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NECEvent2014_6_3_scaffold_15_25

Organism: NECEvent2014_6_3_Clostridium_paraputrificum_29_53

near complete RP 49 / 55 MC: 1 BSCG 51 / 51 ASCG 16 / 38 MC: 1
Location: 28170..31220

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Helicase {ECO:0000313|EMBL:KJU72915.1}; TaxID=1561 species="Bacteria; Firmicutes; Clostridia; Clostridiales; Clostridiaceae; Clostridium.;" source="Clostridium baratii.;" similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 59.4
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1230
  • Evalue 0.0
DEAD/DEAH box helicase family protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 58.8
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1229
  • Evalue 0.0

Lists

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Notes

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Taxonomy

Clostridium baratii → Clostridium → Clostridiales → Clostridia → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3051
ATGAATATTAAAGTTGTTAGAGATAATGTTATGAAGTTTAGTTCTAGCTTTAGTAGAGAAGGGGCAAATTCCATACTTAAAGCTAAAGGAGTAAAAGATCTTAAGGGTAAGAAAATAGAAAATATTTATCATATATATGGGAAAATAAATAGCGAAAATAAGGATTACAACACGCATATTAAAGTTGATATGAAAACTAATAAGGTATTAGATACAAAATGCTCCTGTGATACCTTCATAGAAAATAGAAGACATATTAGAAACTATGTTTGCAAACATATTATAGCTACTAATCTAGCCTTTTATCTTGTTGGAAAATCTAAAGCATCAAATATAAATAAAAGAAGTGAAGAAGTTGTAAATAAGAGAAAATTAAAGTTACATATATCAATAAAATGTAGCATGTTAAATGAGATTAATACATATAAATGTGAATTTAGAATAGGAGAATCAACTACTAATTTAATTACATCACTTAAAGATTTCTTGGAAAAGGATACAATTATATTTAATGATCTATTTACATACCACTCTAGAAGAGACTTTTTTAGTGAAGAGGATACAAAAATAATAGAATTTTTAAAAAGTCATAAGGAAAAAATTAGTGACAGATTCTTAAATTTGAAAGGAAAAGATTTAAGAGAGTTCCTTTCGTTATTAAATGAAAGAAAAATAAGTTTTAATTATGATTTTATAACCTATGAATCTAAAGTGAAAAAGGAGAATGTTCCTCTTTCTCTTACAATAAGAGCTGATAAGGATAGTTTTATATTAAGATCACAAAAGAAGTTTCCTATTTTATTATCTAATACTGGAGATGTTATGTTCTATGATAGGGATATTTACATTCCCCGTAAGAAAGCTATGGAAACCTATCTTCCTTATCATAAATTATTTATAAAAAATAACGAGATAAAGTATGAGAAGAACTTAAAGGCTTTAAATAATCTTATTTCAGACTTAAAGAGCATTACAAAGAATGTTGTGCTAGATGATGGAACAAGAGGGTTCTTAAGAGATATCTCTAAACCTACATTTAGAATATACAAAGTTGGAAAAGAAATTTACTGCAATGTAAAGATTGATTACTGTGGTTATATTATAGATTTAATTAAAGATAAAAATGATAAAAGCTTTTTAAGGGATTTTAAGAAGGAAAACTTAATAGATATAAAATTAGAAAAGGTAGGATTTATAAAAAGAGAAAGAGATTATTTTTATATAGGTAATGGAGAGTTTGACCTTTTAACAACAGGTGTTAAGTTATTAAGACCTATAGGAAAAGTTCAGTTTTCAAAAGAATTTGAAGATATTCAAATATTAGATAGTAGCTTTATTAATTCATCCATAGTAGAATTTGATAACTTTTATAGATTAAACTATGAAGTTGGTGATTTTACAGTTGAGGAATTAAGTAGTGCTATTGCATTTATGAAAAAAGGTGAAAGATTTTTCAAAAGTAAGGATAGATATCTAGATTTAGAAGACCCAGGAGTTTGTGAGTTTTTAAATTTAATTGGAGAATTATCAGAAGATAAATTAAGCCTTGAAATAGATATAGATAAGAACAAAAGCTTATATCTTCAAGAAAAACTTAGAGTATTAGATTTTATTAAAGGTGGGGATGTTCTCCAAAAAATTGTTCAAAAGCTAGTTAATAATGACTTTAAAAGGTCAGTTACCCCAAAATCCTTTAATGGAATCTTAAGAAAATATCAAAAAGAAGGATTTAAGTGGTTAAATGAACTTTCAGAATTAGGCTTTGGAGGAATATTAGCAGATGATATGGGCCTTGGAAAAACAATTCAGGTAATAACTTTTGTCCTTTCTAAAAGGAGTAAAAAAACCTTAATTATAACTCCAACCTCTGTTTTATATAATTGGAAGGATGAATTTGAAAGGTTTGCTCCTAATGTAAGGGTTGGTTTAGTTCATGGAACAAAAGCTCAAAGAGATAGGATGTTAAGTGAAATTAAAAAGTATGATGTGCTTATAACAACCTATGGAACCCTAAAGAATGATGAAAATGAATATGAAAAACTACAGTTTGATTATTGCATTATCGATGAAGGACAAAATATTAAAAATCCAACTTCAAAAACTACACTTTCTGTAAAGAAAATAAACTCAAAATGTAACTTTGCCCTAACAGGAACTCCAATTGAAAACAACTTAATGGAGCTTTGGTCAATATTTGATTTTGTAATGCCAGGTTTCTTATTTACAAAAGAAAGATTTAAGGGGAAGTTTATACAAAATAAAAATACAGAGGAACTTAAGTCTTTAATTACTCCATTTATCTTAAGAAGGGTAAAAGAGTATGTATTAGATGAGTTGCCAGAAAAGATTGAAAAAAAGTACTTGGTAGATATGACAACAAAGCAGAAGTCTATTTATAAGTCTTACGTAAAGGAGATAAAGGAAAAGCTGAAGTCGTCAAAGGGTAACATTAATATGCTTACTTTTATTACAAAGCTTAGAGAGGTGTGCTTGGATCCATCCCTAATAATGGATGATTACAATGGTGGAAGTGGAAAGATAAATGCATTAATGGAGCTACTGGATAATTATATTGATGGAAATAAAAAGATATTAGTATTTTCTCAATTTACTTCAGCTCTTAAAAATATAGAAAAAAACTTAGAGGAAGTTGGAATAAACTATATATACTTAGATGGAAGTATAGGCAGCAAAGAAAGGGGAGAGCTTGTCAAAAAGTTTAATGAAGACCCTTTAATAAGTGTATTTTTAATATCCTTAAAAGCTGGTGGTGTAGGATTAAACTTAACATCAGCAAGTGTTGTTATTCATTTTGATCCATGGTGGAACCCAGCTATTGAAAATCAAGCTACAGATAGAGCCCATAGGTTTGGCCAAAAAAATGTGGTAGAGGTAATTAAGCTTATTTCTAAAGATACCATAGAGGAAAAGATTCTATTATTACAAGAAGATAAGAAGGAACTTATAGAAAGCTTAATGGATGAGAAAGAAATGGATGGTAAGAAGTTTAAGAGGCTAAGTGAAGATGAAATATTAAATTTGTTAGGATAA
PROTEIN sequence
Length: 1017
MNIKVVRDNVMKFSSSFSREGANSILKAKGVKDLKGKKIENIYHIYGKINSENKDYNTHIKVDMKTNKVLDTKCSCDTFIENRRHIRNYVCKHIIATNLAFYLVGKSKASNINKRSEEVVNKRKLKLHISIKCSMLNEINTYKCEFRIGESTTNLITSLKDFLEKDTIIFNDLFTYHSRRDFFSEEDTKIIEFLKSHKEKISDRFLNLKGKDLREFLSLLNERKISFNYDFITYESKVKKENVPLSLTIRADKDSFILRSQKKFPILLSNTGDVMFYDRDIYIPRKKAMETYLPYHKLFIKNNEIKYEKNLKALNNLISDLKSITKNVVLDDGTRGFLRDISKPTFRIYKVGKEIYCNVKIDYCGYIIDLIKDKNDKSFLRDFKKENLIDIKLEKVGFIKRERDYFYIGNGEFDLLTTGVKLLRPIGKVQFSKEFEDIQILDSSFINSSIVEFDNFYRLNYEVGDFTVEELSSAIAFMKKGERFFKSKDRYLDLEDPGVCEFLNLIGELSEDKLSLEIDIDKNKSLYLQEKLRVLDFIKGGDVLQKIVQKLVNNDFKRSVTPKSFNGILRKYQKEGFKWLNELSELGFGGILADDMGLGKTIQVITFVLSKRSKKTLIITPTSVLYNWKDEFERFAPNVRVGLVHGTKAQRDRMLSEIKKYDVLITTYGTLKNDENEYEKLQFDYCIIDEGQNIKNPTSKTTLSVKKINSKCNFALTGTPIENNLMELWSIFDFVMPGFLFTKERFKGKFIQNKNTEELKSLITPFILRRVKEYVLDELPEKIEKKYLVDMTTKQKSIYKSYVKEIKEKLKSSKGNINMLTFITKLREVCLDPSLIMDDYNGGSGKINALMELLDNYIDGNKKILVFSQFTSALKNIEKNLEEVGINYIYLDGSIGSKERGELVKKFNEDPLISVFLISLKAGGVGLNLTSASVVIHFDPWWNPAIENQATDRAHRFGQKNVVEVIKLISKDTIEEKILLLQEDKKELIESLMDEKEMDGKKFKRLSEDEILNLLG*