ggKbase home page

L3_133_091G1_scaffold_122_29

Organism: L3_133_091G1_public_UNK

megabin RP 52 / 55 MC: 52 BSCG 51 / 51 MC: 51 ASCG 16 / 38 MC: 15
Location: comp(35079..37676)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Diguanylate cyclase (GGDEF) domain protein n=1 Tax=Clostridium ramosum DSM 1402 RepID=B0N1Y1_9FIRM similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 99.9
  • Coverage: 865.0
  • Bit_score: 1744
  • Evalue 0.0
Diguanylate cyclase (GGDEF) domain protein {ECO:0000313|EMBL:EDS19741.1}; TaxID=445974 species="Bacteria; Firmicutes; Erysipelotrichia; Erysipelotrichales; Erysipelotrichaceae; Erysipelatoclostridium.;" source="Erysipelatoclostridium ramosum DSM 1402.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 99.9
  • Coverage: 865.0
  • Bit_score: 1744
  • Evalue 0.0
signaling protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 26.8
  • Coverage: 903.0
  • Bit_score: 292
  • Evalue 2.30e-76

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Erysipelatoclostridium ramosum → Erysipelatoclostridium → Erysipelotrichales → Erysipelotrichia → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 2598
TTGAAATTCAAAAATATCGAAGAGTTAATGGATAAACTAAATAATGAATATAAAGTCCTTCTAGATGTTATTGATAATGTTATTCTCGTAATTGATAATGAAATGAAGATACTTTTTGTGAACCGGAAAGGTCGTAAGCTGATAGGTGAAAATGTATTAATGCAGCCTTGTAAAGCTCTTAAAATGGATAATTGTAGTACGGAAAAGTGCTGTATTATGCGTTACCTTCACGGTTTACAACCATTAGATAATCTTCATAAAGATGGAAGTGTAGAAAAAGTAACAGTTTCAAGATTTTATGATAACCAAAACAATCCGCAAGGTTTTATTATCGTAGCTACCGATATAACCGAATTATCAAATATGAAAAAGGAGCTTCTAATAGGTGAAGAAATTTATAAGCTTGCTTTAAAACAAGCAAATACAACATTGTGGCAATATGATGTGTTAAATCATACAATTGAGCAGCTATTTTGTCCTGATGAAGTTGCATTAGGAATTTTAGATATTAATAAAACTTATTATAATATCCCAGAAAGTTTGGTTGAAGCAAAGATCATCAGTCAAGAGGATGGTTTACGAGTAAGAAAATTATGCCAAGAGATTGAAAAAGGCAGGCCTGAAACTTCAATTGAATTAAAGATGAAGCGTGGAGATGGAGAAGAACGCTGGATCAGTCTAAAATGTTCAACAATCTTTGATGAGCAGGGACGTGCAGTTAAATCAATTGGAATCGGTAAAGATATTACGGATTTTGTTGAACTAAAGAGCAAGTATGAAATTGAACGAGAATATCGTGAGGCTTTAGGTAAAGATGCACTGAGTTATATTGAAGTTAATTTAACGATGAATGAAGTTATTGATCGGAAAATAGCAAAAAATAATTTTATTGATTTTTATGATGGTAAAAACTATGAAAAATCAATTTTAAAACTAAGTGAAAATTCAATTCCTAGTGAGTATGGCAAAGTGCTTCGTGAATTAAATCGGCAAAATTTATTAAATAATTATCGTGATGGAAAACGTAAATTAGATTTAGAATATCAATTCTATAATAAGTTTAAAGATAATTATAATTTTATTCAAATTACACTATATTTGATTGAATTTAATAAAGATATTTATGCTTGTGGTTATATCAAGGATATTAATGAAAATAAAGTACATGATCTTGTACTAAAGAAGAAAATTGAATTAGATCCACTAACAGGGCTATATAATCGAGAAGCTATTGAAATTAAAACAAATGAAATTATTCAAAATTTTCCTGAAAATAATCATGCGATTATGATCTTAGACATTGATAATTTTAAGCAGGTTAATGATAATTTCGGTCATTTATACGGTGATGCATTTTTGTGTGAAATATCTCGAAAAATAAAATCTAAATTTCGAAATGATGACTTAGTTGCTCGTCTTGGTGGTGATGAGTATTTAGTTTTAATGAAGAATATTTCAAACAGTGAACTAGCTATTGATAAGGCTAATGATCTATGTAAACTGATTGAAGGTGCTTATGGAACTGGAGGAACAAAAGTTAAAGTAACGGTATCTGTAGGGGTAGTTTTATACCCTAATCATGGAAAAACATTTGATGAGTTATATCACCATGGTGATCAGGCTTTATACAAAATTAAAAAGAATAATAAAAATGGTGTTTGTTTGTATGATGAGAGTTTAGAGATTAGTGATGGTCAATTGGATAAAGTGAATAATATTGTTGATCGGGCTACCAAAAAGTTTTCTGATAATGTTGGTGAGTATATTTTTAGAATTTTATATAAATGTCAAGATTTAAATGAAACAATTACAGCAGTCCTAGAATTATTGGGAATGCATTATTATATGAGCCAAAATTTAATTATTGTACGAGATTTGGATATTGGGAAATACAAAGTAAATAATTATTGGAGTTCAAAGAATGAAGATTTAACAAAAGTTATTGATGTTACTTATCATGATTATTGGCCTGAGTATGTACGGCAATTTGATGATGAGGGGATTCTTTGGGTCAATGATATCAAGGCTTCAGATGTTTCTCCAGCAATTAAAACACTTTATGCTAATAGTAAGACCCGTATGGTAATTAGTGGTCTTATTAAAAATGGCGATGATATTATTGGTATCATAAGCATGGAACATGAAAAACCCTACGCTTATAAAGCGGAAGAAAAAGAAATGTTATTAACTTCGATTGCTATCATTAGTACTTTTCTTGTTAAAAAATATCAGGAAAAAGAAAAGAATCAGTATTTAAATGCAATTCAAATGATTTTAGATTTCCAAGAAAATGGGATTTACGTTATTGATCCCAACACTTATAAACTTGTGTATTATAATCATAAAATCAAACATATTTTTAATCAGGTAAAAGTTGGTGATTATTGCTATAAGTCTTTTAGAGGCTATGATGAACCATGCGCTGACTGCCCAATTAAAGATATGAAGGATAGCGATTTATCGTATACTAAATTGATTTATAATTGTAACATTAGTGCTCAGTTGGAGACAACGGTAAAACGTGTTCGGTGGATCAATGGTCAAGATGTTGCTGCAGTTACTAGTATCGATATAACAAAATATTATAATGAAAAGTAG
PROTEIN sequence
Length: 866
LKFKNIEELMDKLNNEYKVLLDVIDNVILVIDNEMKILFVNRKGRKLIGENVLMQPCKALKMDNCSTEKCCIMRYLHGLQPLDNLHKDGSVEKVTVSRFYDNQNNPQGFIIVATDITELSNMKKELLIGEEIYKLALKQANTTLWQYDVLNHTIEQLFCPDEVALGILDINKTYYNIPESLVEAKIISQEDGLRVRKLCQEIEKGRPETSIELKMKRGDGEERWISLKCSTIFDEQGRAVKSIGIGKDITDFVELKSKYEIEREYREALGKDALSYIEVNLTMNEVIDRKIAKNNFIDFYDGKNYEKSILKLSENSIPSEYGKVLRELNRQNLLNNYRDGKRKLDLEYQFYNKFKDNYNFIQITLYLIEFNKDIYACGYIKDINENKVHDLVLKKKIELDPLTGLYNREAIEIKTNEIIQNFPENNHAIMILDIDNFKQVNDNFGHLYGDAFLCEISRKIKSKFRNDDLVARLGGDEYLVLMKNISNSELAIDKANDLCKLIEGAYGTGGTKVKVTVSVGVVLYPNHGKTFDELYHHGDQALYKIKKNNKNGVCLYDESLEISDGQLDKVNNIVDRATKKFSDNVGEYIFRILYKCQDLNETITAVLELLGMHYYMSQNLIIVRDLDIGKYKVNNYWSSKNEDLTKVIDVTYHDYWPEYVRQFDDEGILWVNDIKASDVSPAIKTLYANSKTRMVISGLIKNGDDIIGIISMEHEKPYAYKAEEKEMLLTSIAIISTFLVKKYQEKEKNQYLNAIQMILDFQENGIYVIDPNTYKLVYYNHKIKHIFNQVKVGDYCYKSFRGYDEPCADCPIKDMKDSDLSYTKLIYNCNISAQLETTVKRVRWINGQDVAAVTSIDITKYYNEK*