ggKbase home page

SCN18_25_8_15_R2_B_scaffold_3793_4

Organism: SCN18_25_8_15_R2_B_SCNPILOT_EXPT_1000_BF_Sphingobacteriia_40_10_40_9

near complete RP 52 / 55 MC: 1 BSCG 50 / 51 MC: 2 ASCG 13 / 38
Location: comp(4432..7527)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
hypothetical protein n=1 Tax=Proteiniphilum acetatigenes RepID=UPI00036F0CA4 similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 71.1
  • Coverage: 996.0
  • Bit_score: 1489
  • Evalue 0.0
TonB-linked outer membrane protein, SusC/RagA family {ECO:0000313|EMBL:AGB28632.1}; TaxID=908937 species="Bacteria; Bacteroidetes; Bacteroidia; Bacteroidales; Prevotellaceae; Prevotella.;" source="Prevotella dentalis (strain ATCC 49559 / DSM 3688 / JCM 13448 / NCTC; 12043 / ES 2772) (Mitsuokella dentalis).;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 56.3
  • Coverage: 1014.0
  • Bit_score: 1198
  • Evalue 0.0
TonB-linked outer membrane protein, SusC/RagA family similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 56.3
  • Coverage: 1014.0
  • Bit_score: 1198
  • Evalue 0.0

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

SCNPILOT_EXPT_1000_BF_Sphingobacteriia_40_10 → SCNPILOT_EXPT_1000_BF_Sphingobacteriia_40_10 → Sphingobacteriales → Sphingobacteriia → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3096
ATGCGTAAGAACAAAAGGCATTTGAAGTGGACATTTGTCTGTGTAATGTTACTGTATGTACTTACCGGGGTTTCCATTGCCCAGGTCAATCCGGATAAAACCATCCAGGTTTCCGGAAAAGTAACAAATGAACAGGGAAATCCTGTGGAAGCAGTTTCTGTTGTAGACCAGAAAACAAAAAAAGGTGTACAAACCGACGCAGGTGGAAACTTTAGTATTACAACAACCACTAATGGTTCTTTAGCCATTTCTGCTGTTGGCTATGCTGATCAGGTTGTGGCGGTAAAAGGCTTATCAGGCATTGATATTGTATTAAAAAGCAATGTCAGCACTTTGAGCGATGTGGTAGTGGTAGGTTATGGACAACAGCGTGCAGCTACTGTAACCGGAGCGGTATCGCAAATTAAGTCAGACAAAATTACCGTAGCTCCAATTGCTAATGTAACCAATGCTTTAGCCGGTCAATTGCCAGGTTTAATATCAAAACAGGTATCCGGTATTCCGGGCTCTGATGATGCCAGTTTAAATATTCGCGGTTTTGGAAATCCTTTGGTAATTGTTGATGGTATTGAAACCAGCCTGAGTAACCTTGACGCTAACCAGATTGAAACAGTATCCATTCTTAAAGATGGTGCTGCTTCTATTTTTGGAGCGCGGGCAGGTAATGGTGTTATTTTGATTACTACCAAACGCGGTAAAAATTCAAAACCAACACTTACGGTTAACAGTTCTTATACATTACAGGGGTCAACCAGGGTTATCAAACCTGGTACTTCAGCTGAACGTGCGCAATATGAAGTGGATAAGTGGTTAAACTCAGGTAAGCCTGCAGACCAGGTGCCATTTACGGCTGAAGAAATTCAGAAATTTAAAGATGGTACAGACCCTAAGTATTTAAATACAGATTGGTTTAATGCATCTATCCGAAAATTTGCTCCCCAGCAAAATCATAATCTTTCAGTATCCGGTGGTAATGAAAGAATAAAATATTATGGCTATTTCGGTGCCAATAAGCAGGAAACTATTTTGAAAAAGAATGGCGGGCACTATGACCGGTATAATTTCCAGGTGAATATGGATGCCAAAGTAACAGACCAGCTTTCTGCTGCGATGGATGTTCAGTATTTTAAAGAACAACGCTACTTTCCATCAGGTGCGGATGGTGTGGGCACCAATAATAATTTCTGGCGCGACCTGATTTATGCTGCTGATCCTTCATATGCATTAACATTACCTGATGAAACAATTATGGCTTATGCAGGTATTCCTTATGGAAGCCCGGTATGGGCTACCAATTCAGATTTAAGTGGTTATTCTGATCTTAACAGGAACGTTACACAGTTTAAAGGAGAGTTGAAATACGATGTTGCACAGGTGCCGGGGTTAAATGCAAAAGGTACTGTTATTTACAGGTCAACTTCAGCTGATAATAAAGTAGCAAAAAACCAGGCAAAATTTTATACGTATAATGCGGATAATGATGAGTATACTTATGTGCGTAGCTCACAAGATCCCATGACGCTAAGCCGCTCTTCCGGCACAGATACCAAACTGGTTCAGCAGTATTCTTTAAACTATAATAAGTCTTTTAGTGGTTTGCACAGGGTTACGGGTATGTTTATGTATGAGTATATACATGAAAAAGGGCAGTCATTTAGTGCATCACGCGGCGGTTACCAGTCAATGGCGCTTGAAGAACTATTTTCAGGAGACCCTATAACCGCTGCCAATAATTCATCAAGTTATGCTAATGGAAGAATATCATGGATTGGCCGGTTAAATTACAGCTATGACGACAGGTATATGCTGGAAACAATTTTGAGAGCTGATGCATCTTCCCGCTTTTCAAAAGCAAACCGTTGGGGATATTTTCCAAGCATATCATTAGGATGGAATATAGCCAGGGAAAAGTTTATGGAGTCTGTGGATATGTTTGACATATTGAAACTACGCGCAAGCTATGGCTCATCCGGCTACGATGCCGTAGCTAATTTTGCATACCTCACCGGCTATGGGTATGATGGTACTTATACCATTGGCGGTAATCTTGTTTCGGGGCTGATTCCTACAGGTTTGGCCAACCCTGATTTAACCTGGGAAAAAATGGCTATTTATAACGCCGGTGTTGATTTTTCATTATGGCGCAGTAAGCTCTATGGTGAAGTTGAATTTTTTCACCGCAGGCGTTTAGGAATTCCCGGAAGCCGCGTTAACTCACTGCCTTCATCATTCGGTGCAACACTTCCTCTTGAAAACCTGAACAGCCAAAGTACACAGGGTATTGAATTAAGATTAGGTACCGTAGGTAAAATAGGTGAAGTTAATTATGACATTGCTGGAAATATAGCTTATTCAAGATCGAAATGGATTTCTTATGATGAAGCAGCATATACAGATGAAGATCAGATGAGAATGTATAAAAATAGCGGGCGTTATACTGATCGTCGTTATGGGTATGTTTTTGATGGATTATTTACCAGCCAGGAAGACGTTGACAAATGGCCTTTAAGCTTCGAAGGTCTGAACAATGACAACTCATCCCTTCGCCCCGGCGATGCAAAGTATAAGGATTTAAATGGTGATGGTGTGATCAACTGGCGCGATCAGACAGAAATAGGAAAGGGCTCAATGCCACACTGGACTTATGGTTTGAACCTCTCATTAAGGTATAAAAACTTTGATTTCTCCGCGCTGTTCCAGGGGGCTTTTGGCTATACCACTTATATTGACCTTGAGGCAGCTCCTACAGCTGTATTCTATAGTAATTACTGGAACGATGGCGCAAACAATCGTGCTGATGTACTGATACCAAGACCTGCCGGTTCATCAACCAATTGGTTATATTCTGATTACAGAAACCATAACACAACTTACCTGAGATTCAGAAACATGTCATTGGGTTACCAGGTGCCGGTTGCTTTATTAAGCAGGGCAGGGATAAGCAAATTCAGGGTATTTGTTGCAGGCACAAACCTGTTTACAATCAGTACACTTGACAAATTTGGTGTTGACCCTGAAATGCCTGAAGGTTTTGGGGCAGGGGTTTACTATCCTCAACAATATACAATGAGCTTTGGTTGTAATCTCACTTTTTAA
PROTEIN sequence
Length: 1032
MRKNKRHLKWTFVCVMLLYVLTGVSIAQVNPDKTIQVSGKVTNEQGNPVEAVSVVDQKTKKGVQTDAGGNFSITTTTNGSLAISAVGYADQVVAVKGLSGIDIVLKSNVSTLSDVVVVGYGQQRAATVTGAVSQIKSDKITVAPIANVTNALAGQLPGLISKQVSGIPGSDDASLNIRGFGNPLVIVDGIETSLSNLDANQIETVSILKDGAASIFGARAGNGVILITTKRGKNSKPTLTVNSSYTLQGSTRVIKPGTSAERAQYEVDKWLNSGKPADQVPFTAEEIQKFKDGTDPKYLNTDWFNASIRKFAPQQNHNLSVSGGNERIKYYGYFGANKQETILKKNGGHYDRYNFQVNMDAKVTDQLSAAMDVQYFKEQRYFPSGADGVGTNNNFWRDLIYAADPSYALTLPDETIMAYAGIPYGSPVWATNSDLSGYSDLNRNVTQFKGELKYDVAQVPGLNAKGTVIYRSTSADNKVAKNQAKFYTYNADNDEYTYVRSSQDPMTLSRSSGTDTKLVQQYSLNYNKSFSGLHRVTGMFMYEYIHEKGQSFSASRGGYQSMALEELFSGDPITAANNSSSYANGRISWIGRLNYSYDDRYMLETILRADASSRFSKANRWGYFPSISLGWNIAREKFMESVDMFDILKLRASYGSSGYDAVANFAYLTGYGYDGTYTIGGNLVSGLIPTGLANPDLTWEKMAIYNAGVDFSLWRSKLYGEVEFFHRRRLGIPGSRVNSLPSSFGATLPLENLNSQSTQGIELRLGTVGKIGEVNYDIAGNIAYSRSKWISYDEAAYTDEDQMRMYKNSGRYTDRRYGYVFDGLFTSQEDVDKWPLSFEGLNNDNSSLRPGDAKYKDLNGDGVINWRDQTEIGKGSMPHWTYGLNLSLRYKNFDFSALFQGAFGYTTYIDLEAAPTAVFYSNYWNDGANNRADVLIPRPAGSSTNWLYSDYRNHNTTYLRFRNMSLGYQVPVALLSRAGISKFRVFVAGTNLFTISTLDKFGVDPEMPEGFGAGVYYPQQYTMSFGCNLTF*