ggKbase home page

rifoxya1_full_scaffold_1714_2

Organism: RIFOXYA1_FULL_Pacearchaeota_34_166

partial RP 34 / 55 MC: 2 BSCG 18 / 51 MC: 1 ASCG 28 / 38 MC: 4
Location: comp(182..2629)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
DNA gyrase subunit A (EC:5.99.1.3) similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 49.3
  • Coverage: 804.0
  • Bit_score: 799
  • Evalue 9.40e-229
DNA gyrase subunit A n=1 Tax=Candidatus Omnitrophus fodinae SCGC AAA011-A17 RepID=UPI0003B468AD similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 51.5
  • Coverage: 804.0
  • Bit_score: 814
  • Evalue 1.30e-232
DNA gyrase subunit A Tax=AR13 UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 72.5
  • Coverage: 815.0
  • Bit_score: 1194
  • Evalue 0.0

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

AR13 → Pacearchaeaota → DPANN → Archaea

Sequences

DNA sequence
Length: 2448
ATGAAAGATACCTGTGAAATGATTCGGGATGATGCGAAGGAGCGAGGAGTAATTAATTCAGAAGTTTCTGTTGAAATGAAGAAGGCTTATCTTGATTATGCGATGAGTGTTATTGTTTCGCGTGCGATTCCGTCGGTGGAAGATGGTATGAAACCTGTTCAGAGAAGAATTTTATATGCAATGAATCAGATGGGTTTGAAACCAAATACTCAGACTAAAAAGTCGGCAAGAATTGTGGGTGAGGTAATGGGTAAGTATCACCCTCACGGTGATTCTTCAATTTATGAAGCGATGGTTAGAATGAGTCAGAGTTTTTCTTTAAGATATCCGTTAGTTTTTGGTCAGGGTAATTTTGGTTCTATCGATGGTGATAGTGCTGCGGCGATGAGGTATACTGAAGCGAAACTTGAAAAAGTAAGTGCAGAATTATTAGAAGATATTGATAAAGAGACTGTTCCTTTTCAAGATAATTATGATGGGTCGGTTAAAGAACCTGCTTTATTTCCCGGTAAACTTCCGGCTTTGCTTTTGAATGGTGCTACGGGAATTGCCGTTGGTATGGCTACGAGTATTCCTCCTCATAATTTGACTGAACTTTGTGATGCGATTATTGCTTATGTTAAAAATACCGATATTACTACTGAACAACTTTGTGAAATTGTGCAAGGTCCGGATTTCCCGACGGGGGGAAGTGCTACGGGGGATATGGTTGATATTTACAAAACTGGAAGAGGAAGAATTGTTATGCGAGGGAAAGTTTTAACTGAAACGTTGAAAAATAAAGAAGCAGTTGTGATTACAGAAATTCCTTATATGTTGAACAAGACTACTTTAATTGAACAGATTGCTAAATTAATTAATGATAAAAAAATTAAGGATGTTTCTGATTTGCGGGACGAGAGTGCGAAGGGGAAAATTCGTATTGTTATTGAATTGAAGAAGGACGCGAATTCGAAGTTTGTGATTAATTCTTTGTATAAATATACAAGGTTGCAGGATTCTTTTAATGTTAATCTTTTGGCGTTGGTCGAGGGACAGCCGAAGGTTTTGGGATTGAAAGATGTGCTTCGAGAATATGTTCGGCATAGAAAGACAATTATTACGAATCGTTCTAAGTTTGAGTTGAAGAGAGCGAAGGCACGTTTGGAGATTGTTGAAGGTTTGTTAATTGCTTTGAAGAGCCTTGATGAAATTATTAAATTAATTAGAAAGGCAGGTTCAAAGACTGAGGCGTTTGATGGGTTGATGAATAATTTTGGTTTGAGTAGGAAACAGGCTGATGCGGTTTTGGAAACTAAGTTGCACCAGTTGACGTCGATGGAAGCGGATAAGTTGAAGAGCGAGCAGAATGATTTAATTCTTACTATTAAAGATCTTGAAAAGATTCTTGGAGATATTCATGAAGTTCTTGGCATTATTACTCGAGAGGTTAAGGAGCTTAAGGTGAAGTATGGTGATAATAGACGGACAAATATTTTGAAGAATATAAAAGAAATTGCAGAAAAAGATTTGGTGCAAAAGAAAGATGTTATTGTTACAATTACAGATAAAGGTTATTGTAAGAGAATGGATATTCAGACTTATCGAGAACAGCGACGAGGTGGAAAGGGGGTTATTGGAAGTGGTTTGGCGACTGGCGATTTTGCGAAGCAATTACTTTCGTGTTCGACTCATGATTATTTGATGTTTTTTACTACGAGGGGAAGAGTGCTTTGGTTGAAGGCTCACGAGATTCCTGCGGCGGAGAGATATAGCAAAGGAAAAGCTTTGGTTAATCTTTTAGGTTTGAAAGAGGAGAATATTACGAGCGTGCTTTCGGTTAAGAATTTTGATGATTTCTTGTTTATGTCGACGAGGGCTGGAATGGTTAAGAAAATTGATTTGAAATATTTCTCTAAACCTCGGGCTGGGGGAGTTAAGGCGATTAATTTGCCGAATGATAATTCTGATTTTTTGATTGGAGTTGAAGTTGTTAAGAAAGGGCAGGAAGTTTCTTTGTCAACAAAGAAAGGTTTGGCGATTCGATTTAACAGCGACGATGTGCGTTCGATGGGTCGTGCGAGTTATGGAGTTACTGGAATTAAATTGAATAAAGGTGACGAGGTTGTGAGCATGGAAGTTTTGAAGACCGAGGCTATTTTTACAATTACAAAGAATGGTTATGGTAAGCGGACTACCGTTACTGATTATCGAAAAACGGCTCGTGCGGGAAAGGGTGTTATTAATTTGAAAGTTTCTGATAAAACTGGCGAGGTTGTGACAACTGTTTCTGTGAATGATAAAGATAGTTTGATTATTACAACTGCGAAGGGAATTGTGATAAGAATGAGTTTGGAAAATATTCGAGTGATGGGAAGAGCGGCTCAAGGTGTGCGAGTTGTTAAGCTTCAAGATGGAGATTCTGTTACAGATGTTGCAAGAGTTATGGAAGATATTGATGTTGAATGA
PROTEIN sequence
Length: 816
MKDTCEMIRDDAKERGVINSEVSVEMKKAYLDYAMSVIVSRAIPSVEDGMKPVQRRILYAMNQMGLKPNTQTKKSARIVGEVMGKYHPHGDSSIYEAMVRMSQSFSLRYPLVFGQGNFGSIDGDSAAAMRYTEAKLEKVSAELLEDIDKETVPFQDNYDGSVKEPALFPGKLPALLLNGATGIAVGMATSIPPHNLTELCDAIIAYVKNTDITTEQLCEIVQGPDFPTGGSATGDMVDIYKTGRGRIVMRGKVLTETLKNKEAVVITEIPYMLNKTTLIEQIAKLINDKKIKDVSDLRDESAKGKIRIVIELKKDANSKFVINSLYKYTRLQDSFNVNLLALVEGQPKVLGLKDVLREYVRHRKTIITNRSKFELKRAKARLEIVEGLLIALKSLDEIIKLIRKAGSKTEAFDGLMNNFGLSRKQADAVLETKLHQLTSMEADKLKSEQNDLILTIKDLEKILGDIHEVLGIITREVKELKVKYGDNRRTNILKNIKEIAEKDLVQKKDVIVTITDKGYCKRMDIQTYREQRRGGKGVIGSGLATGDFAKQLLSCSTHDYLMFFTTRGRVLWLKAHEIPAAERYSKGKALVNLLGLKEENITSVLSVKNFDDFLFMSTRAGMVKKIDLKYFSKPRAGGVKAINLPNDNSDFLIGVEVVKKGQEVSLSTKKGLAIRFNSDDVRSMGRASYGVTGIKLNKGDEVVSMEVLKTEAIFTITKNGYGKRTTVTDYRKTARAGKGVINLKVSDKTGEVVTTVSVNDKDSLIITTAKGIVIRMSLENIRVMGRAAQGVRVVKLQDGDSVTDVARVMEDIDVE*