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NECEvent2014_8_4_scaffold_732_2

Organism: NECEvent2014_8_4_Streptococcus_mitis-rel_41_5_partial

partial RP 40 / 55 MC: 6 BSCG 39 / 51 MC: 2 ASCG 12 / 38 MC: 4
Location: 229..4473

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Value Algorithm Source
DNA polymerase III PolC-type {ECO:0000256|HAMAP-Rule:MF_00356}; Short=PolIII {ECO:0000256|HAMAP-Rule:MF_00356};; EC=2.7.7.7 {ECO:0000256|HAMAP-Rule:MF_00356};; TaxID=435842 species="Bacteria; Firmicut similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 2820
  • Evalue 0.0
polC; DNA polymerase III polC-type (PolIII) (EC:2.7.7.7) similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 94.3
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 2680
  • Evalue 0.0
DNA polymerase III polC-type n=1 Tax=Streptococcus salivarius PS4 RepID=I0QJG6_STRSL similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 99.1
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 2800
  • Evalue 0.0
  • rbh

Lists

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Notes

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Taxonomy

Streptococcus sp. C150 → Streptococcus → Lactobacillales → Bacilli → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 4245
TTGTCAAGTGAGGGCTTTAACCTTTTTAATTCGTTACTTCAGTCTACTTTTAATACCCTTGGTGCAGAAGTTTCTTATGAGTTTATTTTGGAGTCATCGTCTTGTGATAATGACTTACTATCTTTCTATTTTTCTTATGCTTTAGAGTCTTTAAAAGTTTCACATTTTTCCCTTTATTCTTTATTCTCCAATCTCAGTGTTGAATTTTTTAATAAAGAAATTCTCGTTAAAGCTCCATCTCATATTTTTAGAGAGAATGTTCAGGATAGATTTATTTTTTTAGTTTCTAATGTTCTTTCAAATGTTGGATTGTCTGATGTTAAAGTTTCCGTTATTGAAGATAAAGATGTATCTTCTTCTTTCGAAACGGCTTATGAAACAAATAAAGTTTCCTTGCAAGAGCAAGCTGAATCTCAAGCCAAACAAGTTCTTCAATCTATTGTTGAAAGTGAACCAGTATCAACTTCTCGACTTGAGCAGAGTCCAAGATATACCGAGAAACAAAGCCAACGTCAGGCAAGCTTTGATAAGGCTGAGATAACCCCGATGATTGATGTTAATTCTGAAGAAAACAGAATTGTCTTTGAGGGATATATCTTTGATGTTGAACAACGTGAAACGAAGACAGGACGTATTATCATTAATTTTAAAGTAACTGATTATACTTCAAGTTTTGCGATGCAACGTTGGGCGAAGGATAGTGAAGAGCTCGCTAAGTTCGATATGATTAAAAAGGGAAACTGGGTAAGGGTTCGAGGACGTATTGAGAATAATCCTTATACACATAGTTTGACGATGAATGTACAAGATATTAAGGAGATTTCTCATACACCTCGTAAGGATTTGATGCCTGAGGGACAAAAGCGTGTTGAATTCCATGCTCATACCAATATGTCAACTATGGATGCGATGCCTACCGTTGAGGAGCTTATTGATACAGCGGCCTCTTGGGGGCATCCAGCAGTTGCTATAACTGACCATGCCAATGTTCAGAGTTTTCCTCATGGTTACCATAGGGCTAAAAAAGCAGGGATTAAAGCTATTTTTGGTCTTGAAGCTAATCTTGTTGAGGATAAGGTTCCTATTGTTTATAATTCTGAGGAATTGGAATTAAAAGAAGCAACATATGTTGTTTTTGACGTTGAAACGACGGGCTTGTCTGCTGTTCATAATGATTTGATTCAGATTGCGGCATCAAAAATGCATAAAGGTAATATTATTGAGCAATTTGATGAATTTATTGATCCAGGTTACCCCTTGTCTGCGTTTACTACTGAATTGACTGGTATTACTGACAATCATGTTAAAGGTGCCAAACCTTTGTTACAAGTATTACAGGAGTTTCAAGTTTTTTGTCAGGGAACGGTGCTAGTAGCCCACAATGCGACCTTTGACGTTGGGTTTATGAATGCCAATTATGAAAGAAATCAATTACCAACAATTTCACAACCGGTTATTGATACTTTGGAATTTGCTAGAAATCTTTATCCTGAGTATAAGCGTCATGGTTTGGGACCTTTAACCAAACGTTTTGGTGTAGCTTTGGATCACCACCATATGGCCAATTATGATGCGGAAGCTACGGGTCGTTTGTTGTTTATTTTCATTAAAGATGTATTTGATAAGCATGGTTTGACTAATCTGGAACAGTTGAACACGGAGTTGGTTTCTGAGGATTCGTATAAAAAGTCTCGTGTCAAACATGCGACGCTCTATGTTCAGAATCAAACTGGTTTGAAGAATATCTTTAAATTGGTCAGCCTATCAAATGTATCATATTTTGAGGGAGTAGCCCGTATTCCTCGTACGGTTTTAGATGAGTATCGTGAAGGAATCATTGTAGGTTCTGCTTGCGCGGACGGTGAGGTTTTTGATACGCTCTTGTCTCATGGTATTGAAAAGGCAGTTGAAGTTGCTAAATATTATGACTTTATTGAAGTTATGCCACCGGCAATTTATGCGCCATTGATTGCAAAGGATTTAATTAAGGATGAGGCAACTGTAGAACAGCTGATTCGGGATTTGATAGAGGTTGCTAATCGTCTTGACAAGCCTGTACTTGCTACCGGAAATGTACATTATATCAATCCTGAGGATGCCATTTATCGTGAAATCATTGTTCGTGCTTTGGGACAAGGAGCCATGATTAATAGGCCGATTGGTAAGGGAGAAAATGCTAAACCGGCTCCTTTACCCGAAGCACATTTTAGAACAACCAACGAGATGCTAGATGACTTTGCCTTTTTGGGGAAAGAGTTGGCCTATGAGGTTGTAGTAACGAATACGCAGGCTATGGCTGACCAAATTGAAGAGGTCGAGGTTGTCAAAAAAGACTTGTACACGCCTTTTATTGATCGTGCGGAGGAGCAAGTTGCTGAGATGACTTATGCTAAAGCATTTGAGCTATACGGTAATCCTCTACCTGATATTATTGACCTACGGATTGAGAAAGAATTGTCTTCAATTCTTGGTAATGGCTTTGCCGTAATCTATCTGGCTTCACAGATGTTGGTTAACCGTTCAAATGAACGTGGTTACTTGGTTGGCTCTCGAGGGTCTGTTGGCTCTAGTTTTGTTGCGACAATGATAGGAATTACTGAGGTAAATCCTATGCCTCCTCATTATTTATGTCCTAAATGTCAACATTCTGAGTTCATCACAGATGGTTCTTATGGTTCTGGTTTTGATTTGCCTGATAAGAAGTGTTCAGAATGTGGATCCGAGTATAAGAAAGATGGTCAAGATATTCCTTTCGAAACCTTCCTAGGTTTTGATGGGGACAAGGTTCCTGATATTGATTTGAACTTCTCAGGAGATGATCAGCCGTCAGCCCACTTAGATGTTCGAGATATTTTTGGTGAGCAATATGCCTTTCGTGCTGGAACAGTAGGTACTGTTGCAGATAGGACGGCTTATGGTTTTGTCAAGGGTTATGAGCGTGATTACAATAAGTTTTACCGTGATGCCGAGGTCGATCGTTTGGCCATGGGAGCTGCTGGGGTTAAGCGAAGTACAGGTCAACACCCAGGTGGTATCGTTGTTATTCCAAATTATATGGATGTCTATGATTTTACCCCCGTCCAATATCCAGCCGATGATGTGACTGCTGCTTGGCAAACGACTCACTTTAACTTCCACGATATTGATGAGAACGTGTTGAAGCTTGATATTCTGGGACATGATGATCCGACGATGATTCGTAAGTTGCAGGATTTATCGGGAATTGATCCCAAAGATATTCGAGCAGATGATCCAGATGTAATGAAGCTTTTTTCAGGTACCGATATTTTAGGTGTAACACCTGAACAGATTGGGACACCAACGGGAATGTTGGGAATCCCTGAGTTTGGGACTAACTTTGTTCGTGGTATGGTCGATGAGACGCATCCGACGACCTTTGCGGAACTCTTACAGTTATCTGGTTTGTCTCATGGTACAGACGTTTGGTTGGGTAATGCACAAGATTTGATCAAGGAAGGTATTGCCACTCTGAAAACCGTTATCGGTTGTCGTGACGATATCATGGTATACCTAATGCATGCGGGATTAGATCCTAAGATGGCCTTCACCATCATGGAACGTGTGCGTAAGGGAATGTGGTTGAAGATTTCTGAAGAAGAGCGTAATGGCTATATTCAGGCCATGCGTGAAAATAATGTTCCAGACTGGTATATTGAATCTTGTGGAAAAATCAAGTACATGTTCCCGAAAGCCCATGCGGCAGCCTACGTTATGATGGCCCTGCGTGTCGCTTATTTCAAAGTACACCATCCTATTTATTACTATTGTGCCTACTTTTCTATCCGTGCCAAAGCTTTTGAACTTAAGACTATGTCGGCAGGGCTTGATGCTGTTAAAGCGAGAATGGAAGATATTAAAGAAAAGCGTCAACGAAATGAAGCGACTAATGTGGAAATTGATTTGTTTACGACTCTTGAAATTGTCAATGAAATGTTAGAACGTGGCTTTACCTTTGGTCAGTTAGATCTTTACAAAAGTCAGGCAACTGAATTTCTGATTGAGGGAGATACCTTGATTCCACCGTTTATTGCACTTGAAGGTTTGGGCGAGAATGTTGCTAAGCAGGTAGTTGCTGCACGTGAGGAAGGAGAATTCCTTTCTAAAACAGAATTGCGTAAACGAGGAGGCCTTTCATCCACTTTGGTTGAAAAGCTAGATGAAATGGGAATCCTAGGCAATATGCCAGAAGATAATCAGTTAAGTCTTTTTGATGATTTCTTTTAG
PROTEIN sequence
Length: 1415
LSSEGFNLFNSLLQSTFNTLGAEVSYEFILESSSCDNDLLSFYFSYALESLKVSHFSLYSLFSNLSVEFFNKEILVKAPSHIFRENVQDRFIFLVSNVLSNVGLSDVKVSVIEDKDVSSSFETAYETNKVSLQEQAESQAKQVLQSIVESEPVSTSRLEQSPRYTEKQSQRQASFDKAEITPMIDVNSEENRIVFEGYIFDVEQRETKTGRIIINFKVTDYTSSFAMQRWAKDSEELAKFDMIKKGNWVRVRGRIENNPYTHSLTMNVQDIKEISHTPRKDLMPEGQKRVEFHAHTNMSTMDAMPTVEELIDTAASWGHPAVAITDHANVQSFPHGYHRAKKAGIKAIFGLEANLVEDKVPIVYNSEELELKEATYVVFDVETTGLSAVHNDLIQIAASKMHKGNIIEQFDEFIDPGYPLSAFTTELTGITDNHVKGAKPLLQVLQEFQVFCQGTVLVAHNATFDVGFMNANYERNQLPTISQPVIDTLEFARNLYPEYKRHGLGPLTKRFGVALDHHHMANYDAEATGRLLFIFIKDVFDKHGLTNLEQLNTELVSEDSYKKSRVKHATLYVQNQTGLKNIFKLVSLSNVSYFEGVARIPRTVLDEYREGIIVGSACADGEVFDTLLSHGIEKAVEVAKYYDFIEVMPPAIYAPLIAKDLIKDEATVEQLIRDLIEVANRLDKPVLATGNVHYINPEDAIYREIIVRALGQGAMINRPIGKGENAKPAPLPEAHFRTTNEMLDDFAFLGKELAYEVVVTNTQAMADQIEEVEVVKKDLYTPFIDRAEEQVAEMTYAKAFELYGNPLPDIIDLRIEKELSSILGNGFAVIYLASQMLVNRSNERGYLVGSRGSVGSSFVATMIGITEVNPMPPHYLCPKCQHSEFITDGSYGSGFDLPDKKCSECGSEYKKDGQDIPFETFLGFDGDKVPDIDLNFSGDDQPSAHLDVRDIFGEQYAFRAGTVGTVADRTAYGFVKGYERDYNKFYRDAEVDRLAMGAAGVKRSTGQHPGGIVVIPNYMDVYDFTPVQYPADDVTAAWQTTHFNFHDIDENVLKLDILGHDDPTMIRKLQDLSGIDPKDIRADDPDVMKLFSGTDILGVTPEQIGTPTGMLGIPEFGTNFVRGMVDETHPTTFAELLQLSGLSHGTDVWLGNAQDLIKEGIATLKTVIGCRDDIMVYLMHAGLDPKMAFTIMERVRKGMWLKISEEERNGYIQAMRENNVPDWYIESCGKIKYMFPKAHAAAYVMMALRVAYFKVHHPIYYYCAYFSIRAKAFELKTMSAGLDAVKARMEDIKEKRQRNEATNVEIDLFTTLEIVNEMLERGFTFGQLDLYKSQATEFLIEGDTLIPPFIALEGLGENVAKQVVAAREEGEFLSKTELRKRGGLSSTLVEKLDEMGILGNMPEDNQLSLFDDFF*