ggKbase home page

L1_008_124G1_scaffold_255_2

Organism: dasL1_008_124G1_concoct_21_fa

near complete RP 51 / 55 MC: 2 BSCG 51 / 51 MC: 1 ASCG 14 / 38 MC: 1
Location: 573..4967

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
DNA polymerase III PolC-type {ECO:0000256|HAMAP-Rule:MF_00356}; Short=PolIII {ECO:0000256|HAMAP-Rule:MF_00356};; EC=2.7.7.7 {ECO:0000256|HAMAP-Rule:MF_00356};; TaxID=435842 species="Bacteria; Firmicutes; Bacilli; Lactobacillales; Streptococcaceae; Streptococcus.;" source="Streptococcus sp. C150.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 98.8
  • Coverage: 1464.0
  • Bit_score: 2895
  • Evalue 0.0
polC; DNA polymerase III polC-type (PolIII) (EC:2.7.7.7) similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 94.8
  • Coverage: 1464.0
  • Bit_score: 2786
  • Evalue 0.0
DNA polymerase III polC-type n=1 Tax=Streptococcus salivarius PS4 RepID=I0QJG6_STRSL similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 98.0
  • Coverage: 1464.0
  • Bit_score: 2880
  • Evalue 0.0

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Streptococcus sp. C150 → Streptococcus → Lactobacillales → Bacilli → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 4395
ATGTCTGATAAATTTCAGCTTCTTTTAAAACAAATTCGTTTTCCTAAGGATCATAAAACTTATAATGAAATTAAAGATGGTTCTATTCACTCTGTAAAATTATCAAAATCAAAACGTCGTTGGTTTTTTGTTTTTACTTTTCAAAATGTTTTGTCAAGTGAGGGCTTTAACCTTTTTAATTCGTTACTTCAGTCTACTTTTAATACCCTTGGTGCAGAAGTTTCTTATGAGTTTATTTTGGAGTCATCGTCTTGTGATAATGACTTACTATCTTTCTATTTTTCTTATGCTTTAGAGTCTTTAAAAGTTTCACATTTTTCCCTTTATTCTTTATTCTCCAATCTCAGTGTTGAATTTTTTAATAAAGAAATTCTCGTTAAAGCTCCATCTCATATTTTTAGAGAGAATGTTCAGGATAGATTTATTTTTTTAGTTTCTAATGTTCTTTCAAATGTTGGATTGTCTGATGTTAAAGTTTCCGTTATTGAAGATAAAGATGTATCTTCTTCTTTCGAAACGGCTTATGAAACAAATAAAGTTTCCTTGCAAGAGCAAGCTGAATCTCAAGCCAAACAAGTTCTTCAATCTATTGTTGAAAGTGAACCAGTATCAACTTCTCGACTTGAGCAGAGTCCAAGATATACCGAGAAACAAAGCCAACGTCAGGCAAGCTTTGATAAGGCTGAGATAACCCCGATGATTGATGTTAATTCTGAAGAAAACAGAATTGTCTTTGAGGGATATATCTTTGATGTTGAACAACGTGAAACGAAGACAGGACGTATTATCATTAATTTTAAAGTAACTGATTATACTTCAAGTTTTGCGATGCAACGTTGGGCGAAGGATAGTGAAGAGCTCGCTAAGTTCGATATGATTAAAAAGGGAAACTGGGTAAGGGTTCGAGGACGTATTGAGAATAATCCTTATACACATAGTTTGACGATGAATGTACAAGATATTAAGGAGATTTCTCATACACCTCGTAAGGATTTGATGCCTGAGGGACAAAAGCGTGTGGAATTTCATGCGCATACCAACATGTCGACTATGGATGCAATGCCAACTGTTGAAGATCTTATTGATACAGCGGCTTCTTGGGGACATCCAGCAGTTGCCATTACTGACCATGCTAATGTTCAGAGTTTTCCTCATGGCTACCATAGGGCTAAGAAAGCTGGGATTAAGGCTATTTTTGGTCTTGAAGCCAATCTTGTTGAGGATAAAGTTCCTATTGTTTATAATTCCCAGAATTTGGAATTAAAAGAAGCAACTTATGTTGTATTTGACGTTGAGACAACGGGCTTGTCTGCTGTTCATAATGATTTGATTCAGATTGCGGCATCAAAAATGCATAAAGGTAATATTATTGAGCAATTTGATGAATTCATAGATCCAGGACATCCTCTTTCTGCATTTACTACTGAGTTGACCGGTATTACTGATAATCATGTTAAGGGTGCTAAACCTTTAGTGCAAGTTTTACAGGAGTTTCAAGAATTCTGTCAAGGAACTGTTCTAGTGGCCCATAATGCGACCTTTGACGTTGGTTTTATGAATGCCAATTACGAAAGACATCAGTTACCAACAATTTCACAACCGGTTATTGATACTTTAGAATTTGCACGAAATCTTTATCCTGAGTATAAGCGTCATGGTTTGGGGCCTTTGACGAAGCGGTTTGGTGTGGCTTTGGATCATCACCATATGGCCAATTATGATGCGGAAGCTACGGGCCGTTTGTTGTTTATCTTCATAAAAGATGTGTTTGATAAGCACGGTTTGACTAATCTAGAACAGTTGAATACGGAGTTGGTTTCTGAAGATTCGTATAAAAAGTCTCGTGTCAAACATGCGACGCTGTATGTTCAGAATCAAACTGGCTTGAAGAATATCTTTAAGTTGGTAAGTTTATCAAATGTCTCATACTTTGAGGGAGTAGCACGTATTCCTCGTACGGTCTTAGATGAGTATCGTGAGGGAATCATTGTAGGTTCTGCTTGTGCTGATGGTGAGGTTTTTGATACGCTTTTGTCTCACGGTATTGACAAGGCGGTTGAAGTTGCTAAATATTATGACTTTATTGAAGTTATGCCACCGGCAATTTATGCGCCCTTGATTGCAAAGGATTTAATCAAGGATGAGGCGGCTATAGAACAACTGATTAGAGATTTGATTGAAGTCGCTAATCGTCTGGACAAGCCTGTGCTGGCTACAGGAAATGTACACTATATCAACCCTGAGGATGCCATTTATCGTGAAATCATTGTTCGTGCTTTGGGACAAGGAGCCATGATTAATAGGCCAATTGGTAAGGGAGAAAATGCGAAACCTGCTCCTTTACCTGAAGCTCATTTTAGGACAACTAACGAGATGCTAGACGACTTTGCCTTTTTAGGAAAAGACTTAGCCTATGAAATTGTTGTAACTAATACGCAAGCTATGGCAGATCAAATTGAAGAGGTTGAGGTTGTTAAAAAAGACTTGTACACACCTTTTATTGATCGTGCGGAAGAACAGGTTGCGGAGATGACATATGCTAGAGCGTTTGAGCTCTATGGTAATCCTTTGCCTGATATTATTGACCTGCGAATTGAGAAAGAGTTGTCTTCAATTCTTGGTAATGGATTTGCCGTAATCTACCTGGCTTCGCAGATGCTAGTTAACCGTTCAAATGAACGTGGCTACCTAGTTGGTTCGCGTGGATCTGTCGGTTCTAGTTTTGTTGCGACGATGATTGGAATTACTGAGGTCAATCCGATGCCGCCACATTATCTCTGTCCTAATTGTCAACACTCAGAGTTCATTACAGATGGATCTTATGGATCTGGCTTCGATTTGCCTGATAAGGAATGTTCAGAATGTGGAACGGAATATAAAAAAGATGGTCAGGATATTCCTTTCGAGACCTTCCTAGGTTTTGATGGGGATAAGGTTCCTGATATCGATTTGAACTTCTCCGGTGATGATCAACCATCAGCCCACTTGGACGTTCGTGATATTTTTGGAGAGCAATATGCTTTTCGTGCCGGAACAGTAGGAACTGTTGCAGATCGGACGGCTTATGGTTTTGTTAAAGGTTACGAACGTGATTACAATAAGTTTTACCGTGATGCCGAGGTCGATCGTTTAGCCATGGGGGCTGCGGGTGTTAAGCGAAACACAGGTCAGCACCCGGGTGGTATTGTTGTTATTCCAAATTATATGGATGTCTATGATTTCACACCTGTTCAATATCCGGCTGATGATGTAACGGCTGCCTGGCAGACGACTCACTTTAACTTCCACGATATCGATGAGAACGTGTTGAAGCTTGATATTCTGGGACATGATGATCCGACTATGATTCGTAAGTTGCAGGATTTATCAGGAATTGATCCAAAAGATATTCGAGCAGATGATCCAGATGTAATGAAACTTTTTTCAGGGACTGATATTTTAGGGGTAACACCTGAACAGATTGGGACACCAACGGGAATGTTGGGAATCCCTGAGTTTGGGACTAACTTTGTTCGTGGTATGGTCGACGAGACGCATCCGACGACCTTTGCGGAACTCTTACAGTTATCTGGATTGTCCCACGGAACAGACGTTTGGTTAGGTAATGCACAAGATTTGATTAAGGAAGGTATCGCCACTCTGAAAACAGTTATCGGTTGTCGTGATGATATCATGGTATACCTAATGCATGCGGGATTAGATCCTAAGATGGCCTTCACGATCATGGAACGTGTGCGTAAGGGGATGTGGTTGAAGATTTCCGAAGAAGAGCGTAATGGCTATATTCAAGCCATGCGTGAAAATAATGTTCCAGACTGGTACATTGAATCTTGTGGTAAAATCAAGTACATGTTCCCTAAAGCCCATGCGGCAGCCTACGTTATGATGGCCCTACGTGTAGCTTATTTCAAAGTGCACCATCCTATTTATTACTATTGTGCCTACTTCTCGATTCGAGCTAAAGCATTTGAGCTTAAGACGATGTCTGCGGGTCTTGATGCTGTTAAAGCTCGAATGGAAGATATTAAGGAGAAGCGCCAACGAAATGAAGCGACTAATGTTGAAAATGACTTATTTACAACGCTTGAAATTGTCAATGAAATGTTAGAACGTGGCTTTACCTTTGGTCAGTTGGATCTTTATAAGAGTCAGGCAACTGAATTTCTGATTGAAGGAGATACTTTGATTCCACCGTTTATTGCACTTGAAGGTTTGGGTGAGAACGTTGCTAAGCAAGTGGTTGCTGCGCGTGAAGAAGGTGAATTCCTTTCCAAGACAGAATTGCGTAAACGAGGAGGCCTATCATCAACCTTGGTTGAAAAATTGGATGAAATGGGCATCCTAGGAAATATGCCAGAAGATAATCAATTAAGTCTTTTTGATGATTTCTTTTAA
PROTEIN sequence
Length: 1465
MSDKFQLLLKQIRFPKDHKTYNEIKDGSIHSVKLSKSKRRWFFVFTFQNVLSSEGFNLFNSLLQSTFNTLGAEVSYEFILESSSCDNDLLSFYFSYALESLKVSHFSLYSLFSNLSVEFFNKEILVKAPSHIFRENVQDRFIFLVSNVLSNVGLSDVKVSVIEDKDVSSSFETAYETNKVSLQEQAESQAKQVLQSIVESEPVSTSRLEQSPRYTEKQSQRQASFDKAEITPMIDVNSEENRIVFEGYIFDVEQRETKTGRIIINFKVTDYTSSFAMQRWAKDSEELAKFDMIKKGNWVRVRGRIENNPYTHSLTMNVQDIKEISHTPRKDLMPEGQKRVEFHAHTNMSTMDAMPTVEDLIDTAASWGHPAVAITDHANVQSFPHGYHRAKKAGIKAIFGLEANLVEDKVPIVYNSQNLELKEATYVVFDVETTGLSAVHNDLIQIAASKMHKGNIIEQFDEFIDPGHPLSAFTTELTGITDNHVKGAKPLVQVLQEFQEFCQGTVLVAHNATFDVGFMNANYERHQLPTISQPVIDTLEFARNLYPEYKRHGLGPLTKRFGVALDHHHMANYDAEATGRLLFIFIKDVFDKHGLTNLEQLNTELVSEDSYKKSRVKHATLYVQNQTGLKNIFKLVSLSNVSYFEGVARIPRTVLDEYREGIIVGSACADGEVFDTLLSHGIDKAVEVAKYYDFIEVMPPAIYAPLIAKDLIKDEAAIEQLIRDLIEVANRLDKPVLATGNVHYINPEDAIYREIIVRALGQGAMINRPIGKGENAKPAPLPEAHFRTTNEMLDDFAFLGKDLAYEIVVTNTQAMADQIEEVEVVKKDLYTPFIDRAEEQVAEMTYARAFELYGNPLPDIIDLRIEKELSSILGNGFAVIYLASQMLVNRSNERGYLVGSRGSVGSSFVATMIGITEVNPMPPHYLCPNCQHSEFITDGSYGSGFDLPDKECSECGTEYKKDGQDIPFETFLGFDGDKVPDIDLNFSGDDQPSAHLDVRDIFGEQYAFRAGTVGTVADRTAYGFVKGYERDYNKFYRDAEVDRLAMGAAGVKRNTGQHPGGIVVIPNYMDVYDFTPVQYPADDVTAAWQTTHFNFHDIDENVLKLDILGHDDPTMIRKLQDLSGIDPKDIRADDPDVMKLFSGTDILGVTPEQIGTPTGMLGIPEFGTNFVRGMVDETHPTTFAELLQLSGLSHGTDVWLGNAQDLIKEGIATLKTVIGCRDDIMVYLMHAGLDPKMAFTIMERVRKGMWLKISEEERNGYIQAMRENNVPDWYIESCGKIKYMFPKAHAAAYVMMALRVAYFKVHHPIYYYCAYFSIRAKAFELKTMSAGLDAVKARMEDIKEKRQRNEATNVENDLFTTLEIVNEMLERGFTFGQLDLYKSQATEFLIEGDTLIPPFIALEGLGENVAKQVVAAREEGEFLSKTELRKRGGLSSTLVEKLDEMGILGNMPEDNQLSLFDDFF*