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NECEvent2014_6_3_scaffold_382_2

Organism: NECEvent2014_6_3_Clostridium_paraputrificum_29_53

near complete RP 49 / 55 MC: 1 BSCG 51 / 51 ASCG 16 / 38 MC: 1
Location: comp(3827..7261)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
ATP-dependent helicase/deoxyribonuclease subunit B {ECO:0000256|HAMAP-Rule:MF_01452, ECO:0000256|SAAS:SAAS00044573}; EC=3.1.-.- {ECO:0000256|HAMAP-Rule:MF_01452, ECO:0000256|SAAS:SAAS00044602};; EC=3. similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 64.2
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1558
  • Evalue 0.0
addB; helicase-exonuclease AddAB, AddB subunit similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 64.2
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1558
  • Evalue 0.0

Lists

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Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Clostridium baratii → Clostridium → Clostridiales → Clostridia → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3435
ATGGGAATAAGATTTATTTATGGCAGGGCAGGAAGCGGAAAAAGTACATATTGTTTAAATTCAATAAAGAATAGGCTAAATGATAATAATGGTAATACATTAATTTACTTAGTACCTGAACAATATACATTTCAAAGAGAAACTATGTTATTAAAAGATGTAGGAGAAGAAGGCTTATTGAGAGCGCAAGTTTTAAGTTTTAAAACTATGGCTCAAAAGGTTTTCGATGAATGTGGTGGAAGAGTTCATGATAGAATGAGAGATGTTGGAAAGAGCATGCTTATTCATAAAATATTGCAAGAAAGTGAAGAAAATCTTCAATATTTTAATAGAATTTCAAAAGAACAGGGATTTACAGATATAATATCAGAAACTATAACTGAATTTAAGAAGTATAACGTTACTCCTAGTGTATTAAGAGAAGGATTAACTAAAATAGATGATGAGGAGTTAAAATCAAAGTTAACAGACTTAGCTAATATATTTGAGAAATTTGATATAAGTATTTCAGAAAACTTAGTTGATACTGATGATGAACTAACATACTTAGCAAATAAGTTAAATAATTGTAGTTTATATGATAATGCAGAGATATGGATAGATGAATTTACAACATTTACTCCTCAGCAGATGGAGGTAATAAAAGGATTAGCTAAGAAGTGTAAGGAAGTAAATATAGCTCTTTGTATGGATGAAGTTAGCAGTGGTGATGATAGTGAAGTAACTGATATATTTAATTCATTAAAAACAACAGAATTAAGAATACTTAACATGATGAGAGATGAGCATATAGGATATGAGAAACCAGTAAATTTAAATGATAATAAAAATAATAGATTTAAATATAACCATGAGTTAAAGCATCTAGAAAAGTATTTCTTTACATATCCATTTAAAAGTTATAAGCAAGATGTAAATACTATACGTTTGTATAAAGCTAATAATTCTTATGATGAAGTTGAGAATGTAGCAAAGGAAATATTAAGATTTGTAAGAGATAAAGGATATAGATTTAGAGATATTTCAGTTGTATGTAGAAATATAGATGATTATGAAAAAATAGCTACAGTTATATTTAATGAATATGATATACCATTTTTCTTAGATAAAAAGATTGATATATTAAGCAACCCATTAATCGTTCTTATATTATCATCAATAGAAGTTATGATTAGAAATTGGTCATATGAAAGTGTATTTAAATATCTGAAGAGCGGTTTAGTTAACATTGATAGTAATGAAATAGATATTTTAGAAAATTATGTGCTTGCTAATGGGATAAAAGGATTTAAGTGGACTAATGAATTAAGCCTATCAGAAGAAGATAATGATGAGATAGATCCTATAAAAGTTATGATTAAGGTTAGAGAACCATTAATTAAGTTACATTCTAGAATAAGAGGTAATAAGAGTGTAAAAGCAATATGTACTGCTATTTACGAGTTCTTAATTGAGCTAGACTGCTTTAATAGGATAGAAGAGTGGATAAGTGAATTTGATGAGTATGGTATGCAAAGTAAGGTTATGGAGTACCAACAAGTATCAGAGATAGTGATAGATATATTAGATCAGGCAGTTGATGTTATAGGAGAAGATTTAATTACAATAAATGAATTCTATAAGATTTTAAATGCAGGATTTCAAAACAGGGAGATAGGTATAATACCAGTAGCATTAGATCAAGTAAACATAGGAGGTATAGGAAGAATAAAGGGGAGAAATGTAAAAGTACTATTTATAGTTGGAGTTAATGATGGGGTATTACCAGCGGCAAATAAGGATGAAGGTATTTTATCTGATAGGGATAGAGATTTGCTTAAAGAAAATGGGATAGAGTTATCATCAAGTACTAGGGCTAAGGTCTTTGAAGAACAGTATATGGTATACACTGCGTTAACATTAGCTAGTGATTACTTAATGATAAGTTATCCTATGGCTGACTTTGAAGGAAAGTCATTGAGGGCATCTATTGTAATACCAAGATTAAAGAGGATTTTTCCTAAGCTAATAGAAGAAAGTGATTTATTTAATTTAAAGGAAAAATCAGATAAGTATAGCAAGGTTACTGCTCCAATACCAACTTTTAATGAATTAATATTAGCCTTAAGAAGAAACTACGAGAATGAAGATGTAGAGGATTATTGGAAGGATGTATATTGTTGGTATAAAGATAAGGAAGAGTTTTATAATAAGTCAGGAAATATACTTGAAGGGTTAAAATATTCTAATGATGGAGAAGTAGTAGCTAGAGAAAAACTTAAGAAGTTATATAGCATAAAAGATGGTAGATTACTATTTAGTGTTTCAAGATTAGAAAATTATGCAGAATGTCCATTTTCATATTTTATAAAATATGGCCTTAAAGCTAGGGATAGAAAAGTATATGAATTTTCAGCTCCAGATTTGGGTTCTTTTATGCATGAAATTTTAGATGAGTTCACTAATAAGGTTAAGAGAGAAAGAATATCTTGGTCAGAATTAAACTCTGAAAGATGTAGGAATATAGTATCTGATTTAATAGAAAAAAAGCTGATTGAAGATAGTAATTCTATACTTAATAGTAGTAAAAAATATAAGTATTTTACTAATAGATTTAAAAGAGTTATAGCAAAGTCTGTATCAGTTTTAGCTGAACAAATGAGAAAAGGACAATTTGAGATATTTAGTAATGAATTTCAATTTGGTAATTTAAGAGATGGAGCTCCAATTAAGCTAGAACTACCTTCGGGAGAAGAGGTATATCTTACTGGAAGAATAGATAGAATAGATAGTTTAGATCTTCATGGAAACACTTATATAAGAGTAATAGATTATAAATCAGGTTCTAAGAAGTTTGATTTAAATGAATTATATTATGGATTACAAATTCAGTTATTAGTTTATTTAGATGCGATTCTTAAGAATTCGGAATATATACTTCATACTCAAGCTATGCCAGGGGCAATATTATATTTTAAAATTGATGACCCTATTATAAAAAGTAAGTCAGAGCTTCAGGATGAGGAGATAAGAAAACAAGTATTAGATAAGCTAAAGATGAATGGATTGCTTTTAAAGGATGCTGAATTAGTAAAAGCAATGGATAACGATATGGAGACATATTCATTAGTAATACCAGCAACATTTAAAAAGGATGGAGATTTTTCTTCAAATAGTTCAGTAATTACTGAAGAGCAATTTAACATATTAAGAGAATACGTTAATTTTAAGATGATTGAGTTATGTGAGGATATGTTAAGTGGAAAAATAAGAATAGAGCCATGTAAGAATCAAAGAACTTCTTATTGTGATTACTGCGATTATTCAGCTATATGTCAATTTGATACGAGTATAAAGGATAATAAATATAAACTTGTTTTAAAGAAGGATGATAAAGAAATATGGAATGATATGATAGAAAAGGTTAAAGGAGGTTCAGAGGATGGGGGAAACTAA
PROTEIN sequence
Length: 1145
MGIRFIYGRAGSGKSTYCLNSIKNRLNDNNGNTLIYLVPEQYTFQRETMLLKDVGEEGLLRAQVLSFKTMAQKVFDECGGRVHDRMRDVGKSMLIHKILQESEENLQYFNRISKEQGFTDIISETITEFKKYNVTPSVLREGLTKIDDEELKSKLTDLANIFEKFDISISENLVDTDDELTYLANKLNNCSLYDNAEIWIDEFTTFTPQQMEVIKGLAKKCKEVNIALCMDEVSSGDDSEVTDIFNSLKTTELRILNMMRDEHIGYEKPVNLNDNKNNRFKYNHELKHLEKYFFTYPFKSYKQDVNTIRLYKANNSYDEVENVAKEILRFVRDKGYRFRDISVVCRNIDDYEKIATVIFNEYDIPFFLDKKIDILSNPLIVLILSSIEVMIRNWSYESVFKYLKSGLVNIDSNEIDILENYVLANGIKGFKWTNELSLSEEDNDEIDPIKVMIKVREPLIKLHSRIRGNKSVKAICTAIYEFLIELDCFNRIEEWISEFDEYGMQSKVMEYQQVSEIVIDILDQAVDVIGEDLITINEFYKILNAGFQNREIGIIPVALDQVNIGGIGRIKGRNVKVLFIVGVNDGVLPAANKDEGILSDRDRDLLKENGIELSSSTRAKVFEEQYMVYTALTLASDYLMISYPMADFEGKSLRASIVIPRLKRIFPKLIEESDLFNLKEKSDKYSKVTAPIPTFNELILALRRNYENEDVEDYWKDVYCWYKDKEEFYNKSGNILEGLKYSNDGEVVAREKLKKLYSIKDGRLLFSVSRLENYAECPFSYFIKYGLKARDRKVYEFSAPDLGSFMHEILDEFTNKVKRERISWSELNSERCRNIVSDLIEKKLIEDSNSILNSSKKYKYFTNRFKRVIAKSVSVLAEQMRKGQFEIFSNEFQFGNLRDGAPIKLELPSGEEVYLTGRIDRIDSLDLHGNTYIRVIDYKSGSKKFDLNELYYGLQIQLLVYLDAILKNSEYILHTQAMPGAILYFKIDDPIIKSKSELQDEEIRKQVLDKLKMNGLLLKDAELVKAMDNDMETYSLVIPATFKKDGDFSSNSSVITEEQFNILREYVNFKMIELCEDMLSGKIRIEPCKNQRTSYCDYCDYSAICQFDTSIKDNKYKLVLKKDDKEIWNDMIEKVKGGSEDGGN*