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SCN18_25_8_15_R2_B_scaffold_3161_3

Organism: SCN18_25_8_15_R2_B_SCNPILOT_EXPT_1000_BF_Sphingobacteriia_40_10_40_9

near complete RP 52 / 55 MC: 1 BSCG 50 / 51 MC: 2 ASCG 13 / 38
Location: 5138..8236

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
collagen-binding protein n=1 Tax=Rudanella lutea RepID=UPI00037EBFFD similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 72.1
  • Coverage: 1008.0
  • Bit_score: 1504
  • Evalue 0.0
TonB-dependent receptor plug {ECO:0000313|EMBL:ADB37013.1}; TaxID=504472 species="Bacteria; Bacteroidetes; Cytophagia; Cytophagales; Cytophagaceae; Spirosoma.;" source="Spirosoma linguale (strain ATCC 33905 / DSM 74 / LMG 10896).;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 70.9
  • Coverage: 1018.0
  • Bit_score: 1499
  • Evalue 0.0
TonB-dependent receptor plug similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 70.9
  • Coverage: 1018.0
  • Bit_score: 1499
  • Evalue 0.0

Lists

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Notes

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Taxonomy

SCNPILOT_EXPT_1000_BF_Sphingobacteriia_40_10 → SCNPILOT_EXPT_1000_BF_Sphingobacteriia_40_10 → Sphingobacteriales → Sphingobacteriia → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3099
ATGCTGAAAAAGAAAATTAACTATTACGTTAAATGCATCTCAACTATTGTAGTTGCGATGTCTCTGATCGTATGCTGTGCATATGCACAGGATCGGACAATTACCGGTACTGTTACAGATGAAGCTTCATCTGCAGGAATCCCCGGGGTAACAGTGCATGTAAAAGGCACAAGAATTTCCACTCAAACAGATCCTAATGGAAAATTCTCATTGAATGTAAAAAATGGGAAAATACTTGTTTTTTCTTATGTTGGATACCTTGAAAAAGAAGTGGCGATAGGAGGAGGTTCAGAAGTGAATGCATCTCTCGCGATAGATGCAAAGGGTTTAGGAGAGGTTGTGGTTGTAGGCTATGGCAGCCAGACAAAAAGAAATGTAACCGGCGCTGTTCAGAATATTGACGCTAAAGAAATTAAAGATATTCCGGTATCACAGATGACACAGAAGTTGCAGGGTAAACTTGCGGGTGTACAGATAAACCAAACCACCGGTAAGCCTGGACAAGGTATGTCTGTAAGGATTCGTGGGCAGGTGTCTGTAACTGCGGGTAGTGATCCGCTGTATGTTGTTGATGGTTTTCCGATTACGGGCAACATTTCCAATTTGAACCCTGATGAAATTGATGATATATCAGTATTGAAAGATGCGGCATCTACTTCATTGTATGGTTCAAGAGCTGCAAATGGTGTTGTGCTCATCACTACAAAAAAAGGAGTGAAAGGCAAAACAACTGTTGGATTAAGTGTGTATGGCGGTATACAGGAAGTGCCTAAAAAAGGGCGCATAAAAATGATGAATGCTGAAGAATTCGCACAGTTTAAAAAGGAATATTACGAAGATGCAGGTCAGCCTGTTCCGGTTGAGTTTCAAAACCCTTCTGAGTACAGAGACAAAAACAATGATTGGTATGATGCTTTATTAAGAAAGGCCCCCATACAAAGCTATAGTCTGTCTATTAATTCCAATACAGATAAATTAAGCACCTCAATTGTTGCCGGCGTATTTAATCAACAGGGTGTTGTATTAAATAACGAATACAAGAGATTTTCTTTCAGGATGAACACAGAATACTCAATTACTGATAATCTGAAGATTGGCTTTAATATTGCCCCGTCTTATGTATTTGATAATACGCCAAGAACAGACGGAGACAGGGGTACAGGGATTTTATTTAATGCATTACACACCTGGCCGGTCATGCCTATCCGTGATGCCAATGGTGAACTCACGTTGTATAACAACTTTCCGGGCAGCACAGGTAATATCTTTAACTATCCCAACTGGGTGAGAGCAGCGGATGAACTGGTAAATGAAACAAAGTATAATTATCTTGTTGGTAATGCTTATATACAATACAAGCCAATAGCAGGGTTAACCCTAAAATCTACGTTTAACGTTGAAAACTTTTCCTCCAAGTTTTTCTTCTTTAATCCATCTACTGCCACAAGCGCAATCAATGTGCCAGTGCCTACTACAGCGGTATCTATCAGGCAAAATATTGAAGGACGTTCTTTATTGAATGAAAATCTTGCCACATATGCCAAAAGTTTTGGTGAGCATAATTTTGAATTACTGGCAGGGTTTACCAATCAAAAATTTTATGCAGAACAAACGCGTATTCAGGCAGATACTTATACTGATGACAGGCTGCCGACACTGCAGGGCGCTATCAATATAAACAGAGGCGGAACGAATAACGCGTATAATGAATGGTCGCTTGTATCATATCTCTCAAGATTAACTTATAACTTCAGAGGTAAATATTTATTAACCGCTGCTATACGTAGCGATGGTTCTTCCCGTTTTGGCAGCGCTAATAAGTGGGGTACATTCCCATCGGCTTCTTTAGGCTGGGTTATTTCAGATGAGAACTTTTTTAACAGTATCAAATCCATAAACTTCGCGAAGCTGCGTGCCAGCTATGGAGTGATTGGTAATAATAATATCGGGAACTATACGCAGTATGCGTTGGTGAATAATACCATTAATGCTGTATTTGGCTCTACTGTAGCTACTGGCGCAGCTGTCACTTCTCTTGCTAATCCAAAACTTACATGGGAAACAACCAAGCAATTTGATATAGGGTTAGACCTTGGATTTCTCAACAACAGGATACAATTCATCTACGATTATTACCTGAAAAACACTACCAATCTTTTGTATAGTGTTCAAATTGCACAGGAGTCCGGGTTTACCAATTACAACGATAATATCGGACAGATAAGATTCTGGGGACATGAGTTCGCAATAAATACTATAAATATTGATGCCAATAAATTCCGCTGGACCACCAATGCTAATATTTCTTTCAACCGTAATAAAGTTATTGCGCTTGCTGAGGGGCTTGACAGGGTATACGGCACCTTCCATATCACCCAGGTGGGTAAACCATTCGGACAGTTTTATGGATTGATTGCAGATGGCGTATATATGAACCAGCAGGATCTTGATAACTCTCCGCAGGTGCCCGGACGTTCAAATGTGGGTACCATTAAGTTGCTGGATTTGAATAAAGATGGAAAGATTACCTATGGAGGTGATAATGATGACCGTACCATTATAGGTAGCCCATTTCCTAAATTTATTTATGGTATTACCAATACCATTCAATATGGAAAATTTGATTTTACTATTGTTGGATCTGGTTCATACGGCAATAAATTATTGATCCGCCATTTGTACAGCACTGCAAATCTTGACGGTGTATTTAATATGGTAGAGGAAGCAAAATACCGTTTCAGATCACCTGAAAATCCAGGTAAAGGATTTTTTGGAACTACTGTTGGCGGCGGTAACTATACCGGTATAGAAAGAGACTGGATGAACAGCCGCTTTATTGATGGCGCTTCATTCTTTACGATCAAAAATATTACCCTCGGATATAATGTTGGAATAAAAAGCAAGGCAATTAAATCTGCGAGAATATATGCTTCCATTCAGCAGGCATATGTATTTACGAACTACTGGGGTGGTCCTAATCCTGAAACAAGTGCACAGGGAGATGGTAATGGCGATGGAGGTAACCTGAGTCAGGGTGTTGATCTGTCCAACTATCCTGTTCCGCGTACATATACATTGGGACTTAATCTTAATTTCTAG
PROTEIN sequence
Length: 1033
MLKKKINYYVKCISTIVVAMSLIVCCAYAQDRTITGTVTDEASSAGIPGVTVHVKGTRISTQTDPNGKFSLNVKNGKILVFSYVGYLEKEVAIGGGSEVNASLAIDAKGLGEVVVVGYGSQTKRNVTGAVQNIDAKEIKDIPVSQMTQKLQGKLAGVQINQTTGKPGQGMSVRIRGQVSVTAGSDPLYVVDGFPITGNISNLNPDEIDDISVLKDAASTSLYGSRAANGVVLITTKKGVKGKTTVGLSVYGGIQEVPKKGRIKMMNAEEFAQFKKEYYEDAGQPVPVEFQNPSEYRDKNNDWYDALLRKAPIQSYSLSINSNTDKLSTSIVAGVFNQQGVVLNNEYKRFSFRMNTEYSITDNLKIGFNIAPSYVFDNTPRTDGDRGTGILFNALHTWPVMPIRDANGELTLYNNFPGSTGNIFNYPNWVRAADELVNETKYNYLVGNAYIQYKPIAGLTLKSTFNVENFSSKFFFFNPSTATSAINVPVPTTAVSIRQNIEGRSLLNENLATYAKSFGEHNFELLAGFTNQKFYAEQTRIQADTYTDDRLPTLQGAININRGGTNNAYNEWSLVSYLSRLTYNFRGKYLLTAAIRSDGSSRFGSANKWGTFPSASLGWVISDENFFNSIKSINFAKLRASYGVIGNNNIGNYTQYALVNNTINAVFGSTVATGAAVTSLANPKLTWETTKQFDIGLDLGFLNNRIQFIYDYYLKNTTNLLYSVQIAQESGFTNYNDNIGQIRFWGHEFAINTINIDANKFRWTTNANISFNRNKVIALAEGLDRVYGTFHITQVGKPFGQFYGLIADGVYMNQQDLDNSPQVPGRSNVGTIKLLDLNKDGKITYGGDNDDRTIIGSPFPKFIYGITNTIQYGKFDFTIVGSGSYGNKLLIRHLYSTANLDGVFNMVEEAKYRFRSPENPGKGFFGTTVGGGNYTGIERDWMNSRFIDGASFFTIKNITLGYNVGIKSKAIKSARIYASIQQAYVFTNYWGGPNPETSAQGDGNGDGGNLSQGVDLSNYPVPRTYTLGLNLNF*