ggKbase home page

SCN18_25_8_15_R2_B_scaffold_2797_1

Organism: SCN18_25_8_15_R2_B_SCNPILOT_EXPT_1000_BF_Sphingobacteriia_40_10_40_9

near complete RP 52 / 55 MC: 1 BSCG 50 / 51 MC: 2 ASCG 13 / 38
Location: comp(3..5636)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Protein containing RHS Repeat n=1 Tax=Zunongwangia profunda (strain DSM 18752 / CCTCC AB 206139 / SM-A87) RepID=D5BGY8_ZUNPS similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 43.5
  • Coverage: 1906.0
  • Bit_score: 1516
  • Evalue 0.0
hypothetical protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 43.5
  • Coverage: 1906.0
  • Bit_score: 1516
  • Evalue 0.0
Tax=BJP_08E140C01_Flavobacteriales_35_8 similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 45.5
  • Coverage: 1901.0
  • Bit_score: 1640
  • Evalue 0.0

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

SCNPILOT_EXPT_1000_BF_Sphingobacteriia_40_10 → SCNPILOT_EXPT_1000_BF_Sphingobacteriia_40_10 → Sphingobacteriales → Sphingobacteriia → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 5634
ATGAAAAATATATTGCTAACTGCTTTTTTGCTTTTAAGCTCCTCCCTTTTTGCCCAACAGCAGCTAACTTACAAAATTGGTGCAAAAACAACCGGCAAAGAAATTATTAGTAAAGAAACAATGCTACAAACCAGTGACCCGATGGTTATGACAATGCAGAGCACTGGTAATGATGAAATAGCAGAAACCATGGGCGCTTTGAGTGTATCTTCCAGCGGAGCGGCTGTTTATAATATTCCCATTGCACTTCCCCCTGGTATTGGTGGTGTACAACCTGAACTCTCCATCACATATAGTAGCCAGGGAGGAAGCGGACTAGCAGGCTGGGGTTGGAATGTTTCAAGTGTGTCTTCTATTACAAGAATAGGCGCTACCACCTTTCACGACGGGCGGGTAGGAAAAGTAGATTTTACTTCTGGAAGCACGGGAGATCGATTTTCACTGAACGGACAGCGTCTGATGTTGAAAAGCGGTACTTATGGTGCCGATGGTTCGGTATATGAAACAGAACAATTTTCAAACCTGAAAATAACCGCTTATGGTGTTTCATCATTCGGTGCATCATATGGCCCGGCATACTTTCGGGTTGATTACCCGGATGGCTCCTATGCCGTTTTGGGAAACGGATCCAATTCACTATCCCGTACTACATGGGCAGTTACCTACCGGGAGAATGCCAGCGGATTAAGAATAAGTTATTCCTATACTATAGTTGACAATAACCTTGTTGTTACTAAAATAAGTTATGGCAGTGCCGGCGCCGCTACTCCAATTAATGAAGTGCAGTTTATATATGGTACCAGATCCCGAACAGAGCAGTCCTATATTGGCGGGATTTCGTTCATGAATAAAAGCCTGCTTAAGGAGGTTCGTGTATTTGGTAGTGGTAATGTTGGTTACCGGAGTTATATCATTACCCATAATGTATCGTCACTGGGATATGATCGCCTTACTTCCGTTCAGGAAAAAAGCGGGGACGGTACATTATTGCATGCCCCCGTAAGCTTCTCCTACAACAATACTACAAATGCTATAGGCAATACACCTTCGGAATATACCTATATGGAAAATGTAGAGCAGCGCAATGCAAAAATGGTGGCGCTGGATTATAATGGGGATGGGAAAATGGAATCTATTGTATATCCCACTACGGGAACCTATGGGTTTAAAAAATTTTGGTTTTTGAAAGACTTTCAGCAGCAAGGATCATATTCATACCCGATAGAATATACTCCTCCTTCAGCTTTCAAAGCTATCTTTCCTACTGACCTGCTCTACGCTGATGGGAAAAAACAACCCGGTCAGGGTATTACCCTGGTACAGGAAACCGGAACCTCCACTGTAGAGTTCAATGTATATGGAGAGGCGGCCCCCAGTAGCGGGGTACCGATAGGCTCACAATACCAGAGAACATGGACAGCTCCCACCTATACTTACCAATCCGATTGCAGCCACTCCGACACCTACCGGGTTCCCCTGAAATACGTGTCGGGAGATTTTAACGGTGACGGTTTAACCGATATACTCGCTATTACCCTGCCATATAGTAATAGTTCCTGCACGGCGGTTCCGGGCTGTTCTGCTGCGTATCTGACCGCTGATTCCGCTACTGCAGATAATAATTCCCAGGCGGTTCAGTTGAAGGATAGTGTCACTTCAAACAGCAGTTCCGATGCAACCCCAAACGCGCCACCCCCGGTAGATTGCTGTCAATGTACCACAAGTAACGTCAACGTTGCGAACTTCTACATCATCAACCTCGACCGGCGGCTCACCACCGGGTTTACATCTTATGCAGGCTATTTTTCTTCCGGCTACTCCACCGGTGATGTACTTTATACAGAAGATGTGGACGGAGATGGCAGAACAGATATTATCCTGGTGAAGGAGGGAACCATATATGTGTTTGGTATGAACCAGAATAATATGTTCACACAACTATGGACCACTTCCGACAGTCGCATTAAACGCCAGTACCCGATGCTTACAGGAGATTATAACGGAGACGGTAAGTCCGACATTATGATTCCCACTGCCGACAACAGCAGCCTGTTCGCGCTTTTCCTTTCCACCGGTACCGGTTTTGTGAAAACGGAAAATACTTACCCTTTCACTTACCAGCCCAGGCAGGAAGGCGCTACCTCCCGCACATACGACCTGGTAGCCGTGGATGTTGATGGTGACAGCAAAACAGATATAGTGGACTACAGCACGGTAACCTATAATAGCAGCGATAATGGCACACAAACCCTCACACCCTATTACAATACTCCCCCTTCCAATGCAGATGGCAGGCCTGCATTTACAGCAGGCACTTCCGTTACCCGCACCGGCAACCTGAGGCATTTCCCCATTCCTGTATTCCTGCCTTCTGACAAACCCAACGTGAACCTTGAATTTGCAGCGGTAAGCCATAAATGGGTAACTTATTTTCAGTTCAAAAGAGATCAGAGGGAAGAAGCCTTGATGCGTTCAGTTAACCAGAATGGTGTGGTGCAAAGCATTGACTATCGGCCGCTGGAAAACGGCGCCACACACCCCACCGAAGGATTTACGGTGTATGCGCGGGGATTGGATCAGGTGTATCCTTATACAGATATTGTTACCGCCCGCTCCTTCCAGGTGGTTCAGGGTATAACCCGCACCGTAAACGGAACGGTAAGCGATAAGCAATATTTTGCCTATAAGGGTGCCGTGCTGCACCTCCAGGGGCTAAGGTTCCTCGGCTTTGAAGGCGTTGCTCAAACTAACCGCCACACTGCTTACAACAACCGTATATTTTCCGTTGTTTTAAGCAATCCGCAGCTCCGCGGGGCTCCCATACAGCAGCACAGCCTGTTGTACGCTCCCTCTTTTTCAGCGGGTGTATCGGGCTATATATCTAAAACCGTTCATACTTACCAAAGTGAGCTTCTTTCCAATAAAGTATTTAAGCTAAAGAATACGCAGTCGGTAGATCAAAATGCGCTGGAAGGTACTACGGTTACCCGCCAGGCACAATACGACACTTATAACAATGCCACACAGGTAACCACAACCTACTCCGGGGCAGGCACACTAACTGTTAATCTAACGTATGCCAATAGCACCGGCACCCCATATTATATCGGCCGGCCATCCAATGTAACGGTCACGCGTACCCTAAGCAGCCAGGCCGCTTTTGTAACTACCGAACAGTGGGATTATACCACTTCAGGCCTTATAAGCCAGCACCGATGGAAAGGCAATAATATCACCAATTTTAACAAGGAAGATTTTACCTACGACAGTTATGGCAACCTGCTGAGCAAAACCACAACACCTTACGGCAGCGCAGGCAGAACGGTCAGCTTTACATATGACGCCACCAAGCGGTTTATAACCGGCAGTACAGATATTGAAGGGCTGAGTTCCACCGCTGTGTATAATGCTGTTACAGGCAAGCTGCTCAGCCAAACCAATCCTTTCAGCCAAACCGTATCTTTTGCATATGATGCCTGGGGAAGGTTAATAACTACTACAGATATATACGGAAAGCAAACCACGGTTACCTATACAAAAAACAGTACGAATTATAATTACACTATCGCCGGCTCTGCACAAAATGGAGCTGGCACAGAGCAGGAGTTTGACCCTTTTAAAAGATTGATAAGGGAAAGTTATAAAAACGCACTGGGCCAGTGGGTAAATGTAAAAACAGAATATGATGTTATGGGAAGGCTCTGGCGAAAAAGCGAGCCTTATACAGGTACCACCCCATCGCAATGGACTACCACCGAATACGATATATACAGCAGACCCGTTAAGGTTACGCTGCCCACTGGCAAAGTAACCAACATGAGCTACAGCGGGCTGAGCGTAACAATAAACGATGGTGCTAAAACTACCGTTACTACTAAAAACGCAATAGGGTTGGTAACAACACAACAAGACCCTGGCGGCTCTATCAATTATACATATTATAGTAATGGCACAATGAAAACCGCCGATTACGGAGGCAGTGTGCAAACCACAGAGCAAGACGGCTGGGGACAGAGAACAAAATTAATTGATCCTTCTGCGGGCGAATACAGCTACCAATATAATGCTTGGAGCGAGTTAACTAAGGAGGTAAGCCCTAAAGGAAGTACAGAATACCAGTATGATACCAAAGGCAAATTGACACAAAAAAAAGTATTGGGAGATGCCACTACCGGTACCGTGCCTACCAACATGGTTACTGTATATACTTACGATGCCACCACAAAGCTGCCCCTGGGTATCGCGCTAACCAATGCAGATGGCAACAACAGTACAACAACCCTTACTTACGACAGTTACAAGCGTGTGTCACAAACCGTAGAAGAAAATCCGAAGGCCCGCTTTACAAAAGCCGTTACCTATGATGCTTTCGGGCGCACCAGCACCGAAATGCAGGTGGCAGTCAACAAAAGCAACAGTAAAACAACAGCACAAAATCTTACTTATACCTATCAAAACAATGTGCTGAAAAAAATAGTGAGCGCTGAAGCCGGAGCAGTATGGGAACTTTCCGGTCTTAATGCCCGCGGGCAGTTAACCGGCGCAACGCTGGGAAGCAGTGGGCTGCAGCAACAAAAAACATACGACAGCTACGGGCTGCTCTCGGGAACGAAAATATTAAATCAGGCTGGCACAGAGCTGTTTAACCAGGGCTATACATGGAATGCGCAACGGGGGCTGCTTACCGGGCGCAGTACAACGCTTTTTACCAGCGGCGGACAGGCGCTATCAGAAAGCTTTCAGTATGACGGACTTGACAGGCTGACACAATGGAGCAACCCGGTAACAGGTACTGCACTTACGCAGAGTTATGACACCCGCGGGCGTATTGAAAGCAACGGCGCTATCGGCACTTATACCTATGCCAGCACCACTACCTACCGGCAAAAAGATGTTACCCTGAATACGGCAGGGCAGACGTATTACAGCGGGCATGAGGTGCAGCAGGCGGTGTACAACAATTTTAAGCAACCGGTTGAAATTACTGAGCCGGGTAAAGATAAACTCAGCTTTCAATATGGTGCAGGTGGACAAAGGGCGCACATGCAGTGGGGACGTACCTACAGCGGTGGCACCTGGGGCAGCGCCCGGTACCAGCGCCACTACAGTATGGATGGCAGCATGGAAATAACCGAAGACGCGCAAACCACCACCACCACTTTTGCTTTGTATATTGGTGGCGATGCCTACAATGCGCCTGCCGTTTGGCGGTCAGTACAGGGCGGCGGTACTACCAACGAAATGCTGTATCTGCACAGGGATCATTTGGGTAGCATAGTAGCTATTACCACTGGCGCAGGGGTTATAAAAGAAAAGCGGCATTTTGATGCCTGGGGCAACCTTGCTAAATTGCAGGACGGTAGTGGAAATACCTTAAGCTCTTTTACAATACTGGACAGAGGTTATACCAGCCACGAGCATTTAACGGTAGGGCTGGTGCACATGAACGGGCGGTTATACGACCCCGGGCTGCACCGCTTTTTAATGCCGGATAATTTTGTGCAGGACGCCTACAATACACAAAGCTTTAACCGCTATGCTTATGTGCTGAATAACCCGCTTAGCTATACAGACCCAAGCGGGGAGCTGACCGAAGCCCAATGGAACGAGGCTTTGGATATGATGAGTAACATA
