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FFSP_09252017_12_scaffold_1828_13

Organism: FFSP_09252017_12_Sphingobacteria_36_66

partial RP 32 / 55 MC: 2 BSCG 35 / 51 MC: 3 ASCG 9 / 38
Location: 14469..18749

Top 3 Functional Annotations

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Value Algorithm Source
Cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcA n=1 Tax=Arcticibacter svalbardensis MN12-7 RepID=R9GX07_9SPHI similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 57.5
  • Coverage: 1465.0
  • Bit_score: 1624
  • Evalue 0.0
Acriflavine resistance protein B {ECO:0000313|EMBL:ETZ23188.1}; TaxID=509635 species="Bacteria; Bacteroidetes; Sphingobacteriia; Sphingobacteriales; Sphingobacteriaceae; Pedobacter.;" source="Pedobacter sp. V48.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 62.7
  • Coverage: 1477.0
  • Bit_score: 1739
  • Evalue 0.0
heavy metal efflux pump similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 57.6
  • Coverage: 1466.0
  • Bit_score: 1586
  • Evalue 0.0

Lists

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Notes

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Taxonomy

Pedobacter sp. V48 → Pedobacter → Sphingobacteriales → Sphingobacteriia → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 4281
ATGCTTAATAAAATCATTCAATTCTCCATAAAAAATAAATTGGTCATTGGTCTTTTTACACTTGCATTAATAATATGGGGTGTTTATTCGGCAAATAAATTGCCGATTGATGCCGTTCCTGATATTACCAATAACCAGGTACAGGTAATTACACTGAGCCCATCATTGGCGGCACAGGAAGTAGAACAACTCATTTCATTCCCGGTGGAACAAACAATGGCCACTATTCCGGAAGTACAGGAAATTCGTTCCATATCCAGATTTGGATTATCAGTTGTTACAGTTGTATTTCATGATGATGCAAATATTTATTGGGCCCGTCAGCAAGTAGGTGAGCGGTTGATAGAAGCACGCAACCAAATACCCAATAACATCGGTAATCCTGAGATGGCTCCTATTTCTACGGGGTTAGGTGAAATTTATCAATATGTTTTACATGCAAAAAAAGGGTATGAAAATAAATATGATGCCATGTCGCTTCGGACGATACAGGATTGGATAGTTCGTCGTCAATTACTTGGCACACCCGGCATTGCTGATGTAAGCAGTTTTGGTGGTCTTTTAAAGCAATATGAAATCGCATTGAATATTGATAAGCTTCGCAGTTACAATCTATCCATCGCAGATGTATTTAATGCGCTTGAAAAGAATAACCAGAATACGGGCGGTGCCTATATAGATAAAAAGCCCAATGCTTATTTTATCCGCAGCGAAGGCTTCATTAAAACAATCAATGACATTGACAAAATTGTGGTTACAAGAACTTCCGGTGGTGCACCCGTGCTGGTAAGGGATATTGCAATAGTACAGCTGGGCCATGCCACGCAATACGGGGCATTAACCCGTAATGCAGAAGGCGAAGTAGTTGGTGGAATTGTTTTGATGCTAAAAGGAGCAAATTCCAGTATTGTAATTAACAGTGTAAAAGATAAAATTTTACAGATCCAGAAAAGCTTGCCAGAAGGTGTGGTCATTGAACCCTTTCTTGACAGAAGTGCTTTAGTTAGCAGGGCGATAGGAACTGTAAAAACTAATCTTATTGAAGGTGCGTTAATTGTCATCTTTGTACTGGTGGTTTTTCTTGGCAATATCCGTTCTGGGTTAATAGTGGCTTCCGTCATTCCGCTTGCCATGCTTTTCGCTATTTCGTTGATGAACCTGTTTGGTGTTTCTGGTAACCTGATGAGTTTAGGTGCCATTGATTTTGGTTTGATTGTGGACGGAGCCGTGATTATCGTGGAAGCAACCATGCATCAGTTAGGCCTGCGAAAGGCCGGAAGAATGACGCAAGACCAATTGAATGATGAAGTATATAAATCAGCAGGTAAAATGATGAACTCGGCTGCATTCGGACAAATCATTATCCTGATTGTCTACCTGCCTATTCTTGCGCTGGTTGGTATCGAAGGAAAAATGTTCGGCCCAATGGCACAAACAGTTTCGTTCGCCATACTGGGTGCATTCCTGCTTTCACTTACTTATGTACCCATGATGAGTGCCCTTGTATTAAGTAAGAAAGTCAGCCACAAGGAAAATATTTCAGATAAAATGATGAAGTTTTTCCAACGACTTTATACGCCATTAATACGTGGTGCATTAAAGATGAAATTATTAGTGGTGAGCATTGCTGTGGGAGTATTTGTCATCAGCCTTGTCATTTTTAAAACATTAGGTGGTGAATTTATTCCCACGTTGGAAGAAGGAGATTTTGCCGTAGAAACAAGGTTACTTACTGGTAGTTCGTTAAGCCAAACAATCGAAAAAATAACACAGGCCTCCGATTTACTGTTGAAAAAATTTCCTGAAGTTAAAGAAGTGATCGGAAAGATTGGCGCTTCTGAGATACCAACCGATCCTATGCCTATAGAAGCATGTGATATTACCATTCTTTTAAAAGATAAAAAGGAATGGACCAGTGCACATAACCGGGAAGAACTGGCAGAATTGATGCAAAAGGAGCTGGAGAAAATTCCCGGTGTTTCCTATGGGTTATCACAGCCTATACAACTTCGGTTTAACGAACTGATTTCAGGTGTTCGGCAGGATGTGGGGATTAAAATATTTGGAGAAGACCTAGATGTACTGGCAGATCTGGCAAAAAAAATTGGTGTGATTGTACCCACGGTAAAAGGTGCAGAAGATTTATATGTAGAACAGGTGACTGGTCTGCCGCAAATTATGGTTAAACTAAACCGGGATAAGATTGCGCAATTTGGTTTAAATGTAGAAGATATAAACCGTACCATCAGCGCTGCTTTTGCAGGTGAAGCCGCAGGTATTGTTTATGAAGGCGACCAGGTTCCGTTGGAGCAGGTAGCCGATGTCAATATGGAGTTAGGTCCTAACCAGATACAACGTGAAGATGCTAAGCGAAGAATCATTGTTGGCTTTAATACAAGAGGCCGGGACATCTCATCGGTTGTAAAAGAAATCCAGGAAAAAATTGATAAACAGGTAAAAATGCCCCCCGGATATTTTATTACTTATGGCGGACAGTTTAAAAATCTTGAAGAGGCCAATAAGCGATTATCAGTGGCTGTACCAGTAGCATTAGCGCTGATACTCTTATTGCTCTATTTCACCTTTGGGTCAATTAAATATTCCCTGCTCATATTTACAGCTATACCGATGAGTGCTATCGGTGGTGTATTTGCCTTATGGTTAAGGGGAATGCCATTTAGTATTTCGGCTGGCGTTGGTTTTATAGCCTTGTTTGGTGTGGCAGTATTAAATGGTATTGTATTGATCAGCGAATTTAATCGATTAAAAAAGGAAGGTATGACAGATATAAATGCAATCATCTTAAAAGGAACTTCTGTAAGGTTGCGACCTGTATTAATGACTGCAACGGTTGCTTCTTTGGGCTTTTTGCCAATGGCATTGTCAACAGGTTCCGGAGCAGAAGTACAAAAGCCCTTGGCGACGGTTGTAATTGGTGGGTTGATTACGGCCACATTTCTAACACTGGTTGTTTTGCCTGTATTATATACATGGTTTGAGAAGATAAAACCCAAAACGATGAAACCTGATGTGACGAAAGGGTTGGTTTCATTACTCATCCTGTTTTTAGCTTCATCCTTTACTGCAAATGCGCAACAGCGAAAGATAGTTATCAATCTTAATGATGCTGTTGCGTCAGCTATGAAGAATAACCCCTTGGTTAAAGTGGGAGCGCTGGATATAAGTTACCAGCAGCAGTTGAAGAAGACTGTGAAAGATTATGGCAAAACAAATGTAGGACTCACATTTGGGCAGTATAACAGTCGTATAGCATATGATAATAATTTCAGCATTACCCAGGGTATACAGAATCCAGGGTACTTTAAAAGTCTCATAAAGCTATCTGAGTCAAATATTAAAAGCAGTGAACTGCAATTGAAGGTTTATCAAACTGAACTTGCTGCGAATACAAAAATATCGTACTACCAGTTAAGTTTTTGGATGGAGGAAATAAGGTTGTTGAAGGAACTGCTATCCATTTATGAAAACATATTGAAAGCTTCTGCATTGCGATATAAAACGGGTGAAACAAATGCATTAGAAAATTACAATGCTGAAAGCAAGGTGAATGAGATAAGGGCTCAATTGCGAAGTACAGAAGAGGATTACCGCATTGAATTAAACCGCCTGAAAGTGTTCACCGCAGATTCTTCTGTTACGTCAACTGCCGACACTTTACTTGTTGAAAAGCAGATACAGGTAAATTTTGATACCGCTGCTATTGCTGGTAACCCGACACTTGCCTTTATTAAACAGCAGATTGATATTGCAAACAAAGAGAAAACTGTTGAGCAATCAAGATTAAAACCAGATTTCTCGGTAGGCTATTTCAATCAATCTTTAGTAGGGTATCAAACTGTGAATGGAGTTGATAAATATTATGGCGTTGGCAGTCGTTTCCAAGGTGTTAATTTGGGTGTCAGCATTCCCATATTTGCCAGGGCACAAAAAGAAAAAATAAAAGCGGCAGAAGTAAACCGGGAGCGTCGTGAAGCAGAACTGACCAATTATCAATTCACCCTGCAAGGTGAATTAGCAAGACTGTTTGGCGAATTGCAAAAACAAAAAGTTCAAATCAACTATTACCGAAATACCGCTTTGCCACAGACCAATCTCATCATTACACAGGCACAAAGAGCTTTTACTACCGGCGAAATCGGTTATTATGAATTGACACAATCACTCAATAATGCCGTTGTTGTAAAACAGGGATACACCAAACTTTTAAATCAATATAATCAAACCGTCATTGCCATCGAATTTATCGGCGGCATCAATTAA
PROTEIN sequence
Length: 1427
MLNKIIQFSIKNKLVIGLFTLALIIWGVYSANKLPIDAVPDITNNQVQVITLSPSLAAQEVEQLISFPVEQTMATIPEVQEIRSISRFGLSVVTVVFHDDANIYWARQQVGERLIEARNQIPNNIGNPEMAPISTGLGEIYQYVLHAKKGYENKYDAMSLRTIQDWIVRRQLLGTPGIADVSSFGGLLKQYEIALNIDKLRSYNLSIADVFNALEKNNQNTGGAYIDKKPNAYFIRSEGFIKTINDIDKIVVTRTSGGAPVLVRDIAIVQLGHATQYGALTRNAEGEVVGGIVLMLKGANSSIVINSVKDKILQIQKSLPEGVVIEPFLDRSALVSRAIGTVKTNLIEGALIVIFVLVVFLGNIRSGLIVASVIPLAMLFAISLMNLFGVSGNLMSLGAIDFGLIVDGAVIIVEATMHQLGLRKAGRMTQDQLNDEVYKSAGKMMNSAAFGQIIILIVYLPILALVGIEGKMFGPMAQTVSFAILGAFLLSLTYVPMMSALVLSKKVSHKENISDKMMKFFQRLYTPLIRGALKMKLLVVSIAVGVFVISLVIFKTLGGEFIPTLEEGDFAVETRLLTGSSLSQTIEKITQASDLLLKKFPEVKEVIGKIGASEIPTDPMPIEACDITILLKDKKEWTSAHNREELAELMQKELEKIPGVSYGLSQPIQLRFNELISGVRQDVGIKIFGEDLDVLADLAKKIGVIVPTVKGAEDLYVEQVTGLPQIMVKLNRDKIAQFGLNVEDINRTISAAFAGEAAGIVYEGDQVPLEQVADVNMELGPNQIQREDAKRRIIVGFNTRGRDISSVVKEIQEKIDKQVKMPPGYFITYGGQFKNLEEANKRLSVAVPVALALILLLLYFTFGSIKYSLLIFTAIPMSAIGGVFALWLRGMPFSISAGVGFIALFGVAVLNGIVLISEFNRLKKEGMTDINAIILKGTSVRLRPVLMTATVASLGFLPMALSTGSGAEVQKPLATVVIGGLITATFLTLVVLPVLYTWFEKIKPKTMKPDVTKGLVSLLILFLASSFTANAQQRKIVINLNDAVASAMKNNPLVKVGALDISYQQQLKKTVKDYGKTNVGLTFGQYNSRIAYDNNFSITQGIQNPGYFKSLIKLSESNIKSSELQLKVYQTELAANTKISYYQLSFWMEEIRLLKELLSIYENILKASALRYKTGETNALENYNAESKVNEIRAQLRSTEEDYRIELNRLKVFTADSSVTSTADTLLVEKQIQVNFDTAAIAGNPTLAFIKQQIDIANKEKTVEQSRLKPDFSVGYFNQSLVGYQTVNGVDKYYGVGSRFQGVNLGVSIPIFARAQKEKIKAAEVNRERREAELTNYQFTLQGELARLFGELQKQKVQINYYRNTALPQTNLIITQAQRAFTTGEIGYYELTQSLNNAVVVKQGYTKLLNQYNQTVIAIEFIGGIN*