ggKbase home page

AR2-0.65_scaffold_1001_3

Organism: AR_2015_2-065_BD1-5_24_8

partial RP 47 / 55 MC: 1 BSCG 35 / 51 MC: 2 ASCG 3 / 38
Location: comp(1494..2951)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Putative retron type reverse transcriptase n=1 Tax=Firmicutes bacterium CAG:822 RepID=R5JD36_9FIRM similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 29.9
  • Coverage: 324.0
  • Bit_score: 160
  • Evalue 3.60e-36
Tax=RIFOXYA2_FULL_WOR_1_51_19_curated similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 35.5
  • Coverage: 321.0
  • Bit_score: 212
  • Evalue 1.90e-51

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

RIFOXYA2_FULL_WOR_1_51_19_curated → WOR-1 → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 1458
ATGATTAATGATGAAAAAAAATTTACTAAAATATTTAATAAAGATTTTTGGAAAGCATTTTTAAAATATTTCCCTTTCTACCAAAATATTAAGGATAAAGAAAAAATAATATCAGATTTATATCAAGATATAGTATTAAGAAATTATTATCCTTCAAATCCAAAAGAGATTTTCTATTGTAATAAATGATGATGAGTTGCAAGAAAAATACCATTATTTGAGCTAAAAGATTATCTATTATACTATTATTGTATTCATAAACTTGAAGATAAAATAGCAATTAATAGAATAAACTGAACATATTGATGATGGCCATTATCATGATGAAAAATTAGAAAAAAAGAACAAGAAGAAAAAAATATAAATATTTGTAATTATTTGTTTGGTGATTTTAATAAGAGAGTTATTTTAATTTTAAATTGATTTAATAGTTTATCATTAAGAGTTTTAGAGTTTAATAACCCTTCTATTCCTTCCGTACCACTTAATCCATTTTGATGGGTAAAAGCATATTGAGATTATAATTCTAGTTTATTATTTAATCTTTTATCTTGAAAATTCACAGAGTTAGTAGAATTTGATATATCAAATTTTTATGATAATGTTAGATTAGATATATTAGAAATGAAAATAAGAGAAATTGCATCAAAAGATAGTTCAGAAGAAATAAGTTTACTTTTCCATTTTTTGAATTATTGGAACAGACAAGATAATTTTTATAATAAACAAACTATTTGACTTCCACAAGATATGTTGTCAGAATGTTCAAGAATACTAGCAAATTTTTATTTACAAGATTATGATAGCTATATATATAATATTTGTAATGAAAATAATATAAAATATTTTAGATATGCAGATGATCAAATATTATTTTGAAATAATAGAGAAAAATTAGAAGAGATAGTGTTTTTATCTTCCAAAAAATTATCTGAAATTTGATTGAATATTAATCAAAAAAAGATTAATTATTATAATGTTAAAGCATATATGAATTATAAGTTATTTGATGTTTTTAACATTTTATCTAGAACTAAAGATTTTGAAGATAAAGAATTAATTTTAAAATATTTAAAAAATATATATAGAATTTTTTATAAGGAGAATAGAAACATGTATGTGAAAAAATGAATACAATTAGTTAAAAATTGATTAAAATGTAAATTTTCAAATATTAGTGATTACCACAGAAAAAAATTCATAAATTTGTTATTAGAAGACAATATTTTTTTTTCTTTAAAAAGCTATAATTTTACTAATGCATATAATAATTTGTTTATAAGTAGTAAAGAAAAGAAAAATTTTATAAATAAATTGTTAGAGTTATCAAAAAAATCAATATATAATGATTTTCATAACGAACTATTATTCTTTTTTGATAAAATAGATTTTAAAGAATGAACAGAACATGTAGAAGAAGATATAAAAAAATTAAAGGAAAATTTATATTGTAATTAA
PROTEIN sequence
Length: 486
MINDEKKFTKIFNKDFWKAFLKYFPFYQNIKDKEKIISDLYQDIVLRNYYPSNPKEIFYCNK***VARKIPLFELKDYLLYYYCIHKLEDKIAINRIN*TY**WPLS**KIRKKEQEEKNINICNYLFGDFNKRVILILN*FNSLSLRVLEFNNPSIPSVPLNPF*WVKAY*DYNSSLLFNLLS*KFTELVEFDISNFYDNVRLDILEMKIREIASKDSSEEISLLFHFLNYWNRQDNFYNKQTI*LPQDMLSECSRILANFYLQDYDSYIYNICNENNIKYFRYADDQILF*NNREKLEEIVFLSSKKLSEI*LNINQKKINYYNVKAYMNYKLFDVFNILSRTKDFEDKELILKYLKNIYRIFYKENRNMYVKK*IQLVKN*LKCKFSNISDYHRKKFINLLLEDNIFFSLKSYNFTNAYNNLFISSKEKKNFINKLLELSKKSIYNDFHNELLFFFDKIDFKE*TEHVEEDIKKLKENLYCN*