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NECEvent2014_5_8_scaffold_3048_1

Organism: NECEvent2014_5_8_Clostridium_perfringens_28_7

near complete RP 51 / 55 MC: 1 BSCG 51 / 51 MC: 1 ASCG 15 / 38 MC: 1
Location: 2..2638

Top 3 Functional Annotations

Value Algorithm Source
collagen-binding protein similarity KEGG
DB: KEGG
  • Identity: 30.1
  • Coverage: 183.0
  • Bit_score: 72
  • Evalue 6.50e-10

Lists

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Notes

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Taxonomy

No taxonomy information

Sequences

DNA sequence
Length: 2637
TGCATGGTAGTGGTGTTATCCAGTAATATTTCGGTGTTAGTAGAAGGAAAAAGTATTTCAACAGTTGAAATAAGCGCTGGTGAAAATGGGGATAACAATCCTCACAATCAGTTAGGCAATGATTTGAAAGAAACAACAAACAGAGTAGTAGAAAAAGCTTATAACTATGATGGAGAAAACCCAGATTTATCATTAGGAATTTATCCAGAACGTTATAAAATTTGGAGAGATGAAACTAACAGAGAACACTTAAATGAGGGGGAACTAAATAGATATACCTTTGGTGATTTTGGAGAAAGCTACGATATATTTAATATTTTAGCCAAGTACAATGCCTTTACCTTTGATTATTATGAAGGTACACACATTGTTGGACCAGTTGCAGCTGGTGGAGATGTTAAGGTTTCTATAGGTGGAACTACAACAAAAGTAGAATATCCACATACAGTTCCTTGCTACATTGGGGGTAACGCTGGGAATGGTAATACAATTATTACAACTTCTAATATGCCAATATTTATTAATGGAAACATAGCAGGAAATAAGAAATATTGGACAATGCAAGAATCTCCTACTTCACTTTATTACAATTATTATTATACAAATGATAATTATAAATATATTGATATGGCAGAGGCAAAAGCAAAAATTACTCAGCAAATGCAAGAGCTTATGGATTTTCAAGGGATTGATGTAACAGGACATTACATGGAGAAAATTTCAATTACTGATAAAGATATAGAAGAGATGAAAAGTTTAAAGCCTGGTGAAATTATTGAAAAAGAAGGATATACCTTGGAATGTAATGGATCAGTAGGTTATAGTTATGGAGTTCGTTTACAGCTTGGATACAACTTCGAAATTTCTTCAGTTAAAGATATTGATTATATTGTCTATGATTATGAAAGCTTACATGAAGTAGGTAATATGACAACATTTATAAATATCTTAGATTCTGGAGAATTTAATATGCCAGCTATATTTAAATCAGTTTCTGACAAATTAGGAGTAGATAAAGCTATTATTGGATCTGGAAATATAAAAGATGCTTATCAATTTGAGTCTATTGAGGTTGAAGAGGCCTTCAATATTGTTGGTTTTTTCCCTAATGCAACTAAGATTGTAGTAGGGGGAAGTATGAACAAATATGTTGGACATCTAGTAGCACCAAAAGCGCATGTTGAAGTAAATAGTGGTGACTTTAATGGTACTATGATCGCCGATAGTATTAAATCAAGTGCAGAAGGGCATATGTGGCCATTTAATGTTAAGTCTTTATTGGGATTTAGAAAAACAGTAAATGGATCAATACCAAATGAGAATGAAGTGTTTAAATTTAAAATAGAAAATATTTCAAAGCCTGAAACTGCAGAGAATATTCCAATTCAGTATGCTGAAAATACTATAAATGGATTAGTTACATTTGATCTTTCAGGTTTAACAAAGCGAGGGGAGTATATTTTCAAGATTTCAGAAGAATATACCAACACTCAGTACATTAAAAATGATAATGTGTATTATGCTAGATTTAATGTTTTACCATCAACAAGTACAGTAGGTGGTGTTAATATGTCAGCAAAGCTTGAAGGTTTTTATGAAGATGAGAAATGTACAATAAAGCATGATATGAATGGTAGTAATGTATTGTATAACAACTTTAGAGATCTTAAGGTTCAAAAGAAGTGGATTGACACAGAAGGAAATGAGTTGGACAAGCAATATTGGAAGCCAGTATCAGTTGAAATTCATAGAAAAGCAGTTAAAGATGAAGCTTTTCAGCCAACTGAAGATACTGTTGTAGATAATGTGGACATAAATGAATTAAAAAATAATACATTGGTAGAAAAAGTTACATTAAGTGAGGATAATGACTGGAAGCAAACTTTAATAGGAAATCAATATTTCTCATCAAAAATCCTAGAAGAAGATGGAAAGATAGTAAAATATGATTTTAGCTATTATGCAAAAGAGGTAGATGTACCAAGTAATGCTACTGTAAGCTATGAAAATAATGATGGAATTATTATTGGATGCATTATAGTTAAAAATCAAGTGGATTCAGTAGATTTGACTATACAGAAAAAGAGTAGCACAGGTAATAATGATTATCTATCTGGTGCAGAATTTAAACTCTATAAATCAAGTGATTTAAATGCACCATTAAAATTTACATTAAATAATGGTTATTATGTATTTAATGTAAATGGAGATAAGGAAACATTATTAACAGATGGTTCAGAAACAGGTAAAGACAGTGTTGGATTGTTAAAATTAAAAGATTTACCTTTTGGTGATTATGTTATACAAGAAACAAAACATCCTGAGGGGTTTGTAATTAATAGTCAATTTATCTTTATTCATGTTGATAGTAAGGGAAGCTATTATCAATTAATGGGTGATGAAAAAGTTCCTAATGAGACCATGGAGAAAGTAAACATTAATCATACATCCACTGATTTTAGTATTAAATTAGAATTTGCCGTTGAAAATACACCAAACATTGAGGTTCCAGAAACAGGTGGTACACCTAATGATATATATAAGAAGATTGGGTTATTGCTTACTTGTTTGGGAGCTATAATGCTTACAGTATATGAGGTAAAGTTCAATAAAAATAGAAAAAAGATAGGGTTCTAA
PROTEIN sequence
Length: 879
CMVVVLSSNISVLVEGKSISTVEISAGENGDNNPHNQLGNDLKETTNRVVEKAYNYDGENPDLSLGIYPERYKIWRDETNREHLNEGELNRYTFGDFGESYDIFNILAKYNAFTFDYYEGTHIVGPVAAGGDVKVSIGGTTTKVEYPHTVPCYIGGNAGNGNTIITTSNMPIFINGNIAGNKKYWTMQESPTSLYYNYYYTNDNYKYIDMAEAKAKITQQMQELMDFQGIDVTGHYMEKISITDKDIEEMKSLKPGEIIEKEGYTLECNGSVGYSYGVRLQLGYNFEISSVKDIDYIVYDYESLHEVGNMTTFINILDSGEFNMPAIFKSVSDKLGVDKAIIGSGNIKDAYQFESIEVEEAFNIVGFFPNATKIVVGGSMNKYVGHLVAPKAHVEVNSGDFNGTMIADSIKSSAEGHMWPFNVKSLLGFRKTVNGSIPNENEVFKFKIENISKPETAENIPIQYAENTINGLVTFDLSGLTKRGEYIFKISEEYTNTQYIKNDNVYYARFNVLPSTSTVGGVNMSAKLEGFYEDEKCTIKHDMNGSNVLYNNFRDLKVQKKWIDTEGNELDKQYWKPVSVEIHRKAVKDEAFQPTEDTVVDNVDINELKNNTLVEKVTLSEDNDWKQTLIGNQYFSSKILEEDGKIVKYDFSYYAKEVDVPSNATVSYENNDGIIIGCIIVKNQVDSVDLTIQKKSSTGNNDYLSGAEFKLYKSSDLNAPLKFTLNNGYYVFNVNGDKETLLTDGSETGKDSVGLLKLKDLPFGDYVIQETKHPEGFVINSQFIFIHVDSKGSYYQLMGDEKVPNETMEKVNINHTSTDFSIKLEFAVENTPNIEVPETGGTPNDIYKKIGLLLTCLGAIMLTVYEVKFNKNRKKIGF*