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SCN18_25_8_15_R2_B_scaffold_2133_3

Organism: SCN18_25_8_15_R2_B_SCNPILOT_EXPT_1000_BF_Sphingobacteriia_40_10_40_9

near complete RP 52 / 55 MC: 1 BSCG 50 / 51 MC: 2 ASCG 13 / 38
Location: comp(2911..6288)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
hypothetical protein n=1 Tax=Proteiniphilum acetatigenes RepID=UPI00036E687C similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 49.8
  • Coverage: 998.0
  • Bit_score: 1086
  • Evalue 0.0
Uncharacterized protein {ECO:0000313|EMBL:ETZ19167.1}; TaxID=509635 species="Bacteria; Bacteroidetes; Sphingobacteriia; Sphingobacteriales; Sphingobacteriaceae; Pedobacter.;" source="Pedobacter sp. V48.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 53.4
  • Coverage: 1099.0
  • Bit_score: 1205
  • Evalue 0.0
TonB-dependent receptor plug similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 48.3
  • Coverage: 1097.0
  • Bit_score: 1054
  • Evalue 0.0

Lists

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Notes

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Taxonomy

SCNPILOT_EXPT_1000_BF_Sphingobacteriia_40_10 → SCNPILOT_EXPT_1000_BF_Sphingobacteriia_40_10 → Sphingobacteriales → Sphingobacteriia → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3378
ATGATTGCTTTAAGAAGGAGACTGCCGCTCCAATTATTGATGTGTGGCATTTTATATGGTACTCATCTTGAATCAAAATCGCAGGTAAGTTATGTATCACCAAGCAGGGTAACTACCAGCGGCAACATTCAGAACAAATCTGATCTTATAACGTTTAAAGAGATGGTCGATCATCTCTACGCTCAAAAAAAATGGAAATTTGTATGGGATGAAAATGCTACAAAAAACATCCGCATTCCTGCCGCTGTTATGCAATTAAAAGATGAAGAAATTATACAGCGTCTGGATGATATTCTTAGAGCCGGTGGTTTGCAAATAAATAAGGTTACAGTCACCCAGTATGCAATTGTGCCTTTTAAAAACAAGGCTAAACCTAAAAGCCATCCTGTTTTGATGCAGGAAGAAATAAAAATTACTGGAACGATAAGAGATGCATTGGGTAGCCCACTTCATGGCGTATCTGTATTGATTGTGGGCACAAACAGGGCTACAACTACTAATGAAAAAGGTGAGTTTGAAATTATAGCTAACAAAGGAGAAGTAATGGAATTAAGTTTTGTAGGGTATATAACACAAACCATTACTATAAAAGACAGGATTGAATTTGATATAGCAATGGAGCCTGCTACCGGTGGTTTAAACGAGGTTGTAGTAGTGGGGTATGGAAAACAAAAGAAAATCAGCCAGATCGGCGCCCAGTCTACCGTTAAGGTTGATGAATTAAAACAGCCCGTTGCTAACCTCTCTAATGTATTGGCTGGACGTCTTGCTGGCCTTGTTGGCGTACAGCGCAGCGGCGAGCCGGGCTATGATAATGCGAGTATATGGATAAGGGGTATTTCAACTTTCACCAACAGTAACCCGTTAGTATTGGTAGATGGTGTAGAAAGAAGTTTCAATAATATTGATCCGGAGGATATAGAAAGCTTTAGTATTTTAAAAGATGCTTCTGCCACAGCCGTATATGGTGTAAGAGGTGCGAACGGCGTAATACTTATCCAGACAAAAAAAGGAAAAACTGGTAAGCCTAAAGTTAACTTGCAGTATAACCAGGGTTTTACAGCCTTTACAAAAATGCCCAGCTTTGTTGATGGCCCAACGTATATGGAGCTTGCAAACGAAGCATACAAAAGCAGCAATCCTGCAAGTACTACACCATTGTATTCGGAAGAACGTATTCAGGCTACTAAAGATGGCTCAGATCCGGATCTTTATCCCAATACAAACTGGATGAAGGAAATGTTTAATAAGACCGGAGAAAACAGGAGGGCAAATGCCAATATAACAGGAGGCTCAGAAAATGCAAAATATTATCTTTCTGTTGGTTATTATGATGAAAAAGGATTGTTTAAAGTTGATGAACTGGCCAAATACAACTCATCTATCCGGTATAAGCGTTTCAATTTTACTTCCAATCTTAATCTCAATATTACCAATACCACAAAGCTTGATTTCGGAGCATCTGGTTATATTGCTTCGGGTAATTATCCGGGCACAGGAACCGGCAGCATTTGGGATAATATTTTTTTGATGACACCTGTTGCGATGCCGCCACAGTACTCTAATGGTTATGCGCCTGTTGCCCGTAGCGGGCTTACAAGTCCTTACGTATTGCTCACACAAACAGGTTATGCAACTGAGTATAGAAATCAGCTCTGGTCAAATATACGGCTTACCCAAAGCCTTGATTTCTGGCTGAAGGGGCTTTCTGCTACAGCAATGTATTCTTTTGACGCATTTAACCAACATAATATCGGGCGTAGAAAAACGGTTGATGGATATGCCGTGCTTGGCAGAGACAGTAATGGAGAACTGCAGTTTGAGCAAACACGTGTAGGAACCAATTATCTTGATTTCAGTAAAGGTTTTGATGGCGACAGGCAGTTCTATACAGAAGCTTCTATTAATTATGTGAACAGTTTTGGGAAACATGATGTAAGCGGAATGATATTGTATAATCAGACAGATTTTGTAAATGCCCGTGCCAGTGATTTCATCAGTTCCATACCATTCCGCAACCAGGGTATTGCCGGAAGAGCAACTTATGGTTTTGATACAAGGTATTTGCTGGAAGCTAATTTTGGTTTTAATGGTGCGGAAAATTTTGCACCTGATAAGCGTTATGGCTTTTTCCCTTCATTTGGATTGGGATGGGTGGTCAGCAATGAAAAATTCTTTGCTGATATCAGCAAGGTTATCACCTTCTTAAAGGTGAGAGGATCTTATGGTAAAGTGGGTAATAATAAAATAAGCGACTCTTACCGTTTTGGCTATATAGCCCAGGTAGGTGGAGGTAACGACGGTTATTCTTTTGGACGCAACAACGAGGTATGGTATAATGGAAGGGATATATCTGAGTATGCGGTAGATGTTAGCTGGGAAGAGGCAGCAAAAACTAATATTGGGCTTGAATTGAAAACGCTGAATAACGATCTATCCATTGTAGTAGATTATTTCCAGGAAGACAGAACAGGAATCTTTTTGCGCCGGTCAAACGTGCCATTGTATGTAGGCTTGCGTAGTAATCCTTATGGTAATCTCGGCGTAATACATAACAGGGGAGTTGATGGTACAGTTGAATACTCCACTTCATTAGGTAAGAACTGGGTGATAAGCGCACGAACTAATTTTACCTGGAACCGTGCAGTTATTATTGATGATGCTAATGCAGCCTGGCCTTACCCCTGGCAGCAAAGGATCGGAAGAAAACTGAATCAGCGTTTTGGATTAATTGCCCTGGGTTTATTTGAAGATGAAAAGGATATTGAAAACAGCCCTTATCAAACAGGTATTGTTAAGCCGGGCGATATTAAGTTTAAAGACCTGAACGGAGACGGTAAAATTGATTCTTATGATGAAGCGCCTATAGGATATGGTGCGGTACCTGAATTAGTATATGGCGCCGGCTTTAATATTAGTTGGAAAGGTTTTGCCTTTGGAGCCTTTTTTAAGGGAGTGGGAAATGTAGATGTACGTTTAAATGGAGAAGGTTTTCAACCATTTCAATTAGCCGGCGACAGGGGAAATTTATTACAGGAAGTTACCAACCGGTGGACGCCTGATAATCCGAGTCAAAACGTTATTTATCCCCGCCTCACATATCCTTCTAACGAAAACATGAATTATAATAACAGTTCATGGTGGATAAAAAACGGATCGTTTATCAGGCTGCAAACATTGGAAGCAAGCTATAGTCTGCCTAAAGCTAAGTGGTTTGATAAAGGAGGTTTGTCTGGGTTAAGAATTTATTTTATAGGATATAATGTAGCCACCTTCAGCAAATTTAAAATGTGGGATGTTGAGCTGGGAGATGGAAAGGGCGCTCAGTATCCTCTCCTGAAATCTTTCAACCTTGGTGTTGAATTAAGATTTAAATAA
PROTEIN sequence
Length: 1126
MIALRRRLPLQLLMCGILYGTHLESKSQVSYVSPSRVTTSGNIQNKSDLITFKEMVDHLYAQKKWKFVWDENATKNIRIPAAVMQLKDEEIIQRLDDILRAGGLQINKVTVTQYAIVPFKNKAKPKSHPVLMQEEIKITGTIRDALGSPLHGVSVLIVGTNRATTTNEKGEFEIIANKGEVMELSFVGYITQTITIKDRIEFDIAMEPATGGLNEVVVVGYGKQKKISQIGAQSTVKVDELKQPVANLSNVLAGRLAGLVGVQRSGEPGYDNASIWIRGISTFTNSNPLVLVDGVERSFNNIDPEDIESFSILKDASATAVYGVRGANGVILIQTKKGKTGKPKVNLQYNQGFTAFTKMPSFVDGPTYMELANEAYKSSNPASTTPLYSEERIQATKDGSDPDLYPNTNWMKEMFNKTGENRRANANITGGSENAKYYLSVGYYDEKGLFKVDELAKYNSSIRYKRFNFTSNLNLNITNTTKLDFGASGYIASGNYPGTGTGSIWDNIFLMTPVAMPPQYSNGYAPVARSGLTSPYVLLTQTGYATEYRNQLWSNIRLTQSLDFWLKGLSATAMYSFDAFNQHNIGRRKTVDGYAVLGRDSNGELQFEQTRVGTNYLDFSKGFDGDRQFYTEASINYVNSFGKHDVSGMILYNQTDFVNARASDFISSIPFRNQGIAGRATYGFDTRYLLEANFGFNGAENFAPDKRYGFFPSFGLGWVVSNEKFFADISKVITFLKVRGSYGKVGNNKISDSYRFGYIAQVGGGNDGYSFGRNNEVWYNGRDISEYAVDVSWEEAAKTNIGLELKTLNNDLSIVVDYFQEDRTGIFLRRSNVPLYVGLRSNPYGNLGVIHNRGVDGTVEYSTSLGKNWVISARTNFTWNRAVIIDDANAAWPYPWQQRIGRKLNQRFGLIALGLFEDEKDIENSPYQTGIVKPGDIKFKDLNGDGKIDSYDEAPIGYGAVPELVYGAGFNISWKGFAFGAFFKGVGNVDVRLNGEGFQPFQLAGDRGNLLQEVTNRWTPDNPSQNVIYPRLTYPSNENMNYNNSSWWIKNGSFIRLQTLEASYSLPKAKWFDKGGLSGLRIYFIGYNVATFSKFKMWDVELGDGKGAQYPLLKSFNLGVELRFK*