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SCNpilot_cont_500_bf_scaffold_13310_2

Organism: SCNpilot_P_inoc_Parachlorella_chloroplast_29_6

partial RP 20 / 55 BSCG 17 / 51 ASCG 0 / 38
Location: 801..4952

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
DNA-directed RNA polymerase subunit beta'' {ECO:0000256|HAMAP-Rule:MF_01324}; EC=2.7.7.6 {ECO:0000256|HAMAP-Rule:MF_01324};; PEP {ECO:0000256|HAMAP-Rule:MF_01324}; Plastid-encoded RNA polymerase subunit beta'' {ECO:0000256|HAMAP-Rule:MF_01324}; TaxID=3074 species="Eukaryota; Viridiplantae; Chlorophyta; Trebouxiophyceae; Chlorellales; Chlorellales incertae sedis; Parachlorella.;" source="Parachlorella kessleri (Green alga) (Chlorella kessleri).;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 93.9
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 2587
  • Evalue 0.0
rpoC2; atypical; K03046 DNA-directed RNA polymerase subunit beta' [EC:2.7.7.6] similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 32.2
  • Coverage: 972.0
  • Bit_score: 383
  • Evalue 2.30e-103
  • rbh
DNA-directed RNA polymerase subunit beta'' n=1 Tax=Parachlorella kessleri RepID=C7BEV3_PARKE similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 93.9
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 2587
  • Evalue 0.0
  • rbh

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Parachlorella kessleri → Parachlorella → Chlorellales → Trebouxiophyceae → Chlorophyta → Viridiplantae

Sequences

DNA sequence
Length: 4152
ATGATTTCAACGTGGAATCAAACTAGTGAAGTTCTGAGAAAAACTACCGTACAACAATTTAAAAATAATAATCCAGTAAATCCTGTTTACATGATGGCATTTTCTGGAGCACGAGGAAATATTTCTCAAGTTCGTCAACTTGTTGCTATGCGAGGATTAATGGCAGATCCTCAAGGTGCTATATTAGAATTTCCCATTCAAAGTAATTTTCGTGAAGGCCTTACACTAACCGAATATCTTATTTCATGTTATGGTGCACGAAAAGGTTTAGTGGATACTGCATTAAGAACCGCTACTTCAGGATATTTAACAAGACGTTTAGTGGATGCAGCTCAACATGTTATTGTTTCAACAAAAGATTGTGGTACAACTCAAGGGTTGAGGTTAAAAAATAAAGATTTAGAACAACATTTAGTAGGCCGTGTTTTATCAAAAGATTTAGTATTAAAACAAATTTTTCATTTAAACACAAATCAAATAATTACCCCTACTCTAGCTAAATTAATATCAAAAAACGTTAAAGAAGTTTTTGTAAGATCTCCTTTAACTTGTCAAGCAGAAAATTCAATATGTCAATTATGTTATGGTTGGAATTTAGCACATGGCAATTTAGTTAGCATAGGTGAAGCTGTTGGAGTTATTGCTGCTCAATCTATTGGAGAACCCGGTACCCAATTAACTATGCGTACTTTTCATACAGGGGGTGTTGGAATTTTTTCAGATCAAGCTATGAAATATTTTATAGCTCCTTATGATGGAATAATCGAATATACTGCAGGATTACCAGGTCATTTTGTTAGAACGCCACATGGTAAAATTGTTTATATGTTAAAAAATACTGGTAATACTACTCAGAACATTATTTTAAAACTTAAATCATTTGATACAAAACAACCACAATATTTAATAAAAAAACAAGAATTACCTGCAGGTAGCATATTATTAGTACGACATGGTGAAACTGTTCAAACTGGAAAAGTGTTGGCTCAATCATCACAATTTAAAAAATCTAAACAAAAAATGCCGGAATCTACCTATCCTGTTTTTTCGCCAATTGATGGACAAATTTATTTTGAATCAATGACTATTTTAAAACAAAAACAATTTCCACCAAAAACTAAAAAAACAAAAAAAATACAAAAAAAACAAAATGAAATAGGCCCTTATATTCGAACATTAAAAGGATTAGGTGCTTTTTGGGTTTTTTCCTCTGAAAATCAGCACGAATTTCATATTGCAAAAACTATACTTCGACCTGGAGATTTAGTTTCCATTAATAGTTCATTATTTCAATATGATTTTTACGTAGCTAATAGAAGTAATTTTTATACTATTTTAAAGAAACGTTGTTTAGGTTTAAATCTTGTTTCATTATCACTGCAAAAAATAAATTTTCATAAAGTAGCTTATTCCATGCTATTAAAAAATTATTCAGGGTTTACTACACTTTCCAAAAAGTTTGAAAACAAACTAGGTTCCAAAAACAAAGTTTTTGGAAAAGAAAATCGATCTAATCAAAAAGAATTTTTATTTTTTAATAAAAAAGGACTTCAAAATTTTTTAATTTGGTTTCCAAAAACATCAGTTATACCTACTTCTGGATATTTTTTTAATTTTTTGTTTTATTCTGCAATAAAAAATAATATATCCAGTTTGTCTATATTTTCAAGTAAAGGTCAAAAAATTCTTCAGAATAATTGGTTTAACGGTAGTTTTTTTTATCTTCCAACTAAAATTCAAAAATGGTGTTTTGTACATTCTTTATTTTTACACAGTAAAAATGAAAATAAAAATGAATATAAAAAACCCCGTTTTCTAGTTTGTTTAAAAAATACTGGAATGACTTTTTTTTTAAAAAATCATTTCAAACAATCTTTATTATTACAATACCATCCTACACAGATAGGAATTTCAAGCAAAATTTCGTCACAAAACTTAAAAATAAAATTTTTTATTATTGAAGTTACTCCTAACATTGTCGATAACGGGATTTGCGTCCCTTCCATTAATGTAAAAGAAACTAAAGCACAAAATACTATTGCGTTAGCTACTAGCCTTTCGATTAACCATACTGATTTTTTAAAAACTGCTTTAAATAAAGTTAAATCTTCAATATCAGTTATATATAATACTTCTTCGATATTTTTTCAAGAAAAAAAAGGTTGGATTTATATTCCTTTTTCTAAAACCTCTGTGCTTCCTTTTTCTTTTCCTGTTTTAAAAGAACAGGAACCAACTTTGTTTTTAGAAAAGCAAAAGGGAAAGGAAAAAGAAACAAGAAAAAAAGTAATTAATAAATTTAAAACAAATAAAAAATCATTTATTTTGGAACAAGGAAAAAGATTTGATAATTTATCATTTTTCAATTCCAAAACATCTATTACATATATTCCTACAAATAAAATTGGATTAATTAAATCATTTAAAAACAAAAAGTCAAATAGATATTACCAAAATATTTGGTATTCTAAAGAACATTTTTTAACAAACAATTCTTTTTGTTCTGAAAAAGCAAATTATTCAGAAAAAATTTACCAAAATACTAGTAACTTTAATTTTTCTCAAAATAAAAGAAATTCTATTGAATGTTTTTTATACTATAAACTACAAAATGGAGATTTTAATTTAAATAACAATAAACCAAATATAAATATGAGACCTGTGGTAAGAAAAACTCAACAAGTTAATTCAAATACAACAAAATGTTTTTTCTTTGTTTCTCGAATAAATGAATTTTCTTTACCACAAAAACAACATTTAATTAACCAATGGAATAGTATGAAAAAAATTAATACTATTTGTTTAACAAATTCACCTTTATTTACAAAACAACAATCTACCATTTTTCAAAACAATCCACAACTAAGAAAAAAATTCCAATTGGTACTATCTGTATCTCGAGGTTGGTTTTTGTCCAAAAATATTTTTAAACTATTAATTAATTTAAATGCCCCTTTGTTATTTAAAGGAGTAAATCAAAGTTATTTTTTATCAAATTATGTAAAAAAACATAAACTACCTGTTCTAGGTTTAAATTTATTTTTCTACAATTTTCTCTCATTACCTGAAAATATTTCATTTTATTTTGAAATATTTGAAAATAGTTGGGTGATTCCCAATAATAAAATAACTACAAGTTTTGTTAAAATAACAAAAGATGGCGAATTTCGAAGTTTGAAATCAAAACAAAATACCAGTGTTATATGTATTTTGACAAGAAAAAATCTTGTCACATTAAATTTATTTGATACAAAAAACTTTAATAAAAATAAACAAGTTCAAATAGGTAGTATTCTTCGTTTGGGAACAGAAATTTTTCCTGGTATTGCATCTTCAACTAGTGGTTTTATTTTAAACAAAAATTTCACTCAATTTACCATTCGTTTAGGTATTCCTTTTTTAGCATCTGCTCGTGGAATTATTCATATCTTTCAACATGATTTAATCAAAAAAAATGATCTTTTAGTTACATTAAAATCACGACGTTTACAAACGGAAGATATTGTACAAGGTATTCCAAAAATTGAACAGCTTTTTGAAGCACGAGAGACTCATGGTGGTACGCTTATTCGAAATAGTGTACATAATCGTTTGAAAAAATATTTTATATCATCATTAAAATACAAAAAAGTATCAATTCACAATCTCCATACTAATTTATCAGAAGCTGTAGCTGATAGTTTAAATAAAATCCAGTTTTATTTAGTCCAAAGTATTTTACAAGCTTATTCTTCACAAGGAGTAAAACTTTCTCAAAAACACATTGAGATTATTGTTCGCCAAATGACCACTCGAGTACGTATATTAGCTGGTGGGGATAGTGGTTTATTACCTGGTGAACTTATCCCATTTATAAGAATACAAAAATTAAACAATCAACTTTGTTCTCTAGGTAAACGTCCAGCTATTTATGAACCTATTATTCTTGGAATTACAAAAAGTGTTTTACAATCAGAAAGTTTTCTTTTATCAGCTAGTTTTCAAGAAGTTAGTAGAGTTTTAGTTCGAAGTGCTTTAACTAAAAAAACAGATTTTTTACGAGGATTGCATGAAAATGTAATTTTAGGACAATTGATTCCAACAGGAACAGGATTAGTTTCCTTTTCTACAAACAAAGTTGGTTCCGCTTCGATTTCTTTTTCAAAAACTTAG
PROTEIN sequence
Length: 1384
MISTWNQTSEVLRKTTVQQFKNNNPVNPVYMMAFSGARGNISQVRQLVAMRGLMADPQGAILEFPIQSNFREGLTLTEYLISCYGARKGLVDTALRTATSGYLTRRLVDAAQHVIVSTKDCGTTQGLRLKNKDLEQHLVGRVLSKDLVLKQIFHLNTNQIITPTLAKLISKNVKEVFVRSPLTCQAENSICQLCYGWNLAHGNLVSIGEAVGVIAAQSIGEPGTQLTMRTFHTGGVGIFSDQAMKYFIAPYDGIIEYTAGLPGHFVRTPHGKIVYMLKNTGNTTQNIILKLKSFDTKQPQYLIKKQELPAGSILLVRHGETVQTGKVLAQSSQFKKSKQKMPESTYPVFSPIDGQIYFESMTILKQKQFPPKTKKTKKIQKKQNEIGPYIRTLKGLGAFWVFSSENQHEFHIAKTILRPGDLVSINSSLFQYDFYVANRSNFYTILKKRCLGLNLVSLSLQKINFHKVAYSMLLKNYSGFTTLSKKFENKLGSKNKVFGKENRSNQKEFLFFNKKGLQNFLIWFPKTSVIPTSGYFFNFLFYSAIKNNISSLSIFSSKGQKILQNNWFNGSFFYLPTKIQKWCFVHSLFLHSKNENKNEYKKPRFLVCLKNTGMTFFLKNHFKQSLLLQYHPTQIGISSKISSQNLKIKFFIIEVTPNIVDNGICVPSINVKETKAQNTIALATSLSINHTDFLKTALNKVKSSISVIYNTSSIFFQEKKGWIYIPFSKTSVLPFSFPVLKEQEPTLFLEKQKGKEKETRKKVINKFKTNKKSFILEQGKRFDNLSFFNSKTSITYIPTNKIGLIKSFKNKKSNRYYQNIWYSKEHFLTNNSFCSEKANYSEKIYQNTSNFNFSQNKRNSIECFLYYKLQNGDFNLNNNKPNINMRPVVRKTQQVNSNTTKCFFFVSRINEFSLPQKQHLINQWNSMKKINTICLTNSPLFTKQQSTIFQNNPQLRKKFQLVLSVSRGWFLSKNIFKLLINLNAPLLFKGVNQSYFLSNYVKKHKLPVLGLNLFFYNFLSLPENISFYFEIFENSWVIPNNKITTSFVKITKDGEFRSLKSKQNTSVICILTRKNLVTLNLFDTKNFNKNKQVQIGSILRLGTEIFPGIASSTSGFILNKNFTQFTIRLGIPFLASARGIIHIFQHDLIKKNDLLVTLKSRRLQTEDIVQGIPKIEQLFEARETHGGTLIRNSVHNRLKKYFISSLKYKKVSIHNLHTNLSEAVADSLNKIQFYLVQSILQAYSSQGVKLSQKHIEIIVRQMTTRVRILAGGDSGLLPGELIPFIRIQKLNNQLCSLGKRPAIYEPIILGITKSVLQSESFLLSASFQEVSRVLVRSALTKKTDFLRGLHENVILGQLIPTGTGLVSFSTNKVGSASISFSKT*