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PLM3-1_170_b2_sep16_scaffold_296_12

Organism: PLM6_170_b2_sep16_Ignavibacteria_34_7

near complete RP 51 / 55 MC: 6 BSCG 50 / 51 ASCG 12 / 38
Location: comp(10790..14029)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Putative periplasmic ligand-binding sensor domain protein bin=GWF2_Melioribacter_38_21 species=RAAC39 genus=RAAC39 taxon_order=RAAC39 taxon_class=Ignavibacteria phylum=Ignavibacteriae tax=GWF2_Melioribacter_38_21 organism_group=Ignavibacteria similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 47.9
  • Coverage: 1074.0
  • Bit_score: 1073
  • Evalue 0.0
periplasmic ligand-binding sensor domain-containing protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 47.8
  • Coverage: 1077.0
  • Bit_score: 1023
  • Evalue 2.40e-296
Tax=RBG_16_Ignavibacteria_34_14_curated similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 88.7
  • Coverage: 1079.0
  • Bit_score: 2012
  • Evalue 0.0

Lists

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Notes

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Taxonomy

RBG_16_Ignavibacteria_34_14_curated → Ignavibacteriales → Ignavibacteria → Ignavibacteriae → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3240
ATGTCTTTCCTTATAGCCATCATATTATTAACAAATGCACTTCATGCATCTGAAAGTAAATCAACTGAGGATTATCAATTCCGGCAGTTTACTATTAAAGATGGACTTTCACAGAGCGCTGTTCTTAGTATAATGCAGGACAGACGTGGTTTTATGTGGTTTGGGACAGCTAATGGTCTTAACAGATTCGATGGATATAATTTTATCACTTATGTCAATAATCCATATGATTCAACTTCAATTTCCGATAATGAAATAAGTGCAATCTATGAAGATGCACAAGGTTACATCTGGATTGGAACTATAAAAGGGGTAATAAACAAATTCAACAGACGGACTGAAACTTTTGAATATTTTTATCCCGACAGCAGTTCTGATTTAAATGTAAAGATAAATGATTCTTATACAACTTATCCTATCTCTTTTGTAAGGAACAGCAACAATTCTATTACATCAATAGCAGAAGATAAAAATAGCAACATCTGGATTGGTACTTGGGGAAATGGTCTTTACCGGTTTGATAAAAAAACAAAAGAGTTTGAACACTTTTATTATCAATCAAGCGATCCTAACAGTTTAAGCCATAACAGAATTACAAAAATATTAATAGATAAAAAATCTGCAATATGGATTGGAACTTTCGGTGGCGGTTTAAACAGAGTAATTAAAATTCAGGATAGTAAACGTGCTTCAGATTATTCTTTCAAATTCATTCGTTATAAAGTTAAGAATAACAATTATAGTCTAAGCAATAATGATGTTATTTCAATTTATGAAGACAGCCAGAGTAATATTTGGATAGGTACTTTCAATGGAGGATTAAATAAACTTGATAATTCTCAAAAATTTGTTCCGGTTGAGGAAGCCAGGTTTGTTCAATTCAACTCAGATCAAAGCCAGGTAAAATTACATTACAAAACAATTATGTCCATTGTTGAAAGTAATGAGGGAGATATCTGGCTCGGCACTTTAGGAGATGGGCTTATTAAGTTTAATCCTATTACAAATTCAATTCTGAATTTCAAACATAACCCGCTTGATAATAATACATTGGCAGATAATGATGTTATCGCTATTGAAAAAGATAAATCAGGAATACTATGGATAGGAACATCTTTAGGAAGAGGGATAAGTCAGCTTCAGATTAACAGAAAGAAATTCAATCATATAACTCATAATCCCGGAGAGTCAAACAGCCTTTCAGATAATGTCGTTTGGTCTATCACAGAAGATAAGCATGGTTATATATGGCTTGGAACTTACAGAGGCGGATTGAACAGGTATGATAAAGAGAAAAAAAAGGTTGTCACATATAAACATAATCCAAATGATCCGAACAGCATTCCTGATGATCATGTTCGTTCACTTGCTGTAGATAATCTTAATAACCTTTGGGTTGGTTGTTTTGATGGTGGATTAAGTATGTATAACAGAAAAACAGGCGACTTTGTTGATTTCCATGAATTGGGTCTCAATGATGAAACTCTTGGTTCAGACCAGGTTTTGGATATTCATATTGAAAATGATTCAGTTTTCTGGATAGCTACTTATGGCGGTGGTTTAACAAAATTAATTTTTGGAGAGAAGAACAGAATAAGGTATAAAAGATATGTTCACGATCCGGATAATAATTCAACTATAAGTGATAACCGGCTTTATACAATTTTTGAAAGTAAGCAAGGTATACTCTGGATCGGTACATTTGGTGGAGGTTTAAATAAGTTTGATAAGAGAACCGAAAAGTTTACCAGTTATAAAAATGTTACTAATGATCCTCTAAGCCTAAGTGATAACAGGGTTATTTGTGTTTTTGAAGATAGTGAGGGAATATTATGGATTGGAACCTTTGGGGGAGGACTGAACAAATATAATAAGGAGCTTAACCGGTTTGTCCACTATGGTGAACGAGAAGGATTAACGAGTTATGAGGTTTATGGTATTATAGAAGACAGGCATAAAAATTTATGGATGAGCACTAATAATGGAATATTCAAATACACCAGGGAAGATCAATTATTTACACAATATGATTTGTCAGATGGGGTTCAAAGCCTGGAATTCAGCGGGGGTGCATATTATAAAGCAAGAGATGGTGAAATTTATTTTGGTGGAATAAATGGGGTAAACAGTTTTTATCCTGATAGTATAAATTATGTTTCCTACATACCTAATATTGTTATAAGTTCTTTTAAAGTACTTAATAATGTTTGGCGTGGTGAAAGGAATGAGATAGTTTTATCTCATACAGAAAATTTTTTCTCGTTTGAATTTGCTGCACTTGATTATTCAAACCCTGGAGATTGCCGTTATGCATATATGCTTGAAGGTTTTGATGAGGACTGGCTATACACAGATTCCAAACAGCGGATTGCAATGTACACAAATCTCGCTTCGGGAGACTATATATTCAAAGTCATTGGTTCAAACAGCGATGGGTTATGGAATTATGATGGTGCAAGTATCAAACTAACTATACTTCCTCCCTTCTGGCAAACATGGTGGTTTATTGCCGGAAGCATAGTTTTAGTCTTACTAATAATATACTTGGTTAGTACTGTCAGAATCAGAAATCTTCTTGAAATAGAAAAACTAAAAACAAAACTTGCTGCCGATCTTCACGACAATATTGGTTCCGGATTAACTGAAATATCAATCTTAAGTGAATTAACTTCAAGAGAATTAAATAATGGTTCAGCTAATACTCCTCAGAATTTAAAATCTATCAGTGAAACAGCCAGGAAGTTGGTTGATAATATGAGCGATATAGTTTGGGTTGTTAATCCAAGGAGAGATTCATTACACGATCTTATAATAAGGCTTAAAGATTCTTATAATGAAGTTCTTACTTACCTGGGTATTTCTCTTAAAACTACAAACCTGGATAAACTTGCAAATGTAAAATTGCCAATGGAGTACAGGCAAAATCTCTATTTAATATTTAAAGAAGGAATAAATAATTCACTTAAGCACAGCAGATGCAGCAATATCTTTTTGGAAGTGAACATAAGAAGTGATGTACTGGAAATGATTTTAAAGGATAATGGAACAGGTTTGAATGAAGCCGGTAAAGAAGTCGGTAACGGTTTAAGGAATATGGAAGATAGAGCAAATGCCATTGGAGGGAAATTAAAATGGAGATCTGTTCAAAATACCGGAACCACAGTTACCTTTGTGGGAAAAATAAATGGTGCAAATAAAATAGCTTATTACATTAAAAGATTTTTCAATGTTACAAATTGA
PROTEIN sequence
Length: 1080
MSFLIAIILLTNALHASESKSTEDYQFRQFTIKDGLSQSAVLSIMQDRRGFMWFGTANGLNRFDGYNFITYVNNPYDSTSISDNEISAIYEDAQGYIWIGTIKGVINKFNRRTETFEYFYPDSSSDLNVKINDSYTTYPISFVRNSNNSITSIAEDKNSNIWIGTWGNGLYRFDKKTKEFEHFYYQSSDPNSLSHNRITKILIDKKSAIWIGTFGGGLNRVIKIQDSKRASDYSFKFIRYKVKNNNYSLSNNDVISIYEDSQSNIWIGTFNGGLNKLDNSQKFVPVEEARFVQFNSDQSQVKLHYKTIMSIVESNEGDIWLGTLGDGLIKFNPITNSILNFKHNPLDNNTLADNDVIAIEKDKSGILWIGTSLGRGISQLQINRKKFNHITHNPGESNSLSDNVVWSITEDKHGYIWLGTYRGGLNRYDKEKKKVVTYKHNPNDPNSIPDDHVRSLAVDNLNNLWVGCFDGGLSMYNRKTGDFVDFHELGLNDETLGSDQVLDIHIENDSVFWIATYGGGLTKLIFGEKNRIRYKRYVHDPDNNSTISDNRLYTIFESKQGILWIGTFGGGLNKFDKRTEKFTSYKNVTNDPLSLSDNRVICVFEDSEGILWIGTFGGGLNKYNKELNRFVHYGEREGLTSYEVYGIIEDRHKNLWMSTNNGIFKYTREDQLFTQYDLSDGVQSLEFSGGAYYKARDGEIYFGGINGVNSFYPDSINYVSYIPNIVISSFKVLNNVWRGERNEIVLSHTENFFSFEFAALDYSNPGDCRYAYMLEGFDEDWLYTDSKQRIAMYTNLASGDYIFKVIGSNSDGLWNYDGASIKLTILPPFWQTWWFIAGSIVLVLLIIYLVSTVRIRNLLEIEKLKTKLAADLHDNIGSGLTEISILSELTSRELNNGSANTPQNLKSISETARKLVDNMSDIVWVVNPRRDSLHDLIIRLKDSYNEVLTYLGISLKTTNLDKLANVKLPMEYRQNLYLIFKEGINNSLKHSRCSNIFLEVNIRSDVLEMILKDNGTGLNEAGKEVGNGLRNMEDRANAIGGKLKWRSVQNTGTTVTFVGKINGANKIAYYIKRFFNVTN*