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NECEvent2014_8_5_scaffold_619_5

Organism: NECEvent2014_8_5_Clostridium_perfringens_28_24

near complete RP 51 / 55 MC: 1 BSCG 51 / 51 MC: 1 ASCG 15 / 38 MC: 1
Location: 4813..6261

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
CpsU n=1 Tax=Clostridium sartagoforme AAU1 RepID=R9C5A1_9CLOT similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 51.0
  • Coverage: 469.0
  • Bit_score: 493
  • Evalue 2.30e-136
  • rbh
CpsU {ECO:0000313|EMBL:EOR24549.1}; TaxID=1202534 species="Bacteria; Firmicutes; Clostridia; Clostridiales; Clostridiaceae; Clostridium.;" source="Clostridium sartagoforme AAU1.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 51.0
  • Coverage: 469.0
  • Bit_score: 493
  • Evalue 3.20e-136
rfbX; putative O-antigen transporter similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 38.8
  • Coverage: 467.0
  • Bit_score: 353
  • Evalue 1.10e-94

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Clostridium sartagoforme → Clostridium → Clostridiales → Clostridia → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 1449
ATGAAAAGTAATAAAATTATATCAAATTATTTCTATAATATGTTATATCAGGTTATGAATATAATAATTCCTATACTAACTATACCATATATTTCAAGAGTACTTGGGGTAGAAGGTGTTGGAACAAATGGATATGTATCTTCGATAGTTATTGTATTTACAGCAATTTGTACTTTTGGAATGATTAATTATGGGAGTAAAAGTATAGCTTATGTAAGAAATAAAAAGGATCAAATAAGTAATGAATTTTGGGGTATTTGGATAGTTCAATTAAGTGCAAGTATAATTAGTATAATAGTTTTTATTTTAGTATTTATAATTTTAGATTATTTAAATATGAAATTATTATTTGTAATGCAAATACCTAATTTAATAGCTGCATTGCTAGATATATCTTGGTTTTTTATTGGTATAGAAGACATTAAAAAAGTATCATTACGAAATATACTAGTTAAAGTTATAGCACTTGTATTAATTTTTTTACTTATTAAATCTGAAAGAGATCTATGGTTATATATGTTAATAAATTCTGCATCAGCATTAATAGGAAATATATATTTCTGGATATATATACGAAGGTATATACATTTCTCTAAATTGAAAAAATTAAAAATAAAAACACATATGAAAGGTGCATTTATATTGTTAATTCCTCAATTAGTTGCACAAATATATACATCATTAGATAGAACAATAATTGGTGGAGTATCAAATTTGGTTGAGGTAGGTTATTATGATCAATCTCAAAAGATAGCACGAATAGCTTTAACAATAGTAACATCTTTAAGTATAGTATTGATGCCTAGAATTGCTAATATGTATGCAGAAAATGATGATAAAAATATTTTAACATTTTTAAAAAAATCGTTAAACTTTACTATTTTTACATCAGTATTAATAGCTGCAGGTATAGCAACTATTTCACGAGAGTTTGTACCATTATTCTTTAGTAATGAATTTTTGGTTATTATTCCATATATGATGTTAAGTAGTTTTATTATAATTTTTATTTCTATAGGTGGTGTGTTTGCAAATCAATATGCATTAGCAACAGAAAAAAATAAGGAGTATTTAATACCATTAGTGAGTGGAGCAATTATAAATGTAGTTTTAAATTTTATATTATCATCAAAGCTAGGTGCTTTAGGTGGAGTAATTTCAATTATAGTTACTGAATTTATAATAATGATATTAAGAATTATATTGGTTAAAAAATATATAAATATAAAATTTCTATTTAGTGGCACTTATAAATATATAATAAGTGGTATGGTCAGTTTTGCTATAAGTTACTTTATATCATATTTACAAATAGGAAATTTATCAATAATAATTCTTAAAGGAATAGTATGTATAGTTATTTATTTATTAACTTTATTGATTTTATATAAAAATAAAACTAATTTATTAAATGTATTTAAGGAAAAAATTTTAAACTGTGTCAGATAA
PROTEIN sequence
Length: 483
MKSNKIISNYFYNMLYQVMNIIIPILTIPYISRVLGVEGVGTNGYVSSIVIVFTAICTFGMINYGSKSIAYVRNKKDQISNEFWGIWIVQLSASIISIIVFILVFIILDYLNMKLLFVMQIPNLIAALLDISWFFIGIEDIKKVSLRNILVKVIALVLIFLLIKSERDLWLYMLINSASALIGNIYFWIYIRRYIHFSKLKKLKIKTHMKGAFILLIPQLVAQIYTSLDRTIIGGVSNLVEVGYYDQSQKIARIALTIVTSLSIVLMPRIANMYAENDDKNILTFLKKSLNFTIFTSVLIAAGIATISREFVPLFFSNEFLVIIPYMMLSSFIIIFISIGGVFANQYALATEKNKEYLIPLVSGAIINVVLNFILSSKLGALGGVISIIVTEFIIMILRIILVKKYINIKFLFSGTYKYIISGMVSFAISYFISYLQIGNLSIIILKGIVCIVIYLLTLLILYKNKTNLLNVFKEKILNCVR*