ggKbase home page

NECEvent2014_6_5_scaffold_694_9

Organism: NECEvent2014_6_5_Clostridium_butyricum_28_55

near complete RP 52 / 55 MC: 2 BSCG 50 / 51 MC: 4 ASCG 15 / 38 MC: 1
Location: 9997..13098

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
RND multidrug efflux transporter Acriflavin resistance protein {ECO:0000313|EMBL:KJZ84006.1}; TaxID=1523154 species="Bacteria; Firmicutes; Clostridia; Clostridiales; Clostridiaceae; Clostridium.;" sou similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 98.9
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1945
  • Evalue 0.0
nolG3; nodulation protein NolG similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 73.4
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1453
  • Evalue 0.0

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Clostridium sp. IBUN125C → Clostridium → Clostridiales → Clostridia → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3102
ATGAAAATAGCAGATATAAGTATAAAAAGACCTGTATTTATCATAGTTATAATGATTACACTCACTATTTTAGGTTTTGTTTCATATAAATCATTAGCATTAAATGATATGCCAGATGCAGATTTACCGTATGTTTCAGTAATGATAACTGAAAATGGTGCAACACCTGAAGAAATTGAAACAAAGATAACAAAAGAAGTAGAAGATGCGGTTCAACAGATTTCCGGAGTTCAAAGTTTAACTTCAACAATAAATTCTGGCTATTCTCAAACAACAATAGAATTTGACCTTGGGATAGATCCATCAACTGCGGCTCAAGAAGTTAGAGATAAAATTTCTGGAATAAGAGGAAATCTTCCAACAGATATTAATGATCCAATTGTTTCAAAGTTTGATATGTCAGCCAGTGCCATTGTATCAATAGCTGTTTATGGTACTGATGATAATCAGAAAGCATCTGATTTTGTAGATAATACGTTGAAAAATAAATTATATTCAGTATCTGGAGTAGGATCAATAAATGTATCAGGTGAAGATACAAGAGAAATTCATATAAAATTAGATAATGATAAAATGTTAAAATATGGTCTTACAGCAAGTGCTGTATTAAATAGCATTAAAACTGATAATACGGATCAATCTTCAGGAAAAGTCAGTGATGGAAATAATGAAATATCGATTACTACAACTAGTAAAATACAAAAAATAGAAGATTTCAAAAATATAGTAATAGAAAATGTTAAGGGTACAGAAGTAAGAGTAAAAGATGTAGCAACAGTTGAAGATGGAGTCGAGGAAAGAACTAGTCAAGCTTATTACAATGGAAATAAAGCAATTGGTATTGATGTAGTAAAACAGTCTGGTTCTAATACTGTTGAAGTAGCCAAAGGTGTTAAGAATGTAGTAGAAGAAGTAAAGCATTCATTACCAGAGGGATTAAGTATTGATATTGTCTCAGATAATTCTCAATCTATTGAGGATACAGTAGATGATGTTATGAAAACTATTTATGAAGGTTGTATTTTAGCTGTAATTATTGTATTTTTATTTTTACATGAATGGGAAAGTACAATTATAAGTGCCTTTTCTCTTTTAATTTCAGTTATAACTACTTTTATATGTCTAAAGCTTATGCATTTTACTTTAAACACAATGTCATTAATGTCCTTGTCACTTGCTGTTGGTCTTTTAATTGATGATGCTATAGTTGTAATAGAAAATATTATACGACATCTGCATATGGGTAAAAGGCCTTTTGAGGCAGCAAGGGATGCTACTTCAGAAATTGGTTTTGCAGTAATAGCTACAACTTCAGCAGTTATTGCAGTATTTTTACCATTAGCTATGATAAGTGGAATGATAGGAAAATACTTTATTGAATTCGCTTTGACAATTGTATTTAGTATGGCTGTTTCATTGTTTGTATCATTTACCCTTGTTCCAATGATGGCTTCTAAAATGCTAAAAATATCTGATGGGAAAAAGAGTACAATTATAGGAAGAGCTTTTGTTGTGTTTGATAAAAAGTTTGAATATGTTTCAGAAAAATATTCACATCTTTTAAGATTTCTTTTGACTAAACGAGTTGTTGTATTAATTGTATGTGGAGCTATGTTTTTCAGCAGTCTTTTACTTATAAAATCTTTAGGATTTAATATGTTACCAACAACAGATAAAGGGATTATAAATGTTAAGGCAGATTTCGACTCTGGAATTACTTTAGATAAAGCAATAGAAAAAACTAAAAAGATTGAAGAATGCATTGATAAATATCCAGAGGTAAAATATATGTATTCAACAGTAGAAAATAGTTCAGCATCAGTTTCAATTACCCTTGTAGATAAAAAAGAACGTAAAGATACCTCAAAAGTAATTGCACAGAAAATAAGTGATGATTTAAAATCACTATCAGGAATGGAAGTATATGCATCAGCATCATCTATGGGGGGATTTGGTTCTTCAAAAGATGTAACTTATAATATTGTTGGAGATGATAGAGAAAAAGTAATTGCATTTGCTCAAAAGATAAAAGAAGAAATGGAAAATGATTCACAGGCAGCAGATGTTGGAATTAATGCGAAGACAGGTATTCCAGAAGTTAAAATGGTTGTTGATCGTGATAAAGCAGCAGACTTAGGAGTTAAAAGTTCAGATGTAGCAAGTACTCTTAATACATTTTTCAACTATTCTACTGTAAGTAAATATGATGGTGGAAAAGATAGATATGATGTTAAAGTAATGCTTAAGGATGATCAGCGTAAGAGTATAGAAGACCTTAATGGAATATATGTTTCAGGAACAAATAACAAACTGATCCCAGTAAATCAGGTAAGTAAAAAAGTTATTGGAAGAACATCTTCATCATTGCACAGATATAATAAACAGGCAGAAGTGTCTCTTTCATGTAATGTAAAAGGAAAAACAGCAGGAACTTTCCAAACAGAATATTTAAATAAAATAAAAAGTGAACTACCAGATGGAGTTTCACTATCTGTTGGAGGAATGAATGGTACAATGCAGAAAAGCTTAAGTAGCTTTGGATTATGTGCACTTTTATCAATTGTATTTTTATATTTGGTAATGGCAGCACAATTTGAAAGTTTTGTAGAGCCAATGGCAGTGATGTTTGCTCTCCCACTTTCAATGATAGGTGCAATAATAGCATTATTTATATGCAGAAGTGAATTAAGTATTATGGCTTTAATAGGGATTGTAATGCTTATGGGGCTTGTTGCTAAAAATGGTATATTACTTATTGATGCTGCAAAAGAGAGAATGGAAAATGGAATGAATAGAAATGAAGCTTTAGTAGAAGCCGGGTTTGTAAGACTTCGTCCAATTATTATGACAACTTTAGCAATGATTTTAGGTATGCTACCTACAGCAGTAGCTACAGGTGCTGGAACTGAAATGCGTAAACCAATGGCAGAAGCTGTAATTGGAGGACTAATCACTTCAACTATACTTACTTTATTTGTAGTTCCAATTGCGTACACATTACTTGATGGATTGAAAAGAAGAATTTTAAAGATATTTAGTAAAAACTTGAGCCCTAAAGATATTCATAAGGATTTAGAATTACAGGAAGAGTTAAAAAAATGA
PROTEIN sequence
Length: 1034
MKIADISIKRPVFIIVIMITLTILGFVSYKSLALNDMPDADLPYVSVMITENGATPEEIETKITKEVEDAVQQISGVQSLTSTINSGYSQTTIEFDLGIDPSTAAQEVRDKISGIRGNLPTDINDPIVSKFDMSASAIVSIAVYGTDDNQKASDFVDNTLKNKLYSVSGVGSINVSGEDTREIHIKLDNDKMLKYGLTASAVLNSIKTDNTDQSSGKVSDGNNEISITTTSKIQKIEDFKNIVIENVKGTEVRVKDVATVEDGVEERTSQAYYNGNKAIGIDVVKQSGSNTVEVAKGVKNVVEEVKHSLPEGLSIDIVSDNSQSIEDTVDDVMKTIYEGCILAVIIVFLFLHEWESTIISAFSLLISVITTFICLKLMHFTLNTMSLMSLSLAVGLLIDDAIVVIENIIRHLHMGKRPFEAARDATSEIGFAVIATTSAVIAVFLPLAMISGMIGKYFIEFALTIVFSMAVSLFVSFTLVPMMASKMLKISDGKKSTIIGRAFVVFDKKFEYVSEKYSHLLRFLLTKRVVVLIVCGAMFFSSLLLIKSLGFNMLPTTDKGIINVKADFDSGITLDKAIEKTKKIEECIDKYPEVKYMYSTVENSSASVSITLVDKKERKDTSKVIAQKISDDLKSLSGMEVYASASSMGGFGSSKDVTYNIVGDDREKVIAFAQKIKEEMENDSQAADVGINAKTGIPEVKMVVDRDKAADLGVKSSDVASTLNTFFNYSTVSKYDGGKDRYDVKVMLKDDQRKSIEDLNGIYVSGTNNKLIPVNQVSKKVIGRTSSSLHRYNKQAEVSLSCNVKGKTAGTFQTEYLNKIKSELPDGVSLSVGGMNGTMQKSLSSFGLCALLSIVFLYLVMAAQFESFVEPMAVMFALPLSMIGAIIALFICRSELSIMALIGIVMLMGLVAKNGILLIDAAKERMENGMNRNEALVEAGFVRLRPIIMTTLAMILGMLPTAVATGAGTEMRKPMAEAVIGGLITSTILTLFVVPIAYTLLDGLKRRILKIFSKNLSPKDIHKDLELQEELKK*