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NECEvent2014_5_8_scaffold_543_8

Organism: NECEvent2014_5_8_Clostridium_sporogenes-rel_28_12

near complete RP 51 / 55 MC: 4 BSCG 51 / 51 MC: 3 ASCG 15 / 38 MC: 1
Location: comp(7518..9944)

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Carbamoyltransferase HypF n=1 Tax=Clostridium sporogenes ATCC 15579 RepID=J7SG15_CLOSG similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 808.0
  • Bit_score: 1650
  • Evalue 0.0
  • rbh
Carbamoyltransferase HypF {ECO:0000313|EMBL:EDU36996.1}; TaxID=471871 species="Bacteria; Firmicutes; Clostridia; Clostridiales; Clostridiaceae; Clostridium.;" source="Clostridium sporogenes ATCC 15579 similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 808.0
  • Bit_score: 1650
  • Evalue 0.0
hypF; [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 84.7
  • Coverage: 812.0
  • Bit_score: 1450
  • Evalue 0.0
  • rbh

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Clostridium sporogenes → Clostridium → Clostridiales → Clostridia → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 2427
ATGTATCTGAATCATATAGATAAAGTTAATAATAAAAGACGATATTTAATAAAAATAGAAGGTATAGTACAAGGGGTGGGCTTTAGACCTTTTGTATATAATAAAGCAAAGGAGTTTCATTTAAAAGGATATGTGAAAAATAAGGGCAGTATGGTAGAAATAGATTTAGAGGGACATAAAGAAAATATTAAAAATTTCTTATTAGAAGTAGTTAAAAATCCTCCGATTATGTCTAAAATAGAAAACTTGAAATGTAAATTTTTGAAACCTATTAATTATAGGGACTTTATCATCAAAGAAAGTTCTAGTGAAAAAAATGCAGCAAATTTTATAAGTCCAGATATAGCCCTTTGTCAAAACTGTATAAAAGAATTAAATTTAAGTACTAATAAAAGATATGAACATCCTTTTATTAATTGTACAGATTGCGGACCTAGATACTCTATTATAAAATCTTTGCCCTATGATAGAGAAAGTACAACTATGAAAAATTTTACTATGTGTAATAGTTGCAGACAAGAATATGATATTCCAGACAATAGACGATTTCATGCAGAGCCTAATTGTTGTAATTTATGTGGTCCTTCCTTAATATTATTGAATAATAAAAAACAAGTTATATGTACTAATAAAGCAAAAGAATATATAAATAATGGTGATTATAATAAAAAGAAAATTTATAACAATTATATAAATCTAGCTAATTTAAGTTATAAAAGACATCCCATTTATACTGCTGTAGAATTAATAAAAAAGGGATACATTGTAGCTGTAAAAGGTATAGGAGGATTTCATTTAGTTTGTAATGGTAAAAATAAAAAGGCTATAGAGAATTTAAGAATAAGAAAAAAAAGACCTCATAAACCTTTAGCTATAATGTGTAAGGATTTAAAAACCGTAAAAGAATTATGTTATATATCTAAATTAGAAGAACAGATTTTAAAAGGCAATAAAAAACCTATTTTAATTTTAAAGAAAAAAAGTACAAATATATTGCCAGATAACATAGCTCCTTTAAATAAATATATAGGAGTTATGCTGCCTTATAGCCCGCTCCATTATTTACTATTTAAAGAAGGTTTAGATGTAATAATAGCTACTAGTGGCAATATAAGTGGAATACCTATGGAATATAAAAACTGTGAGGCTATAGAAAATTTAAAAATTGTAGCAGATTATTTTTTAATCCATAATAGAGATATTCATACTCCTGTTGATGATTCTGTAGTAAAAGTTATAAATAATAAAGAAAGTTTAATTAGAATAGGTCGTGGTTATGCTCCTTATACTTTAAATATAGAAAGTAAAAATGAATTATTGGCAAAGGGTACAGAAGAAAAAAACACCTTTTGCCTTTCTAAAAAGGGATATGTGTACATGAGTCAATATATAGGAGACTTAAAAAATCTAGATTGTTATAGTAGACATTTAAATACTATAAAACATTTAAAGGCTTTGTTAGATATAAATCCTAAAATAGCTGTTGAAGATTTACATCCAAATTTTAATACTAATTGTGAAAATAAAAGCTATAATAAAACCATTAAAGTTCAACATCATCATGCTCATATGGTAAGTTGTATGGTAGAGCACTCATTATTTGATAGGGTTATAGCTGTTATATTTGATGGTACAGGCTTTGGTAAGGATAATAGTATATGGGGAGGAGAATTCTTAGTAGGTGACAGAACCTATTTTGAAAGAGTTGGTCATCTAAAAAAAGTTAAGATACAGGGTGGAGATAAATCCATAAAAGAACCTTGGAGGTGTGCTTTAAGTTACTTGCATTCTATAAATTATAAAAATAGTTCTATTATTAAAAACATAGAAGAAGAAAAAATTGAAATAGTAAAAAAAGCTTTATTCAATAATATAAATTGCTATACATCTTCTAGTATGGGAAGATTTTTTGATGCAGTAGCTTCATTAGCAGGTATAAGAAATATCATAAGTTATGATGGTCAAGCTCCTATAGAATTAGAAAATATAATAGATGAATCTGTATCCCTTTATTATGATTATAGCATCAACAAAATAGATAATGTTTTAGAAATAGATTATAAAAATATACTTTTAGGAATAATTACAGATTTAGAAGAAAACAAAGATCTAACTACTATATCCTCAAAATTTCATAATACAGTTATTAATTTTACCTGTGATTTGGTATGTAAAATAAAAAAAAGTTATAAACTTAAATATAAATTAGATAAAGTTGTTTTAAGCGGAGGAGTTTTTCAAAACAATTACTTATTAAAAGGTATATACAATAAATTAAAGGATAATGGGTTTAAGGTATTTTTTAATGAAAAAGTTCCTATAAATGATGAAGGAATAAGCCTTGGTCAATTAGCTATTGGTGACTCTATTATAGAAAGGGAGAGAAGAAATGTGCATTGCAATACCAGGGAAAATTATAAGTATTGA
PROTEIN sequence
Length: 809
MYLNHIDKVNNKRRYLIKIEGIVQGVGFRPFVYNKAKEFHLKGYVKNKGSMVEIDLEGHKENIKNFLLEVVKNPPIMSKIENLKCKFLKPINYRDFIIKESSSEKNAANFISPDIALCQNCIKELNLSTNKRYEHPFINCTDCGPRYSIIKSLPYDRESTTMKNFTMCNSCRQEYDIPDNRRFHAEPNCCNLCGPSLILLNNKKQVICTNKAKEYINNGDYNKKKIYNNYINLANLSYKRHPIYTAVELIKKGYIVAVKGIGGFHLVCNGKNKKAIENLRIRKKRPHKPLAIMCKDLKTVKELCYISKLEEQILKGNKKPILILKKKSTNILPDNIAPLNKYIGVMLPYSPLHYLLFKEGLDVIIATSGNISGIPMEYKNCEAIENLKIVADYFLIHNRDIHTPVDDSVVKVINNKESLIRIGRGYAPYTLNIESKNELLAKGTEEKNTFCLSKKGYVYMSQYIGDLKNLDCYSRHLNTIKHLKALLDINPKIAVEDLHPNFNTNCENKSYNKTIKVQHHHAHMVSCMVEHSLFDRVIAVIFDGTGFGKDNSIWGGEFLVGDRTYFERVGHLKKVKIQGGDKSIKEPWRCALSYLHSINYKNSSIIKNIEEEKIEIVKKALFNNINCYTSSSMGRFFDAVASLAGIRNIISYDGQAPIELENIIDESVSLYYDYSINKIDNVLEIDYKNILLGIITDLEENKDLTTISSKFHNTVINFTCDLVCKIKKSYKLKYKLDKVVLSGGVFQNNYLLKGIYNKLKDNGFKVFFNEKVPINDEGISLGQLAIGDSIIERERRNVHCNTRENYKY*