ggKbase home page
Advanced Search
Search Help

07M_4_2014_scaffold_6519_21

Organism: 07m_4_2014_Wolfebacteria_39_145

partial RP 32 / 55 BSCG 36 / 51 ASCG 8 / 38
Location: comp(11208..15074)

Top 3 Functional Annotations

View all annotations
Value Algorithm Source
hypothetical protein n=1 Tax=Parcubacteria bacterium SCGC AAA010-E09 RepID=UPI00037F0DCC similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 44.0
  • Coverage: 934.0
  • Bit_score: 685
  • Evalue 8.40e-194
  • rbh
Cell surface protein {ECO:0000313|EMBL:KKS95072.1}; TaxID=1618651 species="Bacteria; Parcubacteria.;" source="Parcubacteria (Giovannonibacteria) bacterium GW2011_GWB1_43_13.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 38.5
  • Coverage: 937.0
  • Bit_score: 601
  • Evalue 3.80e-168
Fibronectin type III domain protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 32.2
  • Coverage: 491.0
  • Bit_score: 216
  • Evalue 4.10e-53

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Parcubacteria (Giovannonibacteria) bacterium GW2011_GWB1_43_13 → Parcubacteria → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3867
ATGAATGAACTTTCTCAATTTTTTAAAATAAAAATAATACTCACTCTTGCAGTTTTTACGGCTGGTATTTTTTTATTCCCAATTATTATTAACGCCGAGGGAGATGTTAATTTACCGCCAGAACTTAAAATCCCTGACATCGTAGAAGGCGAAGGCACTCATTTTGAAATAAACAACAGTGAATATCTTAATATTGTTTTAGACAGTTCTGAACAGATAAAACTTAGAATTGAGTCAATCCCCGAAATGATTACAGCGATGATTGAGCCATTAGCCTCTTCAACTACTTCCACTCAAATTACTTTCTCTGGTTTTGCTTCTTCAACTAAATATTTTAAATACCAAGACGACTATCACAATCTCACCGAATTTACCACTGATGAAAACGGAAATTACGCCTATATTCAAGATTTATCGAAACCTCACCTTGTTTTTATCCAACCCAGAGCCAGCACGAAATTCATTAAAGATGACCCGAACGGCGGAGATTGTTATTTAATTGGAACTTGGGATTCAAATAGTAAAACCTGTACTTTCACTCAAGATGTTTTTGAGACAATCCAAATAGATAACGATAACATTATTCTTGATGGAAATGGCTATATTCTTAGCGGTTGGGGACATGGCGTTTTCCTTAATGGGAAAAGTGGCGTAACTATTAAAAATTTAAACATCAAGAACTTCTCCATTGGCATTCGTCTTTACTATTCTAGCGGTAATATTATTACAGATAATAATTTTTCCAATAATTACGACGGAATCCAGCTTTATTATTCCAATAATAACACTTTAAAAAACAACATTTCTGAGCTAAATGCTTGGGGATTTTACTTAGTTTTTTCCAACAATAACACTTTAATAAATAATACGGCCAATTCCAACCGAACTGTTGGAATTGGACTCGGTGGTTCCAGTTATAATATTCTTACTAATAATACTGCTAATAATAACTCCACAGGTATTCTCCTCAGCGGAGAGCATAATATTTTAACGGGTAATAATGCTGACTCCAATGATTTATTCGGAATCCGCCTTAGTGGAGGTACTAATAATACTCTTTCTAATAATTCAATGGCAGGTAACCAGTATAATTTTTTCGTTGACGGCAATTCCGATGCTGATTTTAATCAAAACATAGACACCAGCAATTTAGTTAACGCTAAACCCATCTATTACGTGAAAAATGTTGCCAATCAGACTTATGATGCTTTAACTAATGCTGGTGTTTTTTATTGCGTAAATTGTAGCCAGATAACCATAAAAGACTTGACCATTGTTAATAACGGGGCCGGTATATTTTTCTGGGGAACTCGTGATTCTAAGATAGAAAATATTCGCGCCTTGAATAATTGGTGGGGAGTTTCTCTCAAAAATTCCAGCAATAATGTCATTGCCAGTAGTACTTTTTCAAATAATCACGACGGAATTTTTCTTTACAATAATTCTAACAACAATCTTTTTACAGATAACTTTATTGAGACAAATAGTTTCCATGGCATTGAAATTGCCAATCACAGCAATAACTCCACTGTTACGAACAATGTAATTTCTTATAATAACTATTTCGGAATCAGCAGCGACCTTTCCTCAGACGGTGTTTTTAATAACAACACTTTTATTTCAAATCGTATTGGCGTTGTTTTCGGAAGATCGTCAAACAACAAAGTCTATAATAATAATTTTATTAACAATCAAATTCACCAAGCTATTTCAGATGGTAGTGTTCTCTTCAATCTAAATCCGCCTACCGGCGGCAATTACTGGAGCAACTTTGACACTCCAGCTGAGGGCTGTAATGATTTAAACAGCGATAATTCCTGTGATTCTCCTTATGTTTTTTCTGGGGGCCAAGATAATTTACCTTGGATAAAACAGGATGGTTGGAAAATTCCGGCCAACCAGCCGCCGACAGTTTCTAATCTCAATCAATATAAATCAGACGGACAAACGGAAATATTCGAAGGCGGGATTACTACCGAAGACATTGTTGTTCTTAAAGCCGCAGTTTCTGATCAGGACAATGACCAAGTTAAACTCCAGATAGAGCTCAAAGAATTCAATCAATCTTTTGACGAACAGAATTTACTGGAAAGCGAGTTTGTCAATTCCGGCAGTGAAGCAGTTGTTAGTCGTGAGTCATTAATTGATGGCCAATATAAATGGCGGGCAAGAGCAGTTGATTCTCAAGGAAACGCCAGCGCATGGCAGGAATTCGGAAGCGTGGGGAATGTTGATTTTGAGGTTAAATTAGTGCCGTTGTATACACAGGTGAGATCGCCGTATCCGTCATGGACAAAAACAGATGAATGGGACGATATAGATTATGGCGATGGCAATTATCCAGACTGCATCGATAATGAACTTAATCGTTCTACCATTCGCCGCTGCGGCTGCGCCATCGCCTCAATGGTAATGCTCGGCAGATATTACGGCGTTAATATCGGCATTGATAATATAGATACTGACCTTGTCAATATTAACACTTGGTTGACAAACAACAAAGGCTACACCAAAGACGGTAGGTTATATTGGGGTAAAGCAATTGAATATCTTGGTTTTGTAGAGAACGGCGTAAAGAAGATAAGATTAAGCCTTGATTATTACAACGCAATCTCCACCCTTCCAATTGTGGACAATTACATCACTTCAGCCAAACCGGCGGTTGCCTACGGCAGCCGATTTGGACATTACTTTGTAGTTGATGGCAAATTACAGAACACCTACACCCTTAAAGATTCTTACTGGTACAATACAAAAAAACTGAATGATCCGGAAAATCTCGCCAATGAAATTCGCGGCTACAATAACTATTTTGATACCGCAAACCTCTTTAGTTATTTAGAGATACCCAAAAAACTCACTGCCTCGATTTACCTTTATCTCTCCTCTCCAGCCGAACTTCTTATTGCTGATCCCCAAGGCCGAAAACTCGGCAGGGACCCTATACTTAACATAACCTATAATGAAATTCCTGACAGCAGTTACGCCCAAGAAGGTCTCATCATAACCAGCGATATTCCGCTTGATTCAACTCAAGTTCATAAAATAAAAGTAGTCTATATCCCAACTCCAATTGACGGCAATTATGATGTCCAAGTTATTGGCATTGACACCGGAAGCTACGAACTTAACACATTGACCTATGACAACCAAGGAGATTCCCATACTCAAACCCAAACCGGAAATATTCAAGATAATTTAAGTATAAATTATAACCTCAATTTTACTCCCGATACGCCAGAAAATATTACAATTCAACCAGAAGACAGCGAAGCCCCAATAATTTTCCATACCTCGCTAAATGAGCAATATATCTTAAATTTCGCGCCAATTACTTTTAATTTTTCCGCTCAAGACGATGGAGTGGGTGTTTATAAAGTCTTTGCAGTTCTTAATGGAAATCCGATAACAAATGGTCAATCAATATCATTTGAGCAATTGGGGTCGTATGAAATTAAAATCACGGCAGAGGATTTTATTGGAAATATCGCGACAGAAATTATTAAGTTCGATGTAATTTATAATTTCTCCGGCTATTTCCCGCCGATAAAGATAGATGGATCGGGAATTTACAAGTTGGGCCGAACCCTGCCCGTCAAGTTTCAATTAACAGACGCTAATAACAACTATATTTCTACTGCGGTAGGGCAATTATTCGTTGCCAAAATATCTAACGGAATAGTTGGAACTGATGAAGTACCGCTTTCTATAAGTAATGCTGATAGCGGAAATATTTTCCGATATGACGTGAACAATAATCAGTACATTTACAATTTGTCGACAGACACATTATCAGTCGGTTCTTGGCAGTTGAAGACAACTTTAAATGATGGCCGGAATTATACGATTGTTATTTCGATTAAATAA
PROTEIN sequence
Length: 1289
MNELSQFFKIKIILTLAVFTAGIFLFPIIINAEGDVNLPPELKIPDIVEGEGTHFEINNSEYLNIVLDSSEQIKLRIESIPEMITAMIEPLASSTTSTQITFSGFASSTKYFKYQDDYHNLTEFTTDENGNYAYIQDLSKPHLVFIQPRASTKFIKDDPNGGDCYLIGTWDSNSKTCTFTQDVFETIQIDNDNIILDGNGYILSGWGHGVFLNGKSGVTIKNLNIKNFSIGIRLYYSSGNIITDNNFSNNYDGIQLYYSNNNTLKNNISELNAWGFYLVFSNNNTLINNTANSNRTVGIGLGGSSYNILTNNTANNNSTGILLSGEHNILTGNNADSNDLFGIRLSGGTNNTLSNNSMAGNQYNFFVDGNSDADFNQNIDTSNLVNAKPIYYVKNVANQTYDALTNAGVFYCVNCSQITIKDLTIVNNGAGIFFWGTRDSKIENIRALNNWWGVSLKNSSNNVIASSTFSNNHDGIFLYNNSNNNLFTDNFIETNSFHGIEIANHSNNSTVTNNVISYNNYFGISSDLSSDGVFNNNTFISNRIGVVFGRSSNNKVYNNNFINNQIHQAISDGSVLFNLNPPTGGNYWSNFDTPAEGCNDLNSDNSCDSPYVFSGGQDNLPWIKQDGWKIPANQPPTVSNLNQYKSDGQTEIFEGGITTEDIVVLKAAVSDQDNDQVKLQIELKEFNQSFDEQNLLESEFVNSGSEAVVSRESLIDGQYKWRARAVDSQGNASAWQEFGSVGNVDFEVKLVPLYTQVRSPYPSWTKTDEWDDIDYGDGNYPDCIDNELNRSTIRRCGCAIASMVMLGRYYGVNIGIDNIDTDLVNINTWLTNNKGYTKDGRLYWGKAIEYLGFVENGVKKIRLSLDYYNAISTLPIVDNYITSAKPAVAYGSRFGHYFVVDGKLQNTYTLKDSYWYNTKKLNDPENLANEIRGYNNYFDTANLFSYLEIPKKLTASIYLYLSSPAELLIADPQGRKLGRDPILNITYNEIPDSSYAQEGLIITSDIPLDSTQVHKIKVVYIPTPIDGNYDVQVIGIDTGSYELNTLTYDNQGDSHTQTQTGNIQDNLSINYNLNFTPDTPENITIQPEDSEAPIIFHTSLNEQYILNFAPITFNFSAQDDGVGVYKVFAVLNGNPITNGQSISFEQLGSYEIKITAEDFIGNIATEIIKFDVIYNFSGYFPPIKIDGSGIYKLGRTLPVKFQLTDANNNYISTAVGQLFVAKISNGIVGTDEVPLSISNADSGNIFRYDVNNNQYIYNLSTDTLSVGSWQLKTTLNDGRNYTIVISIK*