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NECEvent2014_2_8_scaffold_785_1

Organism: NECEvent2014_2_8_Peptoclostridium_difficile_29_5

near complete RP 45 / 55 MC: 1 BSCG 47 / 51 ASCG 12 / 38 MC: 3
Location: 2..3214

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Toxin B {ECO:0000313|EMBL:EQG77883.1}; EC=2.4.1.- {ECO:0000313|EMBL:EQG77883.1};; TaxID=1151334 species="Bacteria; Firmicutes; Clostridia; Clostridiales; Peptostreptococcaceae; Peptoclostridium.;" sou similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 2172
  • Evalue 0.0
tcdB; Toxin B (EC:2.4.1.-) similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 2172
  • Evalue 0.0
Toxin B n=1 Tax=Clostridium difficile CD129 RepID=T3F1T7_CLODI similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 2172
  • Evalue 0.0
  • rbh

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Peptoclostridium difficile → Peptoclostridium → Clostridiales → Clostridia → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3213
AGTTTTATAGTTCCAATAATAACTACAGAATATATAAGAGAAAAATTATCATATTCTTTCTATGGTTCAGGAGGAACTTATGCATTGTCTCTTTCTCAATATAATATGGGTATAAATATAGAATTAAGTGAAAGTGATGTTTGGATTATAGATGTTGATAATGTTGTGAGAGATGTAACTATAGAATCTGATAAAATTAAAAAAGGTGATTTAATAGAAGGTATTTTATCTACACTAAGTATTGAAGAGAATAAAATTATCTTAAATAGCCATGAGATTAATTTTTCTGGTGAGGTAAATGGAAGTAATGGATTTGTTTCTTTAACATTTTCAATTTTAGAAGGAATAAATGCAATTATAGAAGTTGATTTATTATCTAAATCATATAAATTACTTATTTCTGGCGAATTAAAAATATTGATGTTAAATTCAAATCATATTCAACAGAAAATAGATTATATAGGATTCAATAGCGAATTACAGAAAAATATACCATATAGCTTTGTAGATAGTGAAGGAAAAGAGAATGGTTTTATTAATGGTTCAACAAAAGAAGGTTTATTTGTATCTGAATTACCTGATGTAGTTCTTATAAGTAAGGTTTATATGGATGATAGTAAGCCTTCATTTGGATATTATAGTAATAATTTGAAAGATGTCAAAGTTATAACTAAAGATAATGTTAATATATTAACAGGTTATTATCTTAAGGATGATATAAAAATCTCTCTTTCTTTGACTCTACAAGATGAAAAAACTATAAAGTTAAATAGTGTGCATTTAGATGAAAGTGGAGTAGCTGAGATTTTGAAGTTCATGAATAGAAAAGGTAATACAAATACTTCAGATTCTTTAATGAGCTTTTTAGAAAGTATGAATATAAAAAGTATTTTCGTTAATTTCTTACAATCTAATATTAAGTTTATATTAGATGCTAATTTTATAATAAGTGGTACTACTTCTATTGGCCAATTTGAGTTTATTTGTGATGAAAATGATAATATACAACCATATTTCATTAAGTTTAATACACTAGAAACTAATTATACTTTATATGTAGGAAATAGACAAAATATGATAGTGGAACCAAATTATGATTTAGATGATTCTGGAGATATATCTTCAACTGTTATCAATTTCTCTCAAAAGTATCTTTATGGAATAGACAGTTGTGTTAATAAAGTTGTAATTTCACCAAATATTTATACAGATGAAATAAATATAACGCCTGTATATGAAACAAATAATACTTATCCAGAAGTTATTGTATTAGATGCAAATTATATAAATGAAAAAATAAATGTTAATATCAATGATCTATCTATACGATATGTATGGAGTAATGATGGTAATGATTTTATTCTTATGTCAACTAGTGAAGAAAATAAGGTGTCACAAGTTAAAATAAGATTCGTTAATGTTTTTAAAGATAAGACTTTGGCAAATAAGCTATCTTTTAACTTTAGTGATAAACAAGATGTACCTGTAAGTGAAATAATCTTATCATTTACACCTTCATATTATGAGGATGGATTGATTGGCTATGATTTGGGTCTAGTTTCTTTATATAATGAGAAATTTTATATTAATAACTTTGGAATGATGGTATCTGGATTAATATATATTAATGATTCATTATATTATTTTAAACCACCAGTAAATAATTTGATAACTGGATTTGTGACTGTAGGCGATGATAAATACTACTTTAATCCAATTAATGGTGGAGCTGCTTCAATTGGAGAGACAATAATTGATGACAAAAATTATTATTTCAACCAAAGTGGAGTGTTACAAACAGGTGTATTTAGTACAGAAGATGGATTTAAATATTTTGCCCCAGCTAATACACTTGATGAAAACCTAGAAGGAGAAGCAATTGATTTTACTGGAAAATTAATTATTGACGAAAATATTTATTATTTTGATGATAATTATAGAGGAGCTGTAGAATGGAAAGAATTAGATGGTGAAATGCACTATTTTAGCCCAGAAACAGGTAAAGCTTTTAAAGGTCTAAATCAAATAGGTGATTATAAATACTATTTCAATTCTGATGGAGTTATGCAAAAAGGATTTGTTAGTATAAATGATAATAAACACTATTTTGATGATTCTGGTGTTATGAAAGTAGGTTACACTGAAATAGATGGCAAGCATTTCTACTTTGCTGAAAACGGAGAAATGCAAATAGGAGTATTTAATACAGAAGATGGATTTAAATATTTTGCTCATCATAATGAAGATTTAGGAAATGAAGAAGGTGAAGAAATCTCATATTCTGGTATATTAAATTTCAATAATAAAATTTACTATTTTGATGATTCATTTACAGCTGTAGTTGGATGGAAAGATTTAGAGGATGGTTCAAAGTATTATTTTGATGAAGATACAGCAGAAGCATATATAGGTTTGTCATTAATAAATGATGGTCAATATTATTTTAATGATGATGGAATTATGCAAGTTGGATTTGTCACTATAAATGATAAAGTCTTCTACTTCTCTGACTCTGGAATTATAGAATCTGGAGTACAAAACATAGATGACAATTATTTCTATATAGATGATAATGGTATAGTTCAAATTGGTGTATTTGATACTTCAGATGGATATAAATATTTTGCACCTGCTAATACTGTAAATGATAATATTTACGGACAAGCAGTTGAATATAGTGGTTTAGTTAGAGTTGGTGAAGATGTATATTATTTTGGAGAAACATATACAATTGAGACTGGATGGATATATGATATGGAAAATGAAAGTGATAAATATTATTTCAATCCAGAAACTAAAAAAGCATGCAAAGGTATTAATTTAATTGATGATATAAAATATTATTTTGATGAGAAGGGCATAATGAGAACGGGTCTTATATCATTTGAAAATAATAATTATTACTTTAATGAGAATGGTGAAATGCAATTTGGTTATATAAATATAGAAGATAAGATGTTCTATTTTGGTGAAGATGGTGTCATGCAGATTGGAGTATTTAATACACCAGATGGATTTAAATACTTTGCACATCAAAATACTTTGGATGAGAATTTTGAGGGAGAATCAATAAACTATACTGGTTGGTTAGATTTAGATGAAAAGAGATATTATTTTACAGATGAATATATTGCAGCAACTGGTTCAGTTATTATTGATGGTGAGGAGTATTATTTTGATCCTGATACAGCTCAATTAGTGATTAGTGAATAG
PROTEIN sequence
Length: 1071
SFIVPIITTEYIREKLSYSFYGSGGTYALSLSQYNMGINIELSESDVWIIDVDNVVRDVTIESDKIKKGDLIEGILSTLSIEENKIILNSHEINFSGEVNGSNGFVSLTFSILEGINAIIEVDLLSKSYKLLISGELKILMLNSNHIQQKIDYIGFNSELQKNIPYSFVDSEGKENGFINGSTKEGLFVSELPDVVLISKVYMDDSKPSFGYYSNNLKDVKVITKDNVNILTGYYLKDDIKISLSLTLQDEKTIKLNSVHLDESGVAEILKFMNRKGNTNTSDSLMSFLESMNIKSIFVNFLQSNIKFILDANFIISGTTSIGQFEFICDENDNIQPYFIKFNTLETNYTLYVGNRQNMIVEPNYDLDDSGDISSTVINFSQKYLYGIDSCVNKVVISPNIYTDEINITPVYETNNTYPEVIVLDANYINEKINVNINDLSIRYVWSNDGNDFILMSTSEENKVSQVKIRFVNVFKDKTLANKLSFNFSDKQDVPVSEIILSFTPSYYEDGLIGYDLGLVSLYNEKFYINNFGMMVSGLIYINDSLYYFKPPVNNLITGFVTVGDDKYYFNPINGGAASIGETIIDDKNYYFNQSGVLQTGVFSTEDGFKYFAPANTLDENLEGEAIDFTGKLIIDENIYYFDDNYRGAVEWKELDGEMHYFSPETGKAFKGLNQIGDYKYYFNSDGVMQKGFVSINDNKHYFDDSGVMKVGYTEIDGKHFYFAENGEMQIGVFNTEDGFKYFAHHNEDLGNEEGEEISYSGILNFNNKIYYFDDSFTAVVGWKDLEDGSKYYFDEDTAEAYIGLSLINDGQYYFNDDGIMQVGFVTINDKVFYFSDSGIIESGVQNIDDNYFYIDDNGIVQIGVFDTSDGYKYFAPANTVNDNIYGQAVEYSGLVRVGEDVYYFGETYTIETGWIYDMENESDKYYFNPETKKACKGINLIDDIKYYFDEKGIMRTGLISFENNNYYFNENGEMQFGYINIEDKMFYFGEDGVMQIGVFNTPDGFKYFAHQNTLDENFEGESINYTGWLDLDEKRYYFTDEYIAATGSVIIDGEEYYFDPDTAQLVISE*