ggKbase home page
Advanced Search
Search Help

gwc1_scaffold_753_1

Organism: GWC1_OP11_37_12

near complete RP 42 / 55 BSCG 45 / 51 ASCG 8 / 38 MC: 1
Location: 2..5095

Top 3 Functional Annotations

View all annotations
Value Algorithm Source
triple helix repeat-containing collagen KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 44.8
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 679
  • Evalue 2.90e-192
Collagen triple helix repeat similarity UNIREF
DB: UNIREF90
  • Identity: 0.0
  • Coverage: 0.0
  • Bit_score: 684
  • Evalue 5.00e+00

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

GWC1_OP11_37_12 → Roizmanbacteria → Microgenomates → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 5094
ACGGGAGTTACAGGACCAACAGGTGCTACCGGAGTAACCGGTCCTACTGGTAGTACAGGAGTTACTGGTCCTACGGGTGCGACGGGAGTTACAGGACCCACAGGAGCAACAGGAGTCACAGGTCCAACAGGAGCAACTGGGGTTACAGGACCCACAGGAGCGACGGGTGTGACTGGCCCAACTGGGGCAACAGGAGTTACAGGTCCCACGGGTGCAACTGGAGTAACCGGACCGACTGGTGCAACAGGTGTGACGGGGCCAACAGGAGCAACTGGAGTCACAGGACCAACAGGAGCGACGGGTGTAACGGGACCAACAGGAGCAATAGGAGTGACTGGTCCCACAGGAGCGACTGGAGTCACTGGTCCTACCGGTGCGACTGGAGTAACAGGCCCAACCGGAGCAACCGGAGTTACAGGTCCAACTGGGGCAACAGGTGTGACTGGCCCAACTGGGGCAACAGGTGTTACAGGTCCCACAGGAGCAACAGGAGTCACAGGTCCAACAGGTGCAACAGGAGTGACAGGACCAACAGGTGCAACAGGTGTTACAGGTCCTACAGGGGCAACAGGAGTAACTGGACCAACTGGTGATACAGGTGTAACCGGCCCGACTGGTGCTACAGGTGTGACAGGACCAACGGGGGCAACAGGAGTTACAGGTCCTACCGGAAGTACCGGAGTAACCGGGCCTACTGGTAGTACGGGAGTTACTGGTCCTACAGGAGCAACTGGGGTTACAGGTCCAACAGGAGCAACAGGAGTTACAGGTCCTACGGGCGCTACAGGCGTGACTGGCCCAACAGGAGCTACAGGTGTAACAGGTCCTACAGGAGCAACCGGAGTGACAGGTCCTACGGGTGCTATAGGAGTTACTGGTCCTACGGGTGCGACGGGAGTTACAGGACCAACAGGTGCTACCGGAGTAACCGGTCCTACTGGTAGTACAGGAGTTACTGGTCCTACTACAGGGCCAACAGGTGCTACCGGAGTCACAGGACCAACAGGTGCTACCGGAGTGACAGGACCTACCGGTGCTACTGGTGTCACAGGTCCTACCGGAAGTACAGGTGTAACCGGCCCGACTGGAGCAACTGGAGTTACCGGACCTACGGGTGCTACAGGTGTGACTGGTGTAACGGGCGCTACCGGTCCAGCTTCTTTGCAAGCAGCTTATGATGGTGGTAATACTATTACCACTACTGATGCAAGAAATATTTCTATTACTCTGGCAGAATTAGCTACAGATACAACATTTAATATCTATCAAGCTGGTACAGGTGGCGCGGCCGCCTTTAGAGTTGATGATGAAACCGGACTAGGAAGCGATACTACTCCGTTTATTATTGATGAATCTGGAAATGTAGGGATCGGGACGAGTGCGCCGGGATATAAGCTGGAAGTTGCCGGAACAGGCTATGTTAGCGGAGCTTTATCCACCGGCTCAAGCGCCGCTTTTACCTCTTACCTGCAGGTTGGAAGCACTTCCCCTACTACCTATTCCCGATTCGGCGCCAATACCAGCGGCTGGAGTCTTTCCGGAGCTTCTGATGTCCTTATTTCCGGAGATTTGGAAATTGACGCTCTACTCAAAGTCGACGGCGCGGGTGATAATTATTTCGCCGGCAACGTCGGCATCGGAACGACGACACCGGCAGGAAAACTTGATGTTACTGACACTTCCAACACGGCTGCTTCTTTGTCTTTGACAAATAATACTGCTACCACTATTGGAGTCGGAATCGACACTCTTGGAGTTATAGATTTTCAATCAACTTCATTAACAACAGGAAACTTAATGAATTTAGAAGTAAACGCACTAACTAGTGGAAAAGGAATTAACCTTTCTTCCACTTCAACTGGATTGACTACAGGAAGTTTACTAAATGTTACCGCTTCAGGGAATCCAGGAGCAACATGGACGGGAAACCTTGGTTTATTTGAATATACAACAAGCACCGATGCTGATATCGATGGCTCTGCCCTAAAAGTTGGGATAACCGGAGCGGGTGCTGGTGATGGTACTGCTCTTAACGTTACCACTGCTCAAACAGGAACATCTGCCTATGCTCTTCGAGTTAATGATGATGGAACATATACAGACTCTACTCCTTTCGTGGTTGATTATGCCGGCAACGTCGGCATCGGGACGACGGCTCCAAGTAAACCTCTTGATGTCAATGGAGCAATTAAAGCTGGTACTTCTAATGGTTATTATGTTGGAGCGGCTCAGGTTCTCGATGGAGATGGTACAAATACATATTTAAAAGCAGGAGGAGCTATATCGTTTTGGCCATCTAATACCCAAAAAGTAACAATCGATTCTGCTGGTCTCGTCGGGATTGGGACAACAACGCCAATACAAACGTTAGATGTTGTAGGGTCTATCTATTCCACCAAAGAAAACACCTCGAGATATTCATATTTTGGAGATGAATTTACTAGACGTGCAGCTTCAGGAATAATTTCAGATACTTATCCTGATGTTGCCTTAATTGGTGATACTGGAGCATGGGGTTTTGACGAAAATACTGTAGGAAGACTTGATTATCCGGCTGATACTATTAATGGAAAAGTAACTTTAAACTTTGGCACAGGAACGGGTACGGATGGGGTAATGATTTATGTAGCAGATGGCGGAACGGGAGTCAATAATCCAGATCTTCAATGGCAAGCTGCCAATAAACCAATATATATCACCAAGATAAACACAGTAAACGTAAATGTCGGTGCAAACCACTGTTTCTTTGCCGGCATGTCCAGTCAAACTGCAGGTGATGGCGGCGCCGATTGTACCACTGGTGCTTCAAATAATCTCATTGGCTTCCAAAATACAACTACTACCCTCCAGGCGGTTGTTGGAGACACGACCGGTGAAACAACACTTACATGTACGGGAGCTACTATTACGCTTGGCCAAAGTATTTGGTTGAAATTTGAAGTATTTTCGTCCAGTTCCGTGAAATTTTGGTATGACATGAATGTTGATGATGGAGCAGTCAATGAAACCTATTGTGGTGAAATTACTACGAAAATCCCTACAGGAGCCATGGCAGCAAACTTTGATATTGGTTCAAGTGATGCTGCAAATGGCGCAAATTTACAAATGGATTACGTCCGTATTTGGCAAGACGACCAACCAGCATCCACGTCGCTTGCTTTTAGTCCAATTTCTGTACCAATATATGACCCAATTGCACGCTCTGATATCGCCGAGCGGTATATTAGTGATGATCCGGATCACACTGTACCGGGTAATATTGTCAGCGCTGGTGAACGAAATTTTAGTATCAAAAATTCCAATAAACCATATGATCCAGCGATTATTGGTGTTGTTTCTACAAATCCAAGTATGACTATTGGACAAGTATATGATGAAATTTTAAATGATAAAGCTTCTCCTCCGATTGCTTTAACGGGTCGAGTCCCAATTAATATTGATCCAAATTCCACAACAATCAATATTGGTGACTTTATTACTTCGTCGGGAAATAATGGGTTAGGAATGAAAGCTACAAAAGCAGGCCAAATTATTGGTAAGGCTATAGAATCATGGACTCCAGAATCCGGCAAAACTAGTATTCTGGTTTTTATCAACCTCTCATTTTATGACCCTGGTGTCTATTTAACTACGACCGGCGATCTAAAAATTGAGTTAGAAAACGCATCCGGTAGTGCGGATTTTGTCTATGACGGCAACCTGGAAAATCAAATATCAAACATCAAAGATCAAAATTACGTATTAAATTTCAGAAATGAATTAGTTAGTCGAATCGGAGCATTCTCGGAATTGGTCAGCACTAAAATTAAATCAGGATTTATCGAAACGGAAAACGCCATCATTAATAATATTTTGGTCGCTAAAAATATTTTCGTCAAAGAAAAAATCGTCTCCCCTGTTGTTGAAACGGAAAATATAATTGCCACCGGAGAAGCACAAATTAATACAATTGCCACGAACGAAATAAAACCGCAAGATCAGGATTTAATCGTTAATCTTACCAATGAGTCTAATGCGACTCATGAATCAAATGCAAGCAACTCAGGCCAGCTTGCCCGCCTCATCATCAAAGGCCTTGAAGGAAAATCAGCGGTCGTGATAGACGCCGGCGGCAACGCCTCATTCTCCGGTCAAATAATCGCCGATTCTGTCATTGCTTCCTCTTCATCTTTTCTATCATCTAATATCGAGGATCTAACATCTAATACTGCTTCTGTCTCTGGAAAACTAATCGCCGGCGAAATCGAATCCTCAACGATCGAAAATCTATCATCTAGCATCAATGATCAAGGAACTAATATAAATGATATCCAACAGTTATTAGCTGATATTCAAAATCAACCTATCCCCGACCCGACTAATTATCAGAATTTAGATCCTAGTTCGCAGATCCTAGATTCTAGAATTGCAAATTATCTAGCATCTAACATCCAGGATCTATCATCTAACAACCTAACAGTTACCGGTAATTCTAATCTTTACAATGTTTCCGTTTCAGGTTCACTTCTCGTCGGAACAACTTTGATTGACCAAAATTCGATTATATCTCTTTCGTCCGAACTTAGACTTTCTGCCCTATCAACGATCAACCTGCTTGACGGAGCGGTAATGATCGCCAAAGACGGAACAATAACCACAAAGGGCGAATTAATTGCTGAAAAAGGAATCCGGACAGATGAAATTAAATCGCTGACCGACGACGGCCAAGTAACAATTAACAATCTAACAATTAACAATTTAACAATTGAAGATAAATATCTTAATGCCACCGATTCGGCTTCAATCATCGCCGCCCCAGATAATTTTGCCCAAAACGGCCTCTTTGCCCCGGCGATTGAGACGGCGACGGCCAGTGCCGGCCTGGGAATTTTGCCGGAAAATTCCAATGAGATCATTGTTTATAACGATAGCGTTAAAGCAGATTCCTTGATATATTTGACACCAACTTCCACAACTAATTCTATTTCCCAATTAACGATCGGACAAAAACAGGATTGTTCCCAACAGCCGATCGGTTGTAAAAAATATTTCAAAGTCGTTGTTTCAACGCCATCAATTTTGCCAACCAAATTTAATTGGTTGATTGTTAATTAG
PROTEIN sequence
Length: 1698
TGVTGPTGATGVTGPTGSTGVTGPTGATGVTGPTGATGVTGPTGATGVTGPTGATGVTGPTGATGVTGPTGATGVTGPTGATGVTGPTGATGVTGPTGATGVTGPTGAIGVTGPTGATGVTGPTGATGVTGPTGATGVTGPTGATGVTGPTGATGVTGPTGATGVTGPTGATGVTGPTGATGVTGPTGATGVTGPTGDTGVTGPTGATGVTGPTGATGVTGPTGSTGVTGPTGSTGVTGPTGATGVTGPTGATGVTGPTGATGVTGPTGATGVTGPTGATGVTGPTGAIGVTGPTGATGVTGPTGATGVTGPTGSTGVTGPTTGPTGATGVTGPTGATGVTGPTGATGVTGPTGSTGVTGPTGATGVTGPTGATGVTGVTGATGPASLQAAYDGGNTITTTDARNISITLAELATDTTFNIYQAGTGGAAAFRVDDETGLGSDTTPFIIDESGNVGIGTSAPGYKLEVAGTGYVSGALSTGSSAAFTSYLQVGSTSPTTYSRFGANTSGWSLSGASDVLISGDLEIDALLKVDGAGDNYFAGNVGIGTTTPAGKLDVTDTSNTAASLSLTNNTATTIGVGIDTLGVIDFQSTSLTTGNLMNLEVNALTSGKGINLSSTSTGLTTGSLLNVTASGNPGATWTGNLGLFEYTTSTDADIDGSALKVGITGAGAGDGTALNVTTAQTGTSAYALRVNDDGTYTDSTPFVVDYAGNVGIGTTAPSKPLDVNGAIKAGTSNGYYVGAAQVLDGDGTNTYLKAGGAISFWPSNTQKVTIDSAGLVGIGTTTPIQTLDVVGSIYSTKENTSRYSYFGDEFTRRAASGIISDTYPDVALIGDTGAWGFDENTVGRLDYPADTINGKVTLNFGTGTGTDGVMIYVADGGTGVNNPDLQWQAANKPIYITKINTVNVNVGANHCFFAGMSSQTAGDGGADCTTGASNNLIGFQNTTTTLQAVVGDTTGETTLTCTGATITLGQSIWLKFEVFSSSSVKFWYDMNVDDGAVNETYCGEITTKIPTGAMAANFDIGSSDAANGANLQMDYVRIWQDDQPASTSLAFSPISVPIYDPIARSDIAERYISDDPDHTVPGNIVSAGERNFSIKNSNKPYDPAIIGVVSTNPSMTIGQVYDEILNDKASPPIALTGRVPINIDPNSTTINIGDFITSSGNNGLGMKATKAGQIIGKAIESWTPESGKTSILVFINLSFYDPGVYLTTTGDLKIELENASGSADFVYDGNLENQISNIKDQNYVLNFRNELVSRIGAFSELVSTKIKSGFIETENAIINNILVAKNIFVKEKIVSPVVETENIIATGEAQINTIATNEIKPQDQDLIVNLTNESNATHESNASNSGQLARLIIKGLEGKSAVVIDAGGNASFSGQIIADSVIASSSSFLSSNIEDLTSNTASVSGKLIAGEIESSTIENLSSSINDQGTNINDIQQLLADIQNQPIPDPTNYQNLDPSSQILDSRIANYLASNIQDLSSNNLTVTGNSNLYNVSVSGSLLVGTTLIDQNSIISLSSELRLSALSTINLLDGAVMIAKDGTITTKGELIAEKGIRTDEIKSLTDDGQVTINNLTINNLTIEDKYLNATDSASIIAAPDNFAQNGLFAPAIETATASAGLGILPENSNEIIVYNDSVKADSLIYLTPTSTTNSISQLTIGQKQDCSQQPIGCKKYFKVVVSTPSILPTKFNWLIVN*