ggKbase home page

ACD18_30_12

Organism: ACD18

near complete RP 50 / 55 MC: 17 BSCG 44 / 51 MC: 8 ASCG 0 / 38
Location: comp(13768..15519)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
type IV pilus assembly protein PilM similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 26.2
  • Coverage: 343.0
  • Bit_score: 123
  • Evalue 1.60e-25
transmembrane_regions (db=TMHMM db_id=tmhmm from=394 to=416) iprscan interpro
DB: TMHMM
  • Identity: null
  • Coverage: null
  • Bit_score: null
coiled-coil (db=Coil db_id=coil from=254 to=275 evalue=NA) iprscan interpro
DB: Coil
  • Identity: null
  • Coverage: null
  • Bit_score: null

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

RIFOXYD12_FULL_OD1_Magasanikbacteria_33_17_curated → Magasanikbacteria → Parcubacteria → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 1752
ATGAGGGGAAAAGAAACTTTTGTCGGTTTAGATATAGCCGATCATACAATATCAACTTTAGAGCTTTCTGGTTCTGAAAAAAAACCTACCTTAAAAAATTTTAATAGGGTAGTGATAGAACCAGGTGTGATAGAGTGGGGGAGAATAAAAAATCCACAAAAATTGTCTGAAATATTTAAGCAACTTTTTTTGGTCACAAAAACAAAAGAAATAAAGCTTGAAAATGTTGTTGTAAGTTTGCCAGATTCTTTGGTTTATGTACATATTTTTCATTTGCCACCACATAATAAAAGAGATAGAGAAAAGTTAGTTTTGAAAGAATTGCAAGGTATAATACCAGAAAAGATCAATAATATTTTGTATAGTTATCAAGTTTTTTCTGAGGATAATGATGTTGTAAAAGGTATGTTGGTAGCTTTACCAAAGGATGCTGCTAGTGATTGGTTTGATTTTTTTGAAAAAAACAGAATAAAGGTTAAATTTTTTGATATTGAGCCAGTGGCTTTGCGTCGTGCAATTTTCTTTGGTAAAAAAGATGAAAAAATTTGTTTAGTTGATTTAGGTGCACAGTCTACTTCTATTAATATTTTAAATAAAGTTAGATTTTATTTTAGTTACAACAATCACATTGCTGGTGATTTTTTTACTAGAGAAATATCTAATAAACTTAATTTGAGTTTAGAAGAAGCTGAACAGAAAAAAATTAAAAATGGTTTGAATGGAGTAGATGAAGATGTAAATGATATTATAAAGAGTGGTTTAGACAAATTAATTGCAGACATAAAAAATATTATCGAAGTGAATGATGATGCAGAACATCAAATAACTAAAATAGTGTTAGTGGGTGGTACTAGTAAAATGAATGGTTTGATTGATTATATCCAAAAACATTTTGAATTTCCTGTTGAATTATTAAATATTTCAAAATCTTTTACCAATGATGATATCGAATATGCTGAGTCTTTTGGTTTGGCTCTAAGATCTTTTAGTAGCAAAGATTATGAAGATGAACCATTTATAAATCAAAAACAAATTACTAAAAATAGTGGCGCTTTAAAAATTTTGAAAAAAGAGGATACTAATTATATCAAAAATTTGGATGAACATTTTGATTTAGCTAGTGTTTCTTCAGATGTAAATTTTGATAGGTATAATCCAGATCGTAACAAGATTAGTCGTATTTTGTGGTTTGTTATACCTTTGTTTGTGTCTATAATTTTGCTTATTGGTGCTTTCTTTTACAGAGCCTATAGTAGAGATGTTAGAGAGCGAAATTTAGATATTAGTAAAAGTATTCAAGATGTGGTACAATATAAACTACAAGATATTAGTGTAAAAATTCCTGTTGCCACAATCGCAAATGAATATACTAAAGATAGAATAAGGGGAAGAATATTTAATGATGTTATTTTAAAATTAAATATTTCTGAGATTGATACAGAAGATTATATTGTTAGTTTATCCAAAGAGAGGGCTGTCGCAGAATTATCAGTTTCAGAAGAAATCTATCAATACTTTTTGGAAAAAATTGATAATAAAGATGACTTCAATTATCGATGGTTGATATTATCTAGTTTGGATATTAAAACTTTGGCTAAAAACAAAATTGATAGTATGAATACGTCTGGTATAGCATACTTATTTGAAGAATATAGTATTAGTTCTGTAGAAAAGACAAGTGATAGTAATTTGTATATTTTGAATATTGTTGTGAAAGTTTCAAGTAAACAAGAACTAAATCTAAATAATTAA
PROTEIN sequence
Length: 584
MRGKETFVGLDIADHTISTLELSGSEKKPTLKNFNRVVIEPGVIEWGRIKNPQKLSEIFKQLFLVTKTKEIKLENVVVSLPDSLVYVHIFHLPPHNKRDREKLVLKELQGIIPEKINNILYSYQVFSEDNDVVKGMLVALPKDAASDWFDFFEKNRIKVKFFDIEPVALRRAIFFGKKDEKICLVDLGAQSTSINILNKVRFYFSYNNHIAGDFFTREISNKLNLSLEEAEQKKIKNGLNGVDEDVNDIIKSGLDKLIADIKNIIEVNDDAEHQITKIVLVGGTSKMNGLIDYIQKHFEFPVELLNISKSFTNDDIEYAESFGLALRSFSSKDYEDEPFINQKQITKNSGALKILKKEDTNYIKNLDEHFDLASVSSDVNFDRYNPDRNKISRILWFVIPLFVSIILLIGAFFYRAYSRDVRERNLDISKSIQDVVQYKLQDISVKIPVATIANEYTKDRIRGRIFNDVILKLNISEIDTEDYIVSLSKERAVAELSVSEEIYQYFLEKIDNKDDFNYRWLILSSLDIKTLAKNKIDSMNTSGIAYLFEEYSISSVEKTSDSNLYILNIVVKVSSKQELNLNN*