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SCN18_31_3_15_R4_B_scaffold_836_10

Organism: SCN18_31_3_15_R4_B_SCNpilot_BF_INOC_Flavobacterium_39_30_40_63

near complete RP 50 / 55 BSCG 50 / 51 ASCG 15 / 38 MC: 1
Location: 14853..24827

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Value Algorithm Source
YD repeat protein n=1 Tax=Flavobacterium johnsoniae (strain ATCC 17061 / DSM 2064 / UW101) RepID=A5FMC0_FLAJ1 similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 47.4
  • Coverage: 1727.0
  • Bit_score: 1466
  • Evalue 0.0
Uncharacterized protein {ECO:0000313|EMBL:KGO78770.1}; Flags: Fragment;; TaxID=1406840 species="Bacteria; Bacteroidetes; Flavobacteriia; Flavobacteriales; Flavobacteriaceae; Flavobacterium.;" source="Flavobacterium beibuense F44-8.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 43.7
  • Coverage: 3372.0
  • Bit_score: 2566
  • Evalue 0.0
YD repeat-containing protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 47.4
  • Coverage: 1727.0
  • Bit_score: 1466
  • Evalue 0.0

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Taxonomy

SCNPILOT_SOLID2_TRIM150_Sphingobacteriales_40_586 → SCNPILOT_SOLID2_TRIM150_Sphingobacteriales_40_586 → Sphingobacteriales → Sphingobacteriia → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 9975
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PROTEIN sequence
Length: 3325
MYIRKCLYVLILVMCTAFSFGQQEEISGGISTGTQLHSLPTLQVTDPKFSTLNQQNVFTSVDPAVYIHFGFKDNVSDLAAYNNIYYCEVNLAVTPYTATGSAMASYNVVLKIKHDNITESVEFDDYKVHKLPNVHKATVKVQSIQYKNSLDQNIALVANSVAFVEVKFKTDRYYNLKGTKVTPVKRLIKYNGTTETTVANVSNGADELEISWTKNATAPAVEYELEWTWMDNYNPQGGKLLPAQIPLTEQDFKLNSTRIQTKGLSYRIPLVFSKGYLVYRVRPVGRFLDDTSKVYYGVWSNGVSETWKFVSEWVSFLEIDANHELGNKNWQYQASFAEDGKKKEVVSYFDGTLRNRQTVTKINTNNKAVVGEVIYDNQGRPAVEVLPTPIKASGIRFYSDLNKNESNAVYTHNDFDWDNVNALSCDPITAPGMATSSGSSNYFSDQNTVSNNFQDFVPNAKKYPFSQIEYTPDNTGRIRRKGGVGLEHQLGKGHEMQYFYAQPEQEELNRLFGYKVGNNKRYKKNVVIDPNKQVSVSYLDPQGRTIATALAGDKPANLIALGDEANTALHQVTTTDMLSGNNKYASGINGILEDGIRLVTQVSTEKEGSITFNYGLTHTTNTFNDVCLGTKHYPFVYDWSLSLLDDCAAEMLNPKNLNPNSGPSLSTTIGAVNLNSTTPSAPPVLLNQSFDSKTLKVGTYSLSKNVKINQTVLEMYADDYVSEIKKATNACYPDLRQFEVNIDTIDCNVTCRSCEIALICNYLSASDCSAFTNLINANADVNALGDIAARLTLTTKAQTNYIIANLNKTFSGSSFAYNGSQYIDNNALVPQYIINNYVLKFGKEITGLLAGCRELCIQPSNVCDINEGMLLVDVSPHGQYGSLAGINFDNIPSDQQNTVSIETQNELSLFNDKNKLYYGGSTSSPNTTPPLLSNYSWRKPALIYRDADGSISKIKVKKLMEGSYLPELSDNAIVENDPDNPGTEFKIVSPEYLKKVTDFLNNWKPTWAESLLPYHPEYMYYKYGKAICGTKNSSGANSDAYDEKLKELSATDYETAFTTNGIISKMKNLSDNDPFYIAPMVANAEVLYTVEDATDFNLRKNLMKEALDTNYEGLKIGTQSLNMLQAAYYTAVFGNGIAPESFYQPLVTRSFTDLLAAIQGGDQGRVTPFVRKQIWQNFMNSYIGVKQKTRTVFSHIYALKNNGYNGCIGDNENVDTFVTLFNKYTANYGSLLDKINAAFATAVPGSPAGIIPACSTTTYTLYKDKTKRFVSADNGYNSGVTDAQAQADAEADADANMLHQTGKCPLAFDMENFLDGLVNPNIQGQGLLLNGFKAHSMPYLVKDLFDALLINPTAYYANPSNVDIKGSISGDALIIDLIGNGSSVAEKIRLNFVIPNPNNYKNSCGESMAPPSWDGYNTAFTITDFKNIYYVPGSYDSEGQYRFQIVASIKRLTNLTCTGPEEVIIEGVTKAAVGECSLEENNVVNGNAETEIGTGCFKRARFEKALVRVMNKLKGNVLANPGQLFSTNVRLDGAPNVNQDVFTYNNSIMPQIINDANLDAKWSYASGNFTINGATPVSIYSLVNENNAAVLLNTIQFYRITGVKIEKNIVNGIIVGDDKITINYLGSDKKIATLKGRITELNYDCNCTKKVPLQEDAQANFLKLIKHLWIRKDQLPPIADGYTHEVLDNLDPYISGSTAPTVNNFTTNWSNDGMGHVDGMKFDFFNKDINCGFALNILSTPDRPQFNHSDLLNKITHFSNFQITQNLGSGTYSFTVFVHYNAYTIVNNGNIFDTTIAPAGVRVCGGKISCLQNIKCQDEVTVSEIITAMLTTTLAEVMAGVTINDGFTPFGMDLLGQYLQLEGTGTPSVSNFYSVENNNFSQIGFHFTNNPDCGVVFKIPNRRLNEADINSIEIIRFTNDNFNEFTALIINENGEYVEATGSIKCLNLQNCFINAPTPCETCIPPTVAPVSCVDKWNEFILKIKDIEDYVIPEYLSVNGKHFCEANFGYISTDYLYYLHVFHVNSVNHPLFLTISEFGATKLNYGYNGTQVVINEYNNFLTQGGGLTWPEYVDQYFVNNDICPPAPMVPTFSLDTGNIKTPCEIFTNSVKETYLEELKEEYFRNKKEEFKVKYVKAAIDGLRETMTKSAADKEYQYTLYYYDQAGNLVQTVPPQGVVRLTPGSDATINNVRQTKPEEELTVVNGITADPGHTLKTQYRYNSLNQLTWQKTPDGGETQFAYDALGRIIASQNSKQKADAANGIFSYTRYDGLGRIVEAGEIVVPGSTTYSINDKGRLIYAGAPVNAFNTGYTKREITRTLYGLPVKNTEGWFEAYQADNNQKRVTAVLYYDQLTQEIAEIVAYDKYNNAILYDYDVHGNVRELIYHINKNELKTKNQDIKKVVYSYDLISGNVNKVSYQPRKKDQFIHKYEYDADNRITQVFTSKDDVIWEKEANYAYYEHGPLGRTEIGDKKVQGLDYLYTLHGWLKGVNAERLGYYDSTSGTYKIADAGLDGTNAALDAFGFTLNYYNGDYMSRFNASNAVDNRVLAYTKGLNMEGNKDLFNGNIKEMITSLSDLSQNILPSQYNRYEYDQLNRLKTMNSVRQVNNTTTFENSYKSDYSYDRNGNLLTLNRWAPKSATLAVADLMDQLTYNYQAGTNKLTHVDDTVANGVFTNVPANPNDTSLDIDDQNPNNYTYDNIGQLTADAKEGLNISWRVDGKVKTVTKSNGTVISFEYDGLGNRIAKTVTNGANSTTTFYQRDAQGNVLSTYEMVKAGAQTNYYLVEQEIYGSSRLGVEKSRREISEEAGKAVVTQTNKLLAVSDNMMMAMQALTNQPNVWGLKFTGTNKTTWVDPNTSLNFFPRFGGLTEKLEIESHFEIDTTFTSGTKLVAMLQGIKYPDIGEYTRSMVRVDIERDPVRKVYIPIITIETMTRFYQRDGRWWDYYTYMDKHHYRMSAGIPENKWDMKYTMTLNPNVTVTSTDLYTPVLVLNGNVYTDFEYTHEQPYFNTHDHGFVYYPTAPEARNSIGSETVHNKVDDETTIPGVPMEMCDFSYTINNGEGEENIKVNVFEFDEGNVPNAQPKSTNNLLTMQRYAVNYVQSYCGPKEGDMDGDGILDQNDNCPTKPNRDQADTDHDGIGDVCDNCVNISNPLQEDRDGDGVGDVCDNCPDKYNPGQQDADHDGVGDVCDNCPNNANPLQEDDNHDGIGNVCEGFDQGQGTSTPADANKFVTLSRWVGDKNYELSNHLGNVLSVITDRKLIANAGSSYVFKPDVIAYNDYYPFGMLVPNRHAANENYRYGFQGQEKDDELKGGEGNSLNYTFRMHDP