PROTEIN sequence
Length: 1878
MKNILLTAFLLLSSSLFAQQQLTYKIGAKTTGKEIISKETMLQTSDPMVMTMQSTGNDEIAETMGALSVSSSGAAVYNIPIALPPGIGGVQPELSITYSSQGGSGLAGWGWNVSSVSSITRIGATTFHDGRVGKVDFTSGSTGDRFSLNGQRLMLKSGTYGADGSVYETEQFSNLKITAYGVSSFGASYGPAYFRVDYPDGSYAVLGNGSNSLSRTTWAVTYRENASGLRISYSYTIVDNNLVVTKISYGSAGAATPINEVQFIYGTRSRTEQSYIGGISFMNKSLLKEVRVFGSGNVGYRSYIITHNVSSLGYDRLTSVQEKSGDGTLLHAPVSFSYNNTTNAIGNTPSEYTYMENVEQRNAKMVALDYNGDGKMESIVYPTTGTYGFKKFWFLKDFQQQGSYSYPIEYTPPSAFKAIFPTDLLYADGKKQPGQGITLVQETGTSTVEFNVYGEAAPSSGVPIGSQYQRTWTAPTYTYQSDCSHSDTYRVPLKYVSGDFNGDGLTDILAITLPYSNSSCTAVPGCSAAYLTADSATADNNSQAVQLKDSVTSNSSSDATPNAPPPVDCCQCTTSNVNVANFYIINLDRRLTTGFTSYAGYFSSGYSTGDVLYTEDVDGDGRTDIILVKEGTIYVFGMNQNNMFTQLWTTSDSRIKRQYPMLTGDYNGDGKSDIMIPTADNSSLFALFLSTGTGFVKTENTYPFTYQPRQEGATSRTYDLVAVDVDGDSKTDIVDYSTVTYNSSDNGTQTLTPYYNTPPSNADGRPAFTAGTSVTRTGNLRHFPIPVFLPSDKPNVNLEFAAVSHKWVTYFQFKRDQREEALMRSVNQNGVVQSIDYRPLENGATHPTEGFTVYARGLDQVYPYTDIVTARSFQVVQGITRTVNGTVSDKQYFAYKGAVLHLQGLRFLGFEGVAQTNRHTAYNNRIFSVVLSNPQLRGAPIQQHSLLYAPSFSAGVSGYISKTVHTYQSELLSNKVFKLKNTQSVDQNALEGTTVTRQAQYDTYNNATQVTTTYSGAGTLTVNLTYANSTGTPYYIGRPSNVTVTRTLSSQAAFVTTEQWDYTTSGLISQHRWKGNNITNFNKEDFTYDSYGNLLSKTTTPYGSAGRTVSFTYDATKRFITGSTDIEGLSSTAVYNAVTGKLLSQTNPFSQTVSFAYDAWGRLITTTDIYGKQTTVTYTKNSTNYNYTIAGSAQNGAGTEQEFDPFKRLIRESYKNALGQWVNVKTEYDVMGRLWRKSEPYTGTTPSQWTTTEYDIYSRPVKVTLPTGKVTNMSYSGLSVTINDGAKTTVTTKNAIGLVTTQQDPGGSINYTYYSNGTMKTADYGGSVQTTEQDGWGQRTKLIDPSAGEYSYQYNAWSELTKEVSPKGSTEYQYDTKGKLTQKKVLGDATTGTVPTNMVTVYTYDATTKLPLGIALTNADGNNSTTTLTYDSYKRVSQTVEENPKARFTKAVTYDAFGRTSTEMQVAVNKSNSKTTAQNLTYTYQNNVLKKIVSAEAGAVWELSGLNARGQLTGATLGSSGLQQQKTYDSYGLLSGTKILNQAGTELFNQGYTWNAQRGLLTGRSTTLFTSGGQALSESFQYDGLDRLTQWSNPVTGTALTQSYDTRGRIESNGAIGTYTYASTTTYRQKDVTLNTAGQTYYSGHEVQQAVYNNFKQPVEITEPGKDKLSFQYGAGGQRAHMQWGRTYSGGTWGSARYQRHYSMDGSMEITEDAQTTTTTFALYIGGDAYNAPAVWRSVQGGGTTNEMLYLHRDHLGSIVAITTGAGVIKEKRHFDAWGNLAKLQDGSGNTLSSFTILDRGYTSHEHLTVGLVHMNGRLYDPGLHRFLMPDNFVQDAYNTQSFNRYAYVLNNPLSYTDPSGELTEAQWNEALDMMSNI