RepID=B3L428_PLAKH similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 28.0
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 342
  • Evalue 1.80e-90

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Plasmodium knowlesi → Plasmodium → Haemosporida → Aconoidasida → Apicomplexa → Eukaryota

Sequences

DNA sequence
Length: 3879
ATGGCAAACGTCCAAGATGATTTAATTCGTAAACTTTATCAATCAGGAGGAAAGACAAACTTAACGAAATCGCAAATATCGGCGATAACATTAGGAATACTATCACCGGATGATATTAAAAGAATATCAGTGGCTAATATATCGTCAGAAGAATTAAAACCAGATGCAGATGATGTGAGAGCATTAGAAGGAACGTTGTATGATGCAAGATTGGGAACAATAGATGATAATAAATGTCAAACGTGTCATGGAGATGTATTATCATGTTTAGGACATATAGGATATATAGAAATAAAACCAAATTTAAGATTTATACATCCACATTATATAACATTGGTAGCAAAATTATTGTCATGTTTTTGTTATGGATGTAGAGATGATGATGATAAATTGGAATTATTGATACCGAAAGAAGAAATACAACAATATATGAATTTGAGCTATACAAAAAGATTAAAAGCAATAGAAGTGGGATGTAAAAAGGGATGTAAAGAACATCAAGCAAGAAAATATGAAGTGAAGAGAGACAAGAATAAATCGAATGCATATATACAATATAGTTACAAAAAGACAGCTTCAGTTTTAACATTAGATCAAATAGAAGAATTATTGATGGGTATGAGAGATGAAGATTTAAGTTTATTAGGGATAGAGGGAATACGTCCTGAAAATTTTATTATTAAAGTAATACCAGTATTACCAATAGCTTTTAGACCATATAATGTACAAGAAGGAGTGATAAAACATAATGATATAACACATGTATATAAGGAAATATTAGCTGCAAATAACGCAAATGAAGGCGAAAAACTAAGATTATATTATGCGGGATTGATAGATAATAAACAAGGTAAATGTAAAAGTATACATAGTAATGCTTATGTAACTTTTAAAGCACTTATTGATACAAAAACAGGATTAATGCGTAATGTTATTGGTGGTAAACGTGGTAACTATTGTGGTCGTACTGTAATTTCACCAGATCCAAATATTAATGTATGGGAAGTAGGTATGCCTGAAGAAATGGCTAATACATTGACTACTGAAGAAACTGTAACTCGTTTTAATGTTGATGCTATAAGAAAAATGATTCTAAGTGGTGGTGTAAAAACTGTTATTCATAAAGGTACAAAAATGTTGCTTTCTTTGGTAGATGATCTATCAACAATTGAAATTGTACCGGGTGATAAAGTAAAACGTTTTCTTGTTGATGGTGATCCAGTTCTACTCAATCGTCAACCTGGTCTTCATAAACAAAGTTTGATAGGTCTTATAGTTCGTGTTTTACCTGGTTTAACTTTACGTTTAAATCCTTCTATTTGTACAGGTCTAAATGCAGATTTTGATGGTGATGAAAGTAATATAACTGTTCCTCAATCATATATGGCAAAAGCTGAAGCATTATATGTAATGAATATTAAAAATTGTATGATTAGTGATCAAACTGGTAAGGTTATTACAGGTATTGTCCAAGATCCTGTTTTAGGTAGTTATAGAATTACTGCTGATGATGTTGTTGTTAAATTATCTCTATGGAGTGATTGTATTTATAGAGCAAATAGAGAACATATGGTCCAAAGTCTTCGTTTAAGATGTCAACAATTAAATGTAAATCCTTACTCTGGTAAGTCTTTATTCTCTGTCCTTTTCCCTGAAGATTTTGTATATTCTAGACAAAGTGAAGGTAAAAATGTAAATATTGTAAATGGTATTCTTGTTGAAGGTAGACTTACAAGAGAAGTATTGAGTTCTGGTCATAATAGTATTGTACAAACGTTACATAAACGCTATGGAAATGATACTGCTGCTGAATTTTCCAGCAATCTACAATTCTTAGTTAATTTTTGGTTAGGTGAAACTGGTTTTTCTGTAGGTTATGCTGATTGTCAACTTAATGATAGTAGGGATGCCCTTTCTAATTCAGCTAAAGATGCTAAGTCTTACACTGAAGAAAAAATAAAAGAAATCGTTAAAAATGTTAAGAAAGAAGCTATGTCTCAAAATCAAGATCCATTATTGGCTCTTAAACATGAAGCTGAAATTAATAGAAAACTAAATTCGGCTCGTGATACTATCTCTAAAATTGTTATGGAAACTGGTGATTCTATCTCTTTTGATATACCAACAAATGCTACATCTCTTTATGCAACTCGTAGTAATGGTGTTGAACCTCTTCCTCTAGATATAAAAAATATTACAATGGATTATACTAAAGATAAAGTTGAGTTGGTTCATACTAATAATTCTAAGAGCTCTCTCAGTGTTTTAGGCTTGATTTCTATTACTATTGCTTGTGGTGAAGTAGTCACTGCTTATCATTACATTCAACGAGAAAATCCTTTGGTTAGTATGTTGCAAGCTCAAAGTAAAGGTTCTAAGTTAAATATTTCTCAAATTTCTGGTATTATTGGTCAACAAAATCTTTCTGGCCAACGTATTCCTTTCTCTATTACTAATAACACTCGTGTTACTCCTCATTTTATTGAAAATGATTCTGATCCTCTTGCGCGTGGTTTTTGTTCTAGTTCTTATAATCAAGGTATGTCTCCATTAGAATTCTATATGCATGCTATTGCTTCTCGTGAAGGTTTAACTGATACTGCTGTCAAAACTTCTGAAACTGGATATTTACAACGTCGTTTGGGTAAAGTTATGGAAGGTTTATCGACTCGTACTGATGGATCAGTTCGCAGTGAAACAGGCCAAATTGTTCAATATCAATATGGTGGTCATGGCTTTTCTGCAGATAAAATGATTAATATTGATGGTCTCTCTACTTTTACTAATTTACGTCAACGTATTTCTGAATTTGCTCCTTCAAATCCTTCACAGTACTATGGTCAAGTTTTTTCTTTTAAAGTTTCTCCTAACTCTTCTCTTTTTATTACTCGTAATTCGCGCGATGAAACTCTTCCTAATGATATCACTAAAGTTACTATAGATTATCCTAATTCCACTGTAACTTTATTCCATGACGATAACACTAAATCTAATTTGGATGTTAATGGTCTTAAATCAATCACCCATATTGATAATGGAACTACTAAAATTTATGCTTATGGTGTTCCTTCCAAATTTGCTTATGTTTTCTTCATCACTACTCCTGACGCTATTTCTGGTGTCGCTGTTGCTGCTCGTTCTCTTCGTTTAACTAAAACTCCTCATGATATTGTTCTTATCTCTTCTTTCCCTCTTAATTCTACTCTTCGTCATGCTCTTAAACAACCTAATGATTACAATATTCCTCTTATTGATCGTGTTATTTCTTATGTTGGTTCTAACCTTTCATTTGTTCTTTCTCTTACTGAATATGATAAAATTCTCCTCTGTAGTCCTCGTCTTCTTTTCCTCAAAAATGTTGATTCTCTTTTTAATCTTACTACCCCTGCTGCTACCTTTAGTCGTCCCTCTTATCAACCCTATAATCCATCCGGTATTGTCAATCCTTATATTGACTATCAATCTCATGCTTCTATTATTCCTCACTCTCTTATCGCTGACTCTGTCTCTCAATCTCAGTCCTATTCTCCTCTTCCTTCTCTAGTTCTTCTTTCTCCTGATGAATCTATTGCTGACTCTATTGATCCCTCTTTACCTGGCTTCAAACCTATCCAAGATTATTACATTCTTAATGACTATGATTGGACAAATATCAGCCAAGTTTATCAATATTCTCTCACTGATCCTTCTACCCAAAATTGGTTACTTGACTCCGATTTTTCCAAAAAGACTGTTTTTGCTTGGAGTTTCGCTCTCACTAAAGAACCCGTCTGGAAAATGAATCCCTCTTCTTCACCCGATGTTAATAATTGGTTCCGTTTTATCGAAGATCTTCGTATTAATTATCCTCTTCTTTCCTCTTTCCTTGTCTCTTCTTAA
PROTEIN sequence
Length: 1293
MANVQDDLIRKLYQSGGKTNLTKSQISAITLGILSPDDIKRISVANISSEELKPDADDVRALEGTLYDARLGTIDDNKCQTCHGDVLSCLGHIGYIEIKPNLRFIHPHYITLVAKLLSCFCYGCRDDDDKLELLIPKEEIQQYMNLSYTKRLKAIEVGCKKGCKEHQARKYEVKRDKNKSNAYIQYSYKKTASVLTLDQIEELLMGMRDEDLSLLGIEGIRPENFIIKVIPVLPIAFRPYNVQEGVIKHNDITHVYKEILAANNANEGEKLRLYYAGLIDNKQGKCKSIHSNAYVTFKALIDTKTGLMRNVIGGKRGNYCGRTVISPDPNINVWEVGMPEEMANTLTTEETVTRFNVDAIRKMILSGGVKTVIHKGTKMLLSLVDDLSTIEIVPGDKVKRFLVDGDPVLLNRQPGLHKQSLIGLIVRVLPGLTLRLNPSICTGLNADFDGDESNITVPQSYMAKAEALYVMNIKNCMISDQTGKVITGIVQDPVLGSYRITADDVVVKLSLWSDCIYRANREHMVQSLRLRCQQLNVNPYSGKSLFSVLFPEDFVYSRQSEGKNVNIVNGILVEGRLTREVLSSGHNSIVQTLHKRYGNDTAAEFSSNLQFLVNFWLGETGFSVGYADCQLNDSRDALSNSAKDAKSYTEEKIKEIVKNVKKEAMSQNQDPLLALKHEAEINRKLNSARDTISKIVMETGDSISFDIPTNATSLYATRSNGVEPLPLDIKNITMDYTKDKVELVHTNNSKSSLSVLGLISITIACGEVVTAYHYIQRENPLVSMLQAQSKGSKLNISQISGIIGQQNLSGQRIPFSITNNTRVTPHFIENDSDPLARGFCSSSYNQGMSPLEFYMHAIASREGLTDTAVKTSETGYLQRRLGKVMEGLSTRTDGSVRSETGQIVQYQYGGHGFSADKMINIDGLSTFTNLRQRISEFAPSNPSQYYGQVFSFKVSPNSSLFITRNSRDETLPNDITKVTIDYPNSTVTLFHDDNTKSNLDVNGLKSITHIDNGTTKIYAYGVPSKFAYVFFITTPDAISGVAVAARSLRLTKTPHDIVLISSFPLNSTLRHALKQPNDYNIPLIDRVISYVGSNLSFVLSLTEYDKILLCSPRLLFLKNVDSLFNLTTPAATFSRPSYQPYNPSGIVNPYIDYQSHASIIPHSLIADSVSQSQSYSPLPSLVLLSPDESIADSIDPSLPGFKPIQDYYILNDYDWTNISQVYQYSLTDPSTQNWLLDSDFSKKTVFAWSFALTKEPVWKMNPSSSPDVNNWFRFIEDLRINYPLLSSFLVSS*