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scnpilot_solids1_trim150_scaffold_1359_8

Organism: SCNPILOT_SOLID_1_TRIM150_UNK

megabin RP 53 / 55 MC: 53 BSCG 51 / 51 MC: 51 ASCG 19 / 38 MC: 16
Location: comp(3140..7276)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Ribosomal protein S3 n=1 Tax=Vermamoeba vermiformis RepID=D4PBJ2_VERVE similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 27.9
  • Coverage: 269.0
  • Bit_score: 76
  • Evalue 1.90e-10
Ribosomal protein S3 {ECO:0000313|EMBL:ADD62204.1}; TaxID=5778 species="Eukaryota; Amoebozoa; Tubulinea; Euamoebida; Tubulinida; Hartmannellidae; Vermamoeba.;" source="Vermamoeba vermiformis (Amoeba) (Hartmannella vermiformis).;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 27.9
  • Coverage: 269.0
  • Bit_score: 76
  • Evalue 2.70e-10

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Vermamoeba vermiformis → Vermamoeba → Eukaryota

Sequences

DNA sequence
Length: 4137
ATGGGTCATTTAATAAATCCAATAAGTTTTAGAGTTGGTTTTTTTGGTTATTGATTAGATAATTGGTCTCCTTGACAATATTATGCTTATGCTGAAATGTTACATCACAACTTAATTCTTAGAGATTTGTTAAAGGAATCGTTAGATGGTGAATATTGAAGAAAAACAGCTTTTTTTTATAGCCATTTTACAATACAGCATCTTGAGCAGTCAAGATTTATAATTAGAGTTTATTTTTATGATGGTATGACAGAACAAATTGTACAATGTTTTGCTACTTATTGAGTTAGATGGGTGGCCCGTCATAATAGAGCTTATAAAAAAAGGTTAAAACGTTTTAGTTCAGTTAAAAAGGCTAGATTTAAAGAAGATTTATTATTTTGATGGCGTTACATTGATTATGTATTTGCTAAAAAAGTTACTTGATTTTTGTTTGTTATTTTGAAGCGTAGTTTTGAACGTCGTAATAAAGTTACTAGAAGTTATTTTAAATTTAATAGGCGTGGTCTAAAAAAAAAATTACAGTTTTTCAAACGTTACAGACAAAAATATACTATAGATGAATATTTAAATGTTTTAAAGAAATTAAAATGAAAATTAAAGCTTTTTAATAATTTTAAACGTATGTTTTCCATATACTATAGAATGAACTTTAAGCGTTTATGGTATACATTTTTATTAAAGAACGCTAATTTTGAAGTTTTTAATTTTTTAAGGGTTTTTTTTATGTTGCTTTTTAAATTTATTAGATTTTTTTATTATAAGCGTCGTTTTATTCGTTCAGAGTCTTGAACTCCTTATAGAATCTTTTTAAAATCAAAAAAAAAAAATGATAATTCGCTGTTAAGAAAAATTCAATTATGGCGTAAAGAGTTTTTGATTATGCACCCAAGGACATTTAATACAAAAGAAGCTTTTTTAGCTAATAAGTTTATTTCTAAAAAAAAACGTTTTGAGCGCTTTAAATTAATGACTTTCTTAAAACAATTTAAATGAGTTTGGCGTTATATAAATATATATAAAAATCCAAAATTGTTAAAATTTAAAAGATTTTTTAAATTGGCTTCTTCAAAAGGCAATGGTGGTTTTTTTTATTATCCTGAATTTATTTATAATCTGCCTAATCATTTTGTTTATAACAAAAAAGATTTTAATTTTGGTTTGCGTGCTAAGCTAAAAACGAATAGCAATTTGTATAAAAAATTAACATATAAATTGAAATTAAAAAAATTTTTTAATCATATTAAATCAAAAAATGTGAAATTAAAAACTAAATTGATGTTAAATAGTTTTTATAAAAGATATATTAAATTTTATTTAGTTAAGCGTTCTAGAAAAGTAAAAATGCATGCGTTATATCATTATGATTTTGTAAAAAATGCGGCTAGAAAATCATATGATTATATGCGTGAGGTTTATGTACAGGGTTATAGTTTAATGGTTGAGCGTTGACAGCGATTTGTTTTTACAAAGAAAGCTAAAATTTATAGACGTAGGCATGGTGAGATTGCTTTTAGAAATGATGCTTTGGGTAAAAAATGGTTTAAATATAAAAAAAATTTATTTAATTATAAATTAAAATTGAATTTGAATAAAAAATATAAACATAAAATATCTAATTTTAGTAAAGCTAAAAGAAAAAATTTATTTAAAACTGGTTATAAAACAAATATTAGAAATTTTAAACGTAATCAACAAATAAAAAATGTAAATATGAATAGAAAGTTTAATGATAAAGGTCGTCGTTTTTATAATAAGAATTATATTAGTATATTAAAAAAACAGTCAATTAAAAAATCTAACTCAAATTATAATTATGATTCTAAAAATTATGTTAAAGGTAAGACTTTTGTTGATGAGACTTTACAAAAGATTTTTGAAAACAATATACCTTGAAAATTTAGCAAATATAAATATTTAGGTGTAGCTTTGAATTATATGAAACACATAGATGTTAATGTTAATTTTTTAAAAAACTATTTATATGTGAATAAAAAAATTATACCAAATTTGTGTTTGAACTTTAAAAAGCGTTATAATATTGTAAATAAAAAACATTTAAATAGCTTTTATGTTTATAAAATAAAATCTAATAAAAAAAAAAAAGTTAAGAAAACTTATAAGTTAATCACGATTTTTAGAAAATATTTAAAATTTTTAACTAAGTTTTTTAAAAAAAAAAAATTGATAAAATATAATAAATTGATACCTTTTTTTTTGTTTTGTAGAATTTTTTTAAAACGAAAATGTAAAGCACATAAAATTTTTAATAGATATAACTGTACTTTTTTTTTATTTAAAAAAATTAAAATGAGAAACTTTACTTTAATGAATTCTAATAAAAAAGTAAATGAGATTTATTATCAATGGCATAATTTTTTTTTTAAAAAAAAAAATTCGAAATATTTTAATGCTAGTCAAAAAAAAAAAATATTTGCTTTTTTTTATAATTTAATGCGTATAAATTTTGAGTTATATTTAGTTGGTAAAAAAAATTATGCTTTAGAAAAAAAGATTCATTGGAGAAGTCGTGCACACTACAAATATAAGCGAAAGTATTTTTTAAATAAGTTTCGTTGAAAAGAAAAATTATTGAAGTCTACTTTAGATTTTAATGAAAATTTATTATTTTCAAAAACAAGAAAATCTAGATTTAGTTTAAAAAAAAAAATCCAAAATTTAAAATCTGAATTATTATTTAATTATGCTAAAGCGGAAAATGATACAAAAAATAGAACAAATTTTAATTATAATCTTGTTTATGATAGATTAAATTTTTTTTTTTTCAAAAAGTTTAAAAATTTTTTTTCTCAGAGATCAGATGCTATATTAAATATGAAGAATATTTCAGATAAATTTTTTAATTTATATGGTTTGCATTTTAGTTTTTTTAATAATTTTAGATCTTTAGTTGATAAAAATTTATTTGATAAGCTTTTGAAAAAGCAGTTAAATTATTTTATAAAATTAAAGAAGCAACTATACTTTTTAAAAGATAATTTGGCTAATAGTTATAAGCGAAAATTTTTATTTTGAAAACAAAATAAAGATTTACATTTAAAGCGTTATAAATTATATTTTTATAAAAAGAAAGCTTTATTAAATCTTATAATTTCTAAGCAAATATTTCAAAAAACTTTAAATTCTCAAATGTCAAATAATAGTTTTGTTAGAACTTTAGTGGAAAAAAAATCATTTAAATGAATAACATCACGTCGTTTGAAATTTTTAACAACAAAACCTATTTATTCAACTTTGATTTCATTGGATAATTATGAGCGTAGTGTTATTAAACGTACAGGTGAGGATCCTAATCATGGGTCTGTGGCTGTTTTTCCTTATATAACTTATGATTGAAATTGAGTAAATTTTTGGTATAAAGGGTTAGCTTTACCTTCGTATTCATCTACAACATTTGGTACAGCTTCAGATAATAGCACTTTATTACGTATGTCTTTTTATGCAAAGCGCTTTTTATTTTTACGCAGCTATTGATTATATGGTTTATTTAGTTATTATTTTGTTCAAAGGCGTAGTCAATTTCTTTATCTTTTAGCCAGAGAAAAAAAAGTATTAAAATGTATAGATCCTTTTTATGCTTATTTTTCGTATTTTCGAATTACAGATATTGTATGTAAGCGTATTGTTTTGGGTTTTGTACGTTCGGTAATGATAATGAAAAGATATACTTATGGTTTTATGATTTTTGAAAAATCCTTTATCCATATGTATAAGCATCATGTTTTATATCCATTTATTATAAGATTTTATGGTTTCGATAATGATCTAGTATCTGCTGTTTTTGTTGCACGTTATATTGCAGCCAAATTAGAATATAAATTTAGTGTTTGAGAATTATTTAAACCTATTGGTGTTGAACTTAGAGTTGTAGCGCGTGCTGAAAGGTTGTTATCTGGTTATAAATTACAATTTATAGGTAGATTAAAAAGAAGAGATAGACTACGTTATATTTATAATATGGGTGGTTCTTTACCACTTAGTAAAGAGGATGCTTTTATAGAGCACGGATATTTTACCGGTATTTTAAAAAATGGTAAATGTAGTGTGCGTGTTTGAATTTATCGTCATAAAAGTTTTTCTGATTTTTTTTTTAATTACATATATGTGTTATATTAA
PROTEIN sequence
Length: 1379
MGHLINPISFRVGFFGY*LDNWSP*QYYAYAEMLHHNLILRDLLKESLDGEY*RKTAFFYSHFTIQHLEQSRFIIRVYFYDGMTEQIVQCFATY*VRWVARHNRAYKKRLKRFSSVKKARFKEDLLF*WRYIDYVFAKKVT*FLFVILKRSFERRNKVTRSYFKFNRRGLKKKLQFFKRYRQKYTIDEYLNVLKKLK*KLKLFNNFKRMFSIYYRMNFKRLWYTFLLKNANFEVFNFLRVFFMLLFKFIRFFYYKRRFIRSES*TPYRIFLKSKKKNDNSLLRKIQLWRKEFLIMHPRTFNTKEAFLANKFISKKKRFERFKLMTFLKQFK*VWRYINIYKNPKLLKFKRFFKLASSKGNGGFFYYPEFIYNLPNHFVYNKKDFNFGLRAKLKTNSNLYKKLTYKLKLKKFFNHIKSKNVKLKTKLMLNSFYKRYIKFYLVKRSRKVKMHALYHYDFVKNAARKSYDYMREVYVQGYSLMVER*QRFVFTKKAKIYRRRHGEIAFRNDALGKKWFKYKKNLFNYKLKLNLNKKYKHKISNFSKAKRKNLFKTGYKTNIRNFKRNQQIKNVNMNRKFNDKGRRFYNKNYISILKKQSIKKSNSNYNYDSKNYVKGKTFVDETLQKIFENNIP*KFSKYKYLGVALNYMKHIDVNVNFLKNYLYVNKKIIPNLCLNFKKRYNIVNKKHLNSFYVYKIKSNKKKKVKKTYKLITIFRKYLKFLTKFFKKKKLIKYNKLIPFFLFCRIFLKRKCKAHKIFNRYNCTFFLFKKIKMRNFTLMNSNKKVNEIYYQWHNFFFKKKNSKYFNASQKKKIFAFFYNLMRINFELYLVGKKNYALEKKIHWRSRAHYKYKRKYFLNKFR*KEKLLKSTLDFNENLLFSKTRKSRFSLKKKIQNLKSELLFNYAKAENDTKNRTNFNYNLVYDRLNFFFFKKFKNFFSQRSDAILNMKNISDKFFNLYGLHFSFFNNFRSLVDKNLFDKLLKKQLNYFIKLKKQLYFLKDNLANSYKRKFLF*KQNKDLHLKRYKLYFYKKKALLNLIISKQIFQKTLNSQMSNNSFVRTLVEKKSFK*ITSRRLKFLTTKPIYSTLISLDNYERSVIKRTGEDPNHGSVAVFPYITYD*N*VNFWYKGLALPSYSSTTFGTASDNSTLLRMSFYAKRFLFLRSY*LYGLFSYYFVQRRSQFLYLLAREKKVLKCIDPFYAYFSYFRITDIVCKRIVLGFVRSVMIMKRYTYGFMIFEKSFIHMYKHHVLYPFIIRFYGFDNDLVSAVFVARYIAAKLEYKFSV*ELFKPIGVELRVVARAERLLSGYKLQFIGRLKRRDRLRYIYNMGGSLPLSKEDAFIEHGYFTGILKNGKCSVRV*IYRHKSFSDFFFNYIYVLY*