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NECEvent2014_6_3_scaffold_14_3

Organism: NECEvent2014_6_3_Clostridium_paraputrificum_29_53

near complete RP 49 / 55 MC: 1 BSCG 51 / 51 ASCG 16 / 38 MC: 1
Location: 6424..10722

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
LPXTG-domain-containing protein cell wall anchor domain {ECO:0000313|EMBL:EEH96811.1}; TaxID=457396 species="Bacteria; Firmicutes; Clostridia; Clostridiales; Clostridiaceae; Clostridium.;" source="Clo similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 68.5
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 2024
  • Evalue 0.0
beta-galactosidase similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 70.3
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1959
  • Evalue 0.0

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Clostridium sp. 7_2_43FAA → Clostridium → Clostridiales → Clostridia → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 4299
ATGAAACCATGTACAAAAAAAAGATGTTCTTTTGTGCTTGCTTTAGGAATGCTTTTCTCATTATCTCCCACAACTGCATTTGCACAAACAAAACAGACCCAAGAAGCTGAAACTGTATCTGTAGGCTTCATCAAAGATGGAGAACGTTCAACCCTATTCAATCAAAATTGGAAATTCTTTAAGGGTAACCCCTCAGGTGCAAGTGAAACTAATTTTAATGATTCGTCTTGGAGAGTTTTAAATCTTCCTCATGATTGGAGCATTGAAGATGAATTTACAGTACAAGGGGAGGCAGAAAGCGGATTCTTACTTGGAGGTACTGGATGGTATCGTAAACATTTCGTAGTTCCCGAAAAATTTAACGGAAAAGACTTTACCTTAAATTTTGACGGTATTTACATGAATGCAGAAGTTTATGTAAATGGTAAAAAACTAGGTTCTCATAATTATGGATATACAGCCTTTGCTTTTGATATAACTGATGAATTAATTTGTGATGGCATCACCGAAAACGTTATATCTGTAAAAGTATCAAACCCTACTCCTAGTAGTAGATGGTATTCAGGTAGCGGTATTTATCGTGATGTAACTTTAAGTGTAACTGATCCAATTCATGTTGGGTACTTAGGTACAACTGTTACAACTCCAAAGCTTGAAAATCAAAAGTCTGGCAGCGTTGATGTAAACGTTAAAACAACTATAGAAAATGAGTCTCTTTCTGATTCAGAGGTAACTCTTAAAACTACTATTATTAATAAGGATGGAAAAGAAGTCAGCATCCCTGTAAGTGATAAAAAAGTTGTTCAAGTTAATGCAAGTGTTGATTTTGAACAAACTGTTATAGTGAACAAGCCTACTCTATGGTCTGTAGATAATCCTACTATGTATAAAGTAAAAACTGAAGTTATAGTTGAAAATAAAGTTGTAGACACTACATTAACTGATTTTGGATTTAGATATTATGCATTTGATAGAGACACAGGCTTCTCACTAAATGGTGAAAATATGAAACTTCAAGGTGTTTGCATGCATCATGACCAAGGTGCTCTTGGAGCAGCCTCAAACTATTATGCTGTTGAACGTCAAATGCGCATTATGAAAGAAATGGGTGCAAATGCAATACGTGTATCTCATAATCCTGCCAGTGAAATGCTACTTGAAATATGTGATAAATTAGGACTTTTAGTTATAAATGAAGCATTTGATACTTGGACAAATCCTAAGAATGGTAATGTAAATGACTTTTCTAAATACTTCAGAGAAAGCATTGATGAAGATAATAAAATTATAAATGGTAACTCTAACATGACATGGGGAGAATTTGAAGCCAGAACAATGGTTAAAAGTTCAAAGAATAGTCCATCTGTAATCATGTGGTCAATTGGTAATGAAGTTTTAGAAGGTATAGGTGGAAATTCTTCTGATTATACTGATATTGCACAAGATATTATCACTTGGATTAAATCTGAAGACTCAACTAGACCTGTTACAATTGGTGATAATAGAACCAAGAATGGTGATAGTAATGCTAACGCTATCTCAGAAGTAGTAAATAAAAATGATGGTATTGTTGGCTTTAACTATGCAAACGAAAATCAATTTAACACTCAAAGAAATAACCATCCTGACTGGATTCTTTATGGCTCAGAAACAAGTAGTGCCGTTCATAGCAGAGGATACTACAAAACTAAAGGAATAGACCATGCTAATAATCAAATATCAGAATATGATAATGATAGTACAAAAGTAGGTTGGGGACATTCCGCAAGTAATGCTTGGAAATATACAATAAAAAATGATTACAATGCTGGTGAATTTGTTTGGACTGGCTTTGACTATATTGGAGAACCTACTCCATGGAATGGTGTTAATCCTGGACAAGTAAATGGAGGTAAAGGTCCTGCACCTAAATCCAGTTACTTTGGTATAGTTGACACTGCTGGTTTTGAAAAAGATATCTACTATTTATATCAAAGTCAATGGAATAAGGATGTTAATACTCTTCATGTTTTACCTACATGGAATAAAGAAGATATCGTAATTGAAAATGGAAATGTACAAGTTGATGTATTTACTGATGCTTATAAAGTTGAATTATACTTAAATGGTAATAAGGTTGGAGAGGCCACTGCAACTGAACATGTAACACCTGCTGGATATAAATATCAAACATTTGATAATGGTTCATTGTATCCATCATTTAACGTTGCTTATGCTCCTGGTACTCTAACTGCAAAGGCATATGATAAGCAAGGTAATTTAATTACTGATACAAAAGGTAGAAATACAGTTACTACCTACAGTACTCCTACTACAACAAAATTAAGCGCAGATAAAACAACAATTGCTTCTAATGAATATGATTTATCTTATATCACTGTTGATTTAGTTGATGAAAATGGTAATTTTGCTTCTGGTGCTTCTAACACATTAAACTTCAAACTTGAAGGTAATGGTAAAATAGTTGGTATTGATAATGGTAATCCTGTTGATACTACTTCCTATAAGCCTACCACTGATTCAACAGCTACAAGAAAAGCATTTAGTGGAAAAGCTTTAGTTATAGTTCAATCTACAAAAGATACCGGTTCAATGAATCTTACTGTTTCTGGTGAAGGGCTACAAGAACAATCTATAAGTATTACAACAGAAAACCAAGCTTCAGATGATAAATATTTAGAATCTTATGATATAGTAAAGAACTACTATGTAAATGTAGGAGAAACCCCAACTCTACCTAAAACAGTAAATGGTCGTTTTAGTGATGGAACTACTTCTACATTCAATATTATTTGGAATAACTATGATGAGAACCAATTAAATACCCCACAAATTTTTAAAGTCACTGGAACTTTAGAAGGAACTGATGTTGCAGTAGTTGTTAATGTACATGTTATTGGAGAAATAGCTTCTATAGCTAATCTATCTACCTTCACATACGCTGGTACTGCCCCATCACTTCCAAAAACAGTTTATGGATATTATGCAAATGGTTCTAAATCTGAAGAACTTGCTGTAAATTGGGATTTAGATGGTGTTGATTTTACTAAAGAAAATACAATTGTAAAAGTAAATGGTACTGTAGAGTTACTTGGTAAAACTTATCCTGTAACAGCTAGTGTTCGTATAGTTCCGGCTTTAAAGGCAGCTCGAAACTTAGCTATAAATAACTCAGAAAATAATGATGTTCCAAAACTTTCTCAAAGTTGCAAATCAGTTTCTGATAATTTAAATTCTATTAATAATGGAACTACTAATAATGGTTCTCTTGAAGCTGAACGTTGGACTAACTGGAATGAACGTAATTTGACTGAGGAAAATGGCGAACCAAAAGGTGCATATATACAATTTGACTGTAAAAATAAATACAAAATAGATCGTCTAGATATGTGGCTATTTACTGACAATGCATTTTCACGAATTCCAAGTAAAGTTGAAATTAGCTATAGGGATGAAGATGGTAACTACAAAATTGTAAATCATACTAATACAACTGAAGTTTCTTATTCTGTTGGTGAAACAACATATAGACTTGATGAAGTAATAAATACTGATAGTATTCGTATTTATATGCAACAACCTGAAGTGGGTAAGTGCATTGGTCTTACTGAGGTAAATGTATATGAATATGTACCTCAAGAAATCTTAAAAACTGGAAATAAACTTTCTTCAATTTTACTTGATGGACAAGAATTAGAAGGATTTAATCCTGAAACTAATGAATACACTATTGATTTAGAAGCTTTACCTGAAAGGGTTGAAGCTATAGCTAATTCTGATGATAACTCTTCAGTTACTGTATTACCTATTAGTGGTAACAAATCAGTTATAATAGTTAAAGCTGAGGATGGTAGTGAAAATATATATACAATAAACTATGTACTACCAAAACATGATGTAATTATAGAGACTGTAGAAGGCGGTTCTGTATCAGGAGCAGGTACTTATACTAAAGGCGATGAAGCCACTTTAGTTGCTACTGCTAATGGAGGTTATAAATTTGTTGGATGGTTCGATGAAAACGGTAATCTTTTAAGTGATAAAACAACTTACACATTTATAGTAAATGAAAATATAAAATTGATACCAAAATTTGAAAAACTTAAAGAACCTACTCCAAATCCTGAACCAACAAATCCAAATGCTCCTAAGCCAAATAAGCCAAATGATACAAGCAAACCATCAACTAGTAATCCAACAAAAACTTCAGATCCTTCTAATATTTCTACTTTAGCTGGAATATTAGCTTTAGCTGGTGGTTCCCTTGTCTTAAGCTCTAAAAAGAGAAAAATAAAATAA
PROTEIN sequence
Length: 1433
MKPCTKKRCSFVLALGMLFSLSPTTAFAQTKQTQEAETVSVGFIKDGERSTLFNQNWKFFKGNPSGASETNFNDSSWRVLNLPHDWSIEDEFTVQGEAESGFLLGGTGWYRKHFVVPEKFNGKDFTLNFDGIYMNAEVYVNGKKLGSHNYGYTAFAFDITDELICDGITENVISVKVSNPTPSSRWYSGSGIYRDVTLSVTDPIHVGYLGTTVTTPKLENQKSGSVDVNVKTTIENESLSDSEVTLKTTIINKDGKEVSIPVSDKKVVQVNASVDFEQTVIVNKPTLWSVDNPTMYKVKTEVIVENKVVDTTLTDFGFRYYAFDRDTGFSLNGENMKLQGVCMHHDQGALGAASNYYAVERQMRIMKEMGANAIRVSHNPASEMLLEICDKLGLLVINEAFDTWTNPKNGNVNDFSKYFRESIDEDNKIINGNSNMTWGEFEARTMVKSSKNSPSVIMWSIGNEVLEGIGGNSSDYTDIAQDIITWIKSEDSTRPVTIGDNRTKNGDSNANAISEVVNKNDGIVGFNYANENQFNTQRNNHPDWILYGSETSSAVHSRGYYKTKGIDHANNQISEYDNDSTKVGWGHSASNAWKYTIKNDYNAGEFVWTGFDYIGEPTPWNGVNPGQVNGGKGPAPKSSYFGIVDTAGFEKDIYYLYQSQWNKDVNTLHVLPTWNKEDIVIENGNVQVDVFTDAYKVELYLNGNKVGEATATEHVTPAGYKYQTFDNGSLYPSFNVAYAPGTLTAKAYDKQGNLITDTKGRNTVTTYSTPTTTKLSADKTTIASNEYDLSYITVDLVDENGNFASGASNTLNFKLEGNGKIVGIDNGNPVDTTSYKPTTDSTATRKAFSGKALVIVQSTKDTGSMNLTVSGEGLQEQSISITTENQASDDKYLESYDIVKNYYVNVGETPTLPKTVNGRFSDGTTSTFNIIWNNYDENQLNTPQIFKVTGTLEGTDVAVVVNVHVIGEIASIANLSTFTYAGTAPSLPKTVYGYYANGSKSEELAVNWDLDGVDFTKENTIVKVNGTVELLGKTYPVTASVRIVPALKAARNLAINNSENNDVPKLSQSCKSVSDNLNSINNGTTNNGSLEAERWTNWNERNLTEENGEPKGAYIQFDCKNKYKIDRLDMWLFTDNAFSRIPSKVEISYRDEDGNYKIVNHTNTTEVSYSVGETTYRLDEVINTDSIRIYMQQPEVGKCIGLTEVNVYEYVPQEILKTGNKLSSILLDGQELEGFNPETNEYTIDLEALPERVEAIANSDDNSSVTVLPISGNKSVIIVKAEDGSENIYTINYVLPKHDVIIETVEGGSVSGAGTYTKGDEATLVATANGGYKFVGWFDENGNLLSDKTTYTFIVNENIKLIPKFEKLKEPTPNPEPTNPNAPKPNKPNDTSKPSTSNPTKTSDPSNISTLAGILALAGGSLVLSSKKRKIK*