ggKbase home page

L3_122_000M1_scaffold_226_2

Organism: L3_122_000M1_public_UNK

megabin RP 52 / 55 MC: 52 BSCG 51 / 51 MC: 51 ASCG 20 / 38 MC: 18
Location: 1415..4387

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
TonB-linked outer membrane protein, SusC/RagA family n=1 Tax=Bacteroides coprocola DSM 17136 RepID=B3JQF9_9BACE similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 990.0
  • Bit_score: 2030
  • Evalue 0.0
TonB-linked outer membrane protein, SusC/RagA family {ECO:0000313|EMBL:EDU98813.1}; TaxID=470145 species="Bacteria; Bacteroidetes; Bacteroidia; Bacteroidales; Bacteroidaceae; Bacteroides.;" source="Bacteroides coprocola DSM 17136.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 990.0
  • Bit_score: 2030
  • Evalue 0.0
SusC/RagA family TonB-linked outer membrane protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 44.0
  • Coverage: 1002.0
  • Bit_score: 865
  • Evalue 9.90e-249

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Bacteroides coprocola → Bacteroides → Bacteroidales → Bacteroidia → Bacteroidetes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 2973
ATGGTTGTTGCTTATGGAGGAGCTACCAAACGTTCTTTTACAGGTTCAGCTACTGAAATTGGTGGAGAGCAAATCTCGTTGAAGAATCCGACTGAACTATCTAAAGCATTGGCTGGAGAAGTTGCCGGAGTACAAGTGATGTCTACTTCTGGACAACCTGGAAGTAATGCTAGTATCCGTATTCGTGGTTTAGGTTCAGCATATTCTAGCCGTTCTCCGTTGTATGTTGTAGATGGTATTCCTTTTGAAGCTGATTTAAGTGGTATCGATCCAAGTGATATTGCTTCTATGACAGTTTTGAAAGATGCTACTGCTACTGCATTGTATGGATCTCGTGCTGCAAATGGTGTAGTCTTGATTACTACTAAAAAAGGTGAAGCAGGTAAAACACGTGTTGATGCTGAAGTTAAATATGGTGCAAACATGCGTTTGACTCCGCTTTATGATGTAATTGATAGTCCGGAAAGATTTACAGAGCTTACTTGGGAAAGTTTACGTGGTTATGCAGAAGTTGCTGGTGGGTATGATCGTGCTACAGCTGCAACATGGGCTTCACAACAGTTGTTCGGAGGACAAAATGGTATTGCTCCTATATATAATATGTGGAACGCAGATGGTGACAAGTTGATTGATCCTTCTACAGGACGTTTTTATAGTGGCATTACACGTAAATATACTCCGGAAAAATGGGAGGATTATTTGTTTAGAACAGGTCAGAAATTTGATGCTAGCCTTAAAATCTCAGGTGGTAACGAGAAAATGACCCATTATACAGCTTTTAGTTATCTGAAGGATGAAGGATATTATATTTCTTCGGATTACGAACGATTCAATGTTCGTAACAATATGAGTAATCAGATTGCCCCTTGGTTGAAAGCTACAACATCATTATCGTATGCATATATGATTACCAATAAGCCGGGACAGTCTGATAGTAATATGAACAATGGTTTCCAGTTTATAAACGGTATGCCTTCATTGTTCCCTGTTTTTGAACGTGATGAAAACGGAAATATTGTACAAGATACAAGCATTGGAGGAAATAAATACGATTATGGTATGAATGCCGGTTATAGCCGTCCGTTTGCTGCTGGTATTAATCCTGCTGGTGCATTGCTTTTGGATAAAGATGAAATCAAGACACACCAGTTTAATGGTAATGCTTCATTTGAGGCTCGTTTCTTGAAACACTTCAAAGCAACTGCTAATGTTGGTTTGCAGTATTATGGTCAGGCTGAAAACGAATTGACAAATCCATATTATGGTGATAGTGCTGGTAAAGGACAAATTGTGAAAACTCAGGTGAATTATTTGAACTTTACTGCTAACCAGATTTTATCATGGACTCAAAGTTTTGGAAGAAATAATTTTGAAGCTTTTGTTGCTCATGAATCAACAAATAGTACAACCAACGTATCATATGGTGCTAAATCAAAAATGGTTCGTCCGGATAATACAGAATGGAGTAATGCTGTTATAATGGATTATATGGAATCGTATACTTATGGTTATGCGATTGAAAGTTATTTTGGTCAGTTGCGTTATGACTGGGATAATAAATATTTTATTCACGGAACACTTCGTGCTGATGGTAGTTCACGTTTTGCTAAAGGTCATAAGTGGGGAACATTTGGATCTATTGGAACTGCATGGGCTATTACTAACGAAGAATTTATGAAAGATATCAAATGGTTGAAGAATTTGAAATATAAATTGAGCTGGGGTGTTCTTGGTAATCAGGATTTTATAACAAGTCCTGTTGTCGCTGGATACTATCCATATGAAGATTTGTATCAGATTAACAACTTGAACGATAATTATACTTTCAGCTTTGTTTATAAAGGTAATCCTGATTTAACTTGGGAAAGAAGTTCTACTATTAATACTGGTATTGAATTTGATATTGCTGGTATACTTGAAGGTGAAGTTGAATATTTCCATAAAAAGACAACTGATATGTTGTTTATGAAGCAGGTAGCTCCTTCTTTGGGATATGCTTCTTATCCTGTTAATGATGGAGAGCTGGTAAATCAGGGTGTAGAATTTTCTTTGACTGCACATCTTTTGAATAAGAAAGATTATAAATTCGATTTCCGTGTTAATGGTGGATATTATAAGAATGAAATGACTAAGATGCCTATTGATGAAACTACAGGTAAAGAGAAGGCTTTGGAATTAAGCACTTACTATGGATGGGCAAAAGGACATTCTTTGTATGATTTCTACATGCGTGAATATGCAGGTGTAGATCCTCAGACCGGATACGCTATGTATAATCAGTATTATAATGTATTGCCTGATGGTACTAAAGAGTTGATTACAGATATGGAAACTTATAAATCAACTAAAACCATCAATAAACTGGAAGTAGAGCAGACAAGCGACTGGAGTCAAGCTACTAAGAAATTTGTTGATAAATCAGCAATACCTGCTTTACAAGGTGGTTTTGGTTTTGATTTATATGCAAAAGGATTTACTTTGAATGCGACATTCTCATATAGCTTGGGAGGATATGGTTACGATTATAATTATCAGGAATTAATGCATAATGATGGGGCTGGAAAGCATAATTGGCATAAAGATATTGAAAACCGTTGGCAGCAGCCTGGTGATATTACAGATGTTCCTCGACTTACCAATAACTATGGTGGAGGGGATGACGGTACTAGTTATGCTAATGCAACTTCAACACGTTTCTTGACTAGCCGTTCTTATCTGAACCTGTCTAATCTTCGTTTGGGATATACTTTCCCACAAAGCATTACTTCTAAACTGCACCTGGGAGGTCTGAGCGTATATGTATCTGGAGACAACTTGTTCTTCCTTTCGGCTCGTAAAGGTTATGTGGCTAATGCTTCTTCAGGTAGTAGAGATACGGTCAACAATGATAATAATAATGACTCAGGAGAATCAGGCAGAAGCCAATACAGCCCATTGAGTACAATTATGGGAGGTATTAAAGTTCAGTTTTAA
PROTEIN sequence
Length: 991
MVVAYGGATKRSFTGSATEIGGEQISLKNPTELSKALAGEVAGVQVMSTSGQPGSNASIRIRGLGSAYSSRSPLYVVDGIPFEADLSGIDPSDIASMTVLKDATATALYGSRAANGVVLITTKKGEAGKTRVDAEVKYGANMRLTPLYDVIDSPERFTELTWESLRGYAEVAGGYDRATAATWASQQLFGGQNGIAPIYNMWNADGDKLIDPSTGRFYSGITRKYTPEKWEDYLFRTGQKFDASLKISGGNEKMTHYTAFSYLKDEGYYISSDYERFNVRNNMSNQIAPWLKATTSLSYAYMITNKPGQSDSNMNNGFQFINGMPSLFPVFERDENGNIVQDTSIGGNKYDYGMNAGYSRPFAAGINPAGALLLDKDEIKTHQFNGNASFEARFLKHFKATANVGLQYYGQAENELTNPYYGDSAGKGQIVKTQVNYLNFTANQILSWTQSFGRNNFEAFVAHESTNSTTNVSYGAKSKMVRPDNTEWSNAVIMDYMESYTYGYAIESYFGQLRYDWDNKYFIHGTLRADGSSRFAKGHKWGTFGSIGTAWAITNEEFMKDIKWLKNLKYKLSWGVLGNQDFITSPVVAGYYPYEDLYQINNLNDNYTFSFVYKGNPDLTWERSSTINTGIEFDIAGILEGEVEYFHKKTTDMLFMKQVAPSLGYASYPVNDGELVNQGVEFSLTAHLLNKKDYKFDFRVNGGYYKNEMTKMPIDETTGKEKALELSTYYGWAKGHSLYDFYMREYAGVDPQTGYAMYNQYYNVLPDGTKELITDMETYKSTKTINKLEVEQTSDWSQATKKFVDKSAIPALQGGFGFDLYAKGFTLNATFSYSLGGYGYDYNYQELMHNDGAGKHNWHKDIENRWQQPGDITDVPRLTNNYGGGDDGTSYANATSTRFLTSRSYLNLSNLRLGYTFPQSITSKLHLGGLSVYVSGDNLFFLSARKGYVANASSGSRDTVNNDNNNDSGESGRSQYSPLSTIMGGIKVQF*