ggKbase home page

You do not have permission to do that.

Please email help@ggkbase.berkeley.edu for help.

L3_082_090G1_scaffold_206_29

Organism: L3_082_090G1_public_UNK

megabin RP 52 / 55 MC: 52 BSCG 51 / 51 MC: 51 ASCG 18 / 38 MC: 15
Location: comp(33881..39136)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Uncharacterized protein n=1 Tax=Barnesiella intestinihominis YIT 11860 RepID=K0XBN9_9PORP similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 99.8
  • Coverage: 1751.0
  • Bit_score: 3507
  • Evalue 0.0
Uncharacterized protein {ECO:0000313|EMBL:EJZ65219.1}; TaxID=742726 species="Bacteria; Bacteroidetes; Bacteroidia; Bacteroidales; Porphyromonadaceae; Barnesiella.;" source="Barnesiella intestinihominis YIT 11860.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 99.8
  • Coverage: 1751.0
  • Bit_score: 3507
  • Evalue 0.0
hypothetical protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 25.9
  • Coverage: 796.0
  • Bit_score: 216
  • Evalue 5.60e-53

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Barnesiella intestinihominis → Barnesiella → Bacteroidales → Bacteroidia → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 5256
ATGAAGTTATCAAGTACTAAATTAAAGGTTTTTGGAGGTTGGATCGTTGTGCTTATGTGTATAATGGCTTTTTCTTCCAAAGTTTTAGGGTCGGAATCTATTCCGAAAGAACGTGAAAATTATCAATTTACAGAACGGAGTGTACCTCTTAAATCAGGTAAAGCGCAGGTTCGTAAATATAGAAAGCGCTCGTCTCGAAATCCAGTGGGAATTATTAATATCTCTAAGTTGCCGGCTCGTACTCGTGTTGCCAAAATTAATGCACAAAATTCACCGGCGAATTTGTTCGGCTTTTTGGCAGCTACTAATAGTTATGAAGAGAGGGATTATGGTATCTACTCGATTAATCCTAATACAGGAGATTATTCTAAACTGTATGACGTAGAGGAATATGGTGAAGGCGAAGGCGGTGGGACTTACGCTAATGGAAAATTCTATTTATCGGTTTTTGACGAGTTTTACTGGTCGGGTATCAATTCTGCAAAATTGGTAGTCGTAGATGTCGTGACGGGAGATAAACAAGTTATAGAAAAAGAGGCGGAATATCCTAATGCTGCGGTGAATATGACCTATGATCCGGTCAATGATGTCGTTTATTCAATTAATTATGATGAGGCCGGGGAGGCTTATACGTTGAGTAAATTGGACCTCCAAACATTGGATTTTACAGTTGTCGCTCCAATGGAAAATTCTTATCGGGGAATGTGTATCGATGGAGAAGGGCAAATGTATGTAATCGATGATTATGGCGATGTATATAAGTTTGATAAAGAGTCTGCCGTACAGGGGGAGAAAGTAGTGAGTACAGGTTTTTTCCCTGAATATTCTCAATCGTGTTGTTGGAGCCCTCTCGATCGTAAAATCTATTGGGCTGCTTGTAATTGGAGTGAGAGCGAGTTGATTGTAATAGATCCGGTCTCGAAAGAGTTTTATACGCAATTGGCTTTTGAAAATGGAGAGGAGTGGATTGGCTTGTACACGACAGATCCTTTTTCTGATCCTTCTGCTCCGGCTGCTGTTGAAAATTTGAGTATATCCTATGCGACTCCGGGTGCGACGACAGCCCGAATTTCGTGCGATCTTCCTACAAGGACTGCCGGTGGTAATGAACTGAAAGGATTGATAAATGTAGCCATAGTAGTCGATGGCGATACTGTCCAGATAAAGGAAAACCAAAGTCCCGGTGCGGAATTTTCTATATCTCTTGTATTAACGAATGGATTACATGTATTGAAAGTAATTTGTTTGAATAGTGGCGGAGAGGGGGTTGCAGCTTCGATAAAAACTTTTACCGGAGAAGATATGCCCCAAATTCCAACCGAAGTGACCGCTGTTGCCGAAGAATCTGGGAAGGTAACCCTTTCTTGGACATTACCCGAAGCCGGTATTAATGGAGGTTGGGTAAACTTGACAAAAGTTTCGTATGACATTCTTCGTAATGGAGAGTCGTTATCGACCGACATAAAAGAGACAACTTATATCGATAATCTTCCCGAGAATGAGTTAAAGTCTTACAAGTATACTGTAATCGTGAAGTTCGGCGGAGAAGAGTGTGGGTCGGTCGAGAGTAATTCGGTCGTTTTTGGGAAAGCCGTTTCGCTTCCTTATGAACAAACTTTCGAAGATGCATCGTCATTCGATTTGTTGAACATAATCGATAATAATGGCGATGGTGTGACTTGGCAATTCGATACGGGTCAATTTAGTGCGGGTTATACTTTCTCTGCCGATAATGCTGCTGATGATTATTTGGTATTGCCTAAAATGACTTTTAAAGCTTATAATGTTTATTCGCTTTCGTTCGATATTTGTTCAGGCTCGGGGTATAATGCAGAAATTATTGGTGTTAAAGTGGGAGCGGAGCCTTCCGTAGAAACGTTATCTACGATTGTTATGGAACCGACGGAAATTATGGCGGATGCGTCTTCTCCGAGACATATTGTACTTACCTACGTGCCAGAAGCGAACGGGCAAGGAAATTTTGCAATTCATTGTACAAGCGTTGCCGATCGTTTTGGAGTTAATGTAGATAATGTTCGTGTGGAAGAATTCGGAAGTATTTATGCTCCGAAAGGCGTAACCGATTTTGTGGTGACGGCAGATCAAACAGGATTACAGAAAGCTACAATGAGTTTTGTCGTTCCGAAAGAAAATTATCAAGGAGAACCTCTTTCGTCTGTTTCTAAAATTGAAATCTTGCGTAATGGGAAGTTAATAAAAACGTTTGAAAATCCGGTTTTGGGAGCGACATTAACGTATGAAGACGAACATTCGGACTTTGGGTTTAATACATATGGCATCGTGGCTTATAGTGGAGAAAATGCCGGTGTAAAAGTGGAACAAACGGTATTCTGCGGTATTTATTCTTTACCTTATATAGTAGCGCCGACTCAACAGGAGTTTTCTTTGTTTACGATCAAGGATAACAATAACGATGATAATACTTGGTACTACGATATAAGCGACGGTTCGTTGAAGTATGCTTATTGTTCGAATTCGGCCGATGATTATGTCGTAACGCCAGCCATCGAATTGGGAACCGCCCATATGATAGAGGTCGTGTTTGACGCTAAGGCCGGTGTAATGGGTTCTGAGAAATTGGAAGTGACTTATGGTAAATCGGATAAGCCGGAAGATCAACAAAAGGCTCAGACATTTGATTTGACGAACAAGGAATATCAAACTTTTACAGCTACCTTTGAAGTTACAGAGCATGGCCGTTATTATGTCGGATTCCATGCAATTTCCGATCCAGATCAATTTACCTTGAATATAAAAAATATAGAGGTGCGTAACGGTGCGTTGATGAAAGCTCCGGCCGCTGTTACAGAATTAAAGGCTACTCCCGCTGCACAAGGGGGGCTTTCGGCAACGCTGAGTTTCCGGTTGCCTACTCAAAGCTTGAACGGTGAAGAGCTGACCGGTACGGTCGATGTGACCGTGAAACGTGCCGACGGGTCTGTGGTCGCTGAATTTACGGGTAAACAACCCGGAGAAGTTCTTTCTTGTAATGATGAGAATGCGGTTCAGGGAAATAACGTTTATACTGTGGTGGCCAAGAATGAGTTCAGTGAAGGAGGAACAGCTACGGTAACGTGTTATTGCGGTATCGATGTTCCAAGCATTGTGTCGAACTTTACAGCTTTACCCTCTTCCGATAATTTGAAGGCCGAGTTATCGTGGAGTGTTCCTACGGTTGGTGTGCATAATGGTTATTTCCAACCATCTGATATTACGTATAAGATTTATGAGTATGTGGGTACGAGTTATAGAGAAGTGGGAACTACCACAGCCCTTTCTTATACGGCTACTCCGTCCTCTTCTAAACTCGATTCTTATACTTTCCTTGTCTCTGCTACTACTATCGGGGGCGAAGGCGAGGCTGCGTTAGATAATGTCGTATTGGGAATCCCTTATACGATGCCTTTCGAGGAAAACGGTGTGAATAATATGACAACAACTTATCCTTGGATTATGGGGGCATTGAGCGGACAAGCCGAGTGGGGATTGACGAATTATATCCGCAGTCTCGGTTTGGAGCCGGAAGATGGAGGAATGTTCGTTTGCCATTCTCAATCGGGTAAGGGAGAAGCTCGTTTACAAGTCCCCAAATTAAATTTGGGTGGTTTTAATGCTCCTACATTGACATTTTTATTATATCGTTACCAGAATGCTGCCGGAAAATTATCGGTGAAAGTGACTGCCGATGATAAAGCATATACCGAGGTTTATAGCGCCAATACAGCCTCTTTTCTTCCGGGTTGGACCGTATGCAAAGTAAATTTGGCTCAATATAAAGATTATCCGTGGATTGCAATTGTGTTTGATGGAGCTGTTTCTAATGGTAGTGATTATGTAATCATCGATAATATGGCAGTTGCTAATGAGTCGGAATTTGATGCGAAACTCGAAAGTATCAAAGGTGCTCGTCGTCCTGTCGTGGGTGAATCTGAAAATTATACGGTTGTCGTTAAAAATAACGGGAAGCAGTCGATAACTTATGATGTGAATCTTTATGTAGATGAGACTCTGGTTCAAACTCTTTCTCGGACGGAGGCTTTGGCGCAGGGAGAAACAGCCGATCATTTATTTACGGTTACTCCTACGGCTGAAATGATAGGTAAAGAAACTCCTATTAAAGCAGAGGTTATAGCAAAAGAGTCTGATGAGATCCCAGAAAATAATATATTGGAGGCAATAATAATCGCTTCTCAATCAGAGTTGCCTGTTATTACCGACCTAGTCGGGGAGAAAACAGAGAAGGCTCATGAACTGTCTTGGACAAAGCCTACATTGACCCCCGAGCCGATGGTAGATGATTTCGAAGGTTACGAATCGTTTATTTATGAGAATATAGGTGATTATACGGTGGTAGATGGAGATGGCTTGACCTCTGCCGGTATTTTATTCGTAGAATTTCCGAATATGGGTACACCGATGGCGTTTCAAGTCTGGGAACCTCTGGCCGAGGGTGTTGATGTGACTTCGAATAACTGGAAGCCTCATTCTGGTGAAAAATGTTTGGTTTCTTGGGCTGGTTTGAGTTATGACGGTCTGACGCCTCAAAATGACGACTACTTGATTTCTCCTGAAATTATAGGAGGAACAAACGTGTCGTTCTATGCTACGATTCCTACAACGGAATATACGCCGGAGACGTTTGAAGTGCTTTATTCGACGACAACGACCGATGTAGATGCCTTTGAATTGCTTGCTACAGAATCGGTTCTTAATGTAGGTTGGAAAGAATATTCTTATCAGTTACCAGAGAATGCCCGTTATTTTGCAATTCATTATATCACTTCGAATAAGTTCGCTTTATTAGTTGATGATTTGTCGTATGTTCCGGTATCGGCGGTAAAAGATTTATCGGTTGTAGGGTATCATGTTTATTGCAATGGACAGAAACTGACTCAAACTCCTATCGTTGAGACGAATTATTCTACTCCGTCTATTGAATATGGAGCTTATCATGTCACTGTTGTTTATGATAAAGGAGAATCGTTCCGCTCGAATACCGTTCGTTTGGGAACATCGGCAGTAGATGAGTTGAACCGAAATGACATCAGGGTTTATGGTATGAACGGTTGCATTATGGCTGAGGGGGTGACAGGAAGAAAAATATCTGTTTATGGCATTGATGGTCGTACGCTCTTTTATATAGAGTCAGAAAGTGATACAGAGAAAATTCCAATGGAAAGAGGCGTTTATCTTGTGAAGGTAGATAATCGAACAATCCGGGTTCAAGTCCGTTAG
PROTEIN sequence
Length: 1752
MKLSSTKLKVFGGWIVVLMCIMAFSSKVLGSESIPKERENYQFTERSVPLKSGKAQVRKYRKRSSRNPVGIINISKLPARTRVAKINAQNSPANLFGFLAATNSYEERDYGIYSINPNTGDYSKLYDVEEYGEGEGGGTYANGKFYLSVFDEFYWSGINSAKLVVVDVVTGDKQVIEKEAEYPNAAVNMTYDPVNDVVYSINYDEAGEAYTLSKLDLQTLDFTVVAPMENSYRGMCIDGEGQMYVIDDYGDVYKFDKESAVQGEKVVSTGFFPEYSQSCCWSPLDRKIYWAACNWSESELIVIDPVSKEFYTQLAFENGEEWIGLYTTDPFSDPSAPAAVENLSISYATPGATTARISCDLPTRTAGGNELKGLINVAIVVDGDTVQIKENQSPGAEFSISLVLTNGLHVLKVICLNSGGEGVAASIKTFTGEDMPQIPTEVTAVAEESGKVTLSWTLPEAGINGGWVNLTKVSYDILRNGESLSTDIKETTYIDNLPENELKSYKYTVIVKFGGEECGSVESNSVVFGKAVSLPYEQTFEDASSFDLLNIIDNNGDGVTWQFDTGQFSAGYTFSADNAADDYLVLPKMTFKAYNVYSLSFDICSGSGYNAEIIGVKVGAEPSVETLSTIVMEPTEIMADASSPRHIVLTYVPEANGQGNFAIHCTSVADRFGVNVDNVRVEEFGSIYAPKGVTDFVVTADQTGLQKATMSFVVPKENYQGEPLSSVSKIEILRNGKLIKTFENPVLGATLTYEDEHSDFGFNTYGIVAYSGENAGVKVEQTVFCGIYSLPYIVAPTQQEFSLFTIKDNNNDDNTWYYDISDGSLKYAYCSNSADDYVVTPAIELGTAHMIEVVFDAKAGVMGSEKLEVTYGKSDKPEDQQKAQTFDLTNKEYQTFTATFEVTEHGRYYVGFHAISDPDQFTLNIKNIEVRNGALMKAPAAVTELKATPAAQGGLSATLSFRLPTQSLNGEELTGTVDVTVKRADGSVVAEFTGKQPGEVLSCNDENAVQGNNVYTVVAKNEFSEGGTATVTCYCGIDVPSIVSNFTALPSSDNLKAELSWSVPTVGVHNGYFQPSDITYKIYEYVGTSYREVGTTTALSYTATPSSSKLDSYTFLVSATTIGGEGEAALDNVVLGIPYTMPFEENGVNNMTTTYPWIMGALSGQAEWGLTNYIRSLGLEPEDGGMFVCHSQSGKGEARLQVPKLNLGGFNAPTLTFLLYRYQNAAGKLSVKVTADDKAYTEVYSANTASFLPGWTVCKVNLAQYKDYPWIAIVFDGAVSNGSDYVIIDNMAVANESEFDAKLESIKGARRPVVGESENYTVVVKNNGKQSITYDVNLYVDETLVQTLSRTEALAQGETADHLFTVTPTAEMIGKETPIKAEVIAKESDEIPENNILEAIIIASQSELPVITDLVGEKTEKAHELSWTKPTLTPEPMVDDFEGYESFIYENIGDYTVVDGDGLTSAGILFVEFPNMGTPMAFQVWEPLAEGVDVTSNNWKPHSGEKCLVSWAGLSYDGLTPQNDDYLISPEIIGGTNVSFYATIPTTEYTPETFEVLYSTTTTDVDAFELLATESVLNVGWKEYSYQLPENARYFAIHYITSNKFALLVDDLSYVPVSAVKDLSVVGYHVYCNGQKLTQTPIVETNYSTPSIEYGAYHVTVVYDKGESFRSNTVRLGTSAVDELNRNDIRVYGMNGCIMAEGVTGRKISVYGIDGRTLFYIESESDTEKIPMERGVYLVKVDNRTIRVQVR*