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PLM4_32_b1_sep16_scaffold_230_8

Organism: PLM4_32_b1_sep16_Flavobacteriales_Flavobacteriia_35_11

near complete RP 52 / 55 MC: 4 BSCG 51 / 51 ASCG 13 / 38 MC: 1
Location: 9332..12313

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
TonB-linked outer membrane protein, SusC/RagA family Tax=Marinilabilia salmonicolor RepID=UPI000299F4F5 similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 41.5
  • Coverage: 1002.0
  • Bit_score: 787
  • Evalue 1.20e-224
TonB-linked outer membrane protein, SusC/RagA family similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 34.1
  • Coverage: 1015.0
  • Bit_score: 594
  • Evalue 3.30e-167
Tax=GWE2_Bacteroidetes_32_14_curated similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 40.8
  • Coverage: 1014.0
  • Bit_score: 778
  • Evalue 1.00e-221

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

GWE2_Bacteroidetes_32_14_curated → Bacteroidia → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 2982
ATGAAAACAATTTACAAAAAGTTGTTATTTTTAGTACTCCTGCTTCCGTTTTGTGCAATGGCACAAAATAAAGTAGAAGGAACGGTTGTCGATAATGTATCAGGACAGCCTATTCCGGGAGTAAACGTAAAAATAGTAGGAGGTTCTACGGGAGCTTCAACAGGTTTTGATGGTAAATTTCAATTGTCTAATGTAAAACCAACCGATGTGTTAAGCATATCATATATGGGATACAGGACAATAACAGTTGTCGTTGGATCTCAAAGTTCATTAACCATCAAACTTGAAGAAGATTCAAACCAATTAAAAGAAGTTGTGGTGCAAGTAGGTTATGGTTCTACTAAAAAGAAGGACTTAACAGGTGCGGTATCCAAAGTTACAGCAGCAAATTTGAATCAAGGAACTTTAGTTGATCCTATTCAAGGTTTGCAAGGTAAAGCAGCAGGGGTCAGTATTACAAAACAAGGGGGTGATCCGAATAGTGGTTTTGATGTCCGCATTCGTGGTGCCGCTGGTTTTGCTGCCGGAGGTGCTCCTCTATATGTAGTTGATGGAATTAGAGGTGTTGATCCAACGACAATTTCTCCAGACGACATTTCTTCTTATGACATCCTTAAAGATGCAGCATCGACTGCTGTTTATGGTGCTGATGGTGCAAATGGGGTGGTTTTTATTACAACCAAAAAAGGGAAAGTTGGAAAAACTTCTATCGAATTTAACACTTCTGTTGCAACAGATCAAGTAGTTAGTAAGCCAAAATTCATATCTGCAGATGAATACAGAGATTATATAAAATCACATCCAAGTATTGATTTTACAGATAATGGTGGTAATGTGGATTGGCAAGATCAAATTTTCAGAACAGGTTTTTCAAGAGTAAATAGTTTAGCTGTTTCTGGAGGAAGTGAAACAGGGAATTACAGAGCATCTATTTCAAATAGTGATTTTGAGGGAGCAATTAAAAATTCTGGAAAAAACAGAACCGTGGGACGATTAAACTTAACTCAAAAAGCATTTAACGACAAAATGACTATTGATGTGGGGCTTTCTACTACAATAGAAAAAAATGACTATGTAAATTATGGAAGTAATGGTAAAGACCAGGTTATTTATCAAGCTTTCCAGAGGCTACCTACAGATCCGGTTTATGACTCTAATGGAAACTTAGCTGAATATTTTGGTACCCTTAATTATTACAATCCATTACATTCAGTTAATAACATAGAAAACACTAGAGACGCTAAATTTCTTTCAGGCGACTTGGCTATAGCTTATGAACTTGCCAAAGGTTTAACTGCTAAAGTTGCTACCAGCTATTTAAAAAATGACAATGTGACCAACTATTTTGAGCCTTCTTATAGTTATATTGCTCCAGGTGAAACAACACCGGCTTCAATATATACTGGATATGGAAAAAAAACATATACTAATTGGGAACAGGGTTTACTTGAAGCAACTTTAACTTACAAGAAAACATTTGCAGAATCACACAATTTAACATTGCTGGGAGGTTATTCTTTCAGACAAACTAACGCCGATGGTTTTAGTATGCAGGCCAATAATTCTACGTCTAACACTCTAGGCTCAGATAATTTTCTGAATTTTGAAACAATCGTTTTGGGTGATTTAACATCATACAAAAACGAGCGAAAAGACATCGGTATGTTCGCAAGAGCAATATATGATTATAAATCTAAATACTATATCACAGGAATGATTCGTAGAGATGGTTCTTCAATTTTTGGAGAGAATAATCAATGGGGGGTTTTTCCATCGGTACAAGTTGCCTGGAATATGGCTAATGAAGATTTCATTAAAGACAATGTAAGTGCATTGAACTTATTGAAATTCAGAGGAAGTTGGGGTATTTCAGGAAACAGTAATTTACCTGCTGATGCCAAAGACTTAACTGTAAGACCAGAAATTCAATCAGGGCAAGTCGTTTATGGCTATGGTCATAATGCTAATCCAGATTTACAATGGGATCAAAATACGGAGATAAATCTTGGAGTTGATTTTGGTTTGTTCGATAACATCGTATCAGGATCAGTTGAAGTATACAGTAAAAAAATTACTGATATGTTAATTCAAAATACTAATATACCTGAAGGCACGAATTTTTCAAAAAACACATTTCTAAATGGTGGAGAAATGAAAAATTCAGGACTAGAAGCTACTTTGAACGTCAAAGTTGTTGAAAACAACAATTTCAGCTGGAATACTACACTAGTCTATACGCAGAATAAGCAGGAAGTTATTGCATTAGGAACTGACCGTTATGCATATGACTTCATTAATACTGGTTATCTCTCAGGTACGGGTTTGGTAGGTGTTCCAACTCAAAGAATGATGGCAGGAAGTGCATTAGGAACTTTTTACGGATTTGAATATGCTGGGGTAGCTTCTAATGGCAAATGGTTAATCAAAGGAAACGACAATCAGTTACATTATTTAGATGATGTAACAAACTCAGATGATCACCAAAAAGTAATTGGTAGTGCTTTGCCTGATTTTGAAATGGGATGGAGTAATTATCTTAAATACAAAAATTGGGATATGAGCATGTCCTTCAGAGCAGTTGTCGGTAATGACGTTTACAATGCAACAAACCAGGTTTTTGGTAACCCTGATCAAGTAGGAACCAGAAGCGTAAACAATGAGGCTATTCTTTTAAATGATAATGGAATTAAGGGAGTATACAGTTCATTGTCTTATTATCTTGAAGATGCAAGTTTTATAAAATTAGACAACATTAACTTAGGGTACAGCTTTGTAAAACCTTCATTTGCGACGGCAATTGCAAAACTTCGCTTTTATGCTTCTGTGAATAATGTTTTCACCTTGACAAATTACGGCGGTGGTGATCCAGAGGTTAATTTTTCTGGAGGAAAAGACAATAAAGAAATCTATTTTGGAATAGACAATTACAATATCTATCCAAAAACTAGAACATTAACATTTGGTGTAAATATTTCATTTTAA
PROTEIN sequence
Length: 994
MKTIYKKLLFLVLLLPFCAMAQNKVEGTVVDNVSGQPIPGVNVKIVGGSTGASTGFDGKFQLSNVKPTDVLSISYMGYRTITVVVGSQSSLTIKLEEDSNQLKEVVVQVGYGSTKKKDLTGAVSKVTAANLNQGTLVDPIQGLQGKAAGVSITKQGGDPNSGFDVRIRGAAGFAAGGAPLYVVDGIRGVDPTTISPDDISSYDILKDAASTAVYGADGANGVVFITTKKGKVGKTSIEFNTSVATDQVVSKPKFISADEYRDYIKSHPSIDFTDNGGNVDWQDQIFRTGFSRVNSLAVSGGSETGNYRASISNSDFEGAIKNSGKNRTVGRLNLTQKAFNDKMTIDVGLSTTIEKNDYVNYGSNGKDQVIYQAFQRLPTDPVYDSNGNLAEYFGTLNYYNPLHSVNNIENTRDAKFLSGDLAIAYELAKGLTAKVATSYLKNDNVTNYFEPSYSYIAPGETTPASIYTGYGKKTYTNWEQGLLEATLTYKKTFAESHNLTLLGGYSFRQTNADGFSMQANNSTSNTLGSDNFLNFETIVLGDLTSYKNERKDIGMFARAIYDYKSKYYITGMIRRDGSSIFGENNQWGVFPSVQVAWNMANEDFIKDNVSALNLLKFRGSWGISGNSNLPADAKDLTVRPEIQSGQVVYGYGHNANPDLQWDQNTEINLGVDFGLFDNIVSGSVEVYSKKITDMLIQNTNIPEGTNFSKNTFLNGGEMKNSGLEATLNVKVVENNNFSWNTTLVYTQNKQEVIALGTDRYAYDFINTGYLSGTGLVGVPTQRMMAGSALGTFYGFEYAGVASNGKWLIKGNDNQLHYLDDVTNSDDHQKVIGSALPDFEMGWSNYLKYKNWDMSMSFRAVVGNDVYNATNQVFGNPDQVGTRSVNNEAILLNDNGIKGVYSSLSYYLEDASFIKLDNINLGYSFVKPSFATAIAKLRFYASVNNVFTLTNYGGGDPEVNFSGGKDNKEIYFGIDNYNIYPKTRTLTFGVNISF*