ggKbase home page

NECEvent2014_6_5_scaffold_1984_2

Organism: NECEvent2014_6_5_Clostridium_botulinum-rel_29_16_partial

partial RP 9 / 55 BSCG 8 / 51 ASCG 2 / 38
Location: 505..2109

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
PTS system mannose/fructose/sorbose family IID component {ECO:0000313|EMBL:EEG53135.1}; TaxID=518636 species="Bacteria; Firmicutes; Clostridia; Clostridiales; Lachnospiraceae.;" source="[Clostridium a similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 70.0
  • Coverage: 534.0
  • Bit_score: 765
  • Evalue 4.90e-218
manZ; PTS system mannose-specific transporter subunit IICD similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 30.9
  • Coverage: 557.0
  • Bit_score: 297
  • Evalue 7.60e-78

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

[Clostridium] asparagiforme → Lachnoclostridium → Clostridiales → Clostridia → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 1605
GTGAACACAGTTACAGTGTTATTATTAAGTACGTTTATTGCTGTTTTAATGGTTGAAAATTATGGTTATGGATATTGGATGATTTCAAGGCCAATAGTAGGTGGCGCTATAGTAGGTCTATTAATGGGTGATATAAAAACGGGATTAATTGTTGGTGGTAGCGTAGAATTAATGTACATGGGAATTCTACCTATTGGAGGAAGTGTGCCTCCTAATGCACAGATAGCAGGTATGCTATCAACAGTATTTGCAATTTCAAATGGTGGTAATCCTGAAGTAGGTATTGCGCTTGCTTTACCAATAGGTATACTTGCACAAATATTAATTATGTTAGCATGGAATATGAATATATTTCTAATGCACTTAGCAGATAAGTATTTACAAAAAGGTGAAATAAAAAAAGTTGAATTAATTCATTTATCAGGTTTAATCACGTTCTTTATTGTATTCTTTATACCAACATTCTTAGCTATAAATTTTGGTAGTGACTATGTTAATCAGGTTGTAAATAGTATGCCAACAGTTATAGTTGATGGATTAAAGATTGCTTCGGGTATCTTACCAGCAGTTGGTATGGCTATGTTATTAAAGATGATGAATTTCAAAAAATATTGGTCTTTCTTCATAATCGGATTTGTTTTAGCAGTATATTTAAAATTAGATGTTTTAGCAATTTCATTAATTGGAGTAGGTATAGTATCAGCATTATTTACTCTTAGAGTTGATAGTAAAAAGTCTAGTAATGATGATTTCGATGATTTTGATGAAGAGGATGAAACTATAGGGGAGACTGAAAATGTTGTAGGACTTTTAACTAAAAAGGAATTAATTAAAACATATATAAGAAGTTTCTTTAGTATGACAAGTATTAACTATGAAAGATATACTTCGTTAGGATTCTGTTATGCTATGATTCCAGCGCTTAAAAAATTATACCCTAACAAAGATGATTTAAAGGAAGCATTATTAAGACATAATGAATTCTTTAATTGCCATCCATATACAGGAAATGCTATACTTGGAGTTTCACTAGCTTTAGAGGAACAAAAGGCTATGGGTAAACCAATTACGGCAGAAGCAATTTCCGCTGCAAAGGCTGCACTAATGGGACCACTTTCAGGTATTGGAGATTCAATATTCAAGGCGACATTCATGACAATATTTGCAGCTATAGGCGCAGGAATGGCTTTAGAAGGAAATATTCTTGGAATTGTAGTATTCTTAGTACCTAATATTGCATTAAACATTCTTTCTAGGTGGTATTTTATAAAGTATGGTCATAAATTAGGAACATCTCTAGTTGCTAAAATGAAGAGTACAGATATATTAGAAAGATTTGTTGAGGGAGCTACTATAGTTGGTATGATGGTAGTTGGAGCTATGATCGTTTCCTTCGTCAAGATTAACATTGCTTATGTATGGAATTTTGGAGGAAAAGAAATAGTAGTACAAGATTTAATTAATGCAGTTATACCTTCACTTTTACCATTATTAGTTGTACTTGGTTTTCATAACATCTTAAAGAGAAATAAAAAGGGAATGTATATTTGTGTTCTTGCAAGTTTTGTTCTGGGAATATTAGGAAAGGCAATAGGTATGTTCTAA
PROTEIN sequence
Length: 535
VNTVTVLLLSTFIAVLMVENYGYGYWMISRPIVGGAIVGLLMGDIKTGLIVGGSVELMYMGILPIGGSVPPNAQIAGMLSTVFAISNGGNPEVGIALALPIGILAQILIMLAWNMNIFLMHLADKYLQKGEIKKVELIHLSGLITFFIVFFIPTFLAINFGSDYVNQVVNSMPTVIVDGLKIASGILPAVGMAMLLKMMNFKKYWSFFIIGFVLAVYLKLDVLAISLIGVGIVSALFTLRVDSKKSSNDDFDDFDEEDETIGETENVVGLLTKKELIKTYIRSFFSMTSINYERYTSLGFCYAMIPALKKLYPNKDDLKEALLRHNEFFNCHPYTGNAILGVSLALEEQKAMGKPITAEAISAAKAALMGPLSGIGDSIFKATFMTIFAAIGAGMALEGNILGIVVFLVPNIALNILSRWYFIKYGHKLGTSLVAKMKSTDILERFVEGATIVGMMVVGAMIVSFVKINIAYVWNFGGKEIVVQDLINAVIPSLLPLLVVLGFHNILKRNKKGMYICVLASFVLGILGKAIGMF*