ggKbase home page
Advanced Search
Search Help

gwc1_scaffold_3361_6

Organism: GWC1_Spirochaetes_27_15

near complete RP 51 / 55 BSCG 50 / 51 MC: 1 ASCG 13 / 38 MC: 3
Location: comp(4644..8495)

Top 3 Functional Annotations

View all annotations
Value Algorithm Source
Cell surface protein {ECO:0000313|EMBL:EKF49033.1}; TaxID=1161912 species="Bacteria; Thermotogae; Thermotogales; Fervidobacteriaceae; Thermosipho.;" source="Thermosipho africanus H17ap60334.;" UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 28.7
  • Coverage: 850.0
  • Bit_score: 250
  • Evalue 1.30e-62
PQQ enzyme repeat-containing protein KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 23.2
  • Coverage: 917.0
  • Bit_score: 118
  • Evalue 2.00e-23
Cell surface protein similarity UNIREF
DB: UNIREF90
  • Identity: 0.0
  • Coverage: 0.0
  • Bit_score: 250
  • Evalue 3.00e+00

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Thermosipho africanus → Thermosipho → Thermotogales → Thermotogae → Thermotogae → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3852
ATGAAAAAGATTTTTACTTTCCTTTTCTTTATTTCTTTATTTTTTGTTTTTTTAATAGGTTGTCAACAACCAACAACAGAAACAAAGACTGTAACATCGAGTTCTGGAACATCTGCTGGGACACCAACAAAACCAGAATATCCATATCCAATGGATAAAGCAAAAGATGTACAACCATATCAAATCAAAATGTTGAGATGGTCAACAGTTCAAGATGTTAATGCAAAAGACCTTATTGATTTGATTGGAGCTAATAACATAAGCCTTAAAGATTTACTTGGAAGTGGCTCAACACAAGTTGATATGACAGGCGACCATTATAAAGATGGTATTGTAAAACAATGGACTGAATATTTATCTGCATTAGAATCATTCAATATGAAAGATGATATGTATTTTGATGTTTGTCTTGGCATAGTTGATGCTACAAATGATGAAATGCTATTAACTTATAACCCTCCTGCTGTATATCATATTAAAGCTATTAAAGAAAGCCTTCCAATAGTTGAAGTTGATATTTCGGAAGTTTTAAAAAACTTTTATCAAACATCTGGTACAAGTGTAGGTGGTTTTAACCCTATAACTGGAAATAGTTTTATGCTCGAAAATGATAAAATCTATGTTTGGAAAGTAGTTGTTACAAATGGTAATGGAGTTAAAGTAGAAAGTCCTTTATGGCAATTTAAAACAGCAAAAACAAATGCTCCTGTATTAGTATCAACATATTCTGACTTTATGAATAATCCTAATATTGCTCCACAAAATAACTCTTATGCTGGAAATGTATCACAAGTTAATCTAAAACTTCCACCACAAATTGTTCAAGACCCAGATGGAGATAATATTTATTACGAATTATTCTTTGGACAATTGCCAAATTCTATGAAATCATTGGGAAATGTATTATTTGATGCTAATAATGGTGCTTTCGTAGACGTTACAGCAGATAACAACTATTTTTGGTATGTTGTAGCAAAAGATACAAATGGTGGTCAAATAAAATTACCGACTCTAAACTTTACTACAAAATATCATGCAAATACAGCACCAATTTTTAAAAATCCATTATTATCACCTGTAAATGGAGATCAAACTGCTGATAGAAATGTAAACTTAACTTTTACATGGCAATTAGCATCTGATAATGAATCTAATGCTTTAACTTATGTTTTTTATTATGGCACAGATACAAGCAATTTGATAATGAATACAGTTCCTGCTATTAATATTGACAAAATTGGAACATATACTATTAATGCTAATACGCTAGCATATAATACTACTTATTTATGGAAAGTAGATGTTATTGATAGTTATGGTTTAAGAACAGCAAGTCCTGTTTGGTCTTTTAAAACTAAAGCTAACCAAGCACCAATTTTTACAAATCCATTGATATATCCTGTAAATGGAGATCAAACCGCTGATACTACACCAACATTAAATTGGAGAATAGCAACAGATAATGAAGGTGAAACTTTAAGTTACACATTATATTATGGAAAAGATATAAACAAGTTAACAATGGTTACTGGAGGTTTTACTATTAGTGGAACTCTTGTAAGTTATACTCTACCAGTATTAGACAATTATTCTACATATTTCTGGAAAGTAGAAGTTAAAGATGCTTATGGTTTAATGACTTCAAGTGCTACTTGGTCTTTTAAAACTAAAGTATCAATACCAACAGACCCATCAGTTCCAATTCCCGCTTCTGGCTCAACTGCTATAACAACAAAACAAGTGTTAGAATGGACTGGTTCTACTGATGGAAATAATGTTGTAATTTATGATGTTTATATTGGAACAAATACAACTTTTACAAGCCCAGTAACATCTGATATTACAGTAAAATATTTTAAACCAACATTAGCTGTTAATACAACTTACTATTGGAAAGTCGTTGCTAAAAATAATTTTGGTGGTAAAGCAGAAAGCCCAATATGGAATTTTAGAACAGAAAGTTCTCAGACAAGTTTCTTTACTGATTTTAAATTTGCAACTGGTCAAGATGAAACTAATTATGGTTTCACAAAGACAAATGGGGCATTTGATAATTCACTCGGTTATCCATATCCTTCATTAACATTAACAAACTCAACAGGTAATATCAAAAATACAACTGCAAGCAATTTATTTAGTCAATCAGAAGTTGAATTTGATGTAAGAATTGGTAATGCAGATAATTACGAATTTGATCAACACGCAAATTTGACTACTGTAAGTTGGTATCTCGATAGATTTGTTAATGCTAATAATCTAGCAAATCACATAGCACCAGCTACATGTTCAAGAAATCTTAGATATTCAACAGATTATACAGATAATCTAACAGCAATATCATCAGCTGATAGAACATTCTTATATACTGCAAATACTTATACAGTAGCTTTAGATTCAACTGCAAGTATAAATGACTTATATACTGGTGCAACTATTCAGAATTATAGTGTTGCTATACCTAAGTATATAAAATATGGTACCTCAAATGCTAATGATTTAACAGTATCAGAGTTAGTGAACGATGCAGGAGCAGGAACTACAGGAGCAGAAGATCAGGCTATATTTAATGCTTGTTACGATGATATTCCAACATCAACACAAACATTTAACTGGACAACACCTTCTGCTGGTTCTAAAGATGTAATATATTATTATAGACATTATAAATTAAGAACTGGTTTAACAAACGAACAATTGACAGACCTCTACTATGTGTTGAAAAGAGCATCTGGAACTTACAGTATGACAGCTTATGCTAATGCAAGCCCTTCATCTGGTGCTCAAACAACAGACCCTGCAACAGGTACATTACTAAATTCTGGCGATGTTGTAGAAGGATATATGACTGCTTCTGGTGCTAGCAATTCAAACCCAACGACTGCTGGAACATATACATTCTATCGAATTACAGTAGGAGCTGCTGCTGATGTTTATATATCATTAACAAGTATTCCTGTAGGTACTGATTATGATATGGCTTTATATGACAGTATAGCAAATGTATCATCAAATACAAGAATGGCTTCATCTGTTGTTCCATCAAATGCAGATGATAGAATGGAAGTAAATTTACCTGGTGCAGGAACTTATTACTTAAAAGTATATTCTTACAATGGATTTAGTACAACAGATACATATAGATTGACATATTTTATTAAAGATGTTAACCCATTTGTTTTAACAGAATCTTTTATAACAAATAATAGTGGTTCTACAACTGATGATAGTTTCTTTCAAACATATACACATACCTACTATACATTAAAAGATTTTGATGCTGGTACAAATCCAAATATGACTTATACAGCAGCTCAAAGAAATAGAGCAAGATCAATACTCGAACAAGTTTATTATACTTATTATACAGATGATACAGAGTTAAAAATTAAATTAACTAACTCATTAGCAACAGCAGATACAACTTACATAAAATATTCAAAGGATTTCCCATTTGAAATATTGTTTGATGTTACAATGGATTGTAGTAAAGAACAAATCTACTTATGGGGGTCTTATATAGATGATAATTTCAACCCAAATAATGGTGGCTCAAGAATAAAATATACAAAAACTGCCACAACAAAAAATCTTGGTGACTGGTTTAAAGTTAAACTTACCTCAACAGTAAATAGTACTGGTGGTAGTTACACTGTTTCTATTGATGGTACACCAGTTATAACAAATTTTGTATATGACAAGAGAACAACAACAGGTGGAAGAATCCCATCTAAAGTAGACAATTTTATAATCGAAAATAATATTGCATCTGGTGCAGGATTGTCTCAAATTTGGATTGATAACCTATCATTTAAAATTAATGATTCAGGATGGTTAAAATCGATATTTTTCTAA
PROTEIN sequence
Length: 1284
MKKIFTFLFFISLFFVFLIGCQQPTTETKTVTSSSGTSAGTPTKPEYPYPMDKAKDVQPYQIKMLRWSTVQDVNAKDLIDLIGANNISLKDLLGSGSTQVDMTGDHYKDGIVKQWTEYLSALESFNMKDDMYFDVCLGIVDATNDEMLLTYNPPAVYHIKAIKESLPIVEVDISEVLKNFYQTSGTSVGGFNPITGNSFMLENDKIYVWKVVVTNGNGVKVESPLWQFKTAKTNAPVLVSTYSDFMNNPNIAPQNNSYAGNVSQVNLKLPPQIVQDPDGDNIYYELFFGQLPNSMKSLGNVLFDANNGAFVDVTADNNYFWYVVAKDTNGGQIKLPTLNFTTKYHANTAPIFKNPLLSPVNGDQTADRNVNLTFTWQLASDNESNALTYVFYYGTDTSNLIMNTVPAINIDKIGTYTINANTLAYNTTYLWKVDVIDSYGLRTASPVWSFKTKANQAPIFTNPLIYPVNGDQTADTTPTLNWRIATDNEGETLSYTLYYGKDINKLTMVTGGFTISGTLVSYTLPVLDNYSTYFWKVEVKDAYGLMTSSATWSFKTKVSIPTDPSVPIPASGSTAITTKQVLEWTGSTDGNNVVIYDVYIGTNTTFTSPVTSDITVKYFKPTLAVNTTYYWKVVAKNNFGGKAESPIWNFRTESSQTSFFTDFKFATGQDETNYGFTKTNGAFDNSLGYPYPSLTLTNSTGNIKNTTASNLFSQSEVEFDVRIGNADNYEFDQHANLTTVSWYLDRFVNANNLANHIAPATCSRNLRYSTDYTDNLTAISSADRTFLYTANTYTVALDSTASINDLYTGATIQNYSVAIPKYIKYGTSNANDLTVSELVNDAGAGTTGAEDQAIFNACYDDIPTSTQTFNWTTPSAGSKDVIYYYRHYKLRTGLTNEQLTDLYYVLKRASGTYSMTAYANASPSSGAQTTDPATGTLLNSGDVVEGYMTASGASNSNPTTAGTYTFYRITVGAAADVYISLTSIPVGTDYDMALYDSIANVSSNTRMASSVVPSNADDRMEVNLPGAGTYYLKVYSYNGFSTTDTYRLTYFIKDVNPFVLTESFITNNSGSTTDDSFFQTYTHTYYTLKDFDAGTNPNMTYTAAQRNRARSILEQVYYTYYTDDTELKIKLTNSLATADTTYIKYSKDFPFEILFDVTMDCSKEQIYLWGSYIDDNFNPNNGGSRIKYTKTATTKNLGDWFKVKLTSTVNSTGGSYTVSIDGTPVITNFVYDKRTTTGGRIPSKVDNFIIENNIASGAGLSQIWIDNLSFKINDSGWLKSIFF*