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SCNpilot_expt_1000_bf_scaffold_2982_2

Organism: SCNPILOT_EXPT_1000_BF_Sphingobacteriales_41_5

near complete RP 46 / 55 MC: 2 BSCG 42 / 51 MC: 1 ASCG 9 / 38
Location: comp(2092..5376)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
OmpA-related protein n=1 Tax=Niabella soli DSM 19437 RepID=H1NRW7_9SPHI similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 60.2
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1366
  • Evalue 0.0
  • rbh
Cell envelope biogenesis protein OmpA {ECO:0000313|EMBL:AHF16607.1}; TaxID=929713 species="Bacteria; Bacteroidetes; Sphingobacteriia; Sphingobacteriales; Chitinophagaceae; Niabella.;" source="Niabella soli DSM 19437.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 60.2
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1366
  • Evalue 0.0
OmpA-like protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 43.8
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 882
  • Evalue 1.60e-253

Lists

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Notes

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Taxonomy

Niabella soli → Niabella → Sphingobacteriales → Sphingobacteriia → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3285
ATGTTAAAAAGAATTTATCTTTTTGTTGTTACGGTTTTAGCCGTGGCAGCCTTAAATGCGCAGGTAACAACCTCGTCTATCACGGGTACTGTTAAAGGTACTGACGGCGCTCCTTTATCAGGTGCAACTGTTACGGCAACGCATACGCCTTCGGGAACCACGTACGCCGCGGTTTCCCGGGAGAACGGCCTATTTGATTTAAGTGGCCTAAGAATTGGTGGCCCTTATTCCGTAACAATTAGTTACGTGGGTACAGATCCCAAAACTTATAACGACATCAATTTACAATTGGGTGTACCATACGTTTTATCAGCGAGCCTTGCGCAAGGTGCTACAGAATTGGAGAGCGTAATTGTTACAACTACCGGAAGAAGAGGTGCGAGTGTGAAAACAGGGGCTGCAACTACCTTTTCGTCTGTTCAACTACAAACGATGCCTTCAATTTCAAGGTCAATTACAGACTTTACAAGGTTAACTCCTCAGGCAAACGGAACTAGTTTTGCCGGAAGGGATGCCCGTTACAATAACTTTCAGGTTGAAGGTGCCAATTTGAACAATAATTTTGGTTTAAGTAATGATCTTGCGCCGGGCGGTGGTTCTCCAATATCTCTTGATGCGTTCGATCAGTTAACCGTAAATATTGCTCCGTTTGATGTTCGTCAATCCGGTTTTACCGGAGCAGGGGTGAACGCGGTTACGAAAAGTGGTACTAACAAATTTCATGGTTCTGCCTATGGATTTTTAAGAAATCAAAATTCTTATGGATATAAAGTAAATGGGACTCAATTATCTAAAACGCCAAATAACAACACAATAGTGGGCGCTACACTGGGCGGGCCAATTGTGAAAAATAAATTGTTCTTTTTTGTAAACTATGAATATGAAAAGCGGTCAAGACCGGGTATTACCTTTACGCCAAAGGGTTCAAGTTTTACAGGAACTCCTTCTAATACTTCAATCGATAGTTTGAGAAAGGTGTACAATTCCGTAAAAACTAAATATGGATATGATTTCGCGGCTTATGAAAACTTTCCAAATTTTGATGAAAATAATCGCAAGCTCCTGGGAAAGATTGATTGGAATATTAGTAACAGGCACAAGCTTACTTTAAAGTATTCTGACTATAAAGGCGTTGAGGTATCGCCTTTAAATGGCAGCAGCGTTCCACAGAATGGCCCAATTGTAGTTACCGGAGGATCCTTCAACCGTCTTCCTAATAACCGTTTTAGTACCAACTCCATGGCTTTTGCCAGCAGTAATTATGCTACTAACCGATTGGTAAAATCCGGCTCGTTTGAATTAAACAGCAGGTTCTCTTCTTCACTATCGAACCAGTTTATAGCTACATATACTAATTCAAGCGACATTCGTGAACCTTACGGAAATAAAACCTTTTTCCCAACAGTTGACATTTTTAACGGTGCAGGACAAAACTATATTAGTTTAGGTTCCGATCCTTTTACAAGAAATAATCAGTTAGTTAATAATATCCTGAATTTTACCGACAACATTACTTATTACCTTGGTCAACATACTTTAACGGGAGGTATCACATATGAAAGACAAAGAGTCGGAAATATGTTTATGGGGGGAGCTGCCGGCCACTACGCGTTTAATACATTAGATGATTTCATTAACGAAAGGGCGCCTGTGTACTACGGCTACACTTATTCACTGGTTCCCGGCGATCCTGCGCCGTTCTCCGCCAACCTTAAAATGGCTCAATTAGGAATCTATGCGCAGGATGAATACAGCGCAATGAGCAATCTTAAGCTTACACTTGGTTTAAGGGTTGACATGCCTATTTACGGAGAAGCTCCGTTAGCCAATCCAAAAATTAATGAATTACAATTCCCTGATAAGGATGGAAACATGATTCATTATAACACAGGGGCCTGGCCGAAAAACAAACCACTGTTTTCTCCAAGATTGGGTGTAAACTGGGATGTATTTGAAGATAGAAGTTTGATTGTAAGAGGTGGAACAGGTATTTTCACCGGACGTATTCCTTTTGTATTTTTAACAAATATGCCATCAAATAGTGGTATGTATCAAAATGCGATAAGGATTAACTCAGCAGCAACTTTGGCAGCAGCAGGAATTACTAAATTTGACCCTAACCCTGATGCTTATGAAAATTCTTCTGCATTTGTTAAAACTCCCGGTACTACAATTCCCCAAAGTTTTGTTCTAATTGATCCTGATTTTAAATTTCCCCAGGTATGGAGAACGAACATTGGTGCTGAAAAAAGATTTGGAGATGGGTTTACGGCGAGCGTTGATATTATCTACACTAAAGATATCAATGCAGTTATCATGAGAAATCCAAATCTTAAAGCTCCAACGGAAAGATTAACCGGCGCAGATACTCGTTATTATTATCCAACCGGAATTAGCGGCAGCCTGTATTACCCAGCCAATCAGGTAGGAACGCCGATAGTACTTGAAAACATTAAAAAGGGTAACGCTTTTTCATTTACCGCGCAATTGTCTAAAGAGTTCAAAAATGGTTTCTCTGGTATGATTGCATACAATTATTCCGCCGCCAAAGAAGTTAGCCCTAACCCTGGTTCCAGAGCTACATCTGCATGGCAATCTATTTACAACGTGAATGGGCCTAATGACAATGTTTTGGACAACTCTCAATATGCGATACCGCATAGATTAATTTCAAACCTTTCTTATAGAATTGAATACGGTATATTTAATCTGCCATCTACATTCTCATTGTTCTATGAAGGAACCTATCAGGGCGTAATTAGCTATAATGTGAACGGCTCAATTGTGAATGATGGAAATACAGAATTGATGTACGTTTATAAAACAGGAGCAGATGTTCCGTTTATTGCTACTTCAAAATATACTGTGGCTCAACAACAAGCCGCTTATGATCAATTTATTGCAAGCAGTAAATATTTAAGCAAAAACAAAGGCAATTATGTAAACAGGTACGGCGCTGTTTCTTCCTGGTATAATCAAATTGATTTCCGCTATTTACAAGATCTTTTGGTAAGAAGAGATGACAACGACAAAGTAAGCCGCACGTTACAATTCACACTCGACATTTTCAATATTGGCAATATGTTGAATAGCAAATGGAAAAATTGGGGTTATCGCCAGGGAACTTCTTTAACAGACCCACTTCAGGTAAGAGGTTATGCTAATGGAGCCCCTACGTTTAACATGAGAGAGTTTAATGGACAATTAGTAAATGATGCCTTTGCGCCAATTTACTCAACCTTCAGCACCTATTCAATGCAAATGGGTCTGCGCTATACATTCTAG
PROTEIN sequence
Length: 1095
MLKRIYLFVVTVLAVAALNAQVTTSSITGTVKGTDGAPLSGATVTATHTPSGTTYAAVSRENGLFDLSGLRIGGPYSVTISYVGTDPKTYNDINLQLGVPYVLSASLAQGATELESVIVTTTGRRGASVKTGAATTFSSVQLQTMPSISRSITDFTRLTPQANGTSFAGRDARYNNFQVEGANLNNNFGLSNDLAPGGGSPISLDAFDQLTVNIAPFDVRQSGFTGAGVNAVTKSGTNKFHGSAYGFLRNQNSYGYKVNGTQLSKTPNNNTIVGATLGGPIVKNKLFFFVNYEYEKRSRPGITFTPKGSSFTGTPSNTSIDSLRKVYNSVKTKYGYDFAAYENFPNFDENNRKLLGKIDWNISNRHKLTLKYSDYKGVEVSPLNGSSVPQNGPIVVTGGSFNRLPNNRFSTNSMAFASSNYATNRLVKSGSFELNSRFSSSLSNQFIATYTNSSDIREPYGNKTFFPTVDIFNGAGQNYISLGSDPFTRNNQLVNNILNFTDNITYYLGQHTLTGGITYERQRVGNMFMGGAAGHYAFNTLDDFINERAPVYYGYTYSLVPGDPAPFSANLKMAQLGIYAQDEYSAMSNLKLTLGLRVDMPIYGEAPLANPKINELQFPDKDGNMIHYNTGAWPKNKPLFSPRLGVNWDVFEDRSLIVRGGTGIFTGRIPFVFLTNMPSNSGMYQNAIRINSAATLAAAGITKFDPNPDAYENSSAFVKTPGTTIPQSFVLIDPDFKFPQVWRTNIGAEKRFGDGFTASVDIIYTKDINAVIMRNPNLKAPTERLTGADTRYYYPTGISGSLYYPANQVGTPIVLENIKKGNAFSFTAQLSKEFKNGFSGMIAYNYSAAKEVSPNPGSRATSAWQSIYNVNGPNDNVLDNSQYAIPHRLISNLSYRIEYGIFNLPSTFSLFYEGTYQGVISYNVNGSIVNDGNTELMYVYKTGADVPFIATSKYTVAQQQAAYDQFIASSKYLSKNKGNYVNRYGAVSSWYNQIDFRYLQDLLVRRDDNDKVSRTLQFTLDIFNIGNMLNSKWKNWGYRQGTSLTDPLQVRGYANGAPTFNMREFNGQLVNDAFAPIYSTFSTYSMQMGLRYTF*