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SCN18_25_8_15_R2_B_scaffold_3828_4

Organism: SCN18_25_8_15_R2_B_SCNPILOT_EXPT_1000_BF_Sphingobacteriia_40_10_40_9

near complete RP 52 / 55 MC: 1 BSCG 50 / 51 MC: 2 ASCG 13 / 38
Location: 2921..7984

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
hypothetical protein n=1 Tax=Flexithrix dorotheae RepID=UPI000372B2E9 similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 40.2
  • Coverage: 1705.0
  • Bit_score: 1206
  • Evalue 0.0
PA14 domain protein {ECO:0000313|EMBL:ACU61166.1}; Flags: Precursor;; TaxID=485918 species="Bacteria; Bacteroidetes; Sphingobacteriia; Sphingobacteriales; Chitinophagaceae; Chitinophaga.;" source="Chitinophaga pinensis (strain ATCC 43595 / DSM 2588 / NCIB 11800 / UQM; 2034).;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 35.6
  • Coverage: 1794.0
  • Bit_score: 1028
  • Evalue 0.0
PA14 domain-containing protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 35.6
  • Coverage: 1794.0
  • Bit_score: 1028
  • Evalue 0.0

Lists

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Taxonomy

SCNPILOT_EXPT_1000_BF_Sphingobacteriia_40_10 → SCNPILOT_EXPT_1000_BF_Sphingobacteriia_40_10 → Sphingobacteriales → Sphingobacteriia → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 5064
ATGAAGATGTCATCTTTACGCACGTTAACAGCCACATTGATATTTGGGTTCTCAATGGTTGCAAGCTTTACGTTCGCACAGTCCGCAGTATTTAACCCTGATGATGCCATTGTGACTTACAATCCGGCTCAGCCGCCTACCCAGCCTGCATCAGGCCCGGGCAAGTGGGTTCGAACCAGCAGAATGCCATGGACTACATCAAGTTTTAAATGTTATATATATAAGGGGATAGCTTTTCGTTTAAAATACCCTAAAACATTTAAAGATGTTGTTCCGGGTGACGGGAAAAAATTTCCCTTGTTTTTATTTTTTCACGGAGCGGGGGAGAAAGGCACTATTTACGACAACGAATATCAATTATACCATGGTGGAAATAAACATATGCTGGCTGTAGACAATGGAAGTTATGACGGCTTCTTATTATATCCGCAATGTACAAACACCGTTTTTTCATTTAGCGAATTAGTCATTATTAATGAATTAATTGAACAATATTTAATACCTGAAGTTCGTGTCGATCCATTCAGGATAAGCGTAGACGGGTTGTCTGGTGGTGGTAAATCATCATGGAATATGATGACATATTTTCCGAAACTAACAGCCGGCGTTGCTCCCATAAGCAGTTCGGAATATAGTATTATCCCTTATATAAAGGCAAATAAATTTACCCCTATCTGGCTGTTCCAGGGAGCACTTGATAATGAGCCTCCGGTTTCAAGAACACGTGTACTTGTTGACTCGGCTAAAGCATTTGGTGCAAATTTTACTTACACAGAATTTCCCGACAGAGGGCATGATTCCTGGTATAACGCATGGGCAGAGCCTGGATATTTCCCTTTTTTAGCATCTGTGCATAAAGCCAACCCCTGGCCGCTTAACGGAAGATATGAATTTTGCCCGGGCGAGCCCGTTAATCAGGTTATTGGCGTTGGAGATGGATTTGATGAATATCAATGGAGAAAAAATGGTAATATTATTTCCGGGGCAACATCTAACACAATAACTGCAACAACTTTGGGAACATACGATTGCCGGATCCGTCGTGATACTGTATGGTCTGTATGGTCACCTGTTCCTGTAGTGCTCAAAACAAAAGGTACTACTATTTCTCCCGATCCCCAATTGGCAAACTTTGCAAGCAAAGTATTACCGGCACCGGATGGTTCCACACAGGTATTATTAAAAGCGCCCGATGGGTATGCTTCATACAAATGGACGATTGCCGGTAGTAATTCTACTTTAGGCTCCAATGGCACATACCTTGCTTCTGCCGGAAGTTATCAATTAACTACTACAGAGAATTTTGGTTGCGAAAGTTTACCTTCTAATCCATTTACAGTTGTTAATGCCAATGGCACCAATAAGCCAGAAGCTATAAGAGGTTTGATTGCAAATAAATTGTCGAAAACCTCTATTAAATTAAATTGGATAACTAACGCAAATGCTATAAACCTGCCTACGAATTTTGAAATTTACCAGGCTACCAAATCTGGCGGACCATATAAATTTGTTGGAATTGTAGGTGCGAGTGAGCGGGCTTTCACAAAAGTAGAACTCGCTCCGGGTGTTAAATATTATTACATTGTAAGGCCTGTTAATAATACTTCTGCTGGGCCTGTTTCCAGTGAAGTAAGCGCCATAACAGATGTTGATACCCAGGCACCAACCTCACCTGTTAACCTGCGTGTTGACGGAACAACCCGCAATTCAATTGCGGTTTCATGGGAAGCAGCTTCAGATGACGTTGGTGTAATAGGCTATGACGTGTATATTAATGGGGTAAAATCCTATTCTACAACATCCACTTCATACATAATTTATGGTCTGGAGTATAACAAGACTTATAATATTACTGTAAAAGCAAAGGATCTTGCAGGAAATGAATCGCCATTCAGCAACCAGGCTTCAGCAAAAACATTGATGAAGGGGCTGAGTTACAGGTATTATATAGGAGAATGGGATAACTTACCCAATTTTAATGTTCTGACTCCGCAAAGTACAGGATTTGTTCCCAACGTTACTTTAGACAACAGAACCCAGACTTTTAATTTTGCTTTTTTGTGGGAAGGACATATAAGAATAACCACTCCCGGAAGATATACTTTTAGAACCAACTCGAGTGATGGCAGCCGTGTTTACATAAACAAACCATATGATTATTATGCCACTCCTTTAGTGGATAATGATGGGACACATTCAGGACAAAACATACAGGATACCATGACGCTCGCCGCAGGCGTGTATCCTATAGCTATAAGTTATTTTAATAAAGTACGTACAGCGCCAACCATGTCTCTTACGTGGAGATTAGGTACGGCATCTTATACAGCAGTACCAGATAGTGTTTTTGTTGAAGCACAGGGCACAGTAACCAATTTACCTGCTGCTCCGTCTAATTTAAATGCAAGCACTTTATCGTACAAAAAAATTGCGCTTACCTGGACTGATAACAGTAATAATGAAACAGCATTTGAGTTACTCAGATCTACAGACCCGGTAAATAATTTTGCTACTGTTGCTGTTTTACCGGCCAATACAACCTCTTACCAGGATTCTTTACTTAGTGCTGCTACCAAATATTATTACAAGGTAAGGGCGATTAATGCTAACGGAGAATCTGCTTATGACAGAAAAGGACGAGGCGTGGATTATTCATATTATGAAACCTCAGGGCTTTCATCTGCTGCTCTATCAGTTTTCAATTCAATGACACCGGTAAAAACCGGGCGTACTGATAATTTTTCTTTAGGTATGCAGTCACGGGCTGATAATTTTGCTGTAAAATTTGAGGGATATATTAATATAGCTTCTGCAGGTAAATATAAGTTTTATACAACATCTGACGATGGTTCCATGCTGTATATTGATGGCACTTTAAGGGTAAATAATGACGGGGACCATTCAGCTAAGGAAGACTCAAGCAGCGCTTTTAATTTATCTGCCGGGCAGCATTCCATAATAGTAACCTATTACGAAGATGGTGGCAGTGAAGTTCTATCGGCAAGTTACAGAACAACTGAAGCGCCAATTATAAGTAAGCAAATTATTCCTGCAACAATACTTGGACAGGAGTTTGTAAATGCAACTACTTCAAATGCTCCCCAGGCTCCTGCTGCTCCATCCGGGCTTCAAACTACCAATGTTACAACTACAAGTGTTAAACTTACCTGGACAAACAATGCTACAGGTGTAACCAAATTTGAATTGTACAGGTCTTACGGTAATAACGAGGATTATGTGATGTACGCTGAAATTCCCGCAGCTACTACCAATTATACAGATACAGCTTTATTCCCAAGTTCAACTGTGTTTTACAAGGTAAAAGCGATCAATCCGAATGGTTCGTCTGACTTCAGCAATGAGTTAAATGTTCTTACGCCAAGCACCCCCCCTGTGCTAAGTGCTATCGAAAACCAGTACATGCGTTATGGTACACAACTGAAAGTATACATAAATGCAAGTACTACTACTACTGAAGCTCTGACATTACAGGTAACTAATTTACCTTCATTCGCTGTATTTAACATAACCGGAAATGGTAAGGGTGAGATTACGTTTAACCCGGGAGTTAGTCAACAAGGAGTATATAATAATATAACCGTATCGGTAAAGAATCCCCAAAATGCTACTGTAACCAGGTCGTTTAGATTAACAGTGAATGAGAATTTTACCCCAACTGTAACGGGCAATACTACTTACCTTAGCGTTAATGAAAACGATACAAAAACGTTATCATTTACCGGAAATGATGATGATTTGGGAGATGTGCTTAACTGGTCTTTTAGCGGATTACCCAATTTTATAGCCGTAAACATAAATAATAGAACTGCTGTACTAACCGTTTCACCAATCTCTGGTAATGCCGGCACATACAATATAATTGCCAAAGTGGATGATAGTAAGAACGGCAGTGATACAATGGCCTTTACTATTGAAGTAGCTCCGGTAGCTATCAGTACTGTATATATCAATTTATCCGCTTCAACCGATTATGCTGTTGGAGGAATCTGGAACAGTACTAATACCCTTCTTTCTAATGGTACAATATTCCCTTCTGCATCTACAGGGCTTACTGATCATAACGGGCAAAGCACCGGGATTCGCTTCAGTTTCATATCCGGCAGCCGCTATACTCACTATTCAGGGGTGAGTACGGGTTCAAACTCCGGGGTTTATCCAGATAAAGTTCTGAAGGCAGGTTACAGAGCAGACTGGAATGTTACTAATGTTATGCGTTTTACAGGATTAGACCCTGCAAAAAAATATAGTTTCACCTTCTTTGCAAGTTTTGATGCATCTATAACTGCAACTAAATATAAAATCGGTACAGATTCTGTTGTTTTGAATACTACAGGAAACACGCAAAATGTTGTTACCATAAATAATGTAATTCCTGATGCTAATGGTGTGGCATTAGTACAAATTACACAAGGCCCCCCGGTTGGCTACTCAGGATTTTACTATATGAATGCTATAGTAATCTCTAATGCTTCACCCGCAAGTCAAACCACGCCTCCGGGAAAAGTAAAAGATCTTGCAGCGAAATTTGAAAACAATGTAGTTAAAGTCACATGGACTAATACCACAACTAATGCAACACAGTACGAAGTATACAGATCCAATTATCTCAGCGGTCCATTTACACTGCTCAACCCGGGCGCTAATAATGGTACTGATGAATCATATACTGATAGCACCATTCAGGGAAACAAGACTTACTATTATTTTGTAAGGGGAAAGAATAGCTACGGCTATACAACTTCCACTACAATTAAGATTACGATTCCCAATAGGGCTCCGGTTGTTGTTACAAGTGATGTTTATGTTAAAACACAACAAACAACCAATGTTAATATTATAGCCACTGACGATCCTTCAGATATCATTACCTTATCAGCATCAGGTTTGCCTTCGTTTGCAACCTTTACTGATAATGGCAGCGGATCAGGTACGCTTCATTTATCTCCATTGGCAGGTAATACAGGTGTATTCAGTATCATCGTAAAAGCAAAAGATAATTATAATGCTTCTACTGAAAACACGGTAAGAATAAATGTGACGGAT
PROTEIN sequence
Length: 1688
MKMSSLRTLTATLIFGFSMVASFTFAQSAVFNPDDAIVTYNPAQPPTQPASGPGKWVRTSRMPWTTSSFKCYIYKGIAFRLKYPKTFKDVVPGDGKKFPLFLFFHGAGEKGTIYDNEYQLYHGGNKHMLAVDNGSYDGFLLYPQCTNTVFSFSELVIINELIEQYLIPEVRVDPFRISVDGLSGGGKSSWNMMTYFPKLTAGVAPISSSEYSIIPYIKANKFTPIWLFQGALDNEPPVSRTRVLVDSAKAFGANFTYTEFPDRGHDSWYNAWAEPGYFPFLASVHKANPWPLNGRYEFCPGEPVNQVIGVGDGFDEYQWRKNGNIISGATSNTITATTLGTYDCRIRRDTVWSVWSPVPVVLKTKGTTISPDPQLANFASKVLPAPDGSTQVLLKAPDGYASYKWTIAGSNSTLGSNGTYLASAGSYQLTTTENFGCESLPSNPFTVVNANGTNKPEAIRGLIANKLSKTSIKLNWITNANAINLPTNFEIYQATKSGGPYKFVGIVGASERAFTKVELAPGVKYYYIVRPVNNTSAGPVSSEVSAITDVDTQAPTSPVNLRVDGTTRNSIAVSWEAASDDVGVIGYDVYINGVKSYSTTSTSYIIYGLEYNKTYNITVKAKDLAGNESPFSNQASAKTLMKGLSYRYYIGEWDNLPNFNVLTPQSTGFVPNVTLDNRTQTFNFAFLWEGHIRITTPGRYTFRTNSSDGSRVYINKPYDYYATPLVDNDGTHSGQNIQDTMTLAAGVYPIAISYFNKVRTAPTMSLTWRLGTASYTAVPDSVFVEAQGTVTNLPAAPSNLNASTLSYKKIALTWTDNSNNETAFELLRSTDPVNNFATVAVLPANTTSYQDSLLSAATKYYYKVRAINANGESAYDRKGRGVDYSYYETSGLSSAALSVFNSMTPVKTGRTDNFSLGMQSRADNFAVKFEGYINIASAGKYKFYTTSDDGSMLYIDGTLRVNNDGDHSAKEDSSSAFNLSAGQHSIIVTYYEDGGSEVLSASYRTTEAPIISKQIIPATILGQEFVNATTSNAPQAPAAPSGLQTTNVTTTSVKLTWTNNATGVTKFELYRSYGNNEDYVMYAEIPAATTNYTDTALFPSSTVFYKVKAINPNGSSDFSNELNVLTPSTPPVLSAIENQYMRYGTQLKVYINASTTTTEALTLQVTNLPSFAVFNITGNGKGEITFNPGVSQQGVYNNITVSVKNPQNATVTRSFRLTVNENFTPTVTGNTTYLSVNENDTKTLSFTGNDDDLGDVLNWSFSGLPNFIAVNINNRTAVLTVSPISGNAGTYNIIAKVDDSKNGSDTMAFTIEVAPVAISTVYINLSASTDYAVGGIWNSTNTLLSNGTIFPSASTGLTDHNGQSTGIRFSFISGSRYTHYSGVSTGSNSGVYPDKVLKAGYRADWNVTNVMRFTGLDPAKKYSFTFFASFDASITATKYKIGTDSVVLNTTGNTQNVVTINNVIPDANGVALVQITQGPPVGYSGFYYMNAIVISNASPASQTTPPGKVKDLAAKFENNVVKVTWTNTTTNATQYEVYRSNYLSGPFTLLNPGANNGTDESYTDSTIQGNKTYYYFVRGKNSYGYTTSTTIKITIPNRAPVVVTSDVYVKTQQTTNVNIIATDDPSDIITLSASGLPSFATFTDNGSGSGTLHLSPLAGNTGVFSIIVKAKDNYNASTENTVRINVTD