ggKbase home page

NECEvent2014_5_8_scaffold_612_1

Organism: NECEvent2014_5_8_Clostridium_perfringens_28_7

near complete RP 51 / 55 MC: 1 BSCG 51 / 51 MC: 1 ASCG 15 / 38 MC: 1
Location: 2..1075

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
Histidine kinase {ECO:0000256|SAAS:SAAS00251121}; EC=2.7.13.3 {ECO:0000256|SAAS:SAAS00251121};; TaxID=883064 species="Bacteria; Firmicutes; Clostridia; Clostridiales; Clostridiaceae; Clostridium.;" so similarity UNIPROT
DB: UniProtKB
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 357.0
  • Bit_score: 705
  • Evalue 5.20e-200
Sensory box histidine kinase n=2 Tax=Clostridium perfringens RepID=H7D041_CLOPF similarity UNIREF
DB: UNIREF100
  • Identity: 100.0
  • Coverage: 357.0
  • Bit_score: 705
  • Evalue 3.70e-200
  • rbh
sensory box histidine kinase similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 42.5
  • Coverage: 374.0
  • Bit_score: 261
  • Evalue 4.00e-67

Lists

This feature is not on any list.

Notes

This feature has no notes.

Taxonomy

Clostridium perfringens → Clostridium → Clostridiales → Clostridia → Firmicutes → Bacteria

Sequences

DNA sequence
Length: 1074
TTTTATGTTAATAAAAAAATTAAAGAATACTATAATTTTCAAGAAGAACTAACTAAATTTAAAAATGATTTAATAAACAATAAATATTTTTATAGTAAGCTTAAAGAAATTTTTGATGATTTAAATAATAAAGTTTACTGGCATGGAATTATTAAAAATTCTATAAAAAATGAATTATTAGATTGTTATATTCAAAAATTAAATATAAATAATAAGGATGAATTTTTAGTGAGTTATATAGTTGTTAATAATAATAAATTAGGAAAAACATTCAAAAATATTAAATTAAAAAACTTAAAAAGAAATGAATTTATATCTAATATATCACACGAACTAAAAACACCAATTAATATTTTTTATTCAACCATACAACTACTTGAAAATTTTAACAACAATAATAATGTTAATTTCAAAGAAATTTTTAATAAGTATACTGTTTCATTAAAGTTAAACTGTAAAAGAATGATTAAATTAATAAATAACATTATTGACTTATCTAAAATAGAATTAAATTCTTTAAAACCTAATTATGGAAATTATAACATAATTCTATTAATTGAAGATATAAGTAATTCAATAATTCCGTTTGCCTTATCCAAAAATTTATCTATAAAATTTGATACAAATAAAGAAGATCATTATATAATGTGTGATCCAATTATTATCGAAAGAATTTTATTGAATATTTTATCAAATGCTATAAAATATTCAAAAAAAAATAGTACAATTTATATTAATATCTTAGTTGAAAAATCTATTACGAAAATTTCTGTAAAAGATGAAGGATGTGGAATTGATTTAGAAACTCAAAATAATATATTTAATAGATTTGTTAGAGCTAATAATTCTTTTATTCATTCAAATGAAGGATCTGGAATTGGATTAAATATAGTTAAATCTCTTTTAAATACAATTAATGGAGATATAAATATAAAAAGTGAATTAAACAAAGGAAGTATTTTTGAAATTTTACTACCAAATCAAATTTTAAATGATAAATATATAAAAAACTACAAGTATGAAAGTACTGATAATCTATCAATCGAATTATCAGATATATATGAAATTAATTAA
PROTEIN sequence
Length: 358
FYVNKKIKEYYNFQEELTKFKNDLINNKYFYSKLKEIFDDLNNKVYWHGIIKNSIKNELLDCYIQKLNINNKDEFLVSYIVVNNNKLGKTFKNIKLKNLKRNEFISNISHELKTPINIFYSTIQLLENFNNNNNVNFKEIFNKYTVSLKLNCKRMIKLINNIIDLSKIELNSLKPNYGNYNIILLIEDISNSIIPFALSKNLSIKFDTNKEDHYIMCDPIIIERILLNILSNAIKYSKKNSTIYINILVEKSITKISVKDEGCGIDLETQNNIFNRFVRANNSFIHSNEGSGIGLNIVKSLLNTINGDINIKSELNKGSIFEILLPNQILNDKYIKNYKYESTDNLSIELSDIYEIN*