ggKbase home page
Advanced Search
Search Help

NECEvent2014_8_5_scaffold_433_4

Organism: NECEvent2014_8_5_Clostridium_perfringens_28_24

near complete RP 51 / 55 MC: 1 BSCG 51 / 51 MC: 1 ASCG 15 / 38 MC: 1
Location: comp(5631..9656)

Top 3 Functional Annotations

View all annotations
Value Algorithm Source
von Willebrand factor type A domain protein n=1 Tax=Clostridium perfringens NCTC 8239 PF4_CLOPF">RepID=B1RPF4_CLOPF similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 72.0
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1940
  • Evalue 0.0
  • rbh
von Willebrand factor type A domain protein {ECO:0000313|EMBL:EDT27377.1}; TaxID=451756 species="Bacteria; Firmicutes; Clostridia; Clostridiales; Clostridiaceae; Clostridium.;" source="Clostridium per similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 70.6
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1894
  • Evalue 0.0
von Willebrand factor type A domain-containing protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 25.7
  • Coverage: 879.0
  • Bit_score: 192
  • Evalue 6.60e-46

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Clostridium perfringens → Clostridium → Clostridiales → Clostridia → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 4026
ATGAAAAAATTAAAAAATACAAAAAAATATAATTTTCTTATAATAGTTACAATTTTAATAATTAGTATGGTAAGTATGCTTGTTTATGGTATTGGAAATAACAATCAATTTACAATAAGTAAAGAATATGAGTTTGGTGAATTAGAACATGGAAAAACAAAAGATATTAAATATACAATAATACCTAATCCAATTAAGTTTAAAGATAGTGTAGAGAAAGATGTTGTTTTAGTTTTAGACACATCTCAAACTGTTAATCAAAAACAAAAAGCCATAAAAGATTCTGCAAATCAATTTGTAGAAAAATTTTTAACTGATAATAATTCCAAAAATTTTAAATTGGGAATTGTTTCATATAATGAAAAAGCGGAAATGGTTCAAGAATTAACTAAAAATAAGGAGAACCTTAAAACTGCAATAGATAATATTTATAGTGATAGTAACATATATTCTTGGCTTACTAATGGAAATCATCTTGGAACTAACGTTGGTGATGCTTTTAGATTAGCTATATCTATGTTAGGTAAGGATGTTGATGCCAATAAAGAAAAAATTGTTATATTTATGTCTAATGGTAAACCAAATGCTTATACAGGAAAATTTTATAAGGGGCCTGAAAGTACTATAAGTAAGGAAAAAATATCTTCATTAAATAGGTATGAACAACGTTTATATGAAATAACAAGTTTAAATGGAAATGAAGATGGATTAGGAAAAGAGTCTTTATCACAAGAAGAAGTTGCAATGAATAATAAAATAAAAGATTATGAAAAATATTTTTATGATCCAGAAAGTTTAGATGACTATAGAAAACAAGACTTTCAAAAGAGAGGATTAAGAAGTGATAAAGTAAATAATTTAATTTGGAATGAGTATGGAATTAGTCATGCTAATAGTTATATAAATGAGATTTATAAAGGTAAGTCTACATATTCTGTAAATGTACTGCCTAATAAGGATGATGGAGAAAATATAATAAGTTATTATATGGGTTCAGAAATTGGTTATGCATATTCATTGAAGATGGCAAAAGAAATGAAAGATTTGGGGATATCAACTTATCCGATATATTTTGATAATGATGGAAATTCTAATAATGAAAGAAATAATGATACAAGAGAGAATACTATGAAATTAATATCAAAATTTGCTGGTAATGAGGAGAGGAATGGTGTTACTAGTGTAAATACAGTTCACTCAAATGATATAACAGCTTCATTAAATGATGTTTTTACAAATCTTGATAAGAATATAAAGGACTCTTATTCAGTTAATGATGCAAAATTAACTATAAATATACCTGAAGGTTTAGAAATAGAATCTATAAATTATTCAGGAAAAACAATAAAAATAAATAAGGAAGATTTAAAGGACGGAAAATATCAATTACCATTAAATAATTTAAGTTATAAACTTGATGAAAGAGATAGAATTTACATTTATGATGGTAAGCCTTTAGAAATTAGCGTTACTGTAAGAGGGATAAATACAAGTGGAAGTGATAAAAATTGTAGTATAACTGGAGATGTTTATTCCAAATCCATAGAAGACAGTAAGAAAGCAGACTTGCCTAATATTAATATAAAAGTTAAAAGTGGCATTAAGGTAGAGATAACAGTTAATGATTTTATAGGAAATGTTGGGGAAAAATATGATAGCACATATATAAATCCTGAAAATAATTCATTTAATTTTATTAAAGAGCCAAAAAGGTTAATTGGCGATGGAAATGCAGATATTTCTGTAAATGGTATTCAAGAAAAAAGCAATGAGGAGTATTGGATTAAAACTTGGTTTACTAAGGAAAATAGCAAAGAAGAAATAAATCCAGAAGAATTTAAATTAAATAATATAAATTCTGATATAGATTTAGATAAAGCTAATAATTTAACTTATCAATCCTATAATGTTGATAACTTACAAGCAACAGGAGATATGGATAAATGGAATAATAGAGATATAGTTTTTGCTAAAAAGCAAAGTAAAGGTATTTTACCATCAAATATAATAGCTACTGAACCTTATGTAGGATTTACTAAAGATAATAAAAATAAAGCATATTTGGATATAAATAATGATGTTAAGTTAACTTATGAAGGAAAGAATTTAACTTATGAGAATTCAGATGATACATATTCTATATGGAGTTATCAAGATCGAGGTATAAAAAAGTTATATTATTATTATGAAAATGATAAATGGTATAATTCAACATCGAGATTTGCATGGAAAGTAGATGTTATGAATACTAGAAAATACACATTTAAACATAATACAATTTTTTATGATGAAATGAATATAGGAAAAGAATGTGCTTTAAGATATCCTGGATTTCAGTATAAGGAGGCAGATAAGTATTGGGGTTATATAAGGCCTAAAGAATCAGGTTGGTACCTATTTGGAACATATTCAGATGATGGTTCAAGATTTAGTATAACTAAAGATGGAGAAACTTATGAATTATCTAAAAGTAATTTTGGATTGAATAATAAAGGGGGATATTGGTATATAGGACAAGAGAATAGTAATTTTAAAGTCCATGGTTCTTCTTTTTATAGTTCATTTACTCCAATTTATTTAGAAGAAGATAAATATTATCCTATACAGTTAGAGTATTTTAACTGGGGAGGTGGAGGAGCCTTCAAGTTAGCTTATTGCAAGTTAGATAATTATGAAAATGATAAAAATGGACAATTTATTTTGAAAATGTTAAATCAAGCTTCAATAGATGAAAACTATAAAGGTTTCAGTAATGTTTTTTATAGGGAAGGTTATTGGAATAACTATACATATAATTTAACTGAAAGATTTAATGATTATTTAAATAATATTAAATTCAATTGGATAGGAGGGGGAAAGGAAGAGGATAACTTTACTTTATATCCATCCAAGAGTAATGATCCAGGTGATATTGCTGAGGAGGTTTTTGAAGGTAAGTCTGGAGTTAAATTACCTACAGATGCTGGTGTATATACAATGCATTATAAAATTATAACTAGGGAAAAAGGCAGTGACAAATCTGGACGAGTTATAAATGATAATGTTCAATCAGGTGAGTATGGAAAGTTTGAAGTTAAGGACCTATTAGACAATAGTATAAATGTAGTCGGTTCTAATGATAAAAAAGAAATTTATTTAAATGAAAAAGCTAAGGCTATTTATAAAATGATTCCAGATAATATAAAAGCAGAAGATATAATAAGAGATAGTAATGATTTTCCAGATGAAATAAAATTAGTAGGAATTGAAGTGGACGGTCTTCTTCCTAAAGGAATGAAGTTTGATAAGAATAATAATCAAGGCACAACTTTAGGAGTTGAAAGTGATGGAGAAACAAGATTTGTTACAGATAAAATGCCTGACATAACATATCACCTAGAAAATGATGTTTATGTAGCGAAACAATTTGATAAAATTATAAATGTTAGTATAGAGTCAAATGGACCATTTGAATTTAAATCAAGTGAGAATAAGGTTAAATTTAATCTTAATTATAAAGATAAGACAACTAAAACTATGATTGAAAGATTTAAAGGAACTTCAATAAGTGCTAGTGAACCAACTAAAATAGAGAAGTTTGGTATTTTAGATTCTTCATCATCTGATAATATAAAGGATGCTAGTGAAGGGGTACAAGTTGTTAATGGAATACCTCTTAAAGTGGCTATATTAGCAGATGTTAAATCACCTAATTCTATTATTGACTTAGGGTTTAATTCCAAAAATATAAAATTATCTAAAGATACAGAGTCACAATTTAATATTAAAATTTATAACAAAGGAAATTTAATTAATAGCGAAAAAGAATTTACTATTAATAAATTAGAAGGAAGCTTAATTGAGGGATTAAATAGTGGAATTAAAATTTCAGGTTTAGATGTTGGAGAAAAAGTAATAGTTATAGAATTAATTCCTAATAACATAGAAATTAATAATAGTGCCTTATTAAAAACAAAAGTTGAAAATAGTAATGATAAAGAACATTTAGCTAAGCTTGATTATGCAGAAATGCCAGATGTATTTTAA
PROTEIN sequence
Length: 1342
MKKLKNTKKYNFLIIVTILIISMVSMLVYGIGNNNQFTISKEYEFGELEHGKTKDIKYTIIPNPIKFKDSVEKDVVLVLDTSQTVNQKQKAIKDSANQFVEKFLTDNNSKNFKLGIVSYNEKAEMVQELTKNKENLKTAIDNIYSDSNIYSWLTNGNHLGTNVGDAFRLAISMLGKDVDANKEKIVIFMSNGKPNAYTGKFYKGPESTISKEKISSLNRYEQRLYEITSLNGNEDGLGKESLSQEEVAMNNKIKDYEKYFYDPESLDDYRKQDFQKRGLRSDKVNNLIWNEYGISHANSYINEIYKGKSTYSVNVLPNKDDGENIISYYMGSEIGYAYSLKMAKEMKDLGISTYPIYFDNDGNSNNERNNDTRENTMKLISKFAGNEERNGVTSVNTVHSNDITASLNDVFTNLDKNIKDSYSVNDAKLTINIPEGLEIESINYSGKTIKINKEDLKDGKYQLPLNNLSYKLDERDRIYIYDGKPLEISVTVRGINTSGSDKNCSITGDVYSKSIEDSKKADLPNINIKVKSGIKVEITVNDFIGNVGEKYDSTYINPENNSFNFIKEPKRLIGDGNADISVNGIQEKSNEEYWIKTWFTKENSKEEINPEEFKLNNINSDIDLDKANNLTYQSYNVDNLQATGDMDKWNNRDIVFAKKQSKGILPSNIIATEPYVGFTKDNKNKAYLDINNDVKLTYEGKNLTYENSDDTYSIWSYQDRGIKKLYYYYENDKWYNSTSRFAWKVDVMNTRKYTFKHNTIFYDEMNIGKECALRYPGFQYKEADKYWGYIRPKESGWYLFGTYSDDGSRFSITKDGETYELSKSNFGLNNKGGYWYIGQENSNFKVHGSSFYSSFTPIYLEEDKYYPIQLEYFNWGGGGAFKLAYCKLDNYENDKNGQFILKMLNQASIDENYKGFSNVFYREGYWNNYTYNLTERFNDYLNNIKFNWIGGGKEEDNFTLYPSKSNDPGDIAEEVFEGKSGVKLPTDAGVYTMHYKIITREKGSDKSGRVINDNVQSGEYGKFEVKDLLDNSINVVGSNDKKEIYLNEKAKAIYKMIPDNIKAEDIIRDSNDFPDEIKLVGIEVDGLLPKGMKFDKNNNQGTTLGVESDGETRFVTDKMPDITYHLENDVYVAKQFDKIINVSIESNGPFEFKSSENKVKFNLNYKDKTTKTMIERFKGTSISASEPTKIEKFGILDSSSSDNIKDASEGVQVVNGIPLKVAILADVKSPNSIIDLGFNSKNIKLSKDTESQFNIKIYNKGNLINSEKEFTINKLEGSLIEGLNSGIKISGLDVGEKVIVIELIPNNIEINNSALLKTKVENSNDKEHLAKLDYAEMPDVF*