ggKbase home page

NECEvent2014_4_5_scaffold_84_19

Organism: NECEvent2014_4_5_Veillonella_parvula-rel_38_17_partial

partial RP 6 / 55 MC: 1 BSCG 6 / 51 MC: 2 ASCG 6 / 38 MC: 1
Location: comp(21155..24364)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Putative multidrug efflux pump BpeF n=1 Tax=Veillonella atypica KON RepID=L1PZC1_9FIRM similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 96.4
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 2003
  • Evalue 0.0
  • rbh
Putative multidrug efflux pump BpeF {ECO:0000313|EMBL:EKY20732.1}; TaxID=1128111 species="Bacteria; Firmicutes; Negativicutes; Selenomonadales; Veillonellaceae; Veillonella.;" source="Veillonella atyp similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 96.4
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 2002
  • Evalue 0.0
hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family transporter similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 81.6
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1732
  • Evalue 0.0

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Veillonella atypica → Veillonella → Selenomonadales → Negativicutes → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3210
GTGTCGAAATTTTTCATTAATCGACCTATCTTTGCCATTGTTATAGCCATCATGATTACATTGGCCGGCCTTATTTCAATGGTTAACCTTCCGATAGCTCGATATCCACAAATTTCTCCGCCATCAGTACAAGTTAGCACTGCGTACACAGGTGCTACTGCTCAAGTCGTAAATGATACTGTGGCTAGTGTTATTGAAACACAAATCGTTGGGGTTCAAGATTTAGACTTTATGACGTCTACAAGTTCCAGTAATGGTACCTATTCCTTGTCACTCCAATTTAATCAAGGCAGCGATGCCGATATGGATACGGTTAATACACAAAACCGTGTACAAGCAGCACTTGCACAATTGCCATCCGAGGTTCAACAAGTTGGTGTAACAACTACGAAATCATCCGGTGATATGGCATATATTTTCTCCTTGAACTCTCCTAATGGTACATTTGATAGTACATTCCTTAAAAACTATGGTACTAACTATTTGATGGATGCCATTAAAGGGGTAAAAGGCGTTGGTTCTGTTCAAGAGTTTGGTTCCGACTATGCAATGCGCATATGGTTAGATCCTAGTAAGATGCAAAAATTAGGTGTTACTCTTTCAGAGGTAACAGCTGCTATTAAGAGTCAAAACGTACAAGCTGCAGCTGGTACAGTTGGTAAGAACCCTACAAATGGGGAACAAGCATTCCAATATCCGATTAAAATTGATGGTCGTCTTGTAACAGAGGAACAATTTGGCAATATTGTTATCAAAAATTCTAATGGTACAGTATTACATTTAAAGGACATTGCTCGTATTGATGTAGGGGCTAAGGGTTATGATTTTACTCCTAAAGCTTCCTATCGTGATAAAAATGCAAAATCTGATGAAGTTCTATTTGTTGAACATCGACCAACTGCTGGTTTTGCTGTTTCTTTACAAAATGATGCGAATGCGTTAGAAACGATTGCAAATGTTCAAAAAATCTTAGCAGAACAATCTAAATCGTTTCCACAAGATTTGGAATATCATGAAGTTGTAGATAATACTAAATTCGTACGTGCTTCTATTAATGAAGTAGAGCATACATTCTTTGAAGCATTAGTACTTGTTCTTATCGTCGTGTACGTATTCTTACAATCTTGGCGATCTACATTGATTCCGATGATTGCGGTTCCTGTATCTCTACTCGGTACATTCGGTGCGTTTGTATTGTTGGACTTCTCTATCAATACATTGACTCTATTTGCCATGGTACTGGCCATCGGCCTTGTCGTGGATGATGCTATTGTAGTAGTAGAAGCTGTAGAGTATGAATTAAAATATAATGGCTTATCTCCAAAAGAGGCAGCTATAAAAGCCATGGAAAACGTACAAGGTCCAGTTATAGGTATTGCTTTTGTATTATCTGCCGTATTTATTCCAGTTGCCTTTATGGGTGGTATGACTGGTATATTGTATAAGCAATTTGCTTTGACGATTGCTGTATCTGTAGCTATTTCTGCTATTGTGGCATTAGTGTTAACACCTGCACTTTGTGCGATGATGTTAAAACCTCATGTGCATAAAGAACGCGAAGACTTCGTTCATCGTCAACTTAATAAATTCAATCATGGTCTTGAACGATTTAGTGATTGGTATGGTAAGATACTAGCTCGATTAAGCCATCGTTTGAGCTTAACTATTCTTACACTACTTGTTTTTGCGGCTGGTACAGGCATTGTATTCCATTTCTTGCCTACAAGTTTCGTACCTGCGGAGGATAGTGGATATTTCTTAATTGCAGTAAACGAACCACCAGGTGCAACGTCTGCTCGTACCGTAGAAACTCTAGATAAAATCAAAGATTTCTTAGAACAGACACCGGGCATTAAAGATAATGTAGAACAAGTATTTACAGTTTCTGGTCTTGACCTTTTAGGTGGTGGTCAAAAATCTAGTGCTGGGGCTTCCTTTGCGGTATTGAAAGATTGGGATCAACGTAAGTCTTCTGATCAATCTGTTAATGCCATGGTTGGTGCTGTATTTGGCTTTGCTGCTAAAAATATTCCAGAAGCGAGTGTGGTAGCATTGAATCCTCCATCTATTCCTGGTCTTGGTAATACTGGTGGTTTTACAATGTATATCATCAATAAATCTGGTGATAGTGCAGAGGTAATGGCTGAACGGGCACAAGCTTTCATTGCAGAAGCTCGTACTAAACCAGCTATCCGAACAGTGTATACTACATTTGATACTGCTACACCTTCTTTGCAGTTCCAAATTAATCGAGAAAAAGCAGCTCAAGACGGTGTTGCTTTGCCTGATATTTTTACTGCTTTGCAAGGCTTCTATGGTAGTATCCAAGTTAACGATTATACATCATATGGTAAAAACTATAAGGTTATTGTTCAAGCAGATGACGCATTCCGTCAAAATGCAGATAACTTGAATATGCTAGCAGTTCGTAATAGCAAGGGACAAATGGTTTCCGTTGCTAACTATATTACGAAAGAAAAAACTGGCACACCATCATCTATTACGCGTTTCGATAATGCCATGGCTGTCCAAATTGGTGGTTCTGCCGCTAATGGTTACTCCTCTGGTGATGCCATCCAAGCATTGAAAAATGCAGCTGCTAAAACATTGCCACAAGGGTATACATATGATTGGGGCGGCCAAACACGTGAAGAGTTAAAAGCCGGCTCTCAAACACTCCTAATTCTAGGTCTTGGTTTGATATTTGTATTCTTAATTCTTGCTGCATTGTATGAATCCTGGAAGGTTCCATTTGCCGTACTATTCTCTGTACCATCTGGTATGATTGGTGCTACATTAGTACCATTCTTGTTGAATTTTACCGGTCGATTCCAATTAGCAAATGATATTTACATGCAAATCGGTTTATTAACCTTGGTAGGTTTGGCGGCGAAGAACGCCATTCTGATTATCGAGTATGCGAAGATTCGTGTAGATGAACGCGGTATGGATATCGTCGATGCGGCTATCGAAGCAGCTAAGATTCGTTTGCGTCCAATTTTGATGACATCCTTTGCCTTCATCTTTGGTGTATTGCCATTGGCAATTTCCACTGGTGCCGGTTCTGGTGCTCGTACATCAATGGGTATCACAGTAGTAGCAGGTATGACAACAGCTACGTTCTTTGGTATCTTTATTATTCCAATGCTTTTCATCATCATTGAAAAGATTGGTCCTGGATTCTTTACGAAACGTAAAAAGAATCACTAA
PROTEIN sequence
Length: 1070
VSKFFINRPIFAIVIAIMITLAGLISMVNLPIARYPQISPPSVQVSTAYTGATAQVVNDTVASVIETQIVGVQDLDFMTSTSSSNGTYSLSLQFNQGSDADMDTVNTQNRVQAALAQLPSEVQQVGVTTTKSSGDMAYIFSLNSPNGTFDSTFLKNYGTNYLMDAIKGVKGVGSVQEFGSDYAMRIWLDPSKMQKLGVTLSEVTAAIKSQNVQAAAGTVGKNPTNGEQAFQYPIKIDGRLVTEEQFGNIVIKNSNGTVLHLKDIARIDVGAKGYDFTPKASYRDKNAKSDEVLFVEHRPTAGFAVSLQNDANALETIANVQKILAEQSKSFPQDLEYHEVVDNTKFVRASINEVEHTFFEALVLVLIVVYVFLQSWRSTLIPMIAVPVSLLGTFGAFVLLDFSINTLTLFAMVLAIGLVVDDAIVVVEAVEYELKYNGLSPKEAAIKAMENVQGPVIGIAFVLSAVFIPVAFMGGMTGILYKQFALTIAVSVAISAIVALVLTPALCAMMLKPHVHKEREDFVHRQLNKFNHGLERFSDWYGKILARLSHRLSLTILTLLVFAAGTGIVFHFLPTSFVPAEDSGYFLIAVNEPPGATSARTVETLDKIKDFLEQTPGIKDNVEQVFTVSGLDLLGGGQKSSAGASFAVLKDWDQRKSSDQSVNAMVGAVFGFAAKNIPEASVVALNPPSIPGLGNTGGFTMYIINKSGDSAEVMAERAQAFIAEARTKPAIRTVYTTFDTATPSLQFQINREKAAQDGVALPDIFTALQGFYGSIQVNDYTSYGKNYKVIVQADDAFRQNADNLNMLAVRNSKGQMVSVANYITKEKTGTPSSITRFDNAMAVQIGGSAANGYSSGDAIQALKNAAAKTLPQGYTYDWGGQTREELKAGSQTLLILGLGLIFVFLILAALYESWKVPFAVLFSVPSGMIGATLVPFLLNFTGRFQLANDIYMQIGLLTLVGLAAKNAILIIEYAKIRVDERGMDIVDAAIEAAKIRLRPILMTSFAFIFGVLPLAISTGAGSGARTSMGITVVAGMTTATFFGIFIIPMLFIIIEKIGPGFFTKRKKNH*