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NECEvent2014_10_1_scaffold_135_7

Organism: NECEvent2014_10_1_Lactobacillus_gasseri_34_15

near complete RP 49 / 55 MC: 8 BSCG 51 / 51 ASCG 14 / 38 MC: 1
Location: comp(5541..8402)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
UvrABC system protein A n=2 Tax=Lactobacillus gasseri RepID=D7V279_9LACO similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 953.0
  • Bit_score: 1891
  • Evalue 0.0
  • rbh
UvrABC system protein A {ECO:0000256|HAMAP-Rule:MF_00205, ECO:0000256|SAAS:SAAS00088996}; Short=UvrA protein {ECO:0000256|HAMAP-Rule:MF_00205};; Excinuclease ABC subunit A {ECO:0000256|HAMAP-Rule:MF_0 similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 99.9
  • Coverage: 953.0
  • Bit_score: 1888
  • Evalue 0.0
uvrA; excinuclease ABC subunit A similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 99.9
  • Coverage: 953.0
  • Bit_score: 1888
  • Evalue 0.0
  • rbh

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Lactobacillus gasseri → Lactobacillus → Lactobacillales → Bacilli → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 2862
ATGGCAAATGATAAAATTGTAATTCATGGAGCGCGTGAACATAATTTAAAAGATATAAGTTTATCGATTCCAAAAGATAAATTAGTAGTTATTACCGGCTTATCAGGCTCAGGAAAAAGTTCATTAGCTTTCGATACTTTATATGCTGAAGGTAGAAGAAGATATGTTGAGTCACTATCAAGTTATGCTAGACAATTTTTAGGCCAAATGGATAAGGCTGATGTTGATTCAATTGATGGCTTAAATCCCGCAATTTCCATTGATCAAAAGACGACGTCTCATAATCCGCGTTCAACAGTTGGAACTGTAACAGAAATTAATGACTATTTGCGTTTACTGTGGGCACGCGTTGGTCATCCAATTTGTCCAAATGATGGAACTTTGATTGAGAGACAAAGCGTGGATCAGATGGTAGATCGCGTAATGGATTTACCTGAAAGAAGCAGAATTCAGATTTTAGCTCCAATTATTCGCGCTAAAAGAGGAGAACATAAGGAAGTATTTAAACGAATCCAGCGTGCGGGTTATGTACGGGTAATTGTAGACGGTGAAATGCATGAAATCACTGATGATTTTGACCTAGACAAAAATAAACGGCACAGTATTGATATTGTTGTTGACCGCTTAATTGTTAAAGAAAATATTCGAAGTCGTTTATTTGATTCTGTTGAAGCTGCTCTTCGTTTGGCAGATGGCTACATGGATGTTGATGTGATTAAAGGTGAACGTATTAACTTTTCTGAATACTATGCCTGTCCAATATGTGGCTTTACGGTCGGCGAAATGGAGCCTCGTTTATTTTCATTTAACGCGCCTTTTGGAGCTTGTCCTGATTGTGATGGATTGGGGATGAAATTATCAGTTGATGAAGATTTAGTTATTCCTGATAAGGATAAAACTTTAGCAGAGGGAGCTTTAGTGCCATGGTCTAATTCAAAATACTATACTGCCATGCTTGAGCAAGCATGTATGGCTTTAAAAATACCTGTGGACAAGCCATATAAAAAATTAACTAAAAAGCAAAAAGATCTAATTTTAAATGGATCTAAAGGGAAAAAAATCAAATTTCATCTTGAAGGTGACTTTGGTGTAAATGATACTGTTCAAGAATTTGAAGGAATTTTAAATAATATCAATCGTCGTTATCATCATCCAATGTCAAAATTTATGCGTGATGCAATGGGTAAGTATATGACTGAACTTACTTGTTCAACTTGTCACGGTAAGCGATTAAATGAAAAGGCATTAGCAGTAAAAGTAAATGGCAAAGATATTGCTGAAGCTTCTGATCTGTCAATTTCTAAGTCATTGAACTTTTTTAATTCAGTAAAATTAAGTGAACAAGAAAAGATGATTGCTAAACCAATTTTGAAAGAGGTACGTGATAGATTAACTTTCTTAAAGAATGTTGGTTTAGACTATCTGACTTTATCTCGTTCTGCTGGAACTTTATCCGGTGGAGAAGCACAAAGAATTAGACTAGCAACCCAAATTGGCTCTAATTTATCTGGCGTTATGTATATTTTGGATGAGCCATCAATTGGTCTTCATCAGCGAGATAACGATCGACTTATTTCTTCGCTGAAAAAGATGCGGGATCTTGGTAATTCTTTAATTGTAGTCGAACATGACGATGAAACGATGAAACAGGCCGATTACTTAGTTGATATGGGACCAGGAGCAGGTGTATATGGCGGAAAAGTAATGGCTGCTGGTACACCAGAAGAAGTGATGAAGAATCCTAAATCTTTAACTGGACAATATTTATCAGGTAAAAAGATCGTTCCTGTACCGTTAGAGAGAAGAAAGGGTAATGGTAAAAAAATTACTGTTACTGGTGCTGCTGAAAATAACTTGAAGGATATTTCAGTAGATTTCCCTCTAGGGAAATTTGTTGTAGTAACCGGCGTTTCAGGTTCTGGAAAATCAACTCTTGTAAACTTGATTCTGAAGCGTGCTTTAGCACAAAAATTAAATAATAATTCAGCTAAACCAGGAAAGTATAAGTCAATTAAGGGATATAAAAACATCGAAAAAATTATCGATATTGATCAAAGCCCTATTGGGCGGACACCACGTAGTAATCCTGCAACTTATACTAGTGTATTTGATGATATTCGAGCTTTATTTGCACAAACTAATGAAGCAAAAATGCGTGGATATACTAAAGCGAGATTTTCTTTTAATGTTAAGGGCGGTAGATGCGAAGCTTGTCATGGTGATGGAATTATTAAAATCGAAATGAATTTCTTACCTGATGTTTATGTACCTTGTGAAGTTTGTCATGGGACAAGATACAATTCAGAAACTCTTGAGGTAACTTACCGTGAAAAAAATATCTCGCAAGTTTTGAATATGACAATTAATGAAGCTTGCAAATTTTTTGAAAATATTCCTAAAATTCATCGTAAGCTACAAACAATCGTTGATGTTGGTTTGGGTTATGTAAAACTTGGGCAGTCAGCCACAACTTTATCTGGTGGGGAAGCACAGAGAATGAAATTAGCTTCTGAATTACAGAAGCTTTCCACGGGTAATAATTTCTACATTTTAGATGAACCAACAACGGGTTTACATACTGATGACATTAAGCGGTTATTAGAAGTATTGCAGCGCTTAGTCGATGAGGGAAATACTGTTTTAATTATTGAACATAACTTAGATGTTATTAAAAACGCTGATTGGTTGATTGATTTAGGCCCTGAAGGTGGAGATGGCGGTGGTCAAGTTGTGGCTACTGGTACTCCAGAAGAAGTTGCTGAAGTTAAAGAAAGTTATACGGGACAATACTTAAAACCAGTTCTCAAGCGAGATATTAAGTTAACTAAAAAGTTAATGAATAGCAAAGATGAGCAGGAATAA
PROTEIN sequence
Length: 954
MANDKIVIHGAREHNLKDISLSIPKDKLVVITGLSGSGKSSLAFDTLYAEGRRRYVESLSSYARQFLGQMDKADVDSIDGLNPAISIDQKTTSHNPRSTVGTVTEINDYLRLLWARVGHPICPNDGTLIERQSVDQMVDRVMDLPERSRIQILAPIIRAKRGEHKEVFKRIQRAGYVRVIVDGEMHEITDDFDLDKNKRHSIDIVVDRLIVKENIRSRLFDSVEAALRLADGYMDVDVIKGERINFSEYYACPICGFTVGEMEPRLFSFNAPFGACPDCDGLGMKLSVDEDLVIPDKDKTLAEGALVPWSNSKYYTAMLEQACMALKIPVDKPYKKLTKKQKDLILNGSKGKKIKFHLEGDFGVNDTVQEFEGILNNINRRYHHPMSKFMRDAMGKYMTELTCSTCHGKRLNEKALAVKVNGKDIAEASDLSISKSLNFFNSVKLSEQEKMIAKPILKEVRDRLTFLKNVGLDYLTLSRSAGTLSGGEAQRIRLATQIGSNLSGVMYILDEPSIGLHQRDNDRLISSLKKMRDLGNSLIVVEHDDETMKQADYLVDMGPGAGVYGGKVMAAGTPEEVMKNPKSLTGQYLSGKKIVPVPLERRKGNGKKITVTGAAENNLKDISVDFPLGKFVVVTGVSGSGKSTLVNLILKRALAQKLNNNSAKPGKYKSIKGYKNIEKIIDIDQSPIGRTPRSNPATYTSVFDDIRALFAQTNEAKMRGYTKARFSFNVKGGRCEACHGDGIIKIEMNFLPDVYVPCEVCHGTRYNSETLEVTYREKNISQVLNMTINEACKFFENIPKIHRKLQTIVDVGLGYVKLGQSATTLSGGEAQRMKLASELQKLSTGNNFYILDEPTTGLHTDDIKRLLEVLQRLVDEGNTVLIIEHNLDVIKNADWLIDLGPEGGDGGGQVVATGTPEEVAEVKESYTGQYLKPVLKRDIKLTKKLMNSKDEQE*