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NECEvent2014_4_7_scaffold_1661_2

Organism: NECEvent2014_4_7_Clostridium_perfringens_28_5

near complete RP 49 / 55 MC: 2 BSCG 48 / 51 MC: 2 ASCG 15 / 38 MC: 2
Location: comp(1989..3950)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Histidine kinase {ECO:0000256|SAAS:SAAS00251121}; EC=2.7.13.3 {ECO:0000256|SAAS:SAAS00251121};; TaxID=883064 species="Bacteria; Firmicutes; Clostridia; Clostridiales; Clostridiaceae; Clostridium.;" so similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 99.8
  • Coverage: 653.0
  • Bit_score: 1275
  • Evalue 0.0
sensory box histidine kinase (EC:2.7.3.-) similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 99.8
  • Coverage: 653.0
  • Bit_score: 1275
  • Evalue 0.0
Sensory box histidine kinase n=4 Tax=Clostridium perfringens RepID=H7CS01_CLOPF similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 99.8
  • Coverage: 653.0
  • Bit_score: 1275
  • Evalue 0.0
  • rbh

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Clostridium perfringens → Clostridium → Clostridiales → Clostridia → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 1962
GGTATATCCCCTCTTATTACTAAACATAAAATAATTACATCAATAGTAGTTTTTTTATTTTCAGTTATAACACCTATGATTAACTATAGAATTTTTTCTAACAATTTATTTGCTAAAGATATTTATTTTTATGCTACTTTAATGACTATGATTATTATCCTATACATAATCGCTTGCATATTCTTATCAAAGAAATCTTTAGATGATTGTGAGTTAATATATTCATTTATAATTGCTAGTATTCTTTTAATAGCCCTTAGAGGATTATATTGGATTTGTGAAGTGCTTCTTCCAAATATAACACTTTTAAAAACCAATAATGTTGTTCTTCTACTTACCATACTATCATTTTTATTGGCTATAAGTGGAGTTTTTAATGAAATTACGGCTAAAAACAAAAGAAGCTCTTTACTACAAAATGAACTTCAAGTTTTTTATCACTTAGTTGAATTTAATACTAGTAGTTCTATAATTTTATATGATAATAAAAAGAAGGTTATATATACAAACAAGACAATAAGAGAACGCTACTGCAAATCAACTAAATTAAAAGATCAACTTAAAGAGGTAGAAAAATTATTTGTAGATTCGATTTTTATAGATGACTCTGAAAAAAATGCTACTAAAGCACTTTTTAATAAGGGCAACTGGGAAGGTGAGCTTATTTTAAAAAATGGCAAAATAGTAAGTGCCTACATACAGATATTAAATGTTGAAAATAAAAATTATTTTGCTGTAAATTTAAAAGATATAACCGAAGAATATACCCTAACAAAAAATATTAAAAGAAATGAACAATTATTAAGTTGTATAAATAATAACGTACAGGATTTAATAATAAGTGTTGATAATAATGGTTTAATTACATATGTTAATGATTCTGTATTAAAAACATTAAATTATACCTATGAAGAAATTATAGGAATGCCTATAATAAACCTTTTAGGTAAAAATGATGAGATATTAAATCAATTAAAACTAGAAGATGAGGAAGATAGTATTAAATGTAAACTTGTTGGTAAACATTCCTTTGTATATGTAGAATCTATAATTAGAACTTTAAATGATAATAATGAAATTCCTTATGGAAAAGTTATAGTTGCAAAAAACTTAACCTCTAAAAAACGTCTTGAAAATTTAGCTATAAAATTTAAAGAAGCTAAGGCTTATGAACAAATAAGAAATGAATTTTTCGCCAATATATCCCATGAGCTTAGAACACCACTTAATATTATCTATTCTACAATACAGTTATTAAATTCTAAGCATGAAACTGATCCTATGGACTTTAATAACTTCTATGATAAATATAAGCAAGGTCTTAAGATAAATTGTTATAGAATGCTTAGACTTATAAATAACCTTATTGATGTTAGTAAAATTGAAGTTGGATTTTTAAAAGCTGATTTTACTAATAGAGATATAGTATTCCTTGTAGAAAATATAGTATCTTTGGTTATTCCTCATTCTGAAAATAAGGATATTAATATAATCTTTGATACTAATGTTGAAGAAAACATAATAAAATGTGATCCTGTAAAAATTGAAAGATTAATTCTTAACTTACTTTCAAACGCAATAAAATTCACCCAAAATCATGGTGAAATATTTGTAGATTTAAACATCTCAAAGGATTGGGTTAAAATAAGCATAAAAGATAATGGAATTGGTATTCCCAAAGAAATGCAAGCATCAATTTTTGATAGATTTGTACAAGCTGATAAATCCTTAAAAAGAAGAAATGAAGGTAGTGGAATAGGTCTTAGCATTGTAAAGTCTATTGCAGAACTGCATGATGGTAAAATTGAACTTATAAGTGATGGAATAAAAGGTTCAGAATTTATAGTATGGCTACCAAATGTAAAATTAAATTACACAGAAGAAAGCAATAATTTAGTTGATTATATAACAGATGATAAAAATATAGAGTTAGAGCTTTCTGATATTTATGAAGTACATTAA
PROTEIN sequence
Length: 654
GISPLITKHKIITSIVVFLFSVITPMINYRIFSNNLFAKDIYFYATLMTMIIILYIIACIFLSKKSLDDCELIYSFIIASILLIALRGLYWICEVLLPNITLLKTNNVVLLLTILSFLLAISGVFNEITAKNKRSSLLQNELQVFYHLVEFNTSSSIILYDNKKKVIYTNKTIRERYCKSTKLKDQLKEVEKLFVDSIFIDDSEKNATKALFNKGNWEGELILKNGKIVSAYIQILNVENKNYFAVNLKDITEEYTLTKNIKRNEQLLSCINNNVQDLIISVDNNGLITYVNDSVLKTLNYTYEEIIGMPIINLLGKNDEILNQLKLEDEEDSIKCKLVGKHSFVYVESIIRTLNDNNEIPYGKVIVAKNLTSKKRLENLAIKFKEAKAYEQIRNEFFANISHELRTPLNIIYSTIQLLNSKHETDPMDFNNFYDKYKQGLKINCYRMLRLINNLIDVSKIEVGFLKADFTNRDIVFLVENIVSLVIPHSENKDINIIFDTNVEENIIKCDPVKIERLILNLLSNAIKFTQNHGEIFVDLNISKDWVKISIKDNGIGIPKEMQASIFDRFVQADKSLKRRNEGSGIGLSIVKSIAELHDGKIELISDGIKGSEFIVWLPNVKLNYTEESNNLVDYITDDKNIELELSDIYEVH*