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RTP_11222018_0_1um_scaffold_2767_3

Organism: RTP_11222018_0_1um_Betaproteobacteria_47_59

near complete RP 50 / 55 BSCG 51 / 51 MC: 2 ASCG 14 / 38 MC: 1
Location: 526..6588

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
galactose oxidase n=1 Tax=Ideonella sp. B508-1 RepID=UPI0003B55448 similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 57.8
  • Coverage: 796.0
  • Bit_score: 880
  • Evalue 2.80e-252
Cytochrome c peroxidase {ECO:0000313|EMBL:EUJ10021.1}; TaxID=1101195 species="Bacteria; Proteobacteria; Betaproteobacteria; Methylophilales; Methylophilaceae.;" source="Methylophilaceae bacterium 11.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 50.6
  • Coverage: 1921.0
  • Bit_score: 1782
  • Evalue 0.0
hypothetical protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 47.8
  • Coverage: 615.0
  • Bit_score: 577
  • Evalue 8.40e-162

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Methylophilaceae bacterium 11 → Methylophilales → Betaproteobacteria → Proteobacteria → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 6063
ATGAAGGTTAGTCTAGCTAAGCGGGTAAATGGGGATGGTTTTTACTTTGATGGCGTGCAAGGGCTTGTTTCTTTACGATTACGTAAAGTTGTAGCTAAGGTATTAATTGGTGCAATGCTGGTGTTGGATATGCCTGTCATTCCACTGGCTAGTGCCGATACTACAGGAACATGGGTTACCGTGCCTATTAGCGCTGACCCGATGATGCAGAACCTCACAATTCCTGCTGATGCAGCTACTAAAGGTATGTGGTCTGCAGTGCAGTCTTGGCCATTGAATGGATTGCATACTGCGTTGTTACCTGATGGTAGAGTGCTTTCTTATGGTACGAGTCCAGATGGTACTAATCAAACTGGTAAGTATTGGGATATTTGGGATTCCACATTAGGGTTTACTGCGGCTAGCCATAAAACCTATTACAGCTCAGCCAAAGAAGATAGTTTCTGTTCAACATCTACTTTCTTTAGTGATGGTAGGCTTCTAATTTCTGGGGGAAATGGGGCAACCACTAGCACTATTTATACTCCTTCGACGAATACTGTTGTCACTCCATCCTATAATTTAGCCTTGCAGCGCTGGTATGCCACTATGATTAGCTTGCCAGATGGTCGGCCTATTATGATGGGTGGGATGGTGCCTTACCAGGAAGCCATGCAAAACAATCCCGACCAAGCTATTGCGCAGGGCACTGTTTCAATGACACCAGAAGTTTTGGAAACAACGGGTTGGCGTTCATTATTCGGCGCGTATAGCCGTCTTGCTTTTGGCCCCGATTACTTACGTACGTCTTATCCTAAGGCATTTGTTGCTCCGAATGGTTTGGTTTTTGGTATTTCCGCTGAGCAAATGTGGTACTTAGATCCCGCTAGCAACGGGACAATCACTAGTATGGGAACGTTCAAAGGAGCGCCGAGTGCAACTAACCTAGTAAACGTTGGTACTACAAACAATGCAGTGATGTATGCGCCAGGGAAAATTGTGGTATTGGGCGGTAATGGCGGTGCTCAAGGGGACCCTTATCCAGGTAGTAAAATGGTGACGTCTATTGATATTAATGGCGGCACGCCTGTTTTGACGGAGCAGCAGCCCTTACATTATGGTAGACGCTACCCTAGCTCTATTGTATTGGCTAATGGCGAAGTCGTGGTCACGGGGGGCAGTGCATTTAGTGATACTAATGGCGCTAATGCAGTCTATGTCTCGGAAATATGGAATCCAAGCACTGGAGTCTGGCGAGATGGTGCCAGTGCAGCGATATATCGTGGCTATCATTCAATTTCAACTTTAATGCCCAATGGCACAATTTTATCAACGGGTGGAGGTACACCTGGCCCTGTCATTAACTTAAATGCTGAAATTTATTATCCACCGTATTTGTTTAAGAGCGTAAGTGGCGCCTCAACGCTTGCACCACGCCCTGTAATACAAGCGATTAACTCCCTGTCATATGCAAATGGAGATACTGTTCAGTTGGACATGACGTCGAATGCTACAGTTTCTCAGCTAGTGTTAGTTGGCGCTAGTCGAGGTACACATGCCTTTAACGCTGGGCAGCGTCGAATTCCATTGACGTTTACACAACAAGATATTCGATTATCGGCCACAATCCCAGATGTTAATACTGTTCCACCAGGTTATTACCAAGTAGTAGCATTGGATGCAAATGGGGTTCCTTCTTTAGGGGCACTTGTTGGGATTGGCTCAAATGTTGCGCCACCTCCCGTACCAACTACTCCCTACACTCCACCAGACTTAAGCGGAATTATTCCTGCGCCCGTGGTGTCAACAGGGGGGGCTGTTAGCTATACTCTTCCAGCCATCGCTAATACGACCTATAGCTGGAATTTTGGGGATGGTACGGCGGCCACTGCTTATAGTGCAAGTCCAAGTATATCGTATACGTATACAAGCCCTGGGGTATACGGGGTCACACTTAGCGTTAAAGACGTTAATGGTATTATCACTGCTCGTAGTTTCCTGCAGGCAGTTGCCACTGGGAAGACTGCGCTAGCGCCAACCAACTCAACTTCGATACTTACTGAGTCACGTGGGAGTAATCCGTCCAGAATTTGGGTTGTCAATCCAGATAATGATTCTGTTGGCGTAATCGATAGCCTAAGTAACTCATCTATTGCGGAGATTGCTGTGGGCAAATCTCCTCGCAGTGTTGCTATTGCTCCTAATGGGAATATCTGGGTTACCAATAAAGGTGATTCGACTATCTCCGTGATTAGTCCAAGTACACTTGCTGTGGTTTCAACGATAGCGTTGCCACGTGCTACACAACCGCATGGTTTGGCATTTTCTCCAAATGGTAATGCAGCTTATGTTGTATTAGAGGCGACTGGACAACTGCTCAAATTAGACCCAAGCACAGGTGTGCAGGTGGGCAGCACTACTCTCGGCAATAATCCAAGACATCTATCCGTCAGTGCAAATGGGGCGACTGCTTTAGTTTCCCGTTTTATCACGCCGCCCTTACCAGGAGAATCAACGCTGACCGTTGATACCTCAACGGCAGGGGGTGAAGTGTTGGTGATTAATACAACGAGCATGGCAATTACTAAAACGGTCACGCTCAAACACAGTGACAAGGAAGACACCTCAACGCAGGGTGCGGGTATCCCCAATTACTTAGCCGCTGCTGTTATTTCTCCCGATGGCGGGACGGCATGGGTGCCCTCAAAACAAGATAATATCAAACGAGGCATGGCGCGTAGTGGTCAGGATCTTAATTTCCAAAATTCCGTGCGTGCTATTAGTTCGCGTATTGATCTAGGCACGTTAACTGAAGACTATGCAAAGCGAGTTGACCATGACAACTCTAGCCTAGGTAGCGCAGCGGTTTACCATGCGAGCGGAGACTATTTATTTGTCGCCTTGGAAACCAGTCGTCAAGTCGCTATAGTCGATGCGATTGGTGGGCATGAACTACTTAAGGTGAATGTAGGGATTGCGCCACAAGGGCTCGCCCTGTCTACTGATGGTAATACCTTATATGTTCAAAACTTTATGGATCGTACGGTTAGTGTCCTTGATCTTACCCCATTGACAACACAAGGTATTTTGAAAACCAACTTACTTGCCAATGTTAGCTCAATTACTACAGAAAAACTCCCAGCTGCTGTGCTGGCGGGTAAGCAACTATTTTATGATGCGAAAGATACGCGTTTGGCGCGAGATAGTTACATGAGCTGCGCTAGCTGCCATAGCGATGCAGGACATGATGGTCGAGTATGGGATTTCACAGGTTTTGGCGAGGGCTTGCGTAACACTATCGCGCTGAAGGGCCGAGCTGGTATGGGGCACGGCTTTGTACACTGGTCAGCCAACTTTGACGAAATACAAGACTTTGAGAAACAAATCCGTGTATTCGCAGGCGGGACAGGTTTAATGACCGATGCCCAGTTTAATACGGGGACGGTAAGTCAGCCACTGGGTACTCCCAAGGCAGGTATCAGCGTCGATTTAGATAACCTTGCGGCTTATGTTGGTTCATTGAATACTTTTGCGCAAAACCCGAATCGTAACTCTGATGGTAGTCTGACTGCTTCGGCGACAGCTGGTAAGACTGTATTTGCGAGTAGCTGTGCTAGCTGCCATGGCGGCACGGCATTGACCATCAGCAAAGATGCTACGACACTCAAGGACATTGGTACTATCAACGCTCTGAGTGGTCAACGTCTAGGTGCTACGCTCACAGGGTTGGATGTGCCTACACTACGAGATGCTTGGGCTACTGCGCCATATCTGCATAATGGTAGTGCGTCAACCATTACTGCCGCGGTACAAGCGCATAACAATGTTGCGCTAAATGTGACGGATCTTGCCAATGTTGTGGCCTATGTACAACAAATTGGTAGTGAAGAGGTTGGGTTTGGTAACTTGGTCAGCCTTTCTTCGCCAACTGTAAACGCAACCTATACTACGGCTGATAGTATTCCATTGGCTGCTAGTGCAACCGATACCAGTGGTACGATCACAAAGGTGGAGTTTTACGATGGCACAACTTTAATAAATACCACTACTACTTCTCCGTACACATATTCGTGGACAAGTAATACGCTAGGTAGTCATACGCTCACTGCTAAGTCATATAGCAGTACTGGCAGTGTTACTACTAGTGCGGCGGTCAATATCAGTATTAAACCAACGGCTGTTCCACCAGCAAATGCAACCGTGTGTGCCAATGAGCTCGGTACGTGTACCGTCCCAGCTGGTATAACCGCTACTGTCTGGTATGGTGCATATACCACTACAGGTTTTGATGGCGGTTGGCTATATCAGACAGGCGTTCAGGGGGCAGTCACTTGTAGCAACAGTACCTTTGGTTATGACCCTGCTAGTGGTCTAAACAAAACCTGTAGATACTTATCCAATAGTGTGATTGGTACAAATGTCGCACCAACGGTTGCGCTCACTGCCCCAGCAAATAATGCTAGCTATACTGTGGGTGATAGTATTGTCCTCACAGCAACTGCTACAGAGGTAGGTGGTACGGTTGCCAAAGTTGACTTCTACGATGGTACGACTTTACTCAACACTACTACAACCGCACCATATACATACACTTGGGCGGGCGCAGTTGTGGGTACGCATACGCTTACTGCAGTTGCTACTGATGCAGCAGGTGCTGTTGCAAATAGCAGTAAGGTAAGCGTGAAAGTGACCTCTGTTGGGGTCAGTCCAGTACCAACCGCCAACTCTGTCTACTGTGCAGGTGAGTTTGGAACTTGTACATTGCCTGCTGGCGTTACCGCAACAGTCTGGTTTGGTGCAAACTCAAGCTGGAACTTTAAAGAGGCCGTAGTTAATAGCGCAGATTGTAGCGCTTCATCTTTTGGCGGAGATCCTGCACCTGGGCAGGCTAAAACCTGTAGATATCTCTCTAATGCTGTAACTGGTACCAATGCTGCACCAACGGTCAGCCTCACAGCACCAATTAGTGGGGCAAGCTACACCGCAGGCGGCAGTATTAGCCTTACAGCTACAGCAGCAGA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PROTEIN sequence
Length: 2021
MKVSLAKRVNGDGFYFDGVQGLVSLRLRKVVAKVLIGAMLVLDMPVIPLASADTTGTWVTVPISADPMMQNLTIPADAATKGMWSAVQSWPLNGLHTALLPDGRVLSYGTSPDGTNQTGKYWDIWDSTLGFTAASHKTYYSSAKEDSFCSTSTFFSDGRLLISGGNGATTSTIYTPSTNTVVTPSYNLALQRWYATMISLPDGRPIMMGGMVPYQEAMQNNPDQAIAQGTVSMTPEVLETTGWRSLFGAYSRLAFGPDYLRTSYPKAFVAPNGLVFGISAEQMWYLDPASNGTITSMGTFKGAPSATNLVNVGTTNNAVMYAPGKIVVLGGNGGAQGDPYPGSKMVTSIDINGGTPVLTEQQPLHYGRRYPSSIVLANGEVVVTGGSAFSDTNGANAVYVSEIWNPSTGVWRDGASAAIYRGYHSISTLMPNGTILSTGGGTPGPVINLNAEIYYPPYLFKSVSGASTLAPRPVIQAINSLSYANGDTVQLDMTSNATVSQLVLVGASRGTHAFNAGQRRIPLTFTQQDIRLSATIPDVNTVPPGYYQVVALDANGVPSLGALVGIGSNVAPPPVPTTPYTPPDLSGIIPAPVVSTGGAVSYTLPAIANTTYSWNFGDGTAATAYSASPSISYTYTSPGVYGVTLSVKDVNGIITARSFLQAVATGKTALAPTNSTSILTESRGSNPSRIWVVNPDNDSVGVIDSLSNSSIAEIAVGKSPRSVAIAPNGNIWVTNKGDSTISVISPSTLAVVSTIALPRATQPHGLAFSPNGNAAYVVLEATGQLLKLDPSTGVQVGSTTLGNNPRHLSVSANGATALVSRFITPPLPGESTLTVDTSTAGGEVLVINTTSMAITKTVTLKHSDKEDTSTQGAGIPNYLAAAVISPDGGTAWVPSKQDNIKRGMARSGQDLNFQNSVRAISSRIDLGTLTEDYAKRVDHDNSSLGSAAVYHASGDYLFVALETSRQVAIVDAIGGHELLKVNVGIAPQGLALSTDGNTLYVQNFMDRTVSVLDLTPLTTQGILKTNLLANVSSITTEKLPAAVLAGKQLFYDAKDTRLARDSYMSCASCHSDAGHDGRVWDFTGFGEGLRNTIALKGRAGMGHGFVHWSANFDEIQDFEKQIRVFAGGTGLMTDAQFNTGTVSQPLGTPKAGISVDLDNLAAYVGSLNTFAQNPNRNSDGSLTASATAGKTVFASSCASCHGGTALTISKDATTLKDIGTINALSGQRLGATLTGLDVPTLRDAWATAPYLHNGSASTITAAVQAHNNVALNVTDLANVVAYVQQIGSEEVGFGNLVSLSSPTVNATYTTADSIPLAASATDTSGTITKVEFYDGTTLINTTTTSPYTYSWTSNTLGSHTLTAKSYSSTGSVTTSAAVNISIKPTAVPPANATVCANELGTCTVPAGITATVWYGAYTTTGFDGGWLYQTGVQGAVTCSNSTFGYDPASGLNKTCRYLSNSVIGTNVAPTVALTAPANNASYTVGDSIVLTATATEVGGTVAKVDFYDGTTLLNTTTTAPYTYTWAGAVVGTHTLTAVATDAAGAVANSSKVSVKVTSVGVSPVPTANSVYCAGEFGTCTLPAGVTATVWFGANSSWNFKEAVVNSADCSASSFGGDPAPGQAKTCRYLSNAVTGTNAAPTVSLTAPISGASYTAGGSISLTATAADTDGTVAKVEFYDGATLLGTTTTAPYAYTWATASVGSHSLTAKATDNAGGTTTSAVATVTVTAVSGVSPTPPANATACSGEYGTCTLPAGATATVWYGANANWLYKTNVSNSLDCRNSTFGGDPAPSQTKTCMYLANTTSGNVAPTVSLTAPTANASYTSGISIAVTATAADSDGTVTKVDFYDGATLLGTSTTAPYAYTWNTASVGSHSITAKATDNSGAVTASGAIAITVTSSTGVSPTPPANATTCAGEYGTCTLPAGATATVWYGANTSWLYKTGVSNSLDCRNSTFGSDPAPGLTKSCMYLANSANVAPTVSLTAPAGGASFASGVSISLTATATDSDGTVTKVEFYDGA