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NECEvent2014_8_5_scaffold_51_53

Organism: NECEvent2014_8_5_Clostridium_paraputrificum_29_42

near complete RP 49 / 55 MC: 1 BSCG 51 / 51 ASCG 15 / 38 MC: 2
Location: comp(52456..54339)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Histidine kinase {ECO:0000256|SAAS:SAAS00251121}; EC=2.7.13.3 {ECO:0000256|SAAS:SAAS00251121};; TaxID=999411 species="Bacteria; Firmicutes; Clostridia; Clostridiales; Clostridiaceae; Clostridium.;" so similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 37.0
  • Coverage: 648.0
  • Bit_score: 385
  • Evalue 1.60e-103
Uncharacterized protein n=1 Tax=Clostridium colicanis 209318 RepID=N9WFD9_9CLOT similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 37.0
  • Coverage: 648.0
  • Bit_score: 385
  • Evalue 1.20e-103
  • rbh
PAS domain S-box similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 35.2
  • Coverage: 562.0
  • Bit_score: 260
  • Evalue 9.20e-67

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Clostridium colicanis → Clostridium → Clostridiales → Clostridia → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 1884
ATGAATAACAAGTTTTTTAAAACTATATCAATCACATTAGTTTTAATACTTTTTTTAATACCTACGCAAAACGTATCTGCCTTAAAAACTGATAATAAAATTAATTCAATACTTATACTCACTCCATATAATAAAACAAGTTTTGATGAATCACTATTATCAACTTTGAAAAGCTATATATCTTCAAAATTACCTAACACAGTCTTTTTTGAGAATTCTATTTTATATCCTTCAAATGAAAGCGTTGATTTAACAGATTTCGACCTAATTATCTGTCTAGATAGCAACCGTCTTCAATATATTGAAAATAATTATTCTAATTTCCTTGATGACACACCAGTAATCATTGGTTTAACTGAAGAAAAAAAGTTTAATTTACCTGAAAACTTTGGTGGATACTATATGAATTATGACTTCTCAAAGTATATGGACTTCTTGCTAAATATACATCCTAACCTAAAGAAAGTTAATCTTTTAATCGGATCAAACTTTAAAAGCTCAAGCATATATAAAAGTATAAATTCTTATATATCTAAAAACCCTAAAGATATAAAATTTAATTTTATAACAACTGGAGAAGAAAATGAAATTACTCCTCTATTGTGTGAAAAAAATACTATCACAATAGTTTTTGATTCCCTTTTAAGTAATAATTGGGGAAAATACTTAACATCAGGCTCTTCTTATTCTACTATAAGAGCTATTAGTCGGAAGACAACTAATGAGGTTTATGGTGGTTATAGAGAATTTATAACTAGATTTAATATTGGAGGATATAATTATGATGCTACTGTTCTTGCCAAAGCAATTTCAGATACAGCAGTTTCAATTATAAATAATACTTTATCTATAAAAGATGTTGGTTACAGGGATGTTTCGCTTGATAATGATTTTATAATAAATACTTACATGAATGATAAATATCATCTACCTACTGACCTACCTAATACGTCTTACATAAAAATTGGCTCAGGTGAAACCTTAATTGAAAGCTCAGATTCTAATAAAAGAAATATTATTTTCTCTGCAATAATTATATTTTCAATGTTTATTTTATTTATATATGTACATAACAAGATAAGATTAAGAGATAAAGAAAAATTGGATTTAATGAAAAATAATTTTATAGCTAATCTTTCACATGAGCTAAGAAATCCTTTAAATATTATAATAAGTACAATTCAACTTTTTGATTTATATTTAAAGCAAAATAAAATAGTTTTAAAGGATCCTACTATAAAAAACAAATTCGAATACCTAAAAAATAACAGTAATAGACTATTAAAACTAGTAAATAACGTAATTGATATAACTAAAATAGATGCAGGTTTTTTTAATATTTCTAAAGATAATTATGATATTGTAAGTGTGGTAGAAAACTTAACCTTAAGTACTGTTCCTTACGCAGAATATAAAGATATAACCCTTATTTTTGATACAGATATAGAAGAACTTTATTGTTTATTTGATAAAGATAATATTGAAAGAGTCATTTTAAATCTTCTTTCTAATGCTTTAAAATTTACTCCAGCTAATGGAAATATCTTTGTAACACTAACATATAACTCTAAATACTTAAGTATTAGTGTAAAAGATACCGGTATTGGTATTCCAAGAGAAAAGCAAAAATTTATATTTGATAGATTTAGCCAGCTAGATACAGATAAATATTCTAAGGGGAAAGGTAGTGGTATAGGATTAGCTTTAATCAAATCTGTTGTAGAACTACATAACGGCCATATAGAGGTTAATAGTTTGCCTGGGGTAGGTTCTGAATTTATTGTAATCTTACCAATATATAAAGTAAAAAACTTAACCGAACAAAATGGAAGTTCCTCTGATTCAATCCAAAAGACAAATCTTGAATACTCTGATATATTTTAA
PROTEIN sequence
Length: 628
MNNKFFKTISITLVLILFLIPTQNVSALKTDNKINSILILTPYNKTSFDESLLSTLKSYISSKLPNTVFFENSILYPSNESVDLTDFDLIICLDSNRLQYIENNYSNFLDDTPVIIGLTEEKKFNLPENFGGYYMNYDFSKYMDFLLNIHPNLKKVNLLIGSNFKSSSIYKSINSYISKNPKDIKFNFITTGEENEITPLLCEKNTITIVFDSLLSNNWGKYLTSGSSYSTIRAISRKTTNEVYGGYREFITRFNIGGYNYDATVLAKAISDTAVSIINNTLSIKDVGYRDVSLDNDFIINTYMNDKYHLPTDLPNTSYIKIGSGETLIESSDSNKRNIIFSAIIIFSMFILFIYVHNKIRLRDKEKLDLMKNNFIANLSHELRNPLNIIISTIQLFDLYLKQNKIVLKDPTIKNKFEYLKNNSNRLLKLVNNVIDITKIDAGFFNISKDNYDIVSVVENLTLSTVPYAEYKDITLIFDTDIEELYCLFDKDNIERVILNLLSNALKFTPANGNIFVTLTYNSKYLSISVKDTGIGIPREKQKFIFDRFSQLDTDKYSKGKGSGIGLALIKSVVELHNGHIEVNSLPGVGSEFIVILPIYKVKNLTEQNGSSSDSIQKTNLEYSDIF*