ggKbase home page

L3_133_123G1_scaffold_232_13

Organism: L3_133_123G1_public_UNK

megabin RP 52 / 55 MC: 52 BSCG 51 / 51 MC: 51 ASCG 17 / 38 MC: 16
Location: comp(10629..11948)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
PTS system, lactose/cellobiose family IIC component n=1 Tax=Coprobacillus sp. 8_2_54BFAA RepID=H1APN0_9FIRM similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 439.0
  • Bit_score: 860
  • Evalue 5.00e-247
Permease IIC component {ECO:0000256|PIRNR:PIRNR006351}; TaxID=469597 species="Bacteria; Firmicutes; Erysipelotrichia; Erysipelotrichales; Erysipelotrichaceae; Coprobacillus.;" source="Coprobacillus sp. 8_2_54BFAA.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 439.0
  • Bit_score: 860
  • Evalue 7.00e-247
PTS lactose transporter subunit IIC similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 52.8
  • Coverage: 422.0
  • Bit_score: 428
  • Evalue 1.80e-117

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Coprobacillus sp. 8_2_54BFAA → Coprobacillus → Erysipelotrichales → Erysipelotrichia → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 1320
ATGAAAATTTCAGATTCGTTAACTGAAAAATTATTAGTTGTAGCAAGCAAGATTAGTAATCAAAAACATATGTATGCAATTAAAACAGCTTTTACAACACTGATGCCGGTAATTATTACTGGAGCTTTTTGTACGTTGATTGTTAATGTAGTTTGTTCGACGGAAACAACAGGGATTAGTTTAGCAAAGGTGCAAGGGTTTTCTTGGCTGGAAATGTTCACTGATCTATTTAATGCAGCAAATTATGCTACTTTAAATTTCTTTACAATTGCAGCTGTCGTTTTAATTGGATTAGAGCTGGGAGTTAAAAATGGAATAAAAGGGTTTATGACGGGAATAGTAGCGGTTTGTAGTTTTGTTGCATGCTTAAGTACAAATATTGTAGCTACAGTAGGAGAAGAGTCAATTACGGTTGCTGGAATTGCCAAAGATTATACGGCTTCTAAAGGATTGTTTTTGGGAATGATTATTGCACTGTTTTCGGTAGAACTATTTACAAAATTATGTAAAAGTAAATATTTGAAGATTAATATGCCAGATTCAGTACCTTCAAATGTAACAAGCAGTTTTAATAACTTATTTCCATTTGCATTGACAATTATTATCTTTGCAGCGATTAACTATACAGTGGTTCAATTAGCGGGACTAAGTTTATATGATATCATCTATACTTTTATTCAAAAACCATTGCAGGCAGTAGTACAAGGGTTACCAGGAGTCTTATTGTTAATGTTAGTAGCACAAATTTTCTGGTGTGTAGGTATTCATGGTAATCAAATTATTAAACCAGTAAGGGACCCGTTATTGAATGCAGCAATTTTAGCTAATACGGATATTGTTGCAAATCCGAACTATAATCCGGCTGATCTTAATATTATTTCTATGTCGTTTTGGGATACTTATGGTAATATTGGTGGTTCAGGTTGTGTTGTTGGTTTGTTGATTGCATGTTTAGTCTTCTCAAAACGTGAAGATTATAAACAAGTAGCTAAGTTGTCTATTGCTCCAAATATTTTTAATATTTCTGAAACTTTGCATTTTGGTTTACCAATTATGCTTAATCCATTATTGATGATTCCTTTTATTATTACCCCATTAGCAACAATGGCATTTGGATATTTCATGACGATTATTGGATTCTCAGATATATTAGTATATGCTTTCCCTTGGACAACCCCGCCATTTATTAATGCCTGGATAGCTTCAGGTGGCAGTATTGGAACAGTAATTACCCAAGCACTATGTATTGTTATTTCCATTGCTATTTATACTCCATTTGTTATTATCGCTAATAAACAAAAGGATATTGTTTCACAATAG
PROTEIN sequence
Length: 440
MKISDSLTEKLLVVASKISNQKHMYAIKTAFTTLMPVIITGAFCTLIVNVVCSTETTGISLAKVQGFSWLEMFTDLFNAANYATLNFFTIAAVVLIGLELGVKNGIKGFMTGIVAVCSFVACLSTNIVATVGEESITVAGIAKDYTASKGLFLGMIIALFSVELFTKLCKSKYLKINMPDSVPSNVTSSFNNLFPFALTIIIFAAINYTVVQLAGLSLYDIIYTFIQKPLQAVVQGLPGVLLLMLVAQIFWCVGIHGNQIIKPVRDPLLNAAILANTDIVANPNYNPADLNIISMSFWDTYGNIGGSGCVVGLLIACLVFSKREDYKQVAKLSIAPNIFNISETLHFGLPIMLNPLLMIPFIITPLATMAFGYFMTIIGFSDILVYAFPWTTPPFINAWIASGGSIGTVITQALCIVISIAIYTPFVIIANKQKDIVSQ*