ggKbase home page

L1_007_000M1_scaffold_1077_27

Organism: dasL1_007_000M1_concoct_56_fa

near complete RP 46 / 55 BSCG 50 / 51 ASCG 13 / 38
Location: comp(21380..24037)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Penicillin-binding protein 1A/1B n=1 Tax=Coprobacillus sp. CAG:235 RepID=R5Q445_9FIRM similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 99.3
  • Coverage: 885.0
  • Bit_score: 1752
  • Evalue 0.0
Penicillin-binding protein 1A/1B {ECO:0000313|EMBL:CCZ23550.1}; TaxID=1262854 species="Bacteria; Firmicutes; Erysipelotrichia; Erysipelotrichales; Erysipelotrichaceae; Coprobacillus; environmental samples.;" source="Coprobacillus sp. CAG:235.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 99.3
  • Coverage: 885.0
  • Bit_score: 1752
  • Evalue 0.0
penicillin-binding protein, 1A family similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 32.1
  • Coverage: 910.0
  • Bit_score: 407
  • Evalue 6.60e-111

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Coprobacillus sp. CAG:235 → Coprobacillus → Erysipelotrichales → Erysipelotrichia → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 2658
ATGTCTTCGAAAAAAAATAAAACTCAAAAGAAAATAAATAAAAAGAAAGTATTTATCACTCTTACTATATGTATCTTAGTTGCTTTAATTGGTGGTGTGAGTGTTCTAGCCTATGGTGTCTATAAAGATACAGAAACCTTTGATGCAAAGAAACTTTTATCATCCGGTGCAAGTGTGATGTACGATGATCAAGGACAAGTTCTTTATACTTATGGTAGTGAAGAAAATGGAACAAGAGAAAATATCACCTATGAAGATCTTCCACAAGTTCTTGTTGATGCTGTTGTTGCTGCTGAAGATTCTCGTTTCTTTGAACATAATGGTTTTGACTTACCACGTATTGCTAAAGCAGCTATGTCTAATTTAGTAGCCGGAGGTATTAGAGGTGGAGGTTCTACAATCACCCAACAATTGATTAAAAAAACTTACTTCCCTAATGCTGAAAAAACATATACGAGAAAGTTTAGTGAAATTATTCTTGCTATCCAAGCGGATAAAGCTTTAAGTAAAGAGGAAATTTTAACACTTTATTTAAATAAGATCTATTTTGGTAGAAGTACACGTTCAATTGGTATTTCTTCTGCTTCTCGTTATTATTTTGATAAAGATGTTAGTGAATTGACCCTACCAGAAGCAGCTATGCTTGCAGGAAGTTTAAATTCACCATACAACTATGATCCTTATTATTGTTTAAATAACGCTACGGAAAGACGTAATACAATTTTAAATCTTATGGTGAAGCATGGTTATATCACTCAAAAAGAATGTGATGACGCCAAAAATGTGAAGGTTGAAAACATGTTATGCTCATCTAAAATTACAAACAGTTCCGTTAATGCAGCTTATGTAGATATCGTAACAGATGAAGTAAAGAAAAGAACAGGATTAGATCCTTTAAAAACACAAATGAATATCTATACATATTGTAATAGTGAAACCCAAGCACTTGCTGCTGCTATTGGTAATGGTGAAAAATATGATTATAGTGATGAAGATATGCGCATGGGTGGTGCTGTTCAATCAAGCCAAGATGGTCGTATTGTCGCTGTCATTGGTGGACGTAATTATAACTTTGGTAATTATAATTATGCTACACAAAAACAACAACCTGGTTCATCTGTAAAACCATTTTTGGATTATGGACTTGCTTTTGAAAATCTTGATTGGTCTACAGGACATTCAATTAATGATGATGATTACTATAATGGTAAATTTAAAAACTGGGATCGTCAGTTCCATGGCTTAGTAACAGTTGAAAACGCTCTTGAAAATTCATGGAATATACCAGCTATTAAAACATTTGATGAAGTTCAACAAAAAATTGGTAGTGATAAAATCCAAGAAGCGATGGAATCTATTGGTATTTCAATGAATAAAGAAAATATTGGTCTAGCAAGTGCCATTGGTGGTTGGTCTTATGGTATTTCCCCACTTGAAATGGCAGGAGCTTACGCTACTATTTCTAATAATGGCTTATATACTGAAAGTCATACAATCAATTATGTTGAAGTTGTCCAAACTGGAGAAACCTTTAATATCGATGAAGAAATCCAAAATAATGCAAAGCAAAGTGCTTATTCAAAAGCAAGTGCTTTTATGGTAAGACAAGTCATGCTTGATTATACAAAAAATGGTAGTGGTAATTATGCTTACGTTTCTGGTATTAATAATGTCGGGGCTAAAACGGGAACATCTAACTGGTCAAGCAGTGCTAAAAATGGTATGGCTGGAAAAAGCCGTGATTTATGGATGTCAGCTTATACATCTGACTATATCTGTTCTGTATGGATGGGATTTGGTAAAGAAGGTATTGATAAAGGTAAAACAACGAGTCAATATAAAGCTTATCCTGGTAAAGTTGTTCAAACACTTTTAAATCATTTACAAAGTAAAGGAAGTCAAAAATCTTATCCTGATCAACCAGATGATGTTGAACAAGCAGCGATGGTCAAAGGTATTTATCCATATGTTTCACCAAGTGAAGGAATGAGCGAAGATATGATTATTCAAGCTTGGTTTAAAAAAGGAACTGCCCCTGCTCAAAGCGTTGATAGTGATGTCTTTAATTTAGCTGGACTTTCTTCATTTGATGTAAGTTTAAGTGGTCAAAGTATTACCTTTAACTTTGCTCCATATAATCCTGAAAACGCCGTTACTGATGAAAACGCTAATGATGCAACGAAAACATTTGGTAAAGTTGTTTATACAGTTGTCGTCCAAGATCAAAATGGTCAAGAACTTCATCGAGAAAACTTCTCTACTTCAAGTGGAACACTGAACTATACAGTCAATCAAAATGTAAAAGTAATTGGTTTCTATAGTTATGAAAGAGCACCAGAACGTACATCTAATCAAATAGAAAAAGATTTATCTATTAATTTATCAACAGTAAATGCATCACTTTCTTGTGATAGTGGTCAAATAAATGATGGGGCAACTATTTCATCAACCTCTATTCAAGCAAGCATTTCAGTTCAAGGTCAAGGTCATAGTGTGACAATTGCTTTATATGATCAAAATGGAAATGTACTTTCATCTGTTAACCATCATAGCGCTACATTTTCTAATTTAAGTCATGGACGTTCATATTCTATTAAATTCTTAGAATCTAATGGTTCAGCATCTGTTGAAAAAACCATTCATTTTACAGTATCTTAA
PROTEIN sequence
Length: 886
MSSKKNKTQKKINKKKVFITLTICILVALIGGVSVLAYGVYKDTETFDAKKLLSSGASVMYDDQGQVLYTYGSEENGTRENITYEDLPQVLVDAVVAAEDSRFFEHNGFDLPRIAKAAMSNLVAGGIRGGGSTITQQLIKKTYFPNAEKTYTRKFSEIILAIQADKALSKEEILTLYLNKIYFGRSTRSIGISSASRYYFDKDVSELTLPEAAMLAGSLNSPYNYDPYYCLNNATERRNTILNLMVKHGYITQKECDDAKNVKVENMLCSSKITNSSVNAAYVDIVTDEVKKRTGLDPLKTQMNIYTYCNSETQALAAAIGNGEKYDYSDEDMRMGGAVQSSQDGRIVAVIGGRNYNFGNYNYATQKQQPGSSVKPFLDYGLAFENLDWSTGHSINDDDYYNGKFKNWDRQFHGLVTVENALENSWNIPAIKTFDEVQQKIGSDKIQEAMESIGISMNKENIGLASAIGGWSYGISPLEMAGAYATISNNGLYTESHTINYVEVVQTGETFNIDEEIQNNAKQSAYSKASAFMVRQVMLDYTKNGSGNYAYVSGINNVGAKTGTSNWSSSAKNGMAGKSRDLWMSAYTSDYICSVWMGFGKEGIDKGKTTSQYKAYPGKVVQTLLNHLQSKGSQKSYPDQPDDVEQAAMVKGIYPYVSPSEGMSEDMIIQAWFKKGTAPAQSVDSDVFNLAGLSSFDVSLSGQSITFNFAPYNPENAVTDENANDATKTFGKVVYTVVVQDQNGQELHRENFSTSSGTLNYTVNQNVKVIGFYSYERAPERTSNQIEKDLSINLSTVNASLSCDSGQINDGATISSTSIQASISVQGQGHSVTIALYDQNGNVLSSVNHHSATFSNLSHGRSYSIKFLESNGSASVEKTIHFTVS*