ggKbase home page
Advanced Search
Search Help

NECEvent2014_4_7_scaffold_270_2

Organism: NECEvent2014_4_7_Anaerococcus_vaginalis_29_18_partial

near complete RP 52 / 55 MC: 1 BSCG 51 / 51 ASCG 14 / 38 MC: 1
Location: 324..3833

Top 3 Functional Annotations

View all annotations
Value Algorithm Source
Transcription-repair-coupling factor {ECO:0000256|HAMAP-Rule:MF_00969}; Short=TRCF {ECO:0000256|HAMAP-Rule:MF_00969};; EC=3.6.4.- {ECO:0000256|HAMAP-Rule:MF_00969};; TaxID=655811 species="Bacteria; Fi similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 98.0
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 2243
  • Evalue 0.0
transcription-repair coupling factor n=1 Tax=Anaerococcus obesiensis RepID=UPI0002F73EA1 similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 98.3
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 2246
  • Evalue 0.0
  • rbh
transcription-repair coupling factor similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 58.1
  • Coverage: 999.99
  • Bit_score: 1384
  • Evalue 0.0

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Anaerococcus vaginalis → Anaerococcus → Clostridiales → Clostridia → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 3510
ATGAATAGCCTTATTAATGAAATTTATAATATTAGTCAAGTTAAGGAAATAATTGAAAATTATAAAAAATTATCTCCAATATTTTTACATGGACTAACTGATGAGAGCAAAGCTCATATTTTTCAAACTCTATTTACTTATACTGGGAAAACATTAATTATTATTTGCGAGAATGAAAAAAAAGCAAAGCTAATGCGTGATGATATTAATTCTTTGCAAGATGATTCTTGTATGTATTTTCCATCAACTGAAATCAACTACTATAATATTAAAAATTTAGAAAATAATAATGAAATAAATCGAATTGAAGTTTTAACAAGGCTTATTAATGAGGATAAATTTATAATTACTACTACTTTAGATGCCTTAAGAAATAAATTAACTCCAAGAAAAATTTTTAAAGATAAGTCATTTAAAATTGATATTGATAGTGAATTAGATTTAAGAGATGTAAAAAAATCATTTATAGAATTAAATTATGATTTTACAAAATTAGTTGAGTCAAAAGGAGAATTTTCTATTAGAGGCTCAATAATAGATTTTTGGCCTATAGAATATGATAATCCTATAAGAATAGAATTATTTGATACAGAAATAGATTCAATAAGATTTTTTGATAAAGACACTCAAAGATCTCTTGAAAATATTGATGAAATAATAATTAGACCAACAAAAGAGTTAATTTATGATAAAAATGATTATCAGAAAATAATTGAATTAATAAAAAAAGATATAAAAAACATATCAGATTCAGGTAATTCTAGAAAATTAAAAGATAAATATAATCAAATAATTTCTTATCTCAATGATAGTTTATATATTGCAAATGAGGATTTAATTACTCCCTATAGAAATGAAAATTTTGATGAATTTTTTGCTTATTTAGATAAAGATTCAATATTTCTTTTTCAAGATTTAAATAGGTCAATTGACAATTTTTCACAAGATATGGAAAAATCGGATCTGGATTTTACAAATCAGTTAGAAAATGGGGAAATATTTCCATCATTTAAAAATATTAAAATAGATATAAATAAAATTTTTACTAATATCAAATCATATCCTATAATAAATTCTTCAAGTTTATTAAAAAACAATAATATAATCAAAGCCAAAAAAATTATTGAATTAAAATCTATTGAGCAAGAAAATTTTAATAAAAATATTGAAAACTTCATTTTTAATATTAATTCTTTAATTAAAAATAATGAAAAAGCTATTATTTTTGCATCTGATAAAAAATCTCTAGAAAGTATAAAAGAAATTTTTAATGAAAATAATATTGACAATTTTTCTATTGGTCTAGATTCTGATTTAAGTAATACCAATATAATCTTAACTGAAAATTCTTTATCAAGAGGTTATATTTTCACTGATAATAAAATAAATTTATATTCTCATAGGGATATTTTTGGTAAAGATAAATTAAAAAATAAAAAAACAAGAAAGAAACCAGTAAGTGCTAAAGATATAATAAATTATTCCGATATAGAAATTGGCGATTATGTAGTTCATGAAAATAATGGTATTGGTATATATAAAGGCATATCTAAAATTGAAGTAAATAATACAAAAAAAGATTATTTTGTAATTGAATACAAGGGAAATGATAAGGTATTTGTTCCTGTTGACCAAATGGATTTAGTTAGTAAATATATTGGTAATAAGGGAGATAAGCCAAAAATTTCATCACTTGGAAGTAATCAATGGAAAAAAGCTAAGCAAAGAGCAAAAAAAGCAGTTGATGAAATAGCAGATGATTTGGTAGAACTTTACGCAAAAAGATCAAAAGCCAAGGGACATGCTTTTAGTGAAGATACAACTTGGCAAAAAGAATTTGAAGATTCTTTTATTTATGAAGAAACGGATAGCCAAGTAAGATCTATTAATGAAATTAAAGATGATATGGAAAATATCAAACCAATGGATAGACTTCTTTGTGGAGATGTTGGTTATGGAAAAACTGAAGTAGCTTTAAGAGCTGCATTTAAAGCAATAATGGACGGCTATCAAGTTTGTTTTTTAGTACCAACTACAATTCTTGCAAGTCAACATTATTCTACAATGAAAGAAAGGTTTAAAGATTATCCTGTCGAGTGTGCTTTATTATCTAGATTTGTAAGTAAAAAAGAACAAGATAAAAATATAAAAAATTTAAAATCAGGTAAAATTGATATTATTGTAGGAACTCATAGGTTACTATCAAATGATATAAAATTTAAAAATCTTGGCTTGTTAATTATAGATGAAGAGCAAAGATTTGGTGTAAGACATAAAGACAAACTAAAAAAATTAAAAGAAAATATTGATGTTTTAACTTTGTCTGCTACGCCAATTCCAAGAACCTTACAATTATCATTGACTGGGATAAGGGATATGTCAACTTTGGATGAACCTCCAGAAAGAAGACTTCCTGTAAATACTTACGTATTAGAATATGATTCATCAATTATAAAAAGAGCTATCGAAAAAGAGCTTGATAGGGATGGGCAAGTATATTTTGTCTATAATAGAGTTTATAATATCGAAAAAATTTACAATGAACTTGTTGAATTAATACCAGATGCAAATATTGCTATCGCTCATGGGCAAATGTCTGCAAAAAATCTTGAAAAAATAATGGAAGATTTTGTGAATGGGGATATTGATATACTTCTTGCCACAACAATCATTGAAACTGGTATGGATATACAAAATGTAAACACAATTATAGTTTATGATTCTGACATGATGGGACTTAGTCAACTTTATCAATTGAAAGGACGAATAGGTCGATCATCTAGGTCTTCTTATGCTTATTTTACTTATGCCAAAGGAAAAGTTTTAACTGAAATAGGTGAAAAAAGATTAAAATCAATTAAAGATTTTTCTGACTTTGGTAGTGGTTATAAAATTGCTATGAGAGATTTAGAACTTAGGGGCGCAGGAAATATTTTAGGTGAAAGCCAAAGTGGGCAAGTAGAAGCTATTGGATATGACTTATATGTTAAATTCTTGCAACAAGCTGTTAATAAAGCAAGCGGAAAAGAATTTAAATCTAGCGATTTAAATGACGTATATATTGACTTGAAAGTGGATGCTTATATTCCAGAATCTTATATAGAAGATCAAGGACAAAAAATAGAAATGTACACTAGAATATCAAGAATTGAAACTTTGGAAGACTATAGTTTTCTTGTTGAAGATTTGATTGATAGATATGGAGATATTCCATTAATGGTTGACAATATAATGTACGTATCATTGGTAAAATCCCTTGCTGATAAATTAGGTTTTGATGAAATTAGAGAAGTGAAAAATGAAATAATAATATCTTATGACGATAGAAATAAATTTACTTTTGAGCAATTATCTCAAATTAATGAAAATTATCACGGAGAACTTTCATTTGACCTTTCACAAAATCCAGCTTTTAAATTACCAAATAAAAATACAAAACTGTTAGACTGTTACGAATTATTAAAAGTTATTAAAAATGTTAAGGAGAAAAAATGAACAAAAGACTTATAG
PROTEIN sequence
Length: 1170
MNSLINEIYNISQVKEIIENYKKLSPIFLHGLTDESKAHIFQTLFTYTGKTLIIICENEKKAKLMRDDINSLQDDSCMYFPSTEINYYNIKNLENNNEINRIEVLTRLINEDKFIITTTLDALRNKLTPRKIFKDKSFKIDIDSELDLRDVKKSFIELNYDFTKLVESKGEFSIRGSIIDFWPIEYDNPIRIELFDTEIDSIRFFDKDTQRSLENIDEIIIRPTKELIYDKNDYQKIIELIKKDIKNISDSGNSRKLKDKYNQIISYLNDSLYIANEDLITPYRNENFDEFFAYLDKDSIFLFQDLNRSIDNFSQDMEKSDLDFTNQLENGEIFPSFKNIKIDINKIFTNIKSYPIINSSSLLKNNNIIKAKKIIELKSIEQENFNKNIENFIFNINSLIKNNEKAIIFASDKKSLESIKEIFNENNIDNFSIGLDSDLSNTNIILTENSLSRGYIFTDNKINLYSHRDIFGKDKLKNKKTRKKPVSAKDIINYSDIEIGDYVVHENNGIGIYKGISKIEVNNTKKDYFVIEYKGNDKVFVPVDQMDLVSKYIGNKGDKPKISSLGSNQWKKAKQRAKKAVDEIADDLVELYAKRSKAKGHAFSEDTTWQKEFEDSFIYEETDSQVRSINEIKDDMENIKPMDRLLCGDVGYGKTEVALRAAFKAIMDGYQVCFLVPTTILASQHYSTMKERFKDYPVECALLSRFVSKKEQDKNIKNLKSGKIDIIVGTHRLLSNDIKFKNLGLLIIDEEQRFGVRHKDKLKKLKENIDVLTLSATPIPRTLQLSLTGIRDMSTLDEPPERRLPVNTYVLEYDSSIIKRAIEKELDRDGQVYFVYNRVYNIEKIYNELVELIPDANIAIAHGQMSAKNLEKIMEDFVNGDIDILLATTIIETGMDIQNVNTIIVYDSDMMGLSQLYQLKGRIGRSSRSSYAYFTYAKGKVLTEIGEKRLKSIKDFSDFGSGYKIAMRDLELRGAGNILGESQSGQVEAIGYDLYVKFLQQAVNKASGKEFKSSDLNDVYIDLKVDAYIPESYIEDQGQKIEMYTRISRIETLEDYSFLVEDLIDRYGDIPLMVDNIMYVSLVKSLADKLGFDEIREVKNEIIISYDDRNKFTFEQLSQINENYHGELSFDLSQNPAFKLPNKNTKLLDCYELLKVIKNVKEKK*TKDL*