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NECEvent2014_4_5_scaffold_73_28

Organism: NECEvent2014_4_5_Veillonella_parvula-rel_39_99_partial

partial RP 17 / 55 MC: 1 BSCG 15 / 51 ASCG 9 / 38
Location: comp(23887..26787)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Helicase C-terminal domain protein n=1 Tax=Veillonella atypica ACS-134-V-Col7a RepID=E1LD85_9FIRM similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 83.1
  • Coverage: 967.0
  • Bit_score: 1633
  • Evalue 0.0
  • rbh
Helicase C-terminal domain protein {ECO:0000313|EMBL:EFL57449.1}; TaxID=866778 species="Bacteria; Firmicutes; Negativicutes; Selenomonadales; Veillonellaceae; Veillonella.;" source="Veillonella atypic similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 83.1
  • Coverage: 967.0
  • Bit_score: 1633
  • Evalue 0.0
type III restriction protein res subunit similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 72.1
  • Coverage: 968.0
  • Bit_score: 1457
  • Evalue 0.0

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Veillonella atypica → Veillonella → Selenomonadales → Negativicutes → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 2901
ATGTTTGATTCAAAAAATATGATTAATTTTTCTACAACCGAGCTCATTGCTAATGGGGAGGGACGTAATGTTTTATCTGCTATTGAGGATGGCTTACGTACATGTGATGAGTTTATTATTAGCGTAGCCTTTATAACTGCAGATGGATTATTGGTATTGAAACCTATTTTGAAAGAATTAGAAGATAGAGGCATAAAGGGTCGTATTTTAACTACAGATTATTTAGGGTTTAATAATCCAGATGTTCTTGATGATTTAGGGCATTTAAATAATATAGAGCTTCGTGTATATTGCACTAGTAATGGCAGTAAACATGGTTTTCATACAAAGGGATATATTTTTAAACAAGATCAGTTATATCAAATAATAGTAGGTAGTTCGAACTTAACTATTAATGCGCTAAAAAAGAATAGAGAATGGAATACTAGAGCTCAATCTCATAAAGATGATACTTATACTAAAGAAGTTTTAGAGGAGTTTGAATTGTATTGGAATTCCGAGTTTACTATGAAATATTCTGAGTTCTTGCCATGGTATAGGCCTAGATGGGAACGGTCCAATCGTCAATCACTACAAAGTATTGCAGAACAAGTAGAGTTAAAAGGCTCCTTAAAATTGGAGCCTAATTTGATGCAGCGTCAATTTATAGATAACTTTAATGAGTTAAGATATAGAAATGAAACTCGTGGATTATTAATTTCTGCTACAGGTACTGGTAAAACTTATGCAGCAGCATTCGCAATGCGTGATATGAAACCCAAAAGATTGCTGTTTTTGGTGCATCGAGAACAAATTGCAAAGCAAGCATTGGGAAGTTTTCAACGTGTTTTTGATGATAAGTCGATTTCGTATGGCATTGTTTCAGGAACTGTAAAACGTTTTGATGCAGATTATGTATTTTCAACTATGCAAATGATGGGGCGCTCTGATATTTTAAAAAAATATAATCCAGATGATTTTGATTGTATTATTATTGACGAAGTGCATCGGGCAGGCGCAGAGAGTTATCAACGAATTATTGACTATTTCAAGCCCAAATTCTTATTAGGTATGACAGCTAGTCCAGAACGTACTGATGGATATGACTTATATAACTTATTCCATCATAATATTGTCTATGAGATTAGATTAGAGCAAGCGCTAGATGAGGATTTATTGTGTCCATTCCATTACTTTGGGATAAGTGATCTTTGGATAGATGGAAAGGAAATAAACATTGAAGAGGATAATATTAGTTTTTCCAATTTGTCTGAAGGAGAACGGGTTGATAAAATCATTGAAAAAATTCGTTATTTTGGTCATAGTGGACGTCGTGTTAAAGGCTTAGTATTTTGTAGCAATAAAAAAGAAGCAAAAGAGTTATCTGCTGCATTCAATCTTAGGAGATTTAGGACTATTTCCTTAACTGGTGAAGATTCACAAGAAATACGTGAAGATGCAATAGCACGATTGACAGGGACTGGTGATTATCAAGGTATTGTAGATGAGCAATTGGATTATATATTCACAGTAGATATTTTTAATGAAGGCGTAGATATTCCAGAAGTAAATCAAGTTATTATGTTGCGGCAAACAGAAAGTCCTATTGTATTTATTCAACAGTTAGGTCGTGGTTTACGGAAGTTTGAAGATAAGGAATTTGTAGTTATCTTAGATTTTATAGGTAATTATTCTAATAGCTATATGATACCATTAGCGTTATCTGGTGATAGAAGTTATAACAAGGATACTTTACGAAAATATGTACAATCAGGGAATCGTATTATTCCTGGAACGTCAACCGTTCATTTTGATGCTATTGCTAAAAAACGTATCTTTGCTGCTATAGATACAGCTAATTTAAGTAGTGCTAAAATTATTAAAGAAGCATATCTAGATTTGAAATATAAGTTGGGACATGTACCGAGAATTAAAGACTTTAAAGAATATGGCTCTATTGATATAACAAAAATTTTTAATAAATATAAGTCTTACCATCATTTTTTAATCCAAATAAAGGATAAAGACTACAATGTATCTCTTACACCAATTCAAGAACAAATGTTACACTACATATCTCAAAAGTTAGCAACAGGCATGCGTGTGAGAGATTTATTGGCGTTACAGCTTTTATTGGCTGGGAAAGACAATATTATTCATCGAGTAACAGAATTATTGCATGGTGAGTATGGTCTTGAATTATCTGATAAAGGGAGAATTAATTTAATTAATATATTATCTAACCAGTTTTCTGTATCATCTGCAAAAAAAACATTTAAAGATTGTATTTTTATTGAGGCAGATGGTAATGACTATTCAATTTCTAAAATATTTAAAAAGGCTTTGGAGAATGAAGATTTCAGAAAGCATATAAGTGAATTGATAAGTTTTGGATTAGACCGCTATCATACTAGATATAAACATAGTATCTTAAATAATACGCCATTTGCTATTTATGAAAAATATAACTATGAACAAGTATGTCAATTGTTAGAGTGGCCTCAAAATGAAGTTCCGTTGAATATAGGTGGATATAAGTATCATCGTGAAACAAAAACATATCCTGTCTTTATAAACTATCATAAAGATGAAGGAATTCAGGATAGTATAAAGTACGAAGATAGATTTGAATCCCCGACTTTGATTAAAGCAATTTCTAAAAACAATCGATCGTTCACATCTGATGATGTAGTATCGGCTTTTGATGCTGATAGCCTAGATATCGCAATGCACTTATTTGTACGTAAAAATAAGGATGACGAAGAGTCTAAAGAGTTTTATTATTTAGGGCCTATCCATTCAACAGGAAAGGAAAATGCAAAAGAGATTGTAATGGCGAGTGGCACAAATGCGGTTGAATTAGAATATAGATTGGATATACCAGTGCGTGATGATATATATGATTATTTAATAAATGGATAG
PROTEIN sequence
Length: 967
MFDSKNMINFSTTELIANGEGRNVLSAIEDGLRTCDEFIISVAFITADGLLVLKPILKELEDRGIKGRILTTDYLGFNNPDVLDDLGHLNNIELRVYCTSNGSKHGFHTKGYIFKQDQLYQIIVGSSNLTINALKKNREWNTRAQSHKDDTYTKEVLEEFELYWNSEFTMKYSEFLPWYRPRWERSNRQSLQSIAEQVELKGSLKLEPNLMQRQFIDNFNELRYRNETRGLLISATGTGKTYAAAFAMRDMKPKRLLFLVHREQIAKQALGSFQRVFDDKSISYGIVSGTVKRFDADYVFSTMQMMGRSDILKKYNPDDFDCIIIDEVHRAGAESYQRIIDYFKPKFLLGMTASPERTDGYDLYNLFHHNIVYEIRLEQALDEDLLCPFHYFGISDLWIDGKEINIEEDNISFSNLSEGERVDKIIEKIRYFGHSGRRVKGLVFCSNKKEAKELSAAFNLRRFRTISLTGEDSQEIREDAIARLTGTGDYQGIVDEQLDYIFTVDIFNEGVDIPEVNQVIMLRQTESPIVFIQQLGRGLRKFEDKEFVVILDFIGNYSNSYMIPLALSGDRSYNKDTLRKYVQSGNRIIPGTSTVHFDAIAKKRIFAAIDTANLSSAKIIKEAYLDLKYKLGHVPRIKDFKEYGSIDITKIFNKYKSYHHFLIQIKDKDYNVSLTPIQEQMLHYISQKLATGMRVRDLLALQLLLAGKDNIIHRVTELLHGEYGLELSDKGRINLINILSNQFSVSSAKKTFKDCIFIEADGNDYSISKIFKKALENEDFRKHISELISFGLDRYHTRYKHSILNNTPFAIYEKYNYEQVCQLLEWPQNEVPLNIGGYKYHRETKTYPVFINYHKDEGIQDSIKYEDRFESPTLIKAISKNNRSFTSDDVVSAFDADSLDIAMHLFVRKNKDDEESKEFYYLGPIHSTGKENAKEIVMASGTNAVELEYRLDIPVRDDIYDYLING*