ggKbase home page
Advanced Search
Search Help

LD_Run2_13_scaffold_0_prodigal-single_166

Organism: CHG_PHAGE_CIR_31_47

RP 0 / 55 BSCG 0 / 51 ASCG 0 / 38
Location: comp(147802..155679)

Top 3 Functional Annotations

View all annotations
Value Algorithm Source
NOTCH2 protein n=1 Tax=Salpingoeca rosetta (strain ATCC 50818 / BSB-021) RepID=F2UGA3_SALR5 similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 20.6
  • Coverage: 1064.0
  • Bit_score: 109
  • Evalue 5.10e-20

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

No taxonomy information

Sequences

DNA sequence
Length: 7878
ATGGCAGATTACGGAAATTATTTTACTTCAAATAGTGGAAATTACAATTACAATACAAGAGGACATTCTTTTGATGATTCTGATTGGGTTATTGTAGAATTAGCAAATTCTGGTAATGTATCCCAACCTATTCCTCATCCTAATGGTGCAGAATTTACAGGAAATAATACTACTTGTTATTTCTATACTACTAATCACATGACTAGCCCTAATAGGGAAGTAAAGACTGGTAATGATTATGTTGCTTATTTCAATTGGGCAACAGCTAATAAGAATACGATTGGATCTGTATATGGAGATTTCAATTTCTATCCATTTGGAAGCAAAACAGATTCCAGATTTGTTGAACCAACAGGATTAGATGATACTAAGCATGGTGTAAGTCCTTACAGTAATTCCAACAACAACGTCATATCTAGAACTAACTTATCTGTAAAAGGTACAACTTTTACTGCAGGTTACCGTAGACACAAAATACAATATGAACCAAGCATAAAATATGATTTAACTAGCTATAATTACGGTACAAATGACAACTATAAAAGTGATGGTAAGACTAAAGCAACTGGTGGCCGTGTTGTAACAGAAAAATATGATGCTTTCCAAACTTTCTATAATATAGCAGATCCTTATGGAGAACTCTATATTTCTATATCAAATCATGATGATGCAAAGTCTAGTTCTCCTACTTTCTGTACATTAACAAACAATAAATCAGAATACAGAATAAATCATTCTTATACTTATAACCCATATAAGAATTCAGCTACTTGGAACAATACTAACTATCTTTCATTTACATACAATACTCTGCCTACTTATCCTAAGAGATTAGTTTTCGAATATGATGATAATTACAATTCTGTTTCTTATGATGGTGGTAGTGTAAATGTAGAAGCAAAAGCATGGTATGATGGTAAATATGACAGATTCACAACTTCTACTGCTAATGATGATGGTTTCTCTTCTTATAAGAGATATGTTGATGTAACATACAGTTTGATGATAAATAAAAGCTCTACTATGCCTACAGGTACTAACGCTTATACATTCAGAATATGGCAACCAGGTTCTAAGTTAGGAATATCTTATGCTTGGTCTATAGATAGCAATCCATCTTGGGCACATCTTTCTACAACCTCCGGAAATACAACAAAGGTAACATTTGATGACCAAGGGGATGACAAACCAAGTGTTGGTGGTACTCTTTCATTATCATTAAATAATACTTCTATTTCTAACGGTGGTTCTACTACTGGTTCTGTTACCGGTGTATCTTGGACACCTCCTACTAATAGATCAGCTCGTTCTTGTACACTTAGACAGAATATGACTGTCACCAATTGCTGTGCACAAAACATTACACCTAAAGATATCAAAGGTCAACCATATCAAGCATTGACTTTAACACAGCATGGAATGCATTGGAATAATCCATCATTCAATATGAAATGGAAAGTCACACAAGGAAGTAAGACAACTACAACTTATAATGATGGATATGGCCATGGTTGGCCTACTGTTAGTATAGGGGGAATATCAACTTCAGATGGTACAGAAAAGACAACTGGATGGAATTACAACGCATCATCAAAATCTGTTTCTGTTATAATGCCAACAATAAGCAGGCCTTGGGTAAATACTTATAGTGGTGGTAAAGTAACTATAACTAAAGGATCTAATGATGCAGTATCTTATAAAGGAGGTGATGTTACAATAAAGTTACATCCAGATATTACATTCAGACAAGGTTTTACTTCAGGTGTTTCTGAACGTACTTGGACAATATCCAATACCGCAAATACTCCGACAAATCAAGAATATTGGACATTAAAAGAATTTAAAAGTGTAGATATCAAACTTCCTGCTATAGGTGCTGCTAATCATGCATTTGGAAATGCCACATTATCCTGGAAAGATACTGGTACTCAAGATTTGACATTTTCTAAGGCAAGCAAAACATGGAATAATGACAATACTGATGATAGTTTTACTGCAACATTGGCTTCTAATCCGCCAATAATAGGTAATTGGTATGCCTCTGCTAGTGATGGTACACTTACATTTACATCTACTACTAAAAATTCATCAGCAACATCTGGCACTATATCATTTTCAGGATCTACTTATCAAGATGGTGTACTGACACCAAGCCCATCTACTATAACTATATCTCAAAATGGTACTAACATATCTGGTACTATTACTATAAAAGGAACTGGTGAAGGTATAAATAGTTGTGATGGGAGCACCAAATACCCTGTTGATGGTAAGAGTACAAGTGCCAATTATAGTCTCAAATCAGCTAAACAATTGTATGTTACAGGACAAAAAAACCTTACTCCTGGTGTAAATTATACTACTATTCCTTGGTATGGTGCAACTATTATTATATCTAAATCATCAGGTACTGTAGAAACAGAATCTGCAACTAGTAAGAAGCAAGATTATTCAATATCTGTAAGTAGCAATATAATTAGTTCTAAACCTGCAAACCCTGCCAATGGTATTGTACTTAGCGGATCTGTACAACCCAACCCTGCTAATTATAAATATCAATATAAAGTAGATACAGGAAGTTGGTCAGATTCTACTACTAAATATATACAAAGCAATGATGCAACATGGGATAGAGATTGTTCTCTTGATTTGAAATCTTCTGATGAATGGACTGATGTAAATGAAGGAATATACAAATATACATCAGGATATTATAAAACAGCAGATCCAATAAACCATACTATTAAGATAAGAGTAGTAGATATTAATAATAGTAGTATAACATACGAAGGAAATTCAATAACAGTACCACAAAATGGGCAAGAAGGTTGGCATGATGAAATAGCTTATACTTTTGTAACATCTGGAGTAAATTGTACCACATCTAAACCAGTGGGTCCTGCCGATAAAAGTTATAATGAATCTATTGATTATGGCGCATTTACTGTATCTAATATAACATCACCAGATCCTAACCCATCAGGTGATACTGGGTCAAGTGAGAATATAAGTACATACATATATAATTATTCCGATAAGTTATCAGAAGGTAATTTTCCAACTACTGTACCTACTGCAACATTTGAAGGTTCAAGTCAAGAATTTAAATATAATGTTCCTGTAAGTACATATTTAGGAGTAAAATCAATATCTGCTTTAACAGTAAATTACAAACATACTGGTAAGAAGACATGGAATTATATGTATGGTTTTAGTATACATCCAGAAAGTCCAGATGGATGGATTGGCGATACCCAAACAACAACTAAATCATCATCTGGTTCTGTAGGCCCATTAGTTGATACTACATATACTGCTAAAATGGCAGTTGTTGAAGGTACTGATACTAAAAATTGGCAATCATTAGATACTACTGGAGAAAGTACTGTACATATAACAAAACCAGGAACTTATGTTATTTATGTTGCATGGTTTAATGGTGATAATAAATATAATGAATTAAATAGTAGTACAATTACAATAACATCCCAACAGAAGCAATTTAGAATTAAGATTACTTTAGAAGCTTATACAAGTAAAAAAATATATTGGGATTCAACTAAATGGGAATTAAAAGTTGCTGGTTATCAATTACAATCAAAGGTAGGTACTGATGATTGGAAAAATGATAGTACAAGTATTACTGGTGTTAAATATACTTGGGTAGGAACAGATAGTAATAAAAATAACACAGCAACAGTTAATGTTTCATCTGTAACTCCAGGAACTAGTATGGATAACCTAGGCTTAGGTAAAATTATTTCTGTTACAGTAAGTTCAGCAGAAGGATATTCTGGTACTGTAGAATTTAACTTATATAGATTTGGACAAGATTATGGAGGTTATTTAGCCACTCCATTTTTATCTGATGGACATGTGTATGTAGGATCAACTCCGACAAAACGTAGTAGTACTTCAACAGAATATCCTGATAGCCTTCCAGCAATATTAACATTTAGTAGTAGAAAAAAAAGTGGATCAGGTTCATTAAGTGTCTCTGGTAATAAAGATTTTAAATCTACTACATTAGATATAGGTACATATACACAAGATTCTGCATCATTAACATGGACAACTATCAAATTGGATAATGTAACTGTTGGAGCAGAAGAAGGTACACATGATGTTACACCAACAAATAGTCCAAATTATACTGCAGGTTCAGATGGTAAATTTACTATATCTGTTTCAACTTCATGGAATGTTCCTGATGTTGATAGTCCATATACAGATACTTCTGATCCTACATTTAATGGACAATCTACATTTGATGTTGAGGTACCAGGAGAAAAATTAGATGTTAATGATTATTATAAATGGTCATTTACTCCTGATAAAGGAGTAACTGGAGTAACATTAAGTAATAACACTAAGAGAACTGTAAAAATAAATTATCCTAATAATCCTAAACCAAGAGGAGAAAATATTACTGATGAATTTAATGAGTGGATATGGACAAAGGATTCTTACATTTTAACAAAAGAAATAAAAGAAAATAAAGATAAAGTAGGATTTTATAAAGTTATTGGAGGTGTAACTGGAGCTCAAGATAGTAGACCATTAGGTACTTTAAAATTAGATTATACAAAGACTGGTACTAGTGCTACTACTAAGGTCACTCAAAATGGTAAAACTGCAGGTGAACAGACTAATTCAGCAACATTTAAAGTATCAAATCAAATAAATTGTAGTTGTTTAGTAGATACATCAATATCAGCAACCGGAAATAATGAAGATATAGCATATATCACAAAGTTTACTACTGCTGGAGTAAAATGGAATAAAGCTTCTTTAAATATAAAAGAAGGAACATTTACAAAATACGGTGAAAATTATGATAAATGTAGTAGTACTACCACAATAGATAAACCTATCAAATGTACAATAGGTTGTACAGAAAATACAGAAAATAATATTACTGTAGTTGCTATTCCTTCTGCCATAATTGATAGATTAAAGATGAATGGAATATCTTCTAATAGTAGTAAGACTGTTGTTGGTCCAGCAAGTAATAAAATGGTTAAACCTAAAAAACGAACAATTAAATATATTTGGAAATTAGATGGTGAATCTTATGGTGAAACCACTAACACAATAGAAGTTACAACTACACCTTCAACAACAGGTACTAGAACATTTGCATTAGATGAATGTACTGTTACAGATGAATATGAAAATAATTCTACATATCCAGAAATTTCAGGACAAACATTCATTACAAGATACCAGTTAGGATATGAATGGAAATTTGTAGTTACTACGGGTACTGGTTATCAATATAGTGTTGTTATATATTCTACCAAAACACAAACACAAGCAGAAACAATTGAGCACTTATATTGGGCTGAAAATGCATCAACATTTAATTTAAATGTATATGTTAGATGTTGGTATAGAACAACAGAAAATGGTAGTGATTATAATAATTGGATAGAAATTGATGACCCTAAAGTAACATATTCATGGAAAGATAATGGCAATATTATAACAGAAGCAAATGGAAATAATACAAAAGTTGATTTAGAACCAGGTAAAGGGTATAATAATTCTAAAGATAAAATAGTTACATGTACAGCAACTTATAAAGAAACATATCATTCAACTTGTACATTTACTCTTAAACATTATGGGCAAACATATTTAAATACCGTGGATGATCTTTCTTTAGTAAATGATTATAATGTATTTATTACGATGATACCTGCTAAATTAAGTAACAAAACTCCTTTATATCCTAAAACTTTGCCAGGTACTATAAAATTTACATCAGAGAAACTTAATAGTATTATAGATAATGGAAATGGTACATTAAATTTATATGATGAACTTATAGATATAAATGATTGTAAATCGGGTAATACATCTATTAAAACAGGTATTCTTATAGGAAAAGTTACTTTAGATAATGGTGTTTTAACATGGGATAATATAACATTAAATACTATAGATGATAAGATAATGGTAAGTGCTTCTGGAGGTAATGAACCAATATCAGCTTCGGATGAACCTAAGTATGAACCAGGAAAGGACACATTCTTTAAGATTAATGTTGATACAAAATGGAATATTCCCATTGAAGATACCCCTTATACCAATGCTGCATCTACTAGATTTGATCCTAAAGTTTCAACTCCGGACTTGACAAAACCTTCAACATCTTTAACTTATACATATTTTAAAATACCAGCTGGAAAACTTGATGTTGATAATTATTATAGTTGGTCTTTTGAACCTTCTGAAGGAATTGATGAAACAAAAGTATATCTAGATTCTAAAACTATAAAGAGCAAAATTTGTCATTTAATTTATGATAAGAATGAAGGTGAATCTGGTTCAATTATAACACCTGGTGTGAATAATTGGACTGGTAATAAATTGGTTAAATTATTAAAAGAAATAGATGATAAGTCTAATGATACTACTAATTATTCTAAGAAATTAGAATTCTATACAGTAACAGGAGGAGTAAGTACAGGTATTAAAGAAAGACCATTAGGAACTATAAAATTAGAATACACTTACAATAAAAATACTGCTAGTGCACCTGTAGTGCAACAAGGAACACCGAATGGTAAAGGTACACAATCAGCAGAATTTGAAATAACCAAAACATTTAATTGTGCAAACCTAGTTATTGATAAATCTATATCTTCTGAAGGAGCAAAAATACAATCAGCATATATCACAAAGTTTACTAGAATTAAAAAGTATGAGAATACAACTATTAATGTCCATGAAGATAATTTTAAAACTGATAGTACAAATTATGATAAATGTAAAAGTGTTACTAGTATAAGTAAACCTATAAAATGTACAATAGGTGCTACTGAAGATCGTACCGGAATAAAGGTTGTTAGTCCTTTTTCAGCAATAATTAAATTAAGCAAGAAAAATGGTAAACCAGTACAGAATAATACTAAAGTATTTATAGGGCCTTCTTTTATTGAAAATTTACCTTCAAATGCAATAATAAAATACAATTGGTTATGTGATGGTAAAAAGTATGATAAAACTACTAAAACAATAGAAGTTACAACCACTCCTGATGTAATTGGTATTAGAACGTTTAAATTAGATAGTGTAGATATATCTACTACAATAGAAAACCATGAAATAAATAAAAAATATGAATTAAAAGATTATGAGTGGACATTTGAAGTAACATCTATGACTGCTATATATAATCTTTATGTTTATTGTGGTACAAATGTTAATGAAACAAATACAACACAAACTATTGAACATACATACTTTGATACAAATGCTTCAACATTTGATTTAAGTGTACATATTGTTTGTGAAATGGCCACTTCAACTGATGGTGTTAATTTTGGTGATTTTATTGTAATTGATGATCCAGGTGTAACATATAATTGGGATTATGGTAATAGTACAACAAGTACAAATAAAGTTACAGTATCTGCTGGTAAAAATGCAACTGACGGTAATACTACTGATGTTACATGTACTATCTCTTATGGAGGATCAACTGCTAGTTGTACATTTACCCTTAAAAATTATGGAGCAACAGTTGATTTTACTGGTACTTTAACATGTAGTGATGATAAGACAATAACTGCATTTGATCCACAAACCTATGATACTACAGCTTCTATTTCTGATTATAAAGTTACTGCTACTTCTGGTACATCAACAAAGGATTGGACCAAAACTTATAATTATACATTAAATGCAACCAAACATACATTAACTGCAGTACAAGGTACTGATGCTTCTACACTTGGTACTTCATCTTATGAATATACATTTGTATGTCCTATTGATAAGATTCCAAAGAATATACATATTGGTACTGATGCTTCTACTAGTCATACAGTTAACTTATATTGTTATGGTAAATCTTATTATAATCAATAA
PROTEIN sequence
Length: 2626
MADYGNYFTSNSGNYNYNTRGHSFDDSDWVIVELANSGNVSQPIPHPNGAEFTGNNTTCYFYTTNHMTSPNREVKTGNDYVAYFNWATANKNTIGSVYGDFNFYPFGSKTDSRFVEPTGLDDTKHGVSPYSNSNNNVISRTNLSVKGTTFTAGYRRHKIQYEPSIKYDLTSYNYGTNDNYKSDGKTKATGGRVVTEKYDAFQTFYNIADPYGELYISISNHDDAKSSSPTFCTLTNNKSEYRINHSYTYNPYKNSATWNNTNYLSFTYNTLPTYPKRLVFEYDDNYNSVSYDGGSVNVEAKAWYDGKYDRFTTSTANDDGFSSYKRYVDVTYSLMINKSSTMPTGTNAYTFRIWQPGSKLGISYAWSIDSNPSWAHLSTTSGNTTKVTFDDQGDDKPSVGGTLSLSLNNTSISNGGSTTGSVTGVSWTPPTNRSARSCTLRQNMTVTNCCAQNITPKDIKGQPYQALTLTQHGMHWNNPSFNMKWKVTQGSKTTTTYNDGYGHGWPTVSIGGISTSDGTEKTTGWNYNASSKSVSVIMPTISRPWVNTYSGGKVTITKGSNDAVSYKGGDVTIKLHPDITFRQGFTSGVSERTWTISNTANTPTNQEYWTLKEFKSVDIKLPAIGAANHAFGNATLSWKDTGTQDLTFSKASKTWNNDNTDDSFTATLASNPPIIGNWYASASDGTLTFTSTTKNSSATSGTISFSGSTYQDGVLTPSPSTITISQNGTNISGTITIKGTGEGINSCDGSTKYPVDGKSTSANYSLKSAKQLYVTGQKNLTPGVNYTTIPWYGATIIISKSSGTVETESATSKKQDYSISVSSNIISSKPANPANGIVLSGSVQPNPANYKYQYKVDTGSWSDSTTKYIQSNDATWDRDCSLDLKSSDEWTDVNEGIYKYTSGYYKTADPINHTIKIRVVDINNSSITYEGNSITVPQNGQEGWHDEIAYTFVTSGVNCTTSKPVGPADKSYNESIDYGAFTVSNITSPDPNPSGDTGSSENISTYIYNYSDKLSEGNFPTTVPTATFEGSSQEFKYNVPVSTYLGVKSISALTVNYKHTGKKTWNYMYGFSIHPESPDGWIGDTQTTTKSSSGSVGPLVDTTYTAKMAVVEGTDTKNWQSLDTTGESTVHITKPGTYVIYVAWFNGDNKYNELNSSTITITSQQKQFRIKITLEAYTSKKIYWDSTKWELKVAGYQLQSKVGTDDWKNDSTSITGVKYTWVGTDSNKNNTATVNVSSVTPGTSMDNLGLGKIISVTVSSAEGYSGTVEFNLYRFGQDYGGYLATPFLSDGHVYVGSTPTKRSSTSTEYPDSLPAILTFSSRKKSGSGSLSVSGNKDFKSTTLDIGTYTQDSASLTWTTIKLDNVTVGAEEGTHDVTPTNSPNYTAGSDGKFTISVSTSWNVPDVDSPYTDTSDPTFNGQSTFDVEVPGEKLDVNDYYKWSFTPDKGVTGVTLSNNTKRTVKINYPNNPKPRGENITDEFNEWIWTKDSYILTKEIKENKDKVGFYKVIGGVTGAQDSRPLGTLKLDYTKTGTSATTKVTQNGKTAGEQTNSATFKVSNQINCSCLVDTSISATGNNEDIAYITKFTTAGVKWNKASLNIKEGTFTKYGENYDKCSSTTTIDKPIKCTIGCTENTENNITVVAIPSAIIDRLKMNGISSNSSKTVVGPASNKMVKPKKRTIKYIWKLDGESYGETTNTIEVTTTPSTTGTRTFALDECTVTDEYENNSTYPEISGQTFITRYQLGYEWKFVVTTGTGYQYSVVIYSTKTQTQAETIEHLYWAENASTFNLNVYVRCWYRTTENGSDYNNWIEIDDPKVTYSWKDNGNIITEANGNNTKVDLEPGKGYNNSKDKIVTCTATYKETYHSTCTFTLKHYGQTYLNTVDDLSLVNDYNVFITMIPAKLSNKTPLYPKTLPGTIKFTSEKLNSIIDNGNGTLNLYDELIDINDCKSGNTSIKTGILIGKVTLDNGVLTWDNITLNTIDDKIMVSASGGNEPISASDEPKYEPGKDTFFKINVDTKWNIPIEDTPYTNAASTRFDPKVSTPDLTKPSTSLTYTYFKIPAGKLDVDNYYSWSFEPSEGIDETKVYLDSKTIKSKICHLIYDKNEGESGSIITPGVNNWTGNKLVKLLKEIDDKSNDTTNYSKKLEFYTVTGGVSTGIKERPLGTIKLEYTYNKNTASAPVVQQGTPNGKGTQSAEFEITKTFNCANLVIDKSISSEGAKIQSAYITKFTRIKKYENTTINVHEDNFKTDSTNYDKCKSVTSISKPIKCTIGATEDRTGIKVVSPFSAIIKLSKKNGKPVQNNTKVFIGPSFIENLPSNAIIKYNWLCDGKKYDKTTKTIEVTTTPDVIGIRTFKLDSVDISTTIENHEINKKYELKDYEWTFEVTSMTAIYNLYVYCGTNVNETNTTQTIEHTYFDTNASTFDLSVHIVCEMATSTDGVNFGDFIVIDDPGVTYNWDYGNSTTSTNKVTVSAGKNATDGNTTDVTCTISYGGSTASCTFTLKNYGATVDFTGTLTCSDDKTITAFDPQTYDTTASISDYKVTATSGTSTKDWTKTYNYTLNATKHTLTAVQGTDASTLGTSSYEYTFVCPIDKIPKNIHIGTDASTSHTVNLYCYGKSYYNQ*