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gwc2_scaffold_892_4

Organism: GWC2_OD1_34_16_partial

partial RP 33 / 55 MC: 1 BSCG 29 / 51 ASCG 3 / 38
Location: comp(2380..4251)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Type IV secretory pathway VirB4 component-like protein {ECO:0000313|EMBL:KKP59342.1}; TaxID=1619045 species="Bacteria; Parcubacteria.;" source="Parcubacteria (Magasanikbacteria) bacterium GW2011_GWC2_ UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 623.0
  • Bit_score: 1212
  • Evalue 0.0
Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 48.4
  • Coverage: 593.0
  • Bit_score: 596
  • Evalue 1.20e-167
Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein similarity UNIREF
DB: UNIREF90
  • Identity: 0.0
  • Coverage: 0.0
  • Bit_score: 593
  • Evalue 5.00e+00

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

GWC2_OD1_34_16_partial → Magasanikbacteria → Parcubacteria → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 1872
ATGGCTTTTAAACCACTATCTAGTCAAAAACCATTTAAACCTACGGGAGCGGCTGGGCGTGAGGCGGCTGCTTTGGCACAAGGTGCTAATGTCGAGTTAACTACCCTAGAAGAAGAGCGTGTCTATCGCGAAGGTGTAGTTTCGATTCGTGATTTAGTTGCTCCAGCGGCGTTTAATGTCGAATCTAGCTTTTTGCAATTGGGCACAGTATTTTGTCGTACTATTTTTATTACCAGTTATCCGCGTTATATTACAGTGGGTTGGAGTTCGCCAATTATTAATTTGTCCATCAATATGGACATTAGTATGTTTTTTTATCCAGTAAAATCGGCCATTATTTTAAAACAACTAAAAAATAAAGTGGGTGCTTTGGAGGCACAATTATCGGCCGATCGTGATAAAGGTGCCCCTCGCGATCCGCTTCGCGAAACAGCGCTCCGTGATATTGAAGGTTTGCGCGATGATTTAACTCAGGGTACGGAACACTTTTTCCAGTTTGCTTTTTATGTTACGATTTATTCAAAAAATAAAGAACAGTTAGACCAAGTTACAGAAGATGTGGAAAGCATTTTTGGCTCCAAACTTATAAATAGTCGTAAAGTTTTGTATCAGGCCGAACAAGGTTTTAATTCTACTTTACCACTTTGTAACGATGAATTAATGATTTCGTTTAACATGAATTCATCGCCAATTGCTGCGTCTTTTCCGTTTATTTCAGCCGAGTTAACTTCGGATGATGGTATTTTGTATGGTATTAATCGTCATAATAACAGTTTAATTTTGTTTGATCGGTTTTCTCTCATGAATGCAAACATGGTGGTGTTTGCCACTGCTGGTGCTGGTAAAAGTTATTCAATTAAACTAGAAATTTTACGTACCTTAATGATGGGGGTGGATATAATTGTTATCGATCCAGAAATGGAATACAAGCATTTGTGCGATGCTGTGGGTGGTACTTATATTAATATTTCTTTGTCCTCAGAAAGTAAAGTTAATCCGTTTGATTTACCACGGCCAATTGGTCAGGAAATTTCTACCGAAGATGTTATCCGGGGTGCGGTAATTACTACCAAAGGCTTGTTGCGTATTATGCTTGGCGGTTTAACTACCGAACAAGATTCAATTGTTGATCGCGCCTTAATCGAAACTTACGCCAAAAAAGATATTACTCCAGAAGCTGATTTGGCCACAGTTTCTTCGCCTATCATGCAAGATTTGCAAGAAGTGTTAGAAGGTATGGAAGGGGCGGGGGATTTGGTATTAAAATTACAAAAGTTTACCGAAGGTACTTTTAGCGGGTTATTTAATTCGCCCACTAATGTAGATATGAAAAATCAGTTAGTGGTGTTTTCGGTGCGTGATTTGGAAGACGAACTTCGTCCATTAGCAATTTATTCGATTGTTAACTACATTTGGAATGTGGTTCGTTCGGAACGTAAGAAACGTATTTTGGTTATCGACGAAGCATGGTGGTTAATGCAGCATGAAGATTCGGCACGTTTTATCTTTGCTTTGGTTAAACGTTGTCGTAAATATTTTTTGGGTGTTACCACTATTACTCAAGATGTAAACGACTTTTTACGTTCGCAATATGGCCAAGCAATTGTTACCAACTCGGCTTTACAGATGCTCTTGCGTCAATCGCCAGCCGCTGTTGATACGGTGCAAAAGGTATTTATGTTAACGGATAGCGAAAAATATTTATTATTGGAATCTGGTCCGGGTGAAGGTATATTTTTTGCTGGTTTAAAACATGCAGCTATCAAAGTGGTGGCTTCTTATACCGAAGATCAATTAGTAACCACTAATCCACAACAATTGTTAGAGATCGAAAAGGCCAAGAGAGATTTTGAACAACAAACTGGTAAATAA
PROTEIN sequence
Length: 624
MAFKPLSSQKPFKPTGAAGREAAALAQGANVELTTLEEERVYREGVVSIRDLVAPAAFNVESSFLQLGTVFCRTIFITSYPRYITVGWSSPIINLSINMDISMFFYPVKSAIILKQLKNKVGALEAQLSADRDKGAPRDPLRETALRDIEGLRDDLTQGTEHFFQFAFYVTIYSKNKEQLDQVTEDVESIFGSKLINSRKVLYQAEQGFNSTLPLCNDELMISFNMNSSPIAASFPFISAELTSDDGILYGINRHNNSLILFDRFSLMNANMVVFATAGAGKSYSIKLEILRTLMMGVDIIVIDPEMEYKHLCDAVGGTYINISLSSESKVNPFDLPRPIGQEISTEDVIRGAVITTKGLLRIMLGGLTTEQDSIVDRALIETYAKKDITPEADLATVSSPIMQDLQEVLEGMEGAGDLVLKLQKFTEGTFSGLFNSPTNVDMKNQLVVFSVRDLEDELRPLAIYSIVNYIWNVVRSERKKRILVIDEAWWLMQHEDSARFIFALVKRCRKYFLGVTTITQDVNDFLRSQYGQAIVTNSALQMLLRQSPAAVDTVQKVFMLTDSEKYLLLESGPGEGIFFAGLKHAAIKVVASYTEDQLVTTNPQQLLEIEKAKRDFEQQTGK*