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L3_079_029G1_scaffold_239_21

Organism: L3_079_029G1_public_UNK

megabin RP 52 / 55 MC: 52 BSCG 51 / 51 MC: 51 ASCG 16 / 38 MC: 16
Location: 24949..27765

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
cas3; Pre-mRNA-processing ATP-dependent RNA helicase PRP5 (EC:3.6.1.-) similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 34.5
  • Coverage: 820.0
  • Bit_score: 398
  • Evalue 4.20e-108
CRISPR-associated helicase cas3 n=1 Tax=Veillonella ratti ACS-216-V-Col6b RepID=K9DI22_9FIRM similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 99.9
  • Coverage: 938.0
  • Bit_score: 1864
  • Evalue 0.0
CRISPR-associated helicase cas3 {ECO:0000313|EMBL:EKU78427.1}; TaxID=883156 species="Bacteria; Firmicutes; Negativicutes; Selenomonadales; Veillonellaceae; Veillonella.;" source="Veillonella ratti ACS-216-V-Col6b.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 99.9
  • Coverage: 938.0
  • Bit_score: 1864
  • Evalue 0.0

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Veillonella ratti → Veillonella → Selenomonadales → Negativicutes → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 2817
ATGGGAGAATTAATTGCTCATATTGCTGATTTTTCAAATATTAATTTAAAAAAAGAACAATCCTTGTTTGAACATTTGAAAAATTGTGCTATTCATTCTCAAGAGTTGGCATCGGATATTGGAATTCCGACAATGTGTTTTTTAGTGGGATTATTGCATGATGCGGGGAAAAGTAGCGTAGCATTCCAAGAATATATTCGAGGTAATAATAAGGGGCATGTTATACATTCAAGTACGGGTGCACGTTATTTGCAAAAATTATTTAAAGAGTTGTGGGCAGGTAATCCGGAATATAGAGTAAAAGTAGATCAAAATGAACGCAGAAAGCGAAAGCTATATACTGAATTAATGCAATATGCCATATTAGCTCATCATGGGTTATTTGATATTCTCGAAAAAGATCAGTATAAATTTGGGCAGCGCCTGTTGTTGAATCCTAATATGGGTGAGTCTAAGGCTAATGAAACTATATTTTTTAAGGAATTAAATGATTGGTGTGCAGAAGAATTCAACCAAACTTTGAGTGAGATGTTTATTCAAGGATATGAAGAATTCTCTGTATGGAATGATAAAAAGCTAAAACTTTTAGAAAGCTATAATGATTCTAACAATAAGAATGATAAGGTTATAGCTCGAACATTTTATGAAGGGGCTATGGCTCGATTAATTTTAGCAATCTTGAAAGACGCTGACATTTTTGACTCGTCTAATTTTGGTCGTGAAATTATAGATAAGCGATATAATACAGATGAAATGAATGTTGTGTGGAGCCAGTTGAGTGAACGTATACAGCATTTCTATAGTCAATTTAAAGAACCGACAAATCGCTTAAATAAAGTTAGAGGATTATTGGCCGATGAAGTACTGGATAAAGCCAATCAATGTGCTAAAGGAAATTTTAAATTGGATATGCCGGTGGGATCCGGCAAAACCTATGCATCGTTACGTTTTGCTATTGAAAACGCAAAGGTTTTTCAGAAAAATAGAATTTATTATACCACGGCGTTTTTGTCGGTACTTGAACAGAATGCACAAGAGATTCAAGAGGTATTAACTGATAAGGGGCGGTATCCAGCATATGACGCATATATACTAGAGCATCATTCAAATGTAATTTCAGATAATATTGAACAAAATAACTTTAGTAATAATGGAGATATAGCGGATTATACGGAGTCAGAGGATTACGACTATGTAAACTACTTGCGAGAAAGCTGGGAGGTTCCGGTAATTTTAACTACGCTAGTTCAATTAAGCAACACTTTGTTTGCGGGGCGAGCGGCATCAATACGACGATTTTCTAAATTAATTAATTCTACGATTATTATTGATGAAATTCAAAGCTTACCGCCGGAAATAATTTATAATTTTAATTTGATGATGAATTTTTTAACCCATATGATGAAGGTTACTTTGGTGCACTGTACAGCGACGCCGCCAAGTTATGATCAAAAAACAGTATTAGCCTATCCTTGTATTTATGGTTTGTGTCCGATAAAGAAGGATTTAGTAGGGCATAAAAATGAGCAAGTACTTACAGAACTGACATCTAAGGAAAACAGTAAGGATGAAGTATTTTCAAGGGTTGTTTATAAAAGCCTATTAGGCGAAAATTGTCAGAAAATATTTGACACAGAAGAGTTAGCATCACATATTATAAGTCGATTAAACACGGAAAAAAGCATTTTAGTTGTTTTGAATACGAAAAAGGCTGTTATTACGCTGTATGATGCGCTCAAAAATTGTTTGGCTGATGAGGATATAGCACTATATAACATGACAACTAATCAGTGTGCAGCTCATCGTTTAGATTATATTAAGGCTATAAAGACACAATTGAAGGCCTTGCGTAAAGGTGAAGAAGGTACGCCGGTTATTTGTATTAGTACAAAACTTATTGAGGCCGGTGTAGATGTTGATTTTGATATTGTGTACCGTTCATTAATCGGTATTGATAGTATTATGCAGTCTGCTGGGCGTTGTAATCGAGAAGGAAAAAGGACTAAAAAGGGAATAGTCTACATTATGCGATACGGGGTGGAGGATTTAAGTAGACTACCTTTATTTAATGTGGCTCAAAAAGTGATATTAAATATGCTTTCCACCAACGTAGATCGGACGAATTGGAAATTTGATGAAGAAGATTCAAGCTATTTGATGGCAAATTCTATAAGCGAATTACTCGAACAATATTACAAGAGTCTCTATCAAACACTAATATTGCAGAACGTGGCATTTTTGCAATACCCTATAAAATTAAAAAACTGGAAACCAGAATTAAATACGACACTGCTGGATTTATTAAGTAAAAATAAAAAAATCCAAGAGGCGGCTGATCAAGGAATTGATACAATGAAGGCAACAATTGAAAATACACTTAGACGGAGTGGAATACCAGCAGGTATTGTAAATTCCGGAAGTAATAATCGCGGCACAAATAAACCGGATAATTCTAAGCGAAAAGGGAAAGGCGCTTTGATGCAAAGCTTTAAAACCGCAGGTGAAAACTTTCATTTGATTGATAATGATAATGTTACAGTTATTGTGCCGTATCAAAATGAAGAGTGTTCGCAATTGATGGAATTGCTATATGACCTGATTGAAAAAATTAAGGTGGAGAGGGCGATTGCAGATTATGGGCGATTAAAGCATTTATTGAAACGCCTGCAACGATATACGGTATCAATTAGAAAAGATTTAATCAAAGATTATAAAATTTCACTGGAATTAGACAAGCAAATTTGCATCTTGCAAAGTGAAGATTATGATATAGAAAAAGGGTTAATACATGGGGATATGAATGAACTCATATTCTAA
PROTEIN sequence
Length: 939
MGELIAHIADFSNINLKKEQSLFEHLKNCAIHSQELASDIGIPTMCFLVGLLHDAGKSSVAFQEYIRGNNKGHVIHSSTGARYLQKLFKELWAGNPEYRVKVDQNERRKRKLYTELMQYAILAHHGLFDILEKDQYKFGQRLLLNPNMGESKANETIFFKELNDWCAEEFNQTLSEMFIQGYEEFSVWNDKKLKLLESYNDSNNKNDKVIARTFYEGAMARLILAILKDADIFDSSNFGREIIDKRYNTDEMNVVWSQLSERIQHFYSQFKEPTNRLNKVRGLLADEVLDKANQCAKGNFKLDMPVGSGKTYASLRFAIENAKVFQKNRIYYTTAFLSVLEQNAQEIQEVLTDKGRYPAYDAYILEHHSNVISDNIEQNNFSNNGDIADYTESEDYDYVNYLRESWEVPVILTTLVQLSNTLFAGRAASIRRFSKLINSTIIIDEIQSLPPEIIYNFNLMMNFLTHMMKVTLVHCTATPPSYDQKTVLAYPCIYGLCPIKKDLVGHKNEQVLTELTSKENSKDEVFSRVVYKSLLGENCQKIFDTEELASHIISRLNTEKSILVVLNTKKAVITLYDALKNCLADEDIALYNMTTNQCAAHRLDYIKAIKTQLKALRKGEEGTPVICISTKLIEAGVDVDFDIVYRSLIGIDSIMQSAGRCNREGKRTKKGIVYIMRYGVEDLSRLPLFNVAQKVILNMLSTNVDRTNWKFDEEDSSYLMANSISELLEQYYKSLYQTLILQNVAFLQYPIKLKNWKPELNTTLLDLLSKNKKIQEAADQGIDTMKATIENTLRRSGIPAGIVNSGSNNRGTNKPDNSKRKGKGALMQSFKTAGENFHLIDNDNVTVIVPYQNEECSQLMELLYDLIEKIKVERAIADYGRLKHLLKRLQRYTVSIRKDLIKDYKISLELDKQICILQSEDYDIEKGLIHGDMNELIF